FuNGI

C4R3V5

Protein Details

Accession

C4R3V5

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
82-106	LLKVDIAKRRERKEKKASGEIAREK	Basic
590-612	QVVRRRKEKAINFRKESLKRKAD	Basic
634-653	AEDVRQIIADKRRRKKRQKH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
74-120	KAKKFNKVLLKVDIAKRRERKEKKASGEIAREKPKYDKESIEKRRPR
593-653	RRRKEKAINFRKESLKRKADEMKKTEDELKAEAKKAEEDKKAEDVRQIIADKRRRKKRQKH

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0042802 F:identical protein binding GO:0070180 F:large ribosomal subunit rRNA binding GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	ppa:PAS_chr3_0212 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MSDSNKEGKVDKNTLFVRGIPTNASKEQLSDFFSQFAPVKHAIIVTDKAEDSKGFGFVSFTSEDDSVLALAGAKAKKFNKVLLKVDIAKRRERKEKKASGEIAREKPKYDKESIEKRRPRLIVRNLPWSARSSQDLKEVFEKFGNVVDVIIPRKAGGRMSGFAFVTMRKQSGAEAAVAGSKDLKIDGREVQVELALEKEKFLEKKKVETKEESDDEDDDDDDDEDEVDEDGEIEDDEDEDEEDEDHKPNRQTPYCIFIRNLPYDASEETLQEHFEKFGPIRYALPVVDHNTGQAKGTGFVAFKNSQDYEDCLLNAPKPTSNSVLLPDEVSPLYVYQGRVLSIAPAVDRDSAGRLMERNEKKRQEALGKGEKDKRNIYLLHEGRISENSVLASLLTPADLKAREESYKLRVQQLNKNPTLHLSLTRLAIRNLPRAMTEKSLKALGRKAIVEFATELRQGKRNPFSKEELVRSSKHRFEMEGGNFQELLDEATTGHASVTLQKKNKKKGVVLQSKIITEVKGTGEQGRSRGYGFLEYRDHKHALMGLRWLNAHLVTPEEIFEGLNEDEKKSINMEGFSKRRLIVEFAIENAQVVRRRKEKAINFRKESLKRKADEMKKTEDELKAEAKKAEEDKKAEDVRQIIADKRRRKKRQKH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.47
3	0.42
4	0.4
5	0.35
6	0.34
7	0.3
8	0.33
9	0.34
10	0.35
11	0.36
12	0.29
13	0.29
14	0.31
15	0.3
16	0.3
17	0.29
18	0.28
19	0.27
20	0.27
21	0.29
22	0.27
23	0.25
24	0.26
25	0.23
26	0.23
27	0.22
28	0.23
29	0.21
30	0.23
31	0.24
32	0.2
33	0.22
34	0.21
35	0.21
36	0.22
37	0.2
38	0.19
39	0.17
40	0.18
41	0.15
42	0.15
43	0.15
44	0.14
45	0.18
46	0.15
47	0.14
48	0.15
49	0.15
50	0.15
51	0.14
52	0.14
53	0.1
54	0.09
55	0.08
56	0.06
57	0.06
58	0.12
59	0.13
60	0.14
61	0.21
62	0.22
63	0.3
64	0.32
65	0.39
66	0.44
67	0.5
68	0.55
69	0.54
70	0.59
71	0.59
72	0.64
73	0.65
74	0.59
75	0.61
76	0.64
77	0.66
78	0.71
79	0.72
80	0.75
81	0.78
82	0.84
83	0.82
84	0.84
85	0.83
86	0.8
87	0.81
88	0.79
89	0.77
90	0.76
91	0.69
92	0.61
93	0.61
94	0.61
95	0.57
96	0.54
97	0.53
98	0.54
99	0.64
100	0.72
101	0.76
102	0.75
103	0.74
104	0.77
105	0.74
106	0.72
107	0.72
108	0.72
109	0.72
110	0.69
111	0.74
112	0.68
113	0.64
114	0.58
115	0.51
116	0.43
117	0.35
118	0.33
119	0.27
120	0.27
121	0.34
122	0.33
123	0.32
124	0.37
125	0.35
126	0.33
127	0.31
128	0.29
129	0.21
130	0.22
131	0.21
132	0.14
133	0.12
134	0.12
135	0.14
136	0.15
137	0.15
138	0.13
139	0.12
140	0.14
141	0.15
142	0.14
143	0.16
144	0.17
145	0.19
146	0.21
147	0.24
148	0.21
149	0.21
150	0.21
151	0.17
152	0.18
153	0.18
154	0.17
155	0.14
156	0.14
157	0.14
158	0.17
159	0.17
160	0.13
161	0.12
162	0.11
163	0.12
164	0.12
165	0.11
166	0.08
167	0.07
168	0.07
169	0.08
170	0.09
171	0.08
172	0.11
173	0.15
174	0.17
175	0.18
176	0.18
177	0.18
178	0.17
179	0.16
180	0.13
181	0.11
182	0.1
183	0.09
184	0.09
185	0.1
186	0.13
187	0.16
188	0.21
189	0.29
190	0.29
191	0.39
192	0.47
193	0.54
194	0.55
195	0.58
196	0.58
197	0.57
198	0.57
199	0.5
200	0.44
201	0.37
202	0.32
203	0.27
204	0.22
205	0.14
206	0.12
207	0.09
208	0.08
209	0.07
210	0.06
211	0.05
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.05
229	0.06
230	0.07
231	0.09
232	0.09
233	0.13
234	0.15
235	0.19
236	0.27
237	0.29
238	0.32
239	0.32
240	0.38
241	0.37
242	0.38
243	0.34
244	0.32
245	0.35
246	0.32
247	0.32
248	0.25
249	0.23
250	0.22
251	0.22
252	0.19
253	0.13
254	0.12
255	0.12
256	0.12
