FuNGI

A0A2N1JC72

Protein Details

Accession

A0A2N1JC72

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
579-603	IIAYGFKREAKRKRAEKRADKGALV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
585-600	KREAKRKRAEKRADKG

Subcellular Location(s)

nucl 10, cysk 8, cyto 6, mito_nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011262 DNA-dir_RNA_pol_insert IPR011263 DNA-dir_RNA_pol_RpoA/D/Rpb3 IPR029005 LIM-bd/SEUSS IPR036603 RBP11-like IPR022842 RNAP_Rpo3/Rpb3/RPAC1 IPR036643 RNApol_insert_sf
Gene Ontology	GO:0055029 C:nuclear DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0046983 F:protein dimerization activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF01803 LIM_bind PF01000 RNA_pol_A_bac PF01193 RNA_pol_L
CDD	cd07031 RNAP_II_RPB3

Amino Acid Sequences

MTAVNGVYGRDVAPIRAPDGLVAQAHAPNFIIRELNDEHADFILENVDMSYANSLRRTLIADVPTVAIDMVEIMVNTTVLPDEFFAHRLGMVPLLSMDAAKVLVDQRDCVCEDGCDRCSVELTLDALCTSDRGSMYVTSKDLIRSNTIDNPYSDEAMYGPIAPRHPDFGKPAGQDDPNKPDILLVQMRKGQHIKARCIARKGFAKEHAKWSPVSAIGFEYDPHNALRHTTLWYEHDPKKEWPESKNAREEELPLEGAPFDPNRKANRFYFDVESVGNLHPAEIVETGLSLMEYRTAQIVQELGMLYQPMGAPEAMGLFHEPLSAEGMAEIISLQKMADRVPCESFVNIASQPGYSPELAPTYFPPGTGRSRVLQFYTQLLAPNKPRNLSHLRRFELDFYVPDATLRLNLWSDVTKRSQKIDIVSPLTIYFSDGMYGKMERSIRAHLGDMKEYMVDPHQMPPSPSVSFQSKMPDPVTPRYTTHVVESQRMLQITAFENGWQCQRVGMFRCLLTPYTRVEYAPAPPGMEGNEDGNIPQLVTQLRLQYMCFTTLAQSLFVPMPWRRFNLGAVDIPKDVIEEIIAYGFKREAKRKRAEKRADKGALVEKRVRTDQTQQESGTPQEPLEAPELLAKKESEDEEDLPILDQCFRMNSHSNERLAINEWGMPNSLMYVMHLLDSMSQMSELIDVHCETGVPPLQILHNFDNERQHELRASSSRDPFVAPDLTAPLTSQTLFGVSKKQS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.21
3	0.22
4	0.22
5	0.19
6	0.2
7	0.21
8	0.16
9	0.15
10	0.16
11	0.17
12	0.17
13	0.17
14	0.15
15	0.14
16	0.15
17	0.15
18	0.15
19	0.13
20	0.18
21	0.21
22	0.24
23	0.26
24	0.25
25	0.24
26	0.22
27	0.23
28	0.17
29	0.14
30	0.12
31	0.09
32	0.08
33	0.07
34	0.07
35	0.07
36	0.08
37	0.11
38	0.11
39	0.14
40	0.15
41	0.16
42	0.17
43	0.18
44	0.21
45	0.2
46	0.25
47	0.24
48	0.24
49	0.24
50	0.24
51	0.23
52	0.19
53	0.16
54	0.09
55	0.07
56	0.06
57	0.05
58	0.05
59	0.05
60	0.05
61	0.05
62	0.06
63	0.05
64	0.06
65	0.06
66	0.05
67	0.06
68	0.06
69	0.09
70	0.11
71	0.12
72	0.13
73	0.13
74	0.13
75	0.14
76	0.14
77	0.13
78	0.11
79	0.1
80	0.1
81	0.1
82	0.1
83	0.08
84	0.07
85	0.06
86	0.06
87	0.05
88	0.07
89	0.08
90	0.12
91	0.13
92	0.16
93	0.16
94	0.2
95	0.21
96	0.21
97	0.19
98	0.17
99	0.2
100	0.23
101	0.23
102	0.22
103	0.22
104	0.21
105	0.22
106	0.21
107	0.19
108	0.15
109	0.15
110	0.13
111	0.13
112	0.12
113	0.11
114	0.1
115	0.09
116	0.08
117	0.1
118	0.09
119	0.1
120	0.12
121	0.15
122	0.18
123	0.21
124	0.21
125	0.18
126	0.2
127	0.22
128	0.24
129	0.22
130	0.23
131	0.23
132	0.26
133	0.32
134	0.34
135	0.33
136	0.3
137	0.34
138	0.32
139	0.3
140	0.26
141	0.19
142	0.16
143	0.16
144	0.16
145	0.11
146	0.1
147	0.12
148	0.13
149	0.15
150	0.16
151	0.2
152	0.21
153	0.23
154	0.27
155	0.29
156	0.34
157	0.32
158	0.34
159	0.33
160	0.36
161	0.38
162	0.39
163	0.41
164	0.37
165	0.36
166	0.33
167	0.29
168	0.25
169	0.26
170	0.27
171	0.22
172	0.24
173	0.28
174	0.28
175	0.33
176	0.34
177	0.32
178	0.32
179	0.37
180	0.39
181	0.42
182	0.51
183	0.52
184	0.56
185	0.54
186	0.55
187	0.56
188	0.56
189	0.56
190	0.55
191	0.58
192	0.56
193	0.62
194	0.6
195	0.53
196	0.47
197	0.43
198	0.37
199	0.31
200	0.27
201	0.19
202	0.15
203	0.15
204	0.15
205	0.13
206	0.11
207	0.1
208	0.11
209	0.11
210	0.11
211	0.1
212	0.11
213	0.13
214	0.13
215	0.14
216	0.15
217	0.16
218	0.19
219	0.24
220	0.3
221	0.33
222	0.37
223	0.38
224	0.4
225	0.46
226	0.49
227	0.48
228	0.43
229	0.49
230	0.53
231	0.57
232	0.62
233	0.54
234	0.5
235	0.46
236	0.46
237	0.37
238	0.31
239	0.24
240	0.15
241	0.15
242	0.12
243	0.12
244	0.11
245	0.1
246	0.1
247	0.13
248	0.18
249	0.24
250	0.27
251	0.32
252	0.33
253	0.38
254	0.39
255	0.39
256	0.38
257	0.33
258	0.31
259	0.26
260	0.24
261	0.21
262	0.17
263	0.15
264	0.11
265	0.09
266	0.08
267	0.08
268	0.09
269	0.06
270	0.06
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.04
276	0.03
277	0.03
278	0.04
279	0.05
280	0.05
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.07
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.05
293	0.06
294	0.06
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.04
302	0.04
303	0.05
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.07
310	0.07
311	0.06
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.04
322	0.05
323	0.06
324	0.09
325	0.1
326	0.12
327	0.14
328	0.16
329	0.15
330	0.15
331	0.15
332	0.12
333	0.13
334	0.11
335	0.1
336	0.09
337	0.08
338	0.08
339	0.09
340	0.1
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.09
345	0.09
346	0.1
347	0.09
348	0.13
349	0.13
350	0.13
351	0.13
352	0.15
353	0.18
354	0.2
355	0.21
356	0.17
357	0.2
358	0.21
359	0.21
360	0.19
361	0.17
362	0.17
363	0.16
364	0.15
365	0.16
366	0.17
367	0.18
368	0.21
369	0.26
370	0.26
371	0.27
372	0.26
373	0.29
374	0.37
375	0.41
376	0.45
377	0.48
378	0.48
379	0.48
380	0.49
381	0.45
382	0.39
383	0.32
384	0.24
385	0.18
386	0.17
387	0.14
388	0.13
389	0.12
390	0.09
391	0.09
392	0.08
393	0.07
394	0.06
395	0.07
396	0.08
397	0.09
398	0.11
399	0.13
400	0.18
401	0.22
402	0.23
403	0.26
404	0.27
405	0.27
406	0.28
407	0.31
408	0.31
409	0.28
410	0.27
411	0.25
412	0.22
413	0.21
414	0.18
415	0.13
416	0.09
417	0.06
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.08
422	0.08
423	0.08
424	0.11
425	0.12
426	0.12
427	0.14
428	0.17
429	0.18
430	0.18
431	0.2
432	0.2
433	0.21
434	0.21
435	0.2
436	0.17
437	0.15
438	0.14
439	0.13
440	0.1
441	0.11
442	0.1
443	0.14
444	0.16
445	0.16
446	0.17
447	0.19
448	0.21
449	0.19
450	0.19
451	0.18
452	0.19
453	0.2
454	0.2
455	0.24
456	0.22
457	0.24
458	0.24
459	0.25
460	0.26
461	0.31
462	0.33
463	0.3
464	0.31
465	0.32
466	0.34
467	0.3
468	0.3
469	0.29
470	0.27
471	0.27
472	0.28
473	0.26
474	0.25
475	0.25
476	0.22
477	0.16
478	0.17
479	0.16
480	0.16
481	0.13
482	0.11
483	0.13
484	0.13
485	0.15
486	0.13
487	0.12
488	0.11
489	0.12
490	0.16
491	0.2
492	0.22
493	0.22
494	0.21
495	0.23
496	0.23
497	0.24
498	0.21
499	0.19
500	0.19
501	0.2
502	0.2
503	0.19
504	0.19
505	0.2
506	0.21
507	0.24
508	0.21
509	0.18
510	0.17
511	0.18
512	0.16
513	0.16
514	0.14
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.1
519	0.11
520	0.1
521	0.08
522	0.08
523	0.09
524	0.08
525	0.11
526	0.13
527	0.14
528	0.15
529	0.16
530	0.16
531	0.17
532	0.18
533	0.18
534	0.16
535	0.14
536	0.14
537	0.17
538	0.17
539	0.14
540	0.12
541	0.13
542	0.13
543	0.13
544	0.16
545	0.16
546	0.22
547	0.24
548	0.27
549	0.27
550	0.28
551	0.3
552	0.31
553	0.32
554	0.3
555	0.29
556	0.29
557	0.26
558	0.25
559	0.23
560	0.17
561	0.14
562	0.09
563	0.07
564	0.05
565	0.05
566	0.06
567	0.07
568	0.07
569	0.08
570	0.09
571	0.14
572	0.2
573	0.29
574	0.37
575	0.47
576	0.57
577	0.67
578	0.76
579	0.82
580	0.86
581	0.88
582	0.87
583	0.88
584	0.82
585	0.72
586	0.67
587	0.65
588	0.6
589	0.54
590	0.52
591	0.44
592	0.44
593	0.47
594	0.45
595	0.4
596	0.44
597	0.48
598	0.49
599	0.51
600	0.47
601	0.47
602	0.46
603	0.45
604	0.37
605	0.29
606	0.21
607	0.19
608	0.19
609	0.18
610	0.18
611	0.16
612	0.14
613	0.19
614	0.21
615	0.19
616	0.2
617	0.18
618	0.17
619	0.2
620	0.21
621	0.21
622	0.23
623	0.24
624	0.25
625	0.26
626	0.24
627	0.21
628	0.21
629	0.17
630	0.14
631	0.13
632	0.1
633	0.12
634	0.13
635	0.18
636	0.23
637	0.28
638	0.37
639	0.43
640	0.44
641	0.44
642	0.43
643	0.4
644	0.37
645	0.33
646	0.25
647	0.22
648	0.22
649	0.2
650	0.21
651	0.19
652	0.15
653	0.13
654	0.13
655	0.09
656	0.09
657	0.11
658	0.1
659	0.1
660	0.1
661	0.09
662	0.09
663	0.1
664	0.1
665	0.08
666	0.08
667	0.08
668	0.08
669	0.09
670	0.08
671	0.08
672	0.1
673	0.1
674	0.11
675	0.1
676	0.1
677	0.1
678	0.15
679	0.18
680	0.16
681	0.16
682	0.17
683	0.21
684	0.24
685	0.29
686	0.26
687	0.3
688	0.32
689	0.35
690	0.43
691	0.41
692	0.45
693	0.41
694	0.4
695	0.37
696	0.36
697	0.4
698	0.38
699	0.42
700	0.43
701	0.47
702	0.47
703	0.43
704	0.43
705	0.37
706	0.36
707	0.32
708	0.24
709	0.21
710	0.22
711	0.22
712	0.21
713	0.2
714	0.17
715	0.16
716	0.16
717	0.15
718	0.12
719	0.14
720	0.16
721	0.17

A0A2N1JC72

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer