Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N1JDG6

Protein Details
Accession A0A2N1JDG6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-75ADTEEFRRIKPKKKKSTSKPNKKQKLAHGDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-70RRIKPKKKKSTSKPNKKQKL
Subcellular Location(s) mito 17, cyto_mito 11.833, mito_nucl 10.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01717  Sm_B  
Amino Acid Sequences MPPVKAKGGRMMALIDYRLRITLNDGRQLTGQLLAFDTFMNLVLADTEEFRRIKPKKKKSTSKPNKKQKLAHGDAAESKRPEEEDEEEEEEEQVPPVQEQKRTLGLLIVRGETIISLSVEAPPPEPKFEGGLAPGPGHAVPAGRAAGFGGPPGMPRPPPPFGVPPPGMPAGPPPGFAPRPAGAPPGFAPPPPGFRPPGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.22
3 0.19
4 0.18
5 0.18
6 0.16
7 0.14
8 0.18
9 0.24
10 0.28
11 0.34
12 0.34
13 0.35
14 0.35
15 0.36
16 0.3
17 0.25
18 0.21
19 0.13
20 0.14
21 0.13
22 0.13
23 0.11
24 0.11
25 0.08
26 0.07
27 0.07
28 0.06
29 0.05
30 0.05
31 0.06
32 0.06
33 0.07
34 0.08
35 0.12
36 0.12
37 0.13
38 0.22
39 0.27
40 0.37
41 0.47
42 0.57
43 0.64
44 0.75
45 0.85
46 0.86
47 0.93
48 0.94
49 0.95
50 0.94
51 0.94
52 0.94
53 0.91
54 0.87
55 0.85
56 0.84
57 0.77
58 0.72
59 0.62
60 0.54
61 0.52
62 0.48
63 0.42
64 0.32
65 0.27
66 0.21
67 0.2
68 0.2
69 0.16
70 0.17
71 0.16
72 0.19
73 0.2
74 0.2
75 0.19
76 0.18
77 0.16
78 0.12
79 0.1
80 0.07
81 0.05
82 0.05
83 0.1
84 0.12
85 0.14
86 0.16
87 0.18
88 0.2
89 0.2
90 0.2
91 0.17
92 0.15
93 0.17
94 0.16
95 0.14
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.08
100 0.08
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.12
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.16
116 0.15
117 0.13
118 0.15
119 0.14
120 0.13
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.06
127 0.06
128 0.08
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.07
139 0.09
140 0.11
141 0.11
142 0.16
143 0.22
144 0.24
145 0.27
146 0.31
147 0.35
148 0.37
149 0.45
150 0.42
151 0.37
152 0.39
153 0.38
154 0.33
155 0.27
156 0.26
157 0.25
158 0.24
159 0.23
160 0.21
161 0.27
162 0.28
163 0.28
164 0.3
165 0.24
166 0.27
167 0.27
168 0.31
169 0.23
170 0.26
171 0.26
172 0.28
173 0.28
174 0.25
175 0.29
176 0.27
177 0.34
178 0.35
179 0.38