FuNGI

A0A2N1JA41

Protein Details

Accession

A0A2N1JA41

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MSEARRRPKRRREDHDTMGEAD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
5-12	RRRPKRRR

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MSEARRRPKRRREDHDTMGEADTIQLAQDIALNVAGAMPHEQRRATTGYVPGSIVRVACERFVTYDAVEFFPGPYLNMIIGPNGTGKSTVVSAIALGLGWKPSVLGRAKDVASYVKLGHGEGWVEIELQGFSGKDNIVIRRVLFRESNSSDWLLNGANASAREVNEAVSQFHIEVGNLCTFLPQDRVADFAYMSPQRLLRETQYAAGHPKLSEWHDMLISFGGDLGKIKQRITNDTEEYTHLENRNRVLERDVRRYEERVELENRMRMLEARVHFAKYREAKQRYDIAHTERAQAKTQVRECERALLPVQEERDRLEQRAQKMDLQLSVQRKEADDTYGTCRRIEQEREQVDLEMSSLNEQERQLEAAETNRGQQIQALRARIAAMEEETAEEPAQIDTSALDADLRAVKGEHRTITEDCRDLDSQQSDLAAAQQQQRTRKQAVERKLTESNNIRHQRLQILAHNDKDTYEAIRWLDSHRDMFQHRVYDPVLVLLSVKRPDAARAVETCLNWNIQRTFVCQSRADYDLFTRELIDTRGWRLNVVEQEGSAPLTSFKPPISLDALQEAGFDNYILDNVDAPEDVLRFLCTNAHIHLIPISFRGTANAEEVERLRKFQRYIIGTTLFTTFYSKYGKRLPVTQSRELRPLRNFAHSSQSQEKGEAEHQLVAVNEEIARLDERVQQNRRMFDMKRTRLQDLSTKREQLVEEQRAAHRLVSEWRKARSLLAAERQKLVREESRPSAASQRQQINDERKKNALQLGKAAERYLRTLHTLMHARKQCDILVLSKLRHTTELNRIMEQIRTHQTELKEAMDALERVVSVFGQAKEETLAAKHFYELHMESVDAETQQTFFDQYRDDAEGVDQLELQLQGAKASFDIPWGIGPSVLEAFRARKAKIAELKATMDATKVEQTQLESKVQRVESQWLPSLEHLVANVNERFSAAFARLGCAGEVRLARDESFEKWGIDILVKFRETEQLQLLTGHRQSGGERSLSTILYLLSLTELARSPFSLVDEINQGMDPRAERAVHDQMVAITCRPEAGQYFLITPKLLTGLRYHELMKVLLINNGIWLPERLNLSEIVSQKRARVPGASDRSSATASAAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.9
2	0.88
3	0.81
4	0.73
5	0.63
6	0.53
7	0.43
8	0.33
9	0.24
10	0.14
11	0.1
12	0.08
13	0.06
14	0.06
15	0.08
16	0.08
17	0.08
18	0.09
19	0.08
20	0.08
21	0.08
22	0.08
23	0.06
24	0.09
25	0.13
26	0.18
27	0.21
28	0.22
29	0.23
30	0.27
31	0.3
32	0.3
33	0.31
34	0.32
35	0.32
36	0.33
37	0.34
38	0.3
39	0.28
40	0.26
41	0.22
42	0.18
43	0.19
44	0.18
45	0.19
46	0.2
47	0.19
48	0.2
49	0.22
50	0.22
51	0.18
52	0.22
53	0.22
54	0.22
55	0.21
56	0.19
57	0.18
58	0.18
59	0.17
60	0.13
61	0.12
62	0.12
63	0.11
64	0.13
65	0.13
66	0.11
67	0.11
68	0.11
69	0.12
70	0.12
71	0.12
72	0.11
73	0.11
74	0.11
75	0.12
76	0.12
77	0.1
78	0.1
79	0.09
80	0.09
81	0.08
82	0.07
83	0.06
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.06
88	0.07
89	0.08
90	0.15
91	0.19
92	0.2
93	0.23
94	0.29
95	0.3
96	0.3
97	0.31
98	0.28
99	0.25
100	0.25
101	0.22
102	0.2
103	0.2
104	0.2
105	0.19
106	0.17
107	0.16
108	0.13
109	0.15
110	0.11
111	0.11
112	0.11
113	0.11
114	0.09
115	0.08
116	0.09
117	0.07
118	0.07
119	0.09
120	0.09
121	0.12
122	0.16
123	0.18
124	0.21
125	0.23
126	0.24
127	0.28
128	0.3
129	0.31
130	0.29
131	0.3
132	0.35
133	0.38
134	0.4
135	0.36
136	0.36
137	0.32
138	0.29
139	0.28
140	0.2
141	0.16
142	0.13
143	0.1
144	0.1
145	0.1
146	0.13
147	0.14
148	0.13
149	0.15
150	0.15
151	0.16
152	0.17
153	0.18
154	0.17
155	0.16
156	0.16
157	0.14
158	0.15
159	0.14
160	0.11
161	0.12
162	0.13
163	0.13
