Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3P394

Protein Details
Accession J3P394    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-54DDDLDRRGPPRRRHDAQPFPRIRRQLLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-24RPRGGGGRGGFNAKRRR
34-40RGPPRRR
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 8, cyto 5.5, mito 5, plas 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MADSYDRRPRGGGGRGGFNAKRRRYNDDDDLDRRGPPRRRHDAQPFPRIRRQLLGLAESAVRKWHQDAVETAQIVADHWEDDYVNRGFVDLTCQLAVEQPFKTPFVAAVVLVANTMRSEIAAAVLAKAARDLEDAVGRGEWREAKLLLKFLACLQSCLEGEGVFPILDALFDRAVDLQTASSDDTIGTELVKIILLTIPYVMAAAPGQWAEKAAELMDKTEIIASEPHPMQKLVDPYVFDPNDENSSQPSLIALLQKQLQAEAAGGWIVDCIPRPWKMPLEEVEHQSKLDDCPKHALPAVMVPENIVTGSRDLFPEVYFSVYSGQDIDSVPQVTNIAASLIRDAILDTINILHYNRNFVARTLIDVDCFFNNGTFVKRATPFDRLRDIEQGRSTWKPEDMVVDTVFSQLFQLPAPEHKLVYYHSVLYETCKVSPAAIAPSLGRAIRSLYRNGGRLDLELNHRFVDWFSHHLSNFGFTWKWTEWVDDVKLPMLHPHKAFILAALDKEIRLSFAQRIKNTVPDEYKPLISAEKEMDVPVFKFAKDDVPFARQGREMVKLLKSKVPDEEIQPLIEQIQNEAVDQGRDPLVSSTDVFMTAVLAVGSKSLSHVLACIERVKDRLLDSGSASAAARTQIMAAVMSYWSAHPGVALSIVEKLLNYAILTPQVVAEWAVSGEASDEARLAHAYLYELVLNTVIKVSGRARQIVAQQEAAKPAADGDLAMTDASNGDGPDHVPYADTPEAKDLRELFQLIESAVKARSASSVLAAAGDPLARQWVDRWLRAFQRRAAVEENFFVEAEKNRKRIAAAAAEAAAHAAAAAEAAAAAAAAAPTEEVPAAAAEAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.5
3 0.56
4 0.54
5 0.55
6 0.56
7 0.56
8 0.62
9 0.59
10 0.65
11 0.66
12 0.71
13 0.73
14 0.72
15 0.73
16 0.67
17 0.7
18 0.63
19 0.58
20 0.52
21 0.52
22 0.53
23 0.54
24 0.6
25 0.63
26 0.68
27 0.75
28 0.82
29 0.84
30 0.85
31 0.86
32 0.85
33 0.83
34 0.85
35 0.8
36 0.73
37 0.67
38 0.61
39 0.57
40 0.52
41 0.47
42 0.4
43 0.36
44 0.35
45 0.3
46 0.26
47 0.23
48 0.19
49 0.18
50 0.2
51 0.24
52 0.23
53 0.26
54 0.29
55 0.33
56 0.38
57 0.36
58 0.33
59 0.28
60 0.26
61 0.23
62 0.21
63 0.14
64 0.09
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.15
70 0.13
71 0.14
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.19
77 0.14
78 0.16
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.19
83 0.21
84 0.19
85 0.18
86 0.19
87 0.22
88 0.23
89 0.23
90 0.19
91 0.17
92 0.17
93 0.17
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.08
101 0.07
102 0.08
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.08
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.13
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.15
127 0.16
128 0.14
129 0.17
130 0.17
131 0.2
132 0.23
133 0.25
134 0.24
135 0.22
136 0.21
137 0.21
138 0.28
139 0.24
140 0.23
141 0.21
142 0.23
143 0.23
144 0.23
145 0.21
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.08
210 0.1
211 0.1
212 0.15
213 0.16
214 0.18
215 0.18
216 0.19
217 0.19
218 0.21
219 0.25
220 0.22
221 0.23
222 0.22
223 0.23
224 0.32
225 0.3
226 0.26
227 0.24
228 0.22
229 0.24
230 0.23
231 0.22
232 0.15
233 0.17
234 0.16
235 0.15
236 0.13
237 0.1
238 0.12
239 0.14
240 0.12
241 0.13
242 0.15
243 0.16
244 0.16
245 0.15
246 0.14
247 0.11
248 0.11
249 0.08
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.06
259 0.09
260 0.11
261 0.14
262 0.17
263 0.22
264 0.24
265 0.28
266 0.31
267 0.36
268 0.38
269 0.39
270 0.4
271 0.36
272 0.33
273 0.29
274 0.26
275 0.21
276 0.24
277 0.22
278 0.19
279 0.25
280 0.26
281 0.27
282 0.27
283 0.25
284 0.18
285 0.2
286 0.22
287 0.17
288 0.16
289 0.14
290 0.13
291 0.13
292 0.12
293 0.08
294 0.06
295 0.05
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.09
304 0.1
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.06
339 0.08
340 0.08
341 0.12
342 0.13
343 0.15
344 0.15
345 0.15
346 0.19
347 0.16
348 0.18
349 0.18
350 0.17
351 0.15
352 0.15
353 0.16
354 0.12
355 0.13
356 0.11
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.12
364 0.14
365 0.18
366 0.2
367 0.28
368 0.28
369 0.31
370 0.37
371 0.35
372 0.35
373 0.4
374 0.39
375 0.34
376 0.33
377 0.3
378 0.27
379 0.27
380 0.26
381 0.2
382 0.19
383 0.16
384 0.15
385 0.17
386 0.16
387 0.16
388 0.14
389 0.14
390 0.13
391 0.13
392 0.12
393 0.09
394 0.07
395 0.05
396 0.06
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.08
401 0.12
402 0.12
403 0.12
404 0.11
405 0.12
406 0.12
407 0.16
408 0.15
409 0.12
410 0.11
411 0.12
412 0.12
413 0.14
414 0.17
415 0.14
416 0.13
417 0.14
418 0.13
419 0.12
420 0.13
421 0.11
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.09
427 0.1
428 0.09
429 0.08
430 0.07
431 0.08
432 0.12
433 0.14
434 0.15
435 0.19
436 0.21
437 0.24
438 0.24
439 0.25
440 0.21
441 0.19
442 0.19
443 0.17
444 0.2
445 0.19
446 0.2
447 0.18
448 0.17
449 0.17
450 0.15
451 0.16
452 0.12
453 0.14
454 0.16
455 0.19
456 0.19
457 0.2
458 0.2
459 0.18
460 0.17
461 0.15
462 0.12
463 0.09
464 0.14
465 0.13
466 0.15
467 0.14
468 0.15
469 0.14
470 0.17
471 0.19
472 0.15
473 0.15
474 0.15
475 0.15
476 0.14
477 0.18
478 0.18
479 0.2
480 0.19
481 0.2
482 0.19
483 0.2
484 0.19
485 0.14
486 0.15
487 0.12
488 0.11
489 0.12
490 0.12
491 0.1
492 0.11
493 0.1
494 0.08
495 0.08
496 0.1
497 0.14
498 0.2
499 0.26
500 0.26
501 0.31
502 0.3
503 0.36
504 0.36
505 0.36
506 0.33
507 0.29
508 0.34
509 0.31
510 0.3
511 0.24
512 0.24
513 0.2
514 0.17
515 0.18
516 0.13
517 0.13
518 0.13
519 0.12
520 0.12
521 0.11
522 0.11
523 0.14
524 0.13
525 0.11
526 0.12
527 0.12
528 0.19
529 0.19
530 0.22
531 0.2
532 0.23
533 0.27
534 0.27
535 0.29
536 0.22
537 0.23
538 0.22
539 0.24
540 0.22
541 0.22
542 0.27
543 0.29
544 0.3
545 0.31
546 0.31
547 0.28
548 0.29
549 0.3
550 0.26
551 0.25
552 0.29
553 0.26
554 0.25
555 0.24
556 0.21
557 0.18
558 0.17
559 0.14
560 0.09
561 0.12
562 0.11
563 0.11
564 0.12
565 0.11
566 0.1
567 0.1
568 0.11
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.08
573 0.09
574 0.1
575 0.11
576 0.1
577 0.1
578 0.1
579 0.09
580 0.08
581 0.07
582 0.06
583 0.06
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.05
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.07
595 0.09
596 0.1
597 0.12
598 0.14
599 0.15
600 0.16
601 0.17
602 0.18
603 0.19
604 0.18
605 0.21
606 0.2
607 0.2
608 0.2
609 0.2
610 0.19
611 0.17
612 0.16
613 0.11
614 0.1
615 0.09
616 0.08
617 0.07
618 0.07
619 0.06
620 0.07
621 0.07
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.06
632 0.06
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.06
637 0.07
638 0.08
639 0.08
640 0.07
641 0.08
642 0.07
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.09
648 0.09
649 0.09
650 0.08
651 0.08
652 0.08
653 0.07
654 0.06
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.05
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.07
667 0.07
668 0.07
669 0.06
670 0.07
671 0.08
672 0.08
673 0.09
674 0.09
675 0.09
676 0.09
677 0.09
678 0.09
679 0.08
680 0.08
681 0.07
682 0.07
683 0.1
684 0.11
685 0.16
686 0.19
687 0.21
688 0.22
689 0.26
690 0.32
691 0.36
692 0.37
693 0.36
694 0.36
695 0.35
696 0.36
697 0.33
698 0.27
699 0.19
700 0.17
701 0.14
702 0.11
703 0.09
704 0.07
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.06
709 0.06
710 0.06
711 0.07
712 0.07
713 0.06
714 0.06
715 0.07
716 0.08
717 0.1
718 0.11
719 0.1
720 0.1
721 0.1
722 0.17
723 0.2
724 0.2
725 0.19
726 0.26
727 0.28
728 0.27
729 0.31
730 0.26
731 0.25
732 0.28
733 0.28
734 0.22
735 0.22
736 0.22
737 0.18
738 0.18
739 0.15
740 0.13
741 0.13
742 0.13
743 0.11
744 0.11
745 0.13
746 0.13
747 0.13
748 0.13
749 0.13
750 0.13
751 0.13
752 0.13
753 0.11
754 0.1
755 0.09
756 0.08
757 0.06
758 0.1
759 0.09
760 0.1
761 0.11
762 0.2
763 0.26
764 0.3
765 0.33
766 0.37
767 0.47
768 0.55
769 0.59
770 0.54
771 0.58
772 0.56
773 0.57
774 0.55
775 0.5
776 0.45
777 0.41
778 0.38
779 0.3
780 0.28
781 0.24
782 0.22
783 0.24
784 0.3
785 0.35
786 0.36
787 0.37
788 0.39
789 0.39
790 0.42
791 0.43
792 0.41
793 0.37
794 0.36
795 0.35
796 0.33
797 0.31
798 0.26
799 0.18
800 0.1
801 0.07
802 0.04
803 0.03
804 0.03
805 0.03
806 0.03
807 0.03
808 0.03
809 0.03
810 0.02
811 0.02
812 0.03
813 0.03
814 0.03
815 0.03
816 0.04
817 0.04
818 0.05
819 0.06
820 0.05
821 0.06
822 0.06