FuNGI

A0A2N3N0B3

Protein Details

Accession

A0A2N3N0B3

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
27-59	RPFNRPAKRRPADPLVRRKRNPTARPLGPPRPT	Basic
198-224	APSVKDMNSKKQKKPKEEKISFNRMPR	Hydrophilic
413-435	RELERRKATKKLKKTLIKRENVN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
30-57	NRPAKRRPADPLVRRKRNPTARPLGPPR
207-215	KKQKKPKEE
416-427	ERRKATKKLKKT
497-513	KRQADITKKSKGLKRPG

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSPPTSGPPNGQQKDGPQPHNLNANARPFNRPAKRRPADPLVRRKRNPTARPLGPPRPTEGPPLGLNPLGEAKSMATLESLRKQYGGWSEPPPKDYRDFPIVTTAKALREGIRHHVMRLSRSRANDDDKPVDPTDQNVFTRPVTLHRRDPRQPPAGRVASTKEATPEPKAVDDKEIERLQQIKAEREAQRAIDQAKIAPSVKDMNSKKQKKPKEEKISFNRMPRTEQGRKEADLRYEEALPWHLEDVDGRNVWVGNYVAALSETNVAFVIDGARFRMVPLEKWYKFTAKPAFERIPEDKVEDFMKKTAQPGRWMMQALEKREEERKMKDEFRNHGKRLSARAAPSANEVRGYDEVDMEGDEFDDDDENPGFENDDEDMKISNARIRQNQLGANLFGDGDENEVDAQEENELRRELERRKATKKLKKTLIKRENVNDIESDDSASSADPFADSSSEEEEEEEEDESQVKPEDEDKSKSEKEKAASSAGSKGSTTPSGKRQADITKKSKGLKRPGSPHLSESSGNESTLRKKAKTKPDSITGHSRSTTPLPHGQSVTTQVGQRRKMVGGSASDGEATAGEMSDTQPRKKKIKLVGTSARGTPTGSRAASPLPTQTAGSPSVSPTKESQGARSGSPKPAIEAWEIVQALPQLPDGITIANFLKLFEGRVGDNVDGGRMAKSEWIRLVRENCHYGPDKLLRRKS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.6
3	0.55
4	0.53
5	0.56
6	0.57
7	0.63
8	0.59
9	0.54
10	0.52
11	0.57
12	0.56
13	0.53
14	0.54
15	0.51
16	0.59
17	0.63
18	0.65
19	0.65
20	0.69
21	0.73
22	0.73
23	0.76
24	0.77
25	0.77
26	0.79
27	0.81
28	0.81
29	0.85
30	0.84
31	0.84
32	0.84
33	0.84
34	0.82
35	0.81
36	0.8
37	0.77
38	0.82
39	0.83
40	0.82
41	0.78
42	0.72
43	0.68
44	0.64
45	0.58
46	0.55
47	0.49
48	0.43
49	0.38
50	0.39
51	0.36
52	0.31
53	0.29
54	0.23
55	0.24
56	0.2
57	0.18
58	0.16
59	0.14
60	0.15
61	0.16
62	0.14
63	0.11
64	0.13
65	0.18
66	0.24
67	0.27
68	0.24
69	0.25
70	0.25
71	0.29
72	0.34
73	0.33
74	0.31
75	0.36
76	0.45
77	0.47
78	0.51
79	0.49
80	0.46
81	0.45
82	0.44
83	0.43
84	0.42
85	0.4
86	0.37
87	0.44
88	0.41
89	0.38
90	0.39
91	0.34
92	0.27
93	0.29
94	0.29
95	0.22
96	0.26
97	0.28
98	0.31
99	0.38
100	0.37
101	0.36
102	0.39
103	0.39
104	0.42
105	0.47
106	0.46
107	0.42
108	0.45
109	0.49
110	0.5
111	0.54
112	0.53
113	0.52
114	0.5
115	0.47
116	0.49
117	0.44
118	0.42
119	0.35
120	0.32
121	0.3
122	0.3
123	0.3
124	0.27
125	0.29
126	0.25
127	0.28
128	0.26
129	0.29
130	0.32
131	0.37
132	0.44
133	0.5
134	0.59
135	0.63
136	0.71
137	0.72
138	0.73
139	0.7
140	0.66
141	0.67
142	0.62
143	0.56
144	0.5
145	0.46
146	0.42
147	0.4
148	0.35
149	0.29
150	0.28
151	0.29
152	0.3
153	0.28
154	0.24
155	0.27
156	0.29
157	0.28
158	0.28
159	0.28
160	0.27
161	0.31
162	0.3
163	0.26
164	0.27
165	0.28
166	0.24
167	0.26
168	0.27
169	0.24
170	0.26
171	0.34
172	0.34
173	0.36
174	0.37
175	0.35
176	0.35
177	0.34
178	0.32
179	0.26
180	0.23
181	0.21
182	0.2
183	0.21
184	0.2
185	0.16
186	0.17
187	0.19
188	0.2
189	0.28
190	0.29
191	0.37
192	0.47
193	0.56
194	0.62
195	0.67
196	0.74
197	0.76
198	0.84
199	0.85
200	0.85
201	0.85
202	0.86
203	0.86
204	0.88
205	0.82
206	0.78
207	0.74
208	0.64
209	0.6
210	0.56
211	0.56
212	0.54
213	0.53
214	0.54
215	0.5
216	0.5
217	0.51
218	0.48
219	0.42
220	0.37
221	0.34
222	0.29
223	0.26
224	0.25
225	0.21
226	0.19
227	0.16
228	0.13
229	0.12
230	0.1
231	0.09
232	0.09
233	0.12
234	0.13
235	0.13
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.13
241	0.1
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.05
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.06
255	0.06
256	0.07
257	0.05
258	0.06
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.12
264	0.12
265	0.13
266	0.2
267	0.29
268	0.29
269	0.33
270	0.35
271	0.34
272	0.34
273	0.39
274	0.4
275	0.35
276	0.37
277	0.41
278	0.42
279	0.39
280	0.44
281	0.39
282	0.35
