Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A2N3NEE2

Protein Details
Accession A0A2N3NEE2    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MSEPYSRRSRRPDSHQMWDESHydrophilic
34-54RDSGRDRDRNRDRDRDRDRARBasic
63-108GRDDRDRGGRDRKRYRSRSRDRHDRGGRRGDRARSRDRDRERPRDDBasic
111-133GGRRDPRDRERERDRHRRREDEGBasic
328-347GAVRKEKTTQYRQYMNRTKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-129RNRDRDRDRDRARDYHGRDHDGRDDRDRGGRDRKRYRSRSRDRHDRGGRRGDRARSRDRDRERPRDDKHGGRRDPRDRERERDRHRRR
180-197KARRRSASPRRSASPQRP
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSEPYSRRSRRPDSHQMWDESDRQPRHDDRGQGRDSGRDRDRNRDRDRDRDRARDYHGRDHDGRDDRDRGGRDRKRYRSRSRDRHDRGGRRGDRARSRDRDRERPRDDKHGGRRDPRDRERERDRHRRREDEGEDDDAGLELRRRDRDGDRGTTGASSYARRALVVETIISDVQPDNAEKARRRSASPRRSASPQRPRNDSRRENNDEDEDGGGGGGGDDGSDRQDFYRESLPTRSKNERSKHAMSFRVGGRDTASPGPGSERTDSRGRGRGRSHERDGGAMDVEDGEEDEDPDVVVEDDGLADMQAMMGFGGFGTTKDKKVAGNNVGAVRKEKTTQYRQYMNRTKGFNRPLSPPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.82
3 0.77
4 0.72
5 0.67
6 0.63
7 0.57
8 0.59
9 0.51
10 0.47
11 0.5
12 0.48
13 0.52
14 0.52
15 0.56
16 0.55
17 0.62
18 0.61
19 0.6
20 0.57
21 0.57
22 0.55
23 0.55
24 0.54
25 0.54
26 0.55
27 0.6
28 0.69
29 0.71
30 0.75
31 0.77
32 0.75
33 0.76
34 0.81
35 0.81
36 0.79
37 0.78
38 0.77
39 0.72
40 0.74
41 0.73
42 0.7
43 0.7
44 0.68
45 0.65
46 0.61
47 0.59
48 0.6
49 0.58
50 0.56
51 0.52
52 0.49
53 0.45
54 0.48
55 0.48
56 0.46
57 0.49
58 0.52
59 0.57
60 0.64
61 0.72
62 0.77
63 0.83
64 0.87
65 0.88
66 0.92
67 0.92
68 0.92
69 0.93
70 0.89
71 0.9
72 0.89
73 0.87
74 0.85
75 0.84
76 0.79
77 0.76
78 0.75
79 0.73
80 0.72
81 0.7
82 0.72
83 0.7
84 0.73
85 0.75
86 0.76
87 0.78
88 0.78
89 0.81
90 0.79
91 0.8
92 0.76
93 0.77
94 0.75
95 0.73
96 0.74
97 0.73
98 0.72
99 0.71
100 0.76
101 0.75
102 0.79
103 0.78
104 0.78
105 0.73
106 0.75
107 0.77
108 0.78
109 0.79
110 0.8
111 0.82
112 0.82
113 0.85
114 0.83
115 0.78
116 0.77
117 0.71
118 0.67
119 0.6
120 0.53
121 0.45
122 0.38
123 0.32
124 0.22
125 0.18
126 0.11
127 0.09
128 0.08
129 0.11
130 0.13
131 0.14
132 0.18
133 0.21
134 0.3
135 0.34
136 0.36
137 0.35
138 0.33
139 0.33
140 0.29
141 0.26
142 0.18
143 0.14
144 0.11
145 0.1
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.1
165 0.14
166 0.16
167 0.21
168 0.27
169 0.28
170 0.31
171 0.4
172 0.48
173 0.54
174 0.6
175 0.59
176 0.56
177 0.61
178 0.66
179 0.66
180 0.67
181 0.65
182 0.62
183 0.65
184 0.67
185 0.7
186 0.72
187 0.7
188 0.68
189 0.69
190 0.71
191 0.67
192 0.64
193 0.57
194 0.48
195 0.4
196 0.32
197 0.22
198 0.14
199 0.11
200 0.08
201 0.05
202 0.04
203 0.03
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.03
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.08
213 0.08
214 0.11
215 0.18
216 0.17
217 0.2
218 0.27
219 0.33
220 0.35
221 0.42
222 0.47
223 0.49
224 0.57
225 0.6
226 0.62
227 0.64
228 0.65
229 0.66
230 0.64
231 0.61
232 0.54
233 0.54
234 0.47
235 0.45
236 0.39
237 0.32
238 0.28
239 0.24
240 0.25
241 0.21
242 0.2
243 0.15
244 0.15
245 0.18
246 0.18
247 0.19
248 0.19
249 0.19
250 0.22
251 0.28
252 0.31
253 0.32
254 0.38
255 0.38
256 0.43
257 0.46
258 0.52
259 0.57
260 0.62
261 0.63
262 0.61
263 0.59
264 0.54
265 0.5
266 0.41
267 0.32
268 0.23
269 0.17
270 0.11
271 0.1
272 0.08
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.03
291 0.03
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.12
303 0.14
304 0.16
305 0.19
306 0.21
307 0.24
308 0.31
309 0.4
310 0.39
311 0.42
312 0.46
313 0.5
314 0.52
315 0.49
316 0.45
317 0.38
318 0.36
319 0.34
320 0.37
321 0.4
322 0.46
323 0.55
324 0.6
325 0.67
326 0.71
327 0.79
328 0.81
329 0.8
330 0.76
331 0.73
332 0.69
333 0.7
334 0.72
335 0.69
336 0.63