Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N1JHA4

Protein Details
Accession A0A2N1JHA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
563-585AEARRARKEAVKQQKQARREEKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
565-587ARRARKEAVKQQKQARREEKAAT
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 8.5, cyto_nucl 6.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MRKSIWRQPHATHFQVVHRSQRDQNFEAGPHVLKSVTPLNDRKGKSRADLAKEDPSLAHEDPNSTHRKNLGEAALYGIYYEDTDYDYMQHLRPVGDTENSRHGGMDEVDDTDTIWIPSSKPEPKPAPFALKEGEEAKQDNGLLLPASVFASEEKPYSHTAQFDEDPMLQGLQPDMDPHLRQTLEALEDDAFVDDGLGDNFFGDLLQDGAWDGKRGQDDTWRDEAPEGDAIYMDMAERARRERDALQAQGGSSALDELSLAARVALFKQQQASAAPDDSSDTEYASEARDDVHSLASFGRHARPAGSVSSTGSALGGIGKPGALARRAASTRAASEGGASSVWSMSSSSMARNKGLTELDEQFDRVLKTYDEAEDDAFFDEDEAETRGDFDSIMDEFLDTQEVIAGKLKQRLGARDATWDEKLDILRKELGEAHLTDNNEDASSPAAENPFLNPSIIGRDREKWDVQTIQSTKTNLENHPRTIVASSVGANTRHTPKCIVDPRAKHEADKIPKIRIDARTGVPRVVGYTHSASAPPKEVHGESEEDYSSDTVPVTIKRDRNESAEARRARKEAVKQQKQARREEKAATKHIFQEERKRQLHAERRQVESMGGGPAVHLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.61
3 0.59
4 0.58
5 0.55
6 0.56
7 0.58
8 0.63
9 0.63
10 0.56
11 0.58
12 0.52
13 0.48
14 0.45
15 0.41
16 0.34
17 0.27
18 0.26
19 0.2
20 0.16
21 0.19
22 0.23
23 0.25
24 0.31
25 0.36
26 0.42
27 0.51
28 0.54
29 0.56
30 0.56
31 0.55
32 0.52
33 0.57
34 0.58
35 0.57
36 0.61
37 0.6
38 0.61
39 0.58
40 0.54
41 0.44
42 0.38
43 0.37
44 0.3
45 0.29
46 0.21
47 0.23
48 0.24
49 0.31
50 0.36
51 0.31
52 0.34
53 0.34
54 0.36
55 0.36
56 0.4
57 0.37
58 0.32
59 0.31
60 0.32
61 0.28
62 0.25
63 0.22
64 0.16
65 0.12
66 0.1
67 0.1
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.12
74 0.14
75 0.15
76 0.17
77 0.17
78 0.17
79 0.17
80 0.19
81 0.19
82 0.22
83 0.24
84 0.26
85 0.32
86 0.34
87 0.33
88 0.3
89 0.27
90 0.25
91 0.23
92 0.21
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.12
99 0.11
100 0.09
101 0.09
102 0.08
103 0.09
104 0.13
105 0.2
106 0.27
107 0.29
108 0.38
109 0.44
110 0.47
111 0.54
112 0.54
113 0.56
114 0.5
115 0.5
116 0.44
117 0.38
118 0.37
119 0.32
120 0.29
121 0.23
122 0.23
123 0.2
124 0.2
125 0.18
126 0.16
127 0.14
128 0.12
129 0.1
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.13
142 0.16
143 0.2
144 0.21
145 0.2
146 0.21
147 0.25
148 0.25
149 0.24
150 0.23
151 0.2
152 0.19
153 0.18
154 0.16
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.09
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.17
166 0.17
167 0.17
168 0.17
169 0.17
170 0.16
171 0.15
172 0.15
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.08
178 0.06
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.1
200 0.11
201 0.13
202 0.13
203 0.2
204 0.24
205 0.28
206 0.33
207 0.3
208 0.29
209 0.28
210 0.27
211 0.21
212 0.19
213 0.14
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.06
223 0.07
224 0.1
225 0.11
226 0.12
227 0.15
228 0.17
229 0.24
230 0.28
231 0.29
232 0.28
233 0.27
234 0.26
235 0.24
236 0.21
237 0.13
238 0.08
239 0.07
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.09
252 0.1
253 0.11
254 0.12
255 0.13
256 0.14
257 0.15
258 0.17
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.11
263 0.12
264 0.11
265 0.12
266 0.09
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.12
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.11
297 0.09
298 0.08
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.03
306 0.04
307 0.04
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.11
313 0.12
314 0.13
315 0.15
316 0.14
317 0.14
318 0.16
319 0.15
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.06
333 0.07
334 0.1
335 0.14
336 0.16
337 0.16
338 0.16
339 0.17
340 0.17
341 0.17
342 0.16
343 0.15
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.16
348 0.13
349 0.15
350 0.14
351 0.1
352 0.09
353 0.08
354 0.09
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.11
362 0.1
363 0.09
364 0.08
365 0.06
366 0.06
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.09
391 0.11
392 0.13
393 0.19
394 0.19
395 0.22
396 0.25
397 0.28
398 0.29
399 0.32
400 0.3
401 0.31
402 0.33
403 0.32
404 0.3
405 0.28
406 0.24
407 0.21
408 0.22
409 0.21
410 0.19
411 0.18
412 0.2
413 0.19
414 0.2
415 0.2
416 0.2
417 0.18
418 0.18
419 0.19
420 0.2
421 0.2
422 0.19
423 0.17
424 0.16
425 0.14
426 0.12
427 0.09
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.09
433 0.1
434 0.1
435 0.11
436 0.12
437 0.12
438 0.12
439 0.1
440 0.1
441 0.17
442 0.2
443 0.21
444 0.22
445 0.27
446 0.31
447 0.36
448 0.37
449 0.32
450 0.35
451 0.36
452 0.34
453 0.38
454 0.36
455 0.35
456 0.37
457 0.36
458 0.32
459 0.35
460 0.38
461 0.33
462 0.42
463 0.42
464 0.41
465 0.42
466 0.41
467 0.36
468 0.32
469 0.28
470 0.19
471 0.16
472 0.14
473 0.14
474 0.17
475 0.17
476 0.18
477 0.21
478 0.28
479 0.29
480 0.3
481 0.3
482 0.3
483 0.39
484 0.46
485 0.49
486 0.5
487 0.54
488 0.58
489 0.65
490 0.63
491 0.54
492 0.53
493 0.56
494 0.55
495 0.59
496 0.57
497 0.53
498 0.54
499 0.57
500 0.56
501 0.51
502 0.49
503 0.45
504 0.46
505 0.49
506 0.49
507 0.46
508 0.39
509 0.35
510 0.3
511 0.26
512 0.22
513 0.17
514 0.19
515 0.19
516 0.19
517 0.21
518 0.21
519 0.22
520 0.26
521 0.23
522 0.21
523 0.25
524 0.25
525 0.26
526 0.27
527 0.27
528 0.23
529 0.26
530 0.24
531 0.2
532 0.21
533 0.18
534 0.16
535 0.13
536 0.11
537 0.09
538 0.11
539 0.14
540 0.18
541 0.25
542 0.29
543 0.32
544 0.39
545 0.41
546 0.44
547 0.49
548 0.51
549 0.53
550 0.57
551 0.61
552 0.59
553 0.62
554 0.59
555 0.56
556 0.56
557 0.57
558 0.59
559 0.63
560 0.68
561 0.71
562 0.8
563 0.83
564 0.82
565 0.83
566 0.81
567 0.78
568 0.74
569 0.75
570 0.74
571 0.74
572 0.77
573 0.7
574 0.65
575 0.63
576 0.65
577 0.64
578 0.61
579 0.64
580 0.65
581 0.71
582 0.69
583 0.66
584 0.63
585 0.66
586 0.7
587 0.69
588 0.7
589 0.66
590 0.7
591 0.69
592 0.64
593 0.54
594 0.45
595 0.37
596 0.29
597 0.23
598 0.16