164	0.13
165	0.13
166	0.12
167	0.12
168	0.13
169	0.15
170	0.13
171	0.14
172	0.14
173	0.17
174	0.17
175	0.17
176	0.16
177	0.13
178	0.19
179	0.18
180	0.19
181	0.19
182	0.2
183	0.21
184	0.23
185	0.26
186	0.22
187	0.27
188	0.27
189	0.3
190	0.3
191	0.31
192	0.33
193	0.32
194	0.3
195	0.24
196	0.23
197	0.23
198	0.24
199	0.26
200	0.23
201	0.23
202	0.22
203	0.22
204	0.21
205	0.17
206	0.14
207	0.09
208	0.09
209	0.07
210	0.06
211	0.07
212	0.1
213	0.16
214	0.17
215	0.19
216	0.21
217	0.24
218	0.3
219	0.35
220	0.39
221	0.36
222	0.37
223	0.38
224	0.37
225	0.37
226	0.33
227	0.33
228	0.3
229	0.31
230	0.31
231	0.32
232	0.38
233	0.36
234	0.35
235	0.35
236	0.39
237	0.41
238	0.49
239	0.49
240	0.47
241	0.49
242	0.5
243	0.49
244	0.48
245	0.43
246	0.39
247	0.39
248	0.39
249	0.39
250	0.4
251	0.37
252	0.3
253	0.28
254	0.23
255	0.22
256	0.24
257	0.21
258	0.24
259	0.26
260	0.27
261	0.29
262	0.29
263	0.35
264	0.34
265	0.41
266	0.45
267	0.48
268	0.49
269	0.52
270	0.58
271	0.52
272	0.52
273	0.49
274	0.44
275	0.48
276	0.46
277	0.48
278	0.46
279	0.46
280	0.42
281	0.44
282	0.42
283	0.42
284	0.46
285	0.48
286	0.46
287	0.48
288	0.46
289	0.47
290	0.43
291	0.38
292	0.35
293	0.28
294	0.27
295	0.25
296	0.28
297	0.23
298	0.23
299	0.23
300	0.29
301	0.29
302	0.29
303	0.34
304	0.35
305	0.37
306	0.44
307	0.42
308	0.38
309	0.4
310	0.39
311	0.33
312	0.31
313	0.32
314	0.29
315	0.29
316	0.28
317	0.26
318	0.25
319	0.26
320	0.24
321	0.21
322	0.18
323	0.19
324	0.24
325	0.29
326	0.29
327	0.27
328	0.26
329	0.27
330	0.33
331	0.36
332	0.37
333	0.41
334	0.42
335	0.45
336	0.45
337	0.42
338	0.35
339	0.29
340	0.21
341	0.12
342	0.1
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.11
349	0.1
350	0.11
351	0.11
352	0.11
353	0.11
354	0.11
355	0.15
356	0.13
357	0.14
358	0.15
359	0.15
360	0.14
361	0.15
362	0.17
363	0.2
364	0.24
365	0.23
366	0.22
367	0.22
368	0.23
369	0.2
370	0.17
371	0.11
372	0.08
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.08
377	0.09
378	0.08
379	0.07
380	0.07
381	0.06
382	0.07
383	0.05
384	0.05
385	0.04
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.05
392	0.07
393	0.07
394	0.06
395	0.07
396	0.09
397	0.13
398	0.16
399	0.16
400	0.16
401	0.2
402	0.21
403	0.26
404	0.27
405	0.25
406	0.23
407	0.25
408	0.24
409	0.21
410	0.24
411	0.2
412	0.18
413	0.16
414	0.16
415	0.12
416	0.11
417	0.12
418	0.09
419	0.11
420	0.15
421	0.17
422	0.21
423	0.27
424	0.32
425	0.36
426	0.36
427	0.39
428	0.43
429	0.48
430	0.54
431	0.57
432	0.55
433	0.56
434	0.59
435	0.55
436	0.53
437	0.52
438	0.47
439	0.47
440	0.5
441	0.46
442	0.41
443	0.42
444	0.39
445	0.36
446	0.35
447	0.29
448	0.33
449	0.34
450	0.34
451	0.34
452	0.3
453	0.27
454	0.25
455	0.21
456	0.14
457	0.12
458	0.12
459	0.11
460	0.12
461	0.13
462	0.12
463	0.16
464	0.15
465	0.17
466	0.16
467	0.18
468	0.19
469	0.22
470	0.23
