Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N1JFJ1

Protein Details
Accession A0A2N1JFJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
957-986HIAIRSAPAHRHKRHARTHARQRRTFTFPTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
964-977PAHRHKRHARTHAR
Subcellular Location(s) plas 12, nucl 6, mito 4, E.R. 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027536  Mdm34  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
IPR031468  SMP_LBD  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0032865  C:ERMES complex  
GO:0008289  F:lipid binding  
GO:0006869  P:lipid transport  
GO:0007005  P:mitochondrion organization  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51847  SMP  
PS50086  TBC_RABGAP  
CDD cd21673  SMP_Mdm34  
Amino Acid Sequences MVRPTEYDAYILAIYKHFQGVGVAQDGIADGTEHTLHRAGPPVWDAPAAPRIPTLQQDCATDCARYASLDRYGFFAYPGTGVQKEPQLLPTAGFKHRRLLRRASYTLPTPEALLASRAQWEARAKKDEVKRCAKWAHMISMHDGTCTLHAAPKLVRGRVYKGIPDAWRSAAWRAMAKMPHADSAVQTAFETVSAYDTQIDLDIPRTARGHIRFHTRYGRGQCDMFAVLHAASVQNEVCGYCQGMGSVVAVLLLYMIPEEAFAMLQCLLDTFGFRRLYEPGFPGLREELFVLNTLLAQLAPRTTKQLAALGVAPSAYATRWYMTLFTNVLPFPTQLRVWDAVLLDGLDVITLVACALVQTLERYYSTCAPDALFELLNAPVYVESDDALLQWVHNALDAAPVRATIKGARHAWVSHESQGTSDALFLMATSLPLLSSVCQRMIARNLVSVQDIGDMPYRLARPFLQLCRPEQLRMLEQRSPHMLHETEELWRHACLRDFSELRKLEEAHDATLAPPSWRALYEQKEVETRSAREAAKARIKGRYAEHTAQKDAKKLVASTVVIKPRRGRSATLPRDRPMNALQSKGQAMLARARHGTAAQARRMMLAPAKKTMIAPRKRSGTHNAYTQIHNAAHSTPLDRLHVEVVLRHHVTLNMALNRGPKPKVIVGDIEPPELEILEIGDLSHERFRGIFRLMYAGDAHIELATCVQANPLAKRTPGAGMFEGPAASRGMLFAANPLTVPMHVRLSEVRLRAIVVLVVSRAKGITLVFKNDPLESVRVSSTFDSVDAIQRYLQEEIEEQLREVFRQDLPNIIHRLSQQWLHTDLGEARHAKPTVPRPTTPVRRTSWSAHTSDPVPLSLLPMDEPVAHKAATPTRLARLAAENSPRGLKDLFHPSPPATSSTNARTFHTTSQMQRSSLHTPQSTPPQISRVGLHTSMDMAELLRATQTLAQTHNPRHIAIRSAPAHRHKRHARTHARQRRTFTFPTQADSTEH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.16
4 0.14
5 0.13
6 0.14
7 0.14
8 0.17
9 0.18
10 0.16
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.13
15 0.11
16 0.07
17 0.05
18 0.07
19 0.09
20 0.09
21 0.11
22 0.13
23 0.13
24 0.15
25 0.22
26 0.2
27 0.23
28 0.26
29 0.26
30 0.26
31 0.26
32 0.24
33 0.22
34 0.29
35 0.26
36 0.23
37 0.23
38 0.24
39 0.26
40 0.33
41 0.34
42 0.33
43 0.35
44 0.37
45 0.38
46 0.39
47 0.38
48 0.31
49 0.26
50 0.23
51 0.21
52 0.2
53 0.2
54 0.2
55 0.26
56 0.28
57 0.28
58 0.28
59 0.29
60 0.28
61 0.26
62 0.22
63 0.16
64 0.14
65 0.16
66 0.16
67 0.15
68 0.17
69 0.19
70 0.23
71 0.24
72 0.24
73 0.25
74 0.26
75 0.25
76 0.26
77 0.29
78 0.3
79 0.35
80 0.41
81 0.4
82 0.45
83 0.52
84 0.59
85 0.59
86 0.63
87 0.65
88 0.67
89 0.7
90 0.66
91 0.64
92 0.61
93 0.59
94 0.52
95 0.43
96 0.35
97 0.31
98 0.27
99 0.22
100 0.18
101 0.15
102 0.13
103 0.16
104 0.15
105 0.15
106 0.18
107 0.26
108 0.31
109 0.37
110 0.42
111 0.41
112 0.49
113 0.58
114 0.63
115 0.64
116 0.67
117 0.64
118 0.65
119 0.68
120 0.63
121 0.63
122 0.58
123 0.57
124 0.52
125 0.5
126 0.47
127 0.47
128 0.44
129 0.35
130 0.31
131 0.23
132 0.19
133 0.19
134 0.15
135 0.13
136 0.13
137 0.16
138 0.17
139 0.25
140 0.29
141 0.3
142 0.35
143 0.35
144 0.4
145 0.45
146 0.47
147 0.42
148 0.4
149 0.44
150 0.42
151 0.43
152 0.4
153 0.34
154 0.33
155 0.31
156 0.3
157 0.27
158 0.26
159 0.25
160 0.25
161 0.28
162 0.28
163 0.28
164 0.31
165 0.29
166 0.3
167 0.28
168 0.26
169 0.21
170 0.25
171 0.23
172 0.18
173 0.16
174 0.14
175 0.13
176 0.12
177 0.12
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.07
188 0.09
189 0.12
190 0.12
191 0.14
192 0.15
193 0.16
194 0.23
195 0.27
196 0.32
197 0.34
198 0.43
199 0.43
200 0.48
201 0.56
202 0.52
203 0.55
204 0.56
205 0.57
206 0.5
207 0.48
208 0.43
209 0.36
210 0.34
211 0.26
212 0.19
213 0.15
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.08
257 0.07
258 0.14
259 0.15
260 0.15
261 0.17
262 0.19
263 0.21
264 0.23
265 0.24
266 0.22
267 0.22
268 0.22
269 0.23
270 0.22
271 0.19
272 0.17
273 0.16
274 0.12
275 0.11
276 0.12
277 0.1
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.13
289 0.14
290 0.16
291 0.17
292 0.2
293 0.18
294 0.18
295 0.2
296 0.15
297 0.15
298 0.13
299 0.11
300 0.08
301 0.08
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.1
309 0.1
310 0.13
311 0.13
312 0.12
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.14
320 0.14
321 0.12
322 0.16
323 0.17
324 0.16
325 0.18
326 0.16
327 0.13
328 0.13
329 0.12
330 0.08
331 0.06
332 0.05
333 0.03
334 0.03
335 0.02
336 0.02
337 0.02
338 0.02
339 0.02
340 0.02
341 0.02
342 0.02
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.08
350 0.1
351 0.14
352 0.16
353 0.16
354 0.16
355 0.15
356 0.15
357 0.16
358 0.15
359 0.11
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.07
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.04
383 0.1
384 0.1
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.12
391 0.1
392 0.12
393 0.17
394 0.19
395 0.2
396 0.21
397 0.21
398 0.23
399 0.25
400 0.25
401 0.22
402 0.22
403 0.21
404 0.19
405 0.21
406 0.18
407 0.13
408 0.11
409 0.07
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.03
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.11
