FuNGI

A0A2G8SSW1

Protein Details

Accession

A0A2G8SSW1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-128	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 13, cyto 8, nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIILPVIEGEQVKIPDEDGNEVDVPINMADPNPNGVEFDCLYLDMNGLVHPCTHPEGKPAPETEEDMMVEIFNYTERVVNMVRPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKEDARKESIAVWEAMGKTISEDEKNKTAWDSNAITPGTPFMDLLANSLRYWVVLKMNSDPGWKDLQVIISDASVPGEGEHKIMEFIRRQRSNPGYDPNIHHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFHQEGSRTACRICGQEGHYAKQCTGRKADIQKPPPEKKPFIFLDVSILREYLEAELNIPNMPFPFNLEQAIDDWVLLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWRAELPRMGGYLSNHGQLELSRAQIILEGLARREDDIFRRRREAEERQDQNAKRRKVEKEVGANGASVGPDPSLNLTASPAAPGSLPPRPDFAAKADSIGLGGPKTAETVAFTPTASLALAGSNRDVVANRAAIRLANMSAAEMLKAEMASLIPLKKSSKSATKSPAASFVAPPPAASAPASELPSALNATHPPTTVTSTDDVDIPGLGGVTPATSSATISETAMSVDPARPVENGADDVDGEEIAAEAEDSFMTDGTESRGAKRTIDEVEREDAEAPEELGRSDEDEAPAEADTSYALKVRPDGTVEQEDLVKLWEPGYRERYYRQKFDAEYSDLEFRKKVTKCYVEGMAWVLHYYYQGTASWQWYYPFHFAPFAADFEDLDEMNIGFTQGKPFKPFEQLMGVFPAASRTHIPATFHDLMTDESSPIIDFYPSTFQIDMNGKRMAWQGVVLLPFIDEKRLLDAMAPRYPNLTDDEQRRNQWGHNLLFVSEANPLYATMEALYGKRKKDDPLPISPKLSKGFNGALLPNPDCVPDSTFFSPLPTKNLPDIKKDRSLSAMYLYPKQLTPHHSVLLPGVRRPPPVLNAHDLEVARRGGPERNGVRGRGRGGFHSERGGRDSWDWQPHLNRNYRNGGEDGYSNGGSYQQQSSVNGPAGHQQQSSYQAYQGYQRGRGGGYQSQNNSRGQYNDFTAPSRGGRGGGRGNYGGRGGGGYNDNSSGGYGDQGGGFGGSRGGRGGYGGGGPGKAYNQGGYNQGGYNQGGGQGGYGAQGGYNAGGGYGYGGYGGDQQNSNYGQNNYGGYGGGGGGGNYGGPRGGYNNRGRGRGGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.61
3	0.65
4	0.67
5	0.62
6	0.58
7	0.54
8	0.49
9	0.46
10	0.42
11	0.35
12	0.32
13	0.28
14	0.25
15	0.21
16	0.2
17	0.17
18	0.19
19	0.21
20	0.18
21	0.21
22	0.19
23	0.2
24	0.19
25	0.16
26	0.15
27	0.12
28	0.12
29	0.08
30	0.09
31	0.11
32	0.12
33	0.15
34	0.15
35	0.15
36	0.15
37	0.15
38	0.19
39	0.17
40	0.18
41	0.15
42	0.14
43	0.15
44	0.14
45	0.14
46	0.1
47	0.1
48	0.09
49	0.1
50	0.1
51	0.1
52	0.1
53	0.13
54	0.17
55	0.2
56	0.2
57	0.27
58	0.33
59	0.36
60	0.41
61	0.4
62	0.4
63	0.39
64	0.42
65	0.36
66	0.33
67	0.28
68	0.24
69	0.22
70	0.17
71	0.15
72	0.11
73	0.09
74	0.07
75	0.08
76	0.07
77	0.09
78	0.1
79	0.13
80	0.14
81	0.21
82	0.3
83	0.38
84	0.41
85	0.42
86	0.44
87	0.44
88	0.44
89	0.42
90	0.34
91	0.29
92	0.29
93	0.25
94	0.25
95	0.21
96	0.21
97	0.18
98	0.16
99	0.12
100	0.14
101	0.2
102	0.27
103	0.37
104	0.46
105	0.55
106	0.66
107	0.75
108	0.8
109	0.82
110	0.79
111	0.76
112	0.77
113	0.77
114	0.75
115	0.78
116	0.72
117	0.69
118	0.72
119	0.68
120	0.62
121	0.61
122	0.56
123	0.5
124	0.48
125	0.44
126	0.39
127	0.41
128	0.38
129	0.29
130	0.26
131	0.24
132	0.22
133	0.22
134	0.19
135	0.14
136	0.12
137	0.15
138	0.17
139	0.18
140	0.22
141	0.26
142	0.3
143	0.31
144	0.31
145	0.3
146	0.31
147	0.28
148	0.31
149	0.3
150	0.28
151	0.33
152	0.32
153	0.3
154	0.26
155	0.26
156	0.21
157	0.17
158	0.14
159	0.09
160	0.12
161	0.12
162	0.15
163	0.17
164	0.17
165	0.17
166	0.18
167	0.17
168	0.14
169	0.15
170	0.15
171	0.16
172	0.18
173	0.2
174	0.24
175	0.3
176	0.31
177	0.32
178	0.31
179	0.28
180	0.3
181	0.28
182	0.26
183	0.22
184	0.23
185	0.21
186	0.21
187	0.19
188	0.14
189	0.15
190	0.12