471	0.23
472	0.21
473	0.22
474	0.21
475	0.19
476	0.18
477	0.14
478	0.12
479	0.08
480	0.09
481	0.07
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.11
488	0.14
489	0.14
490	0.14
491	0.14
492	0.18
493	0.2
494	0.19
495	0.2
496	0.18
497	0.18
498	0.16
499	0.18
500	0.15
501	0.14
502	0.15
503	0.16
504	0.19
505	0.2
506	0.23
507	0.21
508	0.22
509	0.22
510	0.24
511	0.21
512	0.18
513	0.16
514	0.15
515	0.15
516	0.13
517	0.11
518	0.1
519	0.1
520	0.11
521	0.11
522	0.1
523	0.12
524	0.16
525	0.15
526	0.15
527	0.15
528	0.17
529	0.17
530	0.18
531	0.15
532	0.12
533	0.13
534	0.13
535	0.12
536	0.08
537	0.07
538	0.05
539	0.07
540	0.07
541	0.08
542	0.07
543	0.09
544	0.1
545	0.11
546	0.15
547	0.15
548	0.14
549	0.15
550	0.16
551	0.14
552	0.14
553	0.12
554	0.08
555	0.06
556	0.06
557	0.05
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.06
574	0.07
575	0.07
576	0.08
577	0.09
578	0.11
579	0.1
580	0.1
581	0.12
582	0.11
583	0.1
584	0.1
585	0.1
586	0.09
587	0.09
588	0.1
589	0.09
590	0.1
591	0.11
592	0.1
593	0.09
594	0.1
595	0.11
596	0.15
597	0.14
598	0.15
599	0.16
600	0.18
601	0.19
602	0.22
603	0.28
604	0.26
605	0.28
606	0.3
607	0.3
608	0.27
609	0.27
610	0.25
611	0.18
612	0.15
613	0.15
614	0.11
615	0.11
616	0.17
617	0.16
618	0.19
619	0.25
620	0.3
621	0.29
622	0.35
623	0.39
624	0.44
625	0.5
626	0.54
627	0.54
628	0.52
629	0.59
630	0.55
631	0.54
632	0.46
633	0.46
634	0.41
635	0.41
636	0.4
637	0.33
638	0.39
639	0.35
640	0.39
641	0.37
642	0.39
643	0.33
644	0.32
645	0.31
646	0.25
647	0.25
648	0.22
649	0.18
650	0.14
651	0.14
652	0.14
653	0.14
654	0.12
655	0.1
656	0.08
657	0.07
658	0.06
659	0.06
660	0.05
661	0.06
662	0.06
663	0.07
664	0.13
665	0.18
666	0.26
667	0.3
668	0.37
669	0.4
670	0.42
671	0.43
672	0.42
673	0.39
674	0.41
675	0.48
676	0.46
677	0.5
678	0.52
679	0.51
680	0.48
681	0.49
682	0.47
683	0.44
684	0.45
685	0.43
686	0.41
687	0.39
688	0.4
689	0.38
690	0.37
691	0.39
692	0.36
693	0.34
694	0.34
695	0.34
696	0.34
697	0.34
698	0.27
699	0.18
700	0.15
701	0.21
702	0.24
703	0.31
704	0.33
705	0.34
706	0.36
707	0.36
708	0.35
709	0.32
710	0.3
711	0.29
712	0.34
713	0.38
714	0.38
715	0.41
716	0.4
717	0.38
718	0.34
719	0.33
720	0.3
721	0.27
722	0.31
723	0.31
724	0.35
725	0.33
726	0.33
727	0.37
728	0.36
729	0.37
730	0.39
731	0.42
732	0.4
733	0.42
734	0.48
735	0.51
736	0.56
737	0.57
738	0.53
739	0.5
740	0.49
741	0.49
742	0.49
743	0.43
744	0.35
745	0.35
746	0.37
747	0.36
748	0.35
749	0.32
750	0.28
751	0.24
752	0.25
753	0.21
754	0.18
755	0.18
756	0.18
757	0.18
758	0.22
759	0.29
760	0.29
761	0.36
762	0.39
763	0.37
764	0.39
765	0.4
766	0.34
767	0.3
768	0.29
769	0.23
770	0.25
771	0.27
772	0.25
773	0.26
774	0.28
775	0.25
776	0.26
777	0.26
778	0.25
779	0.32
780	0.4
781	0.39
782	0.38
783	0.39
784	0.38
785	0.38
786	0.33
787	0.29
788	0.26
789	0.28
790	0.28
791	0.31
792	0.3
793	0.32
794	0.34
795	0.29
796	0.23
797	0.2
798	0.19
799	0.18
800	0.17
801	0.12
802	0.11
803	0.1
804	0.09
805	0.1
806	0.08
807	0.07
808	0.11
809	0.12
810	0.13
811	0.14
812	0.14
813	0.14
814	0.15
815	0.14
816	0.1
817	0.12
818	0.11
819	0.12
820	0.12
821	0.12
822	0.12
823	0.16
824	0.16
825	0.17
826	0.15
827	0.15
828	0.15
829	0.15
830	0.15
831	0.1
832	0.1
833	0.08
834	0.08
835	0.08
836	0.08
837	0.08
838	0.08
839	0.1
840	0.11
841	0.11
842	0.14
843	0.16
844	0.16
845	0.15
846	0.15
847	0.16
848	0.15
849	0.14
850	0.11
851	0.09
852	0.1
853	0.09
854	0.09
855	0.09
856	0.08
857	0.09
858	0.09
859	0.09
860	0.08
861	0.09
862	0.09
863	0.08
864	0.08
865	0.08
866	0.09
867	0.11
868	0.11
869	0.1
870	0.1
871	0.11
872	0.12
873	0.11
874	0.12
875	0.11
876	0.14
877	0.2
878	0.24
879	0.22
880	0.25
881	0.28
882	0.35
883	0.42
884	0.46
885	0.45
886	0.44
887	0.46
888	0.43
889	0.41
890	0.33
891	0.25
892	0.2
893	0.18
894	0.18
895	0.17
896	0.16
897	0.16
898	0.19
899	0.24
900	0.26
901	0.3
902	0.28
903	0.29
904	0.34
905	0.34
906	0.34
907	0.31
908	0.34
909	0.32
910	0.36
911	0.39
912	0.33
913	0.34
914	0.31
915	0.32
916	0.26
917	0.22
918	0.18
919	0.16
920	0.16
921	0.19
922	0.2
923	0.17
924	0.16
925	0.16
926	0.16
927	0.13
928	0.14
929	0.11
930	0.13
931	0.13
932	0.15
933	0.16
934	0.16
935	0.15
936	0.14
937	0.13
938	0.14
939	0.15
940	0.16
941	0.18
942	0.18
943	0.18
944	0.21
945	0.22
946	0.21
947	0.25
948	0.25
949	0.22
950	0.21
951	0.22
952	0.19
953	0.21
954	0.2
955	0.18
956	0.21
957	0.21
958	0.22
959	0.21
960	0.28
961	0.26
962	0.28
963	0.29
964	0.26
965	0.26
966	0.28
967	0.29
968	0.27
969	0.28
970	0.25
971	0.21
972	0.2
973	0.21
974	0.24
975	0.26
976	0.22
977	0.21
978	0.23
979	0.25
980	0.24
981	0.23
982	0.17
983	0.14
984	0.13
985	0.12
986	0.09
987	0.07
988	0.08
989	0.07
990	0.09
991	0.1
992	0.11
993	0.12
994	0.12
995	0.13
996	0.14
997	0.16
998	0.16
999	0.15
1000	0.16
1001	0.18
1002	0.18
1003	0.18
1004	0.17
1005	0.16
1006	0.14
1007	0.16
1008	0.15
1009	0.14
1010	0.17
1011	0.17
1012	0.18
1013	0.25
1014	0.31
1015	0.3
1016	0.3
1017	0.28
1018	0.26
1019	0.29
1020	0.29
1021	0.23
1022	0.16
1023	0.15
1024	0.15
1025	0.14
1026	0.15
1027	0.14
1028	0.18
1029	0.2
1030	0.2
1031	0.24
1032	0.25
1033	0.27
1034	0.24
1035	0.22
1036	0.18
1037	0.19
1038	0.18
1039	0.16
1040	0.18
1041	0.23
1042	0.25
1043	0.27
1044	0.27
1045	0.27
1046	0.28
1047	0.27
1048	0.25
1049	0.24
1050	0.22
1051	0.23
1052	0.23
1053	0.19
1054	0.19
1055	0.19
1056	0.18
1057	0.14
1058	0.14
1059	0.13
1060	0.16
1061	0.19
1062	0.18
1063	0.19
1064	0.2
1065	0.22
1066	0.26
1067	0.29
1068	0.31
1069	0.35
1070	0.35
1071	0.39
1072	0.44
1073	0.44
1074	0.41
1075	0.41
1076	0.4
1077	0.46
1078	0.53
1079	0.51
1080	0.47
1081	0.45
1082	0.46
1083	0.42
1084	0.36

A0A2N1JA41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer