Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3NHV6

Protein Details
Accession J3NHV6    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-106VERREDAERRAKKRRQQPASSAEHydrophilic
215-235EGSSRASRKKRIKGPPGPLRLBasic
414-437IETSARSRGNRRIKKEIKHHSSDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-98RRAKKRR
219-234RASRKKRIKGPPGPLR
424-428RRIKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.5, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026846  Nse2(Mms21)  
IPR004181  Znf_MIZ  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0019789  F:SUMO transferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0016925  P:protein sumoylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF11789  zf-Nse  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51044  ZF_SP_RING  
CDD cd16651  SPL-RING_NSE2  
Amino Acid Sequences MSSSRRLVQSGASSAARRHGRERPDAGLEMPPYERPAFSMSDPARQTLAGLANNTADLAELERTLASLSKLLPTAISSINDRLVERREDAERRAKKRRQQPASSAEIPEADARVEEALARLEGVVPGLSADIEAAARDAINYRYATEDTRQSLREVHASVQAQPSQAAAAAAAASANGGNDQRLRFQDVEDVDDFLSSTQRAAADEDADENGEAEGSSRASRKKRIKGPPGPLRLYAESRKAKAAEFEALSAYDKYGQNNDYVSLKKHWHDALHPDGTQNLPDAHRWFDSDGNPVLPAAGGDGRAEGRDDDDDDLIVAGVSDSLKCPITLRGFEEPFSNNKCKHTFEKSAIVDMLTRGNGAPIACPVGGCPAAFTLNDFFNDLVMKRRVDRANQRAEEEESGSEDEGADGPSMIETSARSRGNRRIKKEIKHHSSDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.39
3 0.4
4 0.37
5 0.4
6 0.43
7 0.48
8 0.56
9 0.59
10 0.56
11 0.56
12 0.54
13 0.5
14 0.48
15 0.41
16 0.34
17 0.31
18 0.27
19 0.25
20 0.25
21 0.23
22 0.19
23 0.21
24 0.22
25 0.21
26 0.3
27 0.27
28 0.34
29 0.35
30 0.35
31 0.33
32 0.29
33 0.29
34 0.24
35 0.27
36 0.21
37 0.21
38 0.21
39 0.2
40 0.2
41 0.2
42 0.15
43 0.1
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.08
54 0.1
55 0.1
56 0.13
57 0.14
58 0.13
59 0.13
60 0.13
61 0.15
62 0.16
63 0.17
64 0.17
65 0.18
66 0.21
67 0.22
68 0.22
69 0.22
70 0.24
71 0.25
72 0.25
73 0.26
74 0.29
75 0.32
76 0.37
77 0.45
78 0.49
79 0.54
80 0.63
81 0.67
82 0.7
83 0.76
84 0.81
85 0.81
86 0.8
87 0.81
88 0.78
89 0.78
90 0.73
91 0.64
92 0.53
93 0.44
94 0.36
95 0.28
96 0.21
97 0.12
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.06
126 0.06
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.13
131 0.14
132 0.16
133 0.17
134 0.21
135 0.21
136 0.24
137 0.24
138 0.23
139 0.25
140 0.24
141 0.25
142 0.22
143 0.2
144 0.23
145 0.23
146 0.24
147 0.25
148 0.25
149 0.21
150 0.2
151 0.18
152 0.12
153 0.12
154 0.09
155 0.06
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.05
167 0.07
168 0.08
169 0.11
170 0.12
171 0.16
172 0.15
173 0.16
174 0.2
175 0.18
176 0.21
177 0.19
178 0.19
179 0.15
180 0.15
181 0.14
182 0.09
183 0.09
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.06
205 0.08
206 0.13
207 0.16
208 0.26
209 0.34
210 0.42
211 0.51
212 0.6
213 0.69
214 0.73
215 0.8
216 0.81
217 0.8
218 0.73
219 0.65
220 0.58
221 0.5
222 0.46
223 0.38
224 0.37
225 0.33
226 0.32
227 0.33
228 0.3
229 0.28
230 0.26
231 0.25
232 0.2
233 0.17
234 0.17
235 0.14
236 0.14
237 0.15
238 0.13
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.15
244 0.16
245 0.15
246 0.16
247 0.17
248 0.15
249 0.15
250 0.17
251 0.18
252 0.2
253 0.2
254 0.24
255 0.26
256 0.24
257 0.26
258 0.3
259 0.33
260 0.34
261 0.33
262 0.28
263 0.27
264 0.26
265 0.23
266 0.18
267 0.13
268 0.11
269 0.13
270 0.14
271 0.16
272 0.16
273 0.17
274 0.17
275 0.19
276 0.2
277 0.21
278 0.21
279 0.19
280 0.18
281 0.17
282 0.15
283 0.11
284 0.09
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.07
294 0.08
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.08
303 0.06
304 0.05
305 0.03
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.07
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.14
315 0.19
316 0.21
317 0.25
318 0.31
319 0.32
320 0.33
321 0.34
322 0.31
323 0.32
324 0.36
325 0.38
326 0.32
327 0.37
328 0.4
329 0.42
330 0.47
331 0.49
332 0.51
333 0.5
334 0.57
335 0.53
336 0.53
337 0.48
338 0.42
339 0.34
340 0.27
341 0.25
342 0.15
343 0.14
344 0.1
345 0.1
346 0.12
347 0.11
348 0.11
349 0.09
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.14
355 0.15
356 0.14
357 0.13
358 0.12
359 0.13
360 0.13
361 0.15
362 0.13
363 0.14
364 0.15
365 0.16
366 0.14
367 0.14
368 0.16
369 0.14
370 0.19
371 0.21
372 0.22
373 0.23
374 0.32
375 0.36
376 0.44
377 0.54
378 0.57
379 0.64
380 0.65
381 0.66
382 0.61
383 0.6
384 0.53
385 0.45
386 0.36
387 0.28
388 0.26
389 0.23
390 0.19
391 0.15
392 0.13
393 0.12
394 0.12
395 0.09
396 0.08
397 0.07
398 0.07
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.11
404 0.19
405 0.23
406 0.26
407 0.33
408 0.43
409 0.54
410 0.62
411 0.66
412 0.7
413 0.75
414 0.82
415 0.86
416 0.87
417 0.85