426 0.11
427 0.13
428 0.16
429 0.19
430 0.17
431 0.17
432 0.17
433 0.16
434 0.16
435 0.14
436 0.11
437 0.09
438 0.08
439 0.08
440 0.09
441 0.08
442 0.08
443 0.11
444 0.11
445 0.1
446 0.12
447 0.11
448 0.14
449 0.18
450 0.22
451 0.26
452 0.27
453 0.28
454 0.33
455 0.34
456 0.3
457 0.29
458 0.28
459 0.25
460 0.29
461 0.31
462 0.27
463 0.27
464 0.28
465 0.28
466 0.27
467 0.23
468 0.21
469 0.18
470 0.16
471 0.17
472 0.16
473 0.14
474 0.15
475 0.15
476 0.12
477 0.12
478 0.12
479 0.11
480 0.13
481 0.12
482 0.13
483 0.17
484 0.18
485 0.19
486 0.27
487 0.27
488 0.26
489 0.27
490 0.25
491 0.22
492 0.26
493 0.26
494 0.18
495 0.17
496 0.15
497 0.14
498 0.15
499 0.14
500 0.08
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.08
505 0.1
506 0.14
507 0.18
508 0.22
509 0.23
510 0.24
511 0.26
512 0.26
513 0.26
514 0.24
515 0.2
516 0.19
517 0.23
518 0.22
519 0.23
520 0.26
521 0.29
522 0.33
523 0.37
524 0.36
525 0.36
526 0.37
527 0.37
528 0.36
529 0.37
530 0.36
531 0.37
532 0.41
533 0.39
534 0.41
535 0.43
536 0.41
537 0.38
538 0.32
539 0.29
540 0.24
541 0.22
542 0.2
543 0.18
544 0.17
545 0.18
546 0.22
547 0.27
548 0.28
549 0.29
550 0.33
551 0.35
552 0.4
553 0.38
554 0.36
555 0.38
556 0.48
557 0.56
558 0.6
559 0.59
560 0.54
561 0.56
562 0.54
563 0.47
564 0.39
565 0.38
566 0.31
567 0.3
568 0.3
569 0.28
570 0.28
571 0.25
572 0.23
573 0.15
574 0.15
575 0.18
576 0.18
577 0.18
578 0.18
579 0.18
580 0.17
581 0.16
582 0.18
583 0.19
584 0.23
585 0.23
586 0.25
587 0.25
588 0.26
589 0.26
590 0.23
591 0.2
592 0.2
593 0.2
594 0.2
595 0.21
596 0.2
597 0.21
598 0.28
599 0.34
600 0.37
601 0.42
602 0.45
603 0.5
604 0.52
605 0.55
606 0.55
607 0.53
608 0.48
609 0.48
610 0.47
611 0.44
612 0.43
613 0.4
614 0.35
615 0.28
616 0.25
617 0.2
618 0.15
619 0.14
620 0.14
621 0.13
622 0.12
623 0.13
624 0.14
625 0.13
626 0.14
627 0.13
628 0.14
629 0.12
630 0.13
631 0.14
632 0.18
633 0.18
634 0.17
635 0.17
636 0.16
637 0.17
638 0.17
639 0.2
640 0.17
641 0.17
642 0.18
643 0.21
644 0.24
645 0.27
646 0.25
647 0.21
648 0.23
649 0.25
650 0.26
651 0.24
652 0.24
653 0.23
654 0.31
655 0.31
656 0.27
657 0.24
658 0.22
659 0.2
660 0.17
661 0.14
662 0.05
663 0.04
664 0.04
665 0.04
666 0.03
667 0.04
668 0.04
669 0.06
670 0.08
671 0.08
672 0.08
673 0.09
674 0.1
675 0.13
676 0.15
677 0.15
678 0.13
679 0.17
680 0.17
681 0.18
682 0.17
683 0.14
684 0.12
685 0.11
686 0.1
687 0.07
688 0.07
689 0.05
690 0.05
691 0.05
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.07
696 0.1
697 0.12
698 0.16
699 0.17
700 0.17
701 0.18
702 0.19
703 0.21
704 0.21
705 0.22
706 0.19
707 0.18
708 0.19
709 0.18
710 0.17
711 0.13
712 0.12
713 0.09
714 0.08
715 0.07
716 0.06
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.07
721 0.08
722 0.08
723 0.08
724 0.09
725 0.08
726 0.08
727 0.11
728 0.11
729 0.12
730 0.12
731 0.14
732 0.15
733 0.19
734 0.24
735 0.23
736 0.22
737 0.2
738 0.2
739 0.19
740 0.18
741 0.14
742 0.09
743 0.08
744 0.08
745 0.09
746 0.08
747 0.08
748 0.07
749 0.07
750 0.07
751 0.08
752 0.15
753 0.17
754 0.22
755 0.23
756 0.26
757 0.27
758 0.27
759 0.28
760 0.22
761 0.21
762 0.17
763 0.18
764 0.16
765 0.15
766 0.17
767 0.17
768 0.15
769 0.13
770 0.13
771 0.12
772 0.12
773 0.18
774 0.17
775 0.17
776 0.16
777 0.17
778 0.19
779 0.18
780 0.18
781 0.13
782 0.13
783 0.14
784 0.17
785 0.16
786 0.14
787 0.16
788 0.17
789 0.16
790 0.16
791 0.17
792 0.16
793 0.21
794 0.21
795 0.24
796 0.26
797 0.33
798 0.34
799 0.32
800 0.32
801 0.28
802 0.31
803 0.27
804 0.29
805 0.24
806 0.25
807 0.27
808 0.26
809 0.25
810 0.24
811 0.24
812 0.23
813 0.26
814 0.25
815 0.23
816 0.29
817 0.29
818 0.28
819 0.33
820 0.4
821 0.45
822 0.48
823 0.48
824 0.48
825 0.58
826 0.67
827 0.65
828 0.63
829 0.57
830 0.58
831 0.62
832 0.62
833 0.6
834 0.56
835 0.53
836 0.47
837 0.46
838 0.41
839 0.41
840 0.36
841 0.27
842 0.23
843 0.2
844 0.19
845 0.17
846 0.16
847 0.12
848 0.12
849 0.12
850 0.12
851 0.14
852 0.15
853 0.16
854 0.15
855 0.15
856 0.19
857 0.24
858 0.25
859 0.28
860 0.28
861 0.3
862 0.34
863 0.33
864 0.31
865 0.32
866 0.33
867 0.35
868 0.38
869 0.36
870 0.34
871 0.37
872 0.34
873 0.31
874 0.28
875 0.22
876 0.23
877 0.32
878 0.33
879 0.33
880 0.36
881 0.34
882 0.37
883 0.37
884 0.35
885 0.26
886 0.27
887 0.3
888 0.34
889 0.41
890 0.39
891 0.4
892 0.42
893 0.43
894 0.44
895 0.46
896 0.43
897 0.42
898 0.51
899 0.52
900 0.48
901 0.47
902 0.48
903 0.47
904 0.47
905 0.48
906 0.4
907 0.39
908 0.44
909 0.52
910 0.53
911 0.49
912 0.47
913 0.43
914 0.44
915 0.43
916 0.39
917 0.33
918 0.33
919 0.3
920 0.29
921 0.25
922 0.23
923 0.21
924 0.19
925 0.15
926 0.1
927 0.1
928 0.09
929 0.09
930 0.08
931 0.08
932 0.08
933 0.11
934 0.13
935 0.15
936 0.19
937 0.26
938 0.33
939 0.38
940 0.45
941 0.44
942 0.43
943 0.45
944 0.45
945 0.43
946 0.4
947 0.45
948 0.42
949 0.47
950 0.54
951 0.59
952 0.67
953 0.66
954 0.73
955 0.73
956 0.78
957 0.81
958 0.84
959 0.85
960 0.86
961 0.92
962 0.92
963 0.92
964 0.89
965 0.87
966 0.83
967 0.8
968 0.75
969 0.71
970 0.71
971 0.62
972 0.61
973 0.56