Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N1JHC6

Protein Details
Accession A0A2N1JHC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-279DEEETQRRRRNAQRRARSRTNADRQGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-291RRRRNAQRRARSRTNADRQGRGRGKGRGRGGSA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Amino Acid Sequences MGEKDLPSVPHMAPPDPHMGQAMHGTAWAFQRYSPADTLYDGVHLPPAPVPYDEFTIPQDAIPSLDDLLASSALPNTEAFNLNLGTPSHDAGREGLDLVSPSVRRDEPGNVHHRTLFNENEYTFLDQFLQSLESDLAPTSMDQPDKQEHTQLLPPFQPIPPAKEPEIKHDISDDDEESNLAGATVKRRRHIVSEQRRRNQVRESFTRLSSLLEQSRAFGARALGLNAGAGTSVEDEDLDDRTDTEEVLSLYCDEEETQRRRRNAQRRARSRTNADRQGRGRGKGRGRGGSAGGAGSKSAVLFQVIDLLYWLDVQNTTLRRDIAVLEQAAARP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.34
3 0.3
4 0.3
5 0.27
6 0.25
7 0.24
8 0.26
9 0.23
10 0.15
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.18
15 0.19
16 0.16
17 0.15
18 0.22
19 0.24
20 0.27
21 0.26
22 0.25
23 0.23
24 0.24
25 0.25
26 0.19
27 0.18
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.12
32 0.12
33 0.13
34 0.14
35 0.14
36 0.15
37 0.17
38 0.16
39 0.2
40 0.19
41 0.19
42 0.19
43 0.2
44 0.19
45 0.17
46 0.16
47 0.13
48 0.13
49 0.12
50 0.12
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.09
56 0.08
57 0.07
58 0.06
59 0.07
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.1
65 0.12
66 0.11
67 0.13
68 0.13
69 0.12
70 0.14
71 0.13
72 0.14
73 0.13
74 0.14
75 0.13
76 0.13
77 0.14
78 0.12
79 0.14
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.12
90 0.13
91 0.13
92 0.15
93 0.2
94 0.23
95 0.31
96 0.38
97 0.37
98 0.38
99 0.4
100 0.38
101 0.36
102 0.35
103 0.3
104 0.25
105 0.25
106 0.24
107 0.23
108 0.23
109 0.23
110 0.18
111 0.16
112 0.14
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.13
131 0.16
132 0.2
133 0.21
134 0.21
135 0.19
136 0.21
137 0.25
138 0.24
139 0.23
140 0.2
141 0.2
142 0.19
143 0.18
144 0.22
145 0.19
146 0.24
147 0.25
148 0.27
149 0.28
150 0.33
151 0.34
152 0.34
153 0.39
154 0.32
155 0.29
156 0.27
157 0.26
158 0.21
159 0.21
160 0.15
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.06
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.11
171 0.18
172 0.2
173 0.22
174 0.25
175 0.27
176 0.31
177 0.4
178 0.45
179 0.5
180 0.59
181 0.67
182 0.7
183 0.78
184 0.75
185 0.69
186 0.67
187 0.62
188 0.59
189 0.55
190 0.58
191 0.52
192 0.5
193 0.48
194 0.39
195 0.34
196 0.29
197 0.27
198 0.21
199 0.2
200 0.2
201 0.19
202 0.2
203 0.19
204 0.17
205 0.13
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.07
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.12
242 0.19
243 0.25
244 0.34
245 0.41
246 0.44
247 0.52
248 0.62
249 0.68
250 0.71
251 0.76
252 0.77
253 0.81
254 0.88
255 0.89
256 0.87
257 0.85
258 0.86
259 0.85
260 0.84
261 0.79
262 0.78
263 0.71
264 0.74
265 0.71
266 0.66
267 0.62
268 0.61
269 0.63
270 0.63
271 0.67
272 0.62
273 0.6
274 0.57
275 0.52
276 0.45
277 0.38
278 0.31
279 0.24
280 0.18
281 0.14
282 0.12
283 0.1
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.15
302 0.18
303 0.2
304 0.23
305 0.23
306 0.22
307 0.24
308 0.24
309 0.24
310 0.27
311 0.25
312 0.23