283	0.31
284	0.3
285	0.24
286	0.22
287	0.23
288	0.19
289	0.18
290	0.15
291	0.17
292	0.15
293	0.19
294	0.24
295	0.24
296	0.27
297	0.3
298	0.31
299	0.31
300	0.31
301	0.27
302	0.28
303	0.29
304	0.28
305	0.28
306	0.26
307	0.25
308	0.29
309	0.33
310	0.3
311	0.31
312	0.32
313	0.33
314	0.4
315	0.44
316	0.46
317	0.48
318	0.55
319	0.59
320	0.55
321	0.54
322	0.5
323	0.47
324	0.46
325	0.44
326	0.37
327	0.3
328	0.32
329	0.3
330	0.27
331	0.28
332	0.25
333	0.2
334	0.17
335	0.16
336	0.15
337	0.14
338	0.15
339	0.11
340	0.09
341	0.09
342	0.08
343	0.08
344	0.06
345	0.05
346	0.04
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.04
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.05
361	0.06
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.08
367	0.07
368	0.09
369	0.12
370	0.16
371	0.2
372	0.23
373	0.25
374	0.28
375	0.29
376	0.29
377	0.27
378	0.23
379	0.2
380	0.17
381	0.14
382	0.1
383	0.09
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.06
395	0.06
396	0.08
397	0.09
398	0.09
399	0.11
400	0.16
401	0.19
402	0.27
403	0.36
404	0.4
405	0.46
406	0.55
407	0.64
408	0.68
409	0.74
410	0.75
411	0.76
412	0.79
413	0.82
414	0.84
415	0.83
416	0.8
417	0.76
418	0.71
419	0.7
420	0.63
421	0.54
422	0.43
423	0.35
424	0.3
425	0.24
426	0.2
427	0.11
428	0.09
429	0.08
430	0.08
431	0.07
432	0.05
433	0.05
434	0.04
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.06
439	0.07
440	0.09
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.09
445	0.1
446	0.1
447	0.09
448	0.07
449	0.07
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.08
456	0.11
457	0.17
458	0.2
459	0.24
460	0.26
461	0.32
462	0.36
463	0.39
464	0.41
465	0.4
466	0.39
467	0.4
468	0.4
469	0.36
470	0.34
471	0.31
472	0.31
473	0.28
474	0.26
475	0.21
476	0.19
477	0.18
478	0.22
479	0.23
480	0.22
481	0.28
482	0.37
483	0.38
484	0.37
485	0.4
486	0.45
487	0.52
488	0.57
489	0.55
490	0.53
491	0.57
492	0.63
493	0.64
494	0.63
495	0.64
496	0.65
497	0.68
498	0.69
499	0.72
500	0.73
501	0.69
502	0.63
503	0.56
504	0.49
505	0.41
506	0.35
507	0.33
508	0.27
509	0.25
510	0.23
511	0.22
512	0.24
513	0.31
514	0.33
515	0.3
516	0.38
517	0.47
518	0.56
519	0.63
520	0.66
521	0.65
522	0.7
523	0.72
524	0.69
525	0.7
526	0.63
527	0.58
528	0.5
529	0.45
530	0.38
531	0.36
532	0.34
533	0.29
534	0.32
535	0.32
536	0.35
537	0.35
538	0.33
539	0.32
540	0.34
541	0.33
542	0.28
543	0.27
544	0.29
545	0.35
546	0.37
547	0.39
548	0.37
549	0.34
550	0.33
551	0.33
552	0.3
553	0.26
554	0.27
555	0.24
556	0.21
557	0.19
558	0.18
559	0.15
560	0.12
561	0.09
562	0.06
563	0.05
564	0.04
565	0.05
566	0.06
567	0.14
568	0.18
569	0.24
570	0.31
571	0.38
572	0.45
573	0.5
574	0.58
575	0.59
576	0.67
577	0.68
578	0.7
579	0.73
580	0.73
581	0.7
582	0.64
583	0.56
584	0.45
585	0.39
586	0.31
587	0.26
588	0.26
589	0.23
590	0.22
591	0.22
592	0.24
593	0.26
594	0.25
595	0.25
596	0.22
597	0.22
598	0.22
599	0.22
600	0.23
601	0.22
602	0.22
603	0.2
604	0.19
605	0.26
606	0.25
607	0.27
608	0.26
609	0.3
610	0.35
611	0.36
612	0.38
613	0.38
614	0.39
615	0.4
616	0.44
617	0.42
618	0.41
619	0.45
620	0.41
621	0.36
622	0.38
623	0.38
624	0.34
625	0.31
626	0.27
627	0.28
628	0.28
629	0.24
630	0.23
631	0.2
632	0.19
633	0.17
634	0.16
635	0.1
636	0.1
637	0.11
638	0.1
639	0.11
640	0.09
641	0.11
642	0.12
643	0.14
644	0.14
645	0.13
646	0.16
647	0.15
648	0.16
649	0.16
650	0.18
651	0.15
652	0.19
653	0.22
654	0.19
655	0.21
656	0.19
657	0.17
658	0.16
659	0.16
660	0.14
661	0.11
662	0.11
663	0.15
664	0.17
665	0.21
666	0.27
667	0.31
668	0.34
669	0.41
670	0.47
671	0.47
672	0.53
673	0.55
674	0.49
675	0.51
676	0.52
677	0.47
678	0.49
679	0.52
680	0.55

A0A2N3N0B3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer