Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R3E4

Protein Details
Accession C4R3E4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
310-331LEAWRRLQKRNVEKKAIRNFQGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG ppa:PAS_chr3_0051  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MTDAKDKDHKYRYRMEIQQMMFVSGETNDPPVETTSLIEDIVRSQVVEIVLHSSQTALSRGTKSIVPEDVIFLIRHDKAKVNRLRTYLSWKDVRKNAKDQQSGDLADIGGDDLLDNSTSQVAASGAPGAPGSSSSTSMDSKMLSKYKKSKIRLPWELQFVFTEQPLDTNEDDAEDEDERAATLASLKRLKTNDERTKNMTKEEYVHWSECRQASFTFRKAKRFREWCGLSHLAESRPSDDVIDILGFLTFEMVCSITEEALIVKMLEEQNGDLASSTTTIQKLQESHRKRKHLFDGPDKDVRPITSGHVLEAWRRLQKRNVEKKAIRNFQGGKLRSRVQLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.73
3 0.72
4 0.66
5 0.66
6 0.56
7 0.5
8 0.4
9 0.32
10 0.24
11 0.16
12 0.17
13 0.11
14 0.12
15 0.1
16 0.1
17 0.12
18 0.13
19 0.14
20 0.12
21 0.12
22 0.14
23 0.14
24 0.14
25 0.13
26 0.11
27 0.11
28 0.13
29 0.12
30 0.09
31 0.09
32 0.11
33 0.12
34 0.12
35 0.11
36 0.13
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.1
41 0.11
42 0.12
43 0.13
44 0.11
45 0.15
46 0.17
47 0.18
48 0.2
49 0.21
50 0.22
51 0.24
52 0.24
53 0.22
54 0.2
55 0.21
56 0.2
57 0.2
58 0.18
59 0.14
60 0.17
61 0.17
62 0.19
63 0.19
64 0.24
65 0.28
66 0.38
67 0.44
68 0.47
69 0.51
70 0.52
71 0.54
72 0.5
73 0.54
74 0.5
75 0.49
76 0.49
77 0.47
78 0.52
79 0.55
80 0.61
81 0.57
82 0.61
83 0.62
84 0.64
85 0.66
86 0.61
87 0.58
88 0.54
89 0.49
90 0.4
91 0.33
92 0.23
93 0.17
94 0.15
95 0.1
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.03
100 0.03
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.08
119 0.07
120 0.09
121 0.1
122 0.12
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.12
127 0.13
128 0.16
129 0.2
130 0.2
131 0.25
132 0.34
133 0.42
134 0.5
135 0.53
136 0.57
137 0.61
138 0.7
139 0.72
140 0.69
141 0.65
142 0.63
143 0.59
144 0.51
145 0.42
146 0.33
147 0.25
148 0.19
149 0.16
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.03
169 0.06
170 0.08
171 0.12
172 0.15
173 0.15
174 0.2
175 0.21
176 0.25
177 0.31
178 0.4
179 0.46
180 0.49
181 0.53
182 0.55
183 0.62
184 0.59
185 0.54
186 0.45
187 0.36
188 0.33
189 0.32
190 0.32
191 0.28
192 0.28
193 0.26
194 0.25
195 0.28
196 0.27
197 0.25
198 0.2
199 0.18
200 0.23
201 0.28
202 0.33
203 0.39
204 0.41
205 0.5
206 0.54
207 0.61
208 0.64
209 0.65
210 0.64
211 0.64
212 0.65
213 0.57
214 0.59
215 0.54
216 0.44
217 0.4
218 0.37
219 0.28
220 0.27
221 0.26
222 0.2
223 0.19
224 0.18
225 0.16
226 0.13
227 0.12
228 0.1
229 0.09
230 0.07
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.07
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.05
250 0.05
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.11
255 0.1
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.1
265 0.1
266 0.12
267 0.13
268 0.16
269 0.19
270 0.27
271 0.37
272 0.43
273 0.54
274 0.62
275 0.7
276 0.7
277 0.76
278 0.77
279 0.77
280 0.78
281 0.78
282 0.78
283 0.74
284 0.79
285 0.7
286 0.62
287 0.55
288 0.46
289 0.37
290 0.3
291 0.28
292 0.28
293 0.27
294 0.26
295 0.27
296 0.27
297 0.29
298 0.33
299 0.34
300 0.34
301 0.37
302 0.41
303 0.46
304 0.55
305 0.63
306 0.68
307 0.73
308 0.76
309 0.79
310 0.84
311 0.87
312 0.86
313 0.79
314 0.77
315 0.71
316 0.7
317 0.72
318 0.65
319 0.61
320 0.59
321 0.6