Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N1JDC9

Protein Details
Accession A0A2N1JDC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-59APVKKVTPLAPKPKKRVRIHEAADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-54SAPVRSAGARKPSHGKVPISSASKSRAAAPVKKVTPLAPKPKKRVRI
Subcellular Location(s) mito_nucl 12.166, nucl 12, mito 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MRTAVKRSAPVRSAGARKPSHGKVPISSASKSRAAAPVKKVTPLAPKPKKRVRIHEAADILDAKKARKATVESEEEDDATLEGFDEPDSDSEDAEDDVLATRAAPSVGEIVRLPNSRDDAVVRQRLDQAKSRHAERSDGETGVVYIGRLPHGFFETQLKAYFSQFGDIRRLRLSRNKKTGHSKHYAFIEFDAKEVAEIVVDTMNNYLLDGHLVQMAMIPDRDVNPNMWIGANRTFRKVPTDRIERLSASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.57
3 0.5
4 0.53
5 0.57
6 0.56
7 0.57
8 0.57
9 0.54
10 0.48
11 0.53
12 0.55
13 0.51
14 0.48
15 0.43
16 0.41
17 0.41
18 0.38
19 0.34
20 0.35
21 0.37
22 0.42
23 0.45
24 0.5
25 0.48
26 0.5
27 0.48
28 0.45
29 0.49
30 0.51
31 0.55
32 0.56
33 0.64
34 0.71
35 0.79
36 0.85
37 0.83
38 0.84
39 0.81
40 0.81
41 0.76
42 0.74
43 0.67
44 0.57
45 0.51
46 0.42
47 0.34
48 0.26
49 0.23
50 0.16
51 0.17
52 0.17
53 0.17
54 0.19
55 0.22
56 0.25
57 0.32
58 0.36
59 0.34
60 0.36
61 0.36
62 0.31
63 0.28
64 0.22
65 0.14
66 0.1
67 0.07
68 0.05
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.05
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.07
82 0.06
83 0.04
84 0.04
85 0.05
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.13
99 0.14
100 0.14
101 0.13
102 0.15
103 0.15
104 0.15
105 0.15
106 0.17
107 0.22
108 0.26
109 0.25
110 0.24
111 0.28
112 0.31
113 0.31
114 0.33
115 0.31
116 0.33
117 0.35
118 0.36
119 0.37
120 0.34
121 0.35
122 0.29
123 0.33
124 0.28
125 0.26
126 0.24
127 0.19
128 0.18
129 0.15
130 0.14
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.14
142 0.15
143 0.16
144 0.17
145 0.17
146 0.17
147 0.17
148 0.2
149 0.15
150 0.17
151 0.17
152 0.18
153 0.25
154 0.25
155 0.27
156 0.27
157 0.28
158 0.29
159 0.37
160 0.46
161 0.47
162 0.56
163 0.59
164 0.63
165 0.72
166 0.77
167 0.76
168 0.74
169 0.66
170 0.61
171 0.62
172 0.57
173 0.47
174 0.4
175 0.38
176 0.29
177 0.27
178 0.23
179 0.17
180 0.14
181 0.14
182 0.11
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.06
190 0.08
191 0.07
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.08
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.12
208 0.16
209 0.15
210 0.16
211 0.17
212 0.18
213 0.18
214 0.18
215 0.18
216 0.18
217 0.25
218 0.33
219 0.33
220 0.37
221 0.39
222 0.39
223 0.47
224 0.48
225 0.49
226 0.5
227 0.57
228 0.57
229 0.6
230 0.63