Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N1JFJ8

Protein Details
Accession A0A2N1JFJ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-355HAPSAPHRGQKRKGRGRGRPSDSRAWDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
290-298RRAKDARRG
334-350PHRGQKRKGRGRGRPSD
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 8.5, pero 6, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MGANVSKYWNNEDGQGAAPTSSQIVTQPQSTAQTAECETENQDALHSEHASSREDADFLAEKRKLVQQLRDAQTSSPDKTDNPLYSELALAGLRDERQDDDDDLCDSDDSSDNEVTLEAHQADDEDYAPPATKNELRAEQIFMPTITQVAEEEIRLLVRIGKIHSIVDNVVVVEQESETTADDMGKREFDVLDSESLLCTKDGRVIGFVYETFGSVHAPMYSVRFPSAVDIDPAVCQTGESVYFHPYSSNYVLNYTIRNKGSDASNMWDEEVAEDEAEYSDDEQEVLAKRRAKDARRGKPDTETAPLETSDELDPADALLGPLGAFSAHAPSAPHRGQKRKGRGRGRPSDSRAWDAESGAKRARFQGPAAPHFNPRFAEQWMHMPASLYGAPGGAPIFPPMPVPMPMPEHAPWADGYSPHNPAPGAGTQIRTNLPYTPAQPDRKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.22
4 0.18
5 0.17
6 0.14
7 0.14
8 0.12
9 0.1
10 0.1
11 0.16
12 0.18
13 0.19
14 0.2
15 0.21
16 0.25
17 0.26
18 0.25
19 0.21
20 0.22
21 0.22
22 0.22
23 0.21
24 0.18
25 0.2
26 0.21
27 0.21
28 0.17
29 0.17
30 0.17
31 0.17
32 0.2
33 0.18
34 0.16
35 0.18
36 0.2
37 0.22
38 0.21
39 0.23
40 0.2
41 0.19
42 0.18
43 0.19
44 0.21
45 0.19
46 0.27
47 0.25
48 0.24
49 0.27
50 0.33
51 0.37
52 0.39
53 0.45
54 0.46
55 0.55
56 0.6
57 0.61
58 0.56
59 0.48
60 0.51
61 0.48
62 0.41
63 0.34
64 0.3
65 0.27
66 0.3
67 0.37
68 0.31
69 0.3
70 0.31
71 0.29
72 0.28
73 0.27
74 0.23
75 0.17
76 0.15
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.11
83 0.11
84 0.13
85 0.16
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.18
90 0.17
91 0.16
92 0.13
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.13
97 0.15
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.11
104 0.11
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.12
119 0.13
120 0.16
121 0.21
122 0.24
123 0.26
124 0.27
125 0.3
126 0.28
127 0.27
128 0.24
129 0.19
130 0.17
131 0.13
132 0.12
133 0.09
134 0.07
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.13
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.12
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.07
228 0.08
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.14
235 0.15
236 0.15
237 0.13
238 0.14
239 0.15
240 0.16
241 0.18
242 0.18
243 0.21
244 0.2
245 0.21
246 0.2
247 0.21
248 0.22
249 0.22
250 0.21
251 0.18
252 0.19
253 0.19
254 0.18
255 0.16
256 0.14
257 0.11
258 0.11
259 0.08
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.07
272 0.09
273 0.13
274 0.17
275 0.21
276 0.22
277 0.31
278 0.38
279 0.4
280 0.48
281 0.55
282 0.61
283 0.67
284 0.72
285 0.65
286 0.64
287 0.65
288 0.58
289 0.52
290 0.44
291 0.36
292 0.31
293 0.29
294 0.24
295 0.19
296 0.18
297 0.13
298 0.11
299 0.09
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.07
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.04
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.08
318 0.1
319 0.18
320 0.21
321 0.28
322 0.33
323 0.42
324 0.51
325 0.61
326 0.7
327 0.73
328 0.8
329 0.83
330 0.86
331 0.88
332 0.89
333 0.87
334 0.85
335 0.81
336 0.81
337 0.74
338 0.69
339 0.59
340 0.53
341 0.46
342 0.37
343 0.38
344 0.32
345 0.32
346 0.32
347 0.32
348 0.3
349 0.34
350 0.38
351 0.33
352 0.32
353 0.35
354 0.39
355 0.44
356 0.49
357 0.46
358 0.48
359 0.47
360 0.49
361 0.43
362 0.38
363 0.34
364 0.3
365 0.32
366 0.26
367 0.32
368 0.32
369 0.32
370 0.29
371 0.27
372 0.25
373 0.25
374 0.24
375 0.17
376 0.13
377 0.12
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.07
382 0.07
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.1
387 0.12
388 0.14
389 0.15
390 0.17
391 0.19
392 0.23
393 0.24
394 0.28
395 0.27
396 0.29
397 0.27
398 0.26
399 0.23
400 0.22
401 0.23
402 0.2
403 0.23
404 0.24
405 0.28
406 0.28
407 0.29
408 0.25
409 0.24
410 0.27
411 0.25
412 0.26
413 0.24
414 0.26
415 0.26
416 0.3
417 0.32
418 0.3
419 0.29
420 0.26
421 0.26
422 0.28
423 0.3
424 0.35
425 0.42