Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N1JCN9

Protein Details
Accession A0A2N1JCN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-23DDKTHDRRRGWRDEPRMRKSYEBasic
144-164YAEVRKERTWRQYMNRKGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MDDKTHDRRRGWRDEPRMRKSYEDRDASRGDHPSSSGRWNHGERSWQDTKGARTRRDDDDQSRSDWRAERRDAILSGIKVGVRGHGMTAANKPHATPAQSTEVQTQTVDTPSEELDADQIAAMMGFGNFGSSKGKPVEENTEGYAEVRKERTWRQYMNRKGGFNRPLDKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.85
3 0.85
4 0.82
5 0.74
6 0.73
7 0.71
8 0.7
9 0.69
10 0.66
11 0.61
12 0.6
13 0.6
14 0.55
15 0.51
16 0.45
17 0.38
18 0.3
19 0.29
20 0.27
21 0.27
22 0.31
23 0.3
24 0.29
25 0.33
26 0.35
27 0.37
28 0.37
29 0.42
30 0.37
31 0.43
32 0.43
33 0.38
34 0.39
35 0.38
36 0.42
37 0.43
38 0.48
39 0.45
40 0.47
41 0.51
42 0.53
43 0.56
44 0.56
45 0.53
46 0.53
47 0.5
48 0.47
49 0.45
50 0.4
51 0.36
52 0.34
53 0.34
54 0.32
55 0.33
56 0.32
57 0.31
58 0.32
59 0.3
60 0.28
61 0.26
62 0.19
63 0.17
64 0.15
65 0.13
66 0.12
67 0.11
68 0.09
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.12
76 0.13
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.14
84 0.16
85 0.2
86 0.21
87 0.22
88 0.23
89 0.22
90 0.21
91 0.2
92 0.17
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.09
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.09
118 0.09
119 0.13
120 0.14
121 0.16
122 0.17
123 0.21
124 0.28
125 0.28
126 0.3
127 0.28
128 0.28
129 0.27
130 0.25
131 0.26
132 0.19
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.26
137 0.33
138 0.43
139 0.47
140 0.54
141 0.6
142 0.68
143 0.76
144 0.81
145 0.8
146 0.76
147 0.73
148 0.74
149 0.71
150 0.68