Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A2N3N7F7

Protein Details
Accession A0A2N3N7F7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
460-482KKEEVKSPAKKQVVRPVKKKRKFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
414-424AKPSPARPRGV
458-482GGKKEEVKSPAKKQVVRPVKKKRKF
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 11.333, nucl 4.5, cyto_nucl 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSLTATWRPLPVKQSRNLPTLLASTRFSTTSYALHITDLAHVWSESLDRRAIILRALKEDTSIDPSDGEENMNSFLKCLRAAFDPDDSMHNLARVAVSHAAADPGGKDGLTVTVTCELPRELSNKPLTWRMYLKMQPASTTTAELVFPLVEAHRAQQEQIKSLVEVIKQKDSVINKVLDKLEAMGTSLEHVFTVLSTKRKATREQAEARIKGLATFDFQTWNSTVADGTRQNADGETPELLRRVFDEGGLEYTQNMDSKEYAEGLGRWWSRLSDTGGLPPDDASEPESTIGKGSAPASQKFDSQRSKSPAPSSPKCPPPASRASKPKSSDFDDALTASETESEDDSPPKKFTTLHPPTRCHRPSPPASLSPPPAASTRAGNNRAAREAARPASASGSATRSPTPEEGDKDEARAKPSPARPRGVGIGRIGGIGVIGGKGRARQPSEEDEDDGFEGGGGGKKEEVKSPAKKQVVRPVKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.63
3 0.64
4 0.61
5 0.54
6 0.47
7 0.45
8 0.42
9 0.35
10 0.31
11 0.29
12 0.3
13 0.29
14 0.27
15 0.24
16 0.21
17 0.2
18 0.22
19 0.23
20 0.21
21 0.21
22 0.21
23 0.19
24 0.19
25 0.18
26 0.15
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.13
32 0.14
33 0.16
34 0.16
35 0.15
36 0.17
37 0.2
38 0.2
39 0.23
40 0.26
41 0.26
42 0.3
43 0.32
44 0.31
45 0.29
46 0.3
47 0.27
48 0.26
49 0.25
50 0.2
51 0.18
52 0.19
53 0.2
54 0.19
55 0.17
56 0.12
57 0.12
58 0.14
59 0.16
60 0.15
61 0.14
62 0.15
63 0.15
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.16
68 0.21
69 0.23
70 0.25
71 0.25
72 0.25
73 0.27
74 0.27
75 0.25
76 0.21
77 0.19
78 0.16
79 0.14
80 0.14
81 0.11
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.11
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.08
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.14
104 0.13
105 0.14
106 0.16
107 0.18
108 0.15
109 0.22
110 0.27
111 0.28
112 0.31
113 0.36
114 0.35
115 0.37
116 0.39
117 0.34
118 0.37
119 0.39
120 0.42
121 0.41
122 0.39
123 0.36
124 0.35
125 0.36
126 0.29
127 0.26
128 0.21
129 0.16
130 0.16
131 0.14
132 0.13
133 0.08
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.17
144 0.19
145 0.19
146 0.21
147 0.2
148 0.16
149 0.18
150 0.2
151 0.18
152 0.22
153 0.22
154 0.24
155 0.24
156 0.24
157 0.26
158 0.26
159 0.27
160 0.26
161 0.27
162 0.24
163 0.28
164 0.28
165 0.24
166 0.22
167 0.19
168 0.16
169 0.12
170 0.12
171 0.08
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.05
177 0.06
178 0.05
179 0.04
180 0.08
181 0.1
182 0.13
183 0.14
184 0.17
185 0.23
186 0.26
187 0.31
188 0.36
189 0.41
190 0.47
191 0.52
192 0.59
193 0.6
194 0.57
195 0.54
196 0.47
197 0.39
198 0.31
199 0.25
200 0.16
201 0.1
202 0.11
203 0.1
204 0.11
205 0.12
206 0.13
207 0.12
208 0.13
209 0.12
210 0.1
211 0.1
212 0.08
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.11
236 0.12
237 0.11
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.14
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.16
259 0.17
260 0.15
261 0.15
262 0.19
263 0.2
264 0.2
265 0.19
266 0.17
267 0.15
268 0.12
269 0.12
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.12
282 0.15
283 0.17
284 0.21
285 0.22
286 0.26
287 0.27
288 0.34
289 0.37
290 0.38
291 0.44
292 0.46
293 0.49
294 0.49
295 0.51
296 0.51
297 0.52
298 0.53
299 0.52
300 0.53
301 0.57
302 0.57
303 0.56
304 0.52
305 0.5
306 0.56
307 0.56
308 0.58
309 0.61
310 0.61
311 0.65
312 0.65
313 0.65
314 0.6
315 0.57
316 0.53
317 0.44
318 0.41
319 0.35
320 0.31
321 0.26
322 0.21
323 0.15
324 0.11
325 0.1
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.14
332 0.15
333 0.17
334 0.18
335 0.18
336 0.18
337 0.19
338 0.23
339 0.3
340 0.39
341 0.47
342 0.53
343 0.58
344 0.61
345 0.7
346 0.68
347 0.62
348 0.6
349 0.59
350 0.59
351 0.63
352 0.64
353 0.59
354 0.6
355 0.6
356 0.56
357 0.5
358 0.43
359 0.36
360 0.31
361 0.28
362 0.25
363 0.23
364 0.27
365 0.32
366 0.34
367 0.38
368 0.42
369 0.42
370 0.43
371 0.41
372 0.35
373 0.31
374 0.34
375 0.31
376 0.28
377 0.26
378 0.24
379 0.25
380 0.24
381 0.21
382 0.17
383 0.19
384 0.19
385 0.21
386 0.21
387 0.2
388 0.23
389 0.24
390 0.26
391 0.27
392 0.3
393 0.33
394 0.38
395 0.38
396 0.38
397 0.42
398 0.39
399 0.38
400 0.38
401 0.36
402 0.38
403 0.46
404 0.53
405 0.54
406 0.58
407 0.55
408 0.55
409 0.6
410 0.57
411 0.52
412 0.44
413 0.4
414 0.35
415 0.33
416 0.28
417 0.2
418 0.14
419 0.1
420 0.08
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.07
425 0.1
426 0.15
427 0.22
428 0.25
429 0.29
430 0.34
431 0.42
432 0.48
433 0.48
434 0.47
435 0.41
436 0.39
437 0.36
438 0.3
439 0.22
440 0.14
441 0.12
442 0.1
443 0.12
444 0.11
445 0.11
446 0.13
447 0.17
448 0.19
449 0.24
450 0.29
451 0.35
452 0.44
453 0.52
454 0.6
455 0.64
456 0.69
457 0.72
458 0.77
459 0.79
460 0.8
461 0.82
462 0.84