Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N3NCH6

Protein Details
Accession A0A2N3NCH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-30LSNEISKSKPDKARKFVRRADIEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-25DKARKFVRR
44-98EEKRQARAAAKRKAEEDELAEKQAREEKRRRLAEESRKRREEEEKEEERKRRKRL
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR014906  PRP4-like  
IPR036285  PRP4-like_sf  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
PF08799  PRP4  
Amino Acid Sequences MDFDSLLSNEISKSKPDKARKFVRRADIEAERRAAYEAEQRALEEKRQARAAAKRKAEEDELAEKQAREEKRRRLAEESRKRREEEEKEEERKRRKRLGLPELVEKPEKEEEDEIGEDEEDIAEGELVEKLRAIGAPAVLFGESHVERLRRYRRLTTVVTDGPIPTTLRLVEEKDMKLDGTVPKDKEGRKYLFRQLASYFTLVFSEYQAAMERERRDTLTSKTAYKAMVETRENLKPLFRKFEKGELEDSILEPVVEIVKAAQERRYVDAYDGYLRLSIGKAAWPIGVTMVGIHERSAREKLHTGERGHVMGDEVTRKFLQSIKRCLTFAQVRWPPEDITQLMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.42
3 0.52
4 0.61
5 0.67
6 0.77
7 0.82
8 0.86
9 0.86
10 0.87
11 0.83
12 0.77
13 0.75
14 0.74
15 0.7
16 0.65
17 0.6
18 0.5
19 0.43
20 0.4
21 0.32
22 0.25
23 0.27
24 0.25
25 0.24
26 0.24
27 0.24
28 0.27
29 0.29
30 0.29
31 0.3
32 0.31
33 0.33
34 0.37
35 0.38
36 0.4
37 0.48
38 0.55
39 0.55
40 0.58
41 0.57
42 0.56
43 0.58
44 0.55
45 0.47
46 0.43
47 0.41
48 0.36
49 0.35
50 0.35
51 0.3
52 0.29
53 0.33
54 0.34
55 0.35
56 0.42
57 0.49
58 0.57
59 0.64
60 0.66
61 0.67
62 0.72
63 0.74
64 0.77
65 0.78
66 0.78
67 0.75
68 0.73
69 0.7
70 0.69
71 0.67
72 0.65
73 0.64
74 0.63
75 0.67
76 0.73
77 0.76
78 0.76
79 0.76
80 0.74
81 0.74
82 0.73
83 0.74
84 0.77
85 0.8
86 0.79
87 0.74
88 0.74
89 0.68
90 0.63
91 0.56
92 0.45
93 0.39
94 0.33
95 0.3
96 0.24
97 0.21
98 0.19
99 0.2
100 0.21
101 0.17
102 0.14
103 0.13
104 0.1
105 0.09
106 0.08
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.21
136 0.28
137 0.31
138 0.35
139 0.4
140 0.42
141 0.48
142 0.49
143 0.44
144 0.42
145 0.36
146 0.33
147 0.28
148 0.23
149 0.17
150 0.16
151 0.13
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.12
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.16
163 0.14
164 0.13
165 0.15
166 0.14
167 0.16
168 0.21
169 0.2
170 0.23
171 0.28
172 0.3
173 0.33
174 0.38
175 0.37
176 0.38
177 0.43
178 0.47
179 0.49
180 0.48
181 0.44
182 0.38
183 0.37
184 0.33
185 0.28
186 0.21
187 0.14
188 0.14
189 0.12
190 0.11
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.15
199 0.16
200 0.18
201 0.19
202 0.2
203 0.21
204 0.23
205 0.26
206 0.29
207 0.29
208 0.29
209 0.29
210 0.3
211 0.28
212 0.25
213 0.24
214 0.2
215 0.24
216 0.23
217 0.25
218 0.27
219 0.3
220 0.3
221 0.28
222 0.29
223 0.29
224 0.31
225 0.37
226 0.34
227 0.38
228 0.4
229 0.48
230 0.49
231 0.46
232 0.46
233 0.38
234 0.39
235 0.32
236 0.3
237 0.22
238 0.16
239 0.13
240 0.1
241 0.08
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.08
247 0.1
248 0.11
249 0.14
250 0.18
251 0.2
252 0.24
253 0.26
254 0.24
255 0.23
256 0.25
257 0.24
258 0.23
259 0.22
260 0.18
261 0.16
262 0.15
263 0.15
264 0.12
265 0.11
266 0.08
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.08
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.13
282 0.14
283 0.18
284 0.22
285 0.22
286 0.25
287 0.3
288 0.34
289 0.4
290 0.45
291 0.44
292 0.46
293 0.48
294 0.44
295 0.39
296 0.36
297 0.27
298 0.22
299 0.23
300 0.22
301 0.19
302 0.22
303 0.22
304 0.22
305 0.22
306 0.25
307 0.32
308 0.35
309 0.45
310 0.49
311 0.53
312 0.53
313 0.52
314 0.57
315 0.55
316 0.5
317 0.51
318 0.5
319 0.48
320 0.51
321 0.53
322 0.45
323 0.4
324 0.41