257	0.12
258	0.11
259	0.11
260	0.1
261	0.1
262	0.11
263	0.09
264	0.13
265	0.14
266	0.14
267	0.15
268	0.15
269	0.16
270	0.14
271	0.16
272	0.14
273	0.15
274	0.16
275	0.15
276	0.14
277	0.15
278	0.15
279	0.14
280	0.13
281	0.1
282	0.09
283	0.1
284	0.11
285	0.1
286	0.1
287	0.14
288	0.13
289	0.13
290	0.16
291	0.15
292	0.15
293	0.15
294	0.17
295	0.15
296	0.15
297	0.14
298	0.13
299	0.13
300	0.13
301	0.14
302	0.12
303	0.11
304	0.12
305	0.14
306	0.15
307	0.16
308	0.15
309	0.16
310	0.17
311	0.16
312	0.15
313	0.13
314	0.12
315	0.1
316	0.1
317	0.07
318	0.06
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.09
323	0.09
324	0.09
325	0.1
326	0.1
327	0.09
328	0.07
329	0.07
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.08
341	0.11
342	0.2
343	0.26
344	0.31
345	0.39
346	0.42
347	0.44
348	0.47
349	0.49
350	0.46
351	0.45
352	0.46
353	0.47
354	0.47
355	0.5
356	0.54
357	0.53
358	0.51
359	0.47
360	0.42
361	0.37
362	0.35
363	0.34
364	0.36
365	0.34
366	0.32
367	0.31
368	0.29
369	0.26
370	0.26
371	0.23
372	0.12
373	0.12
374	0.09
375	0.09
376	0.08
377	0.07
378	0.06
379	0.05
380	0.05
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.07
385	0.08
386	0.09
387	0.1
388	0.13
389	0.14
390	0.16
391	0.19
392	0.21
393	0.27
394	0.28
395	0.33
396	0.35
397	0.38
398	0.46
399	0.53
400	0.56
401	0.54
402	0.53
403	0.46
404	0.44
405	0.43
406	0.35
407	0.28
408	0.22
409	0.21
410	0.22
411	0.25
412	0.24
413	0.21
414	0.25
415	0.26
416	0.28
417	0.27
418	0.25
419	0.24
420	0.27
421	0.28
422	0.28
423	0.28
424	0.24
425	0.24
426	0.28
427	0.28
428	0.27
429	0.29
430	0.27
431	0.27
432	0.27
433	0.26
434	0.25
435	0.24
436	0.22
437	0.19
438	0.17
439	0.17
440	0.17
441	0.19
442	0.17
443	0.23
444	0.24
445	0.3
446	0.37
447	0.41
448	0.45
449	0.48
450	0.52
451	0.54
452	0.58
453	0.56
454	0.54
455	0.51
456	0.49
457	0.5
458	0.51
459	0.47
460	0.45
461	0.41
462	0.36
463	0.35
464	0.42
465	0.4
466	0.41
467	0.38
468	0.35
469	0.34
470	0.32
471	0.28
472	0.19
473	0.16
474	0.08
475	0.07
476	0.06
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.06
482	0.06
483	0.13
484	0.2
485	0.26
486	0.33
487	0.4
488	0.49
489	0.58
490	0.65
491	0.65
492	0.64
493	0.67
494	0.72
495	0.75
496	0.7
497	0.67
498	0.64
499	0.57
500	0.53
501	0.44
502	0.33
503	0.23
504	0.22
505	0.18
506	0.17
507	0.18
508	0.2
509	0.24
510	0.26
511	0.27
512	0.27
513	0.26
514	0.24
515	0.25
516	0.22
517	0.24
518	0.24
519	0.26
520	0.31
521	0.33
522	0.36
523	0.4
524	0.4
525	0.32
526	0.33
527	0.32
528	0.3
529	0.29
530	0.31
531	0.29
532	0.29
533	0.29
534	0.28
535	0.25
536	0.21
537	0.19
538	0.13
539	0.13
540	0.12
541	0.13
542	0.13
543	0.12
544	0.12
545	0.1
546	0.1
547	0.11
548	0.1
549	0.15
550	0.16
551	0.16
552	0.17
553	0.18
554	0.19
555	0.17
556	0.19
557	0.16
558	0.18
559	0.22
560	0.3
561	0.34
562	0.35
563	0.37
564	0.35
565	0.35
566	0.34
567	0.34
568	0.28
569	0.31
570	0.29
571	0.29
572	0.3
573	0.27
574	0.25
575	0.21
576	0.23
577	0.22
578	0.26
579	0.32
580	0.36
581	0.42
582	0.49
583	0.58
584	0.63
585	0.68
586	0.74
587	0.77
588	0.77
589	0.8
590	0.83
591	0.82
592	0.81
593	0.8
594	0.78
595	0.7
596	0.72
597	0.74
598	0.74
599	0.75
600	0.71
601	0.7
602	0.65
603	0.67
604	0.66
605	0.59
606	0.53
607	0.47
608	0.5
609	0.45
610	0.45
611	0.43
612	0.38
613	0.4
614	0.45
615	0.49
616	0.48
617	0.48
618	0.49
619	0.56
620	0.59
621	0.54
622	0.52
623	0.46
624	0.42
625	0.43
626	0.42
627	0.4
628	0.45
629	0.52
630	0.56
631	0.65
632	0.73
633	0.78

C4R3V5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer