Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2G8S5Z4

Protein Details
Accession A0A2G8S5Z4    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-32TAEASRPPKSKGKDKEKEKKSKSSGSGQKSHydrophilic
366-392SGAGVERKSRREREKEREKDKEKEKDSBasic
410-429APAPKAKEEKRERGSRRGGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-27RPPKSKGKDKEKEKKSKSSG
226-261TKKGDKKKEGAGGPSAKEKAGDSVAGPSKKGPKKGV
284-305KGPGAKQGASKPPKPPRERKGG
372-389RKSRREREKEREKDKEKE
412-429APKAKEEKRERGSRRGGA
479-494AGRGRGRGRGRGRGRG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSTAEASRPPKSKGKDKEKEKKSKSSGSGQKSQTERLKTVVRRLPPNLPEDVFWQSVGKWVSEETVSWRAYYPGKFKTRLNKENIPSRAYIAFRNEQILASFSREYDGHVFRDKNGNESIAVVEFAPFQKVPNEKKKADSRAGTIEKDEDYVSFLESLKEVSTKPFDADTLETLIASTQPAPLPTTTPLLEALKAEKSAQKDKEAILRNHAHYKDPAALAAAAASTKKGDKKKEGAGGPSAKEKAGDSVAGPSKKGPKKGVTGAKAAAQQQQGQVQSGASKDTKGPGAKQGASKPPKPPRERKGGSSTPGAAPAASSSSSAPASAPTATSTSTAAASAPGDSAPAPSRRSRPVLGLASRQFEAALSGAGVERKSRREREKEREKDKEKEKDSGASTSTATVTAAAEGSSAPAPKAKEEKRERGSRRGGAPPTILQRDAAPKILARPAEGQGAAEGSAPGAGAASGNATEGGEPVASGGAGRGRGRGRGRGRGRGASTQGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.75
3 0.82
4 0.87
5 0.89
6 0.93
7 0.9
8 0.9
9 0.87
10 0.87
11 0.82
12 0.82
13 0.81
14 0.77
15 0.79
16 0.72
17 0.71
18 0.65
19 0.67
20 0.64
21 0.61
22 0.55
23 0.51
24 0.57
25 0.54
26 0.6
27 0.59
28 0.58
29 0.6
30 0.63
31 0.67
32 0.62
33 0.61
34 0.57
35 0.51
36 0.45
37 0.41
38 0.4
39 0.32
40 0.27
41 0.24
42 0.19
43 0.23
44 0.23
45 0.2
46 0.15
47 0.15
48 0.16
49 0.16
50 0.17
51 0.17
52 0.23
53 0.23
54 0.23
55 0.23
56 0.24
57 0.29
58 0.34
59 0.34
60 0.36
61 0.43
62 0.46
63 0.51
64 0.58
65 0.64
66 0.67
67 0.69
68 0.68
69 0.68
70 0.75
71 0.73
72 0.66
73 0.56
74 0.51
75 0.47
76 0.4
77 0.37
78 0.34
79 0.34
80 0.31
81 0.33
82 0.31
83 0.26
84 0.25
85 0.23
86 0.18
87 0.18
88 0.17
89 0.14
90 0.15
91 0.15
92 0.17
93 0.21
94 0.23
95 0.22
96 0.28
97 0.29
98 0.29
99 0.39
100 0.36
101 0.33
102 0.32
103 0.3
104 0.24
105 0.24
106 0.23
107 0.14
108 0.15
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.15
117 0.22
118 0.3
119 0.4
120 0.47
121 0.46
122 0.55
123 0.63
124 0.65
125 0.66
126 0.61
127 0.54
128 0.56
129 0.58
130 0.51
131 0.44
132 0.38
133 0.31
134 0.28
135 0.24
136 0.15
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.11
149 0.14
150 0.14
151 0.15
152 0.15
153 0.14
154 0.15
155 0.16
156 0.15
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.11
171 0.12
172 0.15
173 0.13
174 0.14
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.13
179 0.14
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.14
184 0.17
185 0.25
186 0.26
187 0.27
188 0.28
189 0.29
190 0.36
191 0.41
192 0.37
193 0.37
194 0.4
195 0.39
196 0.45
197 0.44
198 0.38
199 0.31
200 0.32
201 0.29
202 0.24
203 0.21
204 0.15
205 0.14
206 0.11
207 0.11
208 0.08
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.12
215 0.17
216 0.22
217 0.28
218 0.33
219 0.39
220 0.46
221 0.46
222 0.43
223 0.44
224 0.42
225 0.37
226 0.36
227 0.3
228 0.23
229 0.21
230 0.19
231 0.15
232 0.12
233 0.11
234 0.08
235 0.12
236 0.17
237 0.17
238 0.17
239 0.17
240 0.25
241 0.28
242 0.32
243 0.31
244 0.31
245 0.36
246 0.44
247 0.5
248 0.44
249 0.44
250 0.4
251 0.39
252 0.38
253 0.34
254 0.31
255 0.24
256 0.22
257 0.21
258 0.24
259 0.21
260 0.19
261 0.17
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.13
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.15
271 0.15
272 0.16
273 0.2
274 0.25
275 0.26
276 0.3
277 0.33
278 0.39
279 0.43
280 0.45
281 0.48
282 0.53
283 0.6
284 0.65
285 0.69
286 0.67
287 0.73
288 0.72
289 0.69
290 0.69
291 0.65
292 0.6
293 0.53
294 0.49
295 0.38
296 0.36
297 0.3
298 0.21
299 0.15
300 0.12
301 0.1
302 0.08
303 0.08
304 0.07
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.08
312 0.09
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.08
330 0.11
331 0.14
332 0.16
333 0.2
334 0.25
335 0.3
336 0.35
337 0.34
338 0.35
339 0.39
340 0.44
341 0.43
342 0.46
343 0.44
344 0.42
345 0.4
346 0.36
347 0.28
348 0.21
349 0.19
350 0.11
351 0.08
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.08
356 0.08
357 0.11
358 0.14
359 0.21
360 0.29
361 0.37
362 0.46
363 0.55
364 0.65
365 0.73
366 0.81
367 0.84
368 0.86
369 0.89
370 0.86
371 0.85
372 0.84
373 0.84
374 0.76
375 0.73
376 0.65
377 0.61
378 0.57
379 0.51
380 0.43
381 0.34
382 0.31
383 0.25
384 0.23
385 0.17
386 0.14
387 0.11
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.11
399 0.12
400 0.17
401 0.27
402 0.31
403 0.4
404 0.49
405 0.59
406 0.65
407 0.75
408 0.76
409 0.77
410 0.8
411 0.76
412 0.74
413 0.72
414 0.67
415 0.61
416 0.58
417 0.53
418 0.52
419 0.49
420 0.43
421 0.34
422 0.34
423 0.37
424 0.36
425 0.34
426 0.27
427 0.25
428 0.29
429 0.33
430 0.3
431 0.25
432 0.27
433 0.26
434 0.29
435 0.28
436 0.24
437 0.2
438 0.2
439 0.17
440 0.14
441 0.12
442 0.07
443 0.07
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.09
466 0.13
467 0.14
468 0.19
469 0.21
470 0.29
471 0.34
472 0.42
473 0.47
474 0.54
475 0.61
476 0.66
477 0.7
478 0.71
479 0.72
480 0.7