191	0.11
192	0.08
193	0.07
194	0.06
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.1
201	0.11
202	0.16
203	0.2
204	0.28
205	0.38
206	0.41
207	0.43
208	0.51
209	0.56
210	0.59
211	0.58
212	0.59
213	0.54
214	0.55
215	0.59
216	0.55
217	0.53
218	0.46
219	0.39
220	0.32
221	0.27
222	0.22
223	0.17
224	0.11
225	0.07
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.05
230	0.04
231	0.03
232	0.03
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.06
237	0.08
238	0.09
239	0.14
240	0.16
241	0.16
242	0.2
243	0.23
244	0.26
245	0.28
246	0.3
247	0.29
248	0.31
249	0.31
250	0.26
251	0.24
252	0.23
253	0.25
254	0.25
255	0.22
256	0.18
257	0.21
258	0.23
259	0.24
260	0.23
261	0.24
262	0.24
263	0.32
264	0.34
265	0.36
266	0.4
267	0.39
268	0.38
269	0.41
270	0.42
271	0.38
272	0.39
273	0.38
274	0.4
275	0.48
276	0.56
277	0.57
278	0.6
279	0.65
280	0.7
281	0.73
282	0.75
283	0.74
284	0.71
285	0.63
286	0.63
287	0.57
288	0.52
289	0.46
290	0.37
291	0.37
292	0.33
293	0.33
294	0.25
295	0.23
296	0.18
297	0.16
298	0.16
299	0.1
300	0.1
301	0.08
302	0.1
303	0.11
304	0.11
305	0.12
306	0.11
307	0.1
308	0.09
309	0.1
310	0.08
311	0.12
312	0.14
313	0.15
314	0.16
315	0.16
316	0.16
317	0.16
318	0.18
319	0.13
320	0.1
321	0.09
322	0.08
323	0.07
324	0.06
325	0.05
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.04
332	0.06
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.08
338	0.09
339	0.12
340	0.13
341	0.13
342	0.12
343	0.13
344	0.12
345	0.12
346	0.11
347	0.08
348	0.06
349	0.09
350	0.1
351	0.09
352	0.09
353	0.1
354	0.14
355	0.17
356	0.19
357	0.18
358	0.21
359	0.21
360	0.22
361	0.22
362	0.19
363	0.17
364	0.21
365	0.2
366	0.19
367	0.18
368	0.17
369	0.17
370	0.15
371	0.19
372	0.14
373	0.14
374	0.12
375	0.12
376	0.11
377	0.12
378	0.12
379	0.08
380	0.09
381	0.09
382	0.09
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.11
387	0.12
388	0.17
389	0.26
390	0.33
391	0.35
392	0.4
393	0.41
394	0.44
395	0.5
396	0.53
397	0.54
398	0.57
399	0.58
400	0.58
401	0.65
402	0.62
403	0.64
404	0.63
405	0.56
406	0.53
407	0.56
408	0.56
409	0.57
410	0.62
411	0.6
412	0.6
413	0.6
414	0.57
415	0.49
416	0.45
417	0.36
418	0.29
419	0.21
420	0.12
421	0.09
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.06
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.07
434	0.06
435	0.06
436	0.07
437	0.1
438	0.12
439	0.14
440	0.14
441	0.17
442	0.18
443	0.19
444	0.19
445	0.19
446	0.2
447	0.18
448	0.19
449	0.17
450	0.15
451	0.14
452	0.13
453	0.1
454	0.06
455	0.06
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.06
462	0.07
463	0.09
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.09
468	0.09
469	0.07
470	0.06
471	0.04
472	0.05
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.07
481	0.08
482	0.1
483	0.11
484	0.11
485	0.11
486	0.11
487	0.11
488	0.11
489	0.09
490	0.08
491	0.07
492	0.06
493	0.07
494	0.07
495	0.06
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.05
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.08
508	0.1
509	0.11
510	0.14
511	0.18
512	0.24
513	0.28
514	0.34
515	0.39
516	0.43
517	0.44
518	0.42
519	0.44
520	0.37
521	0.34
522	0.28
523	0.24
524	0.23
525	0.2
526	0.19
527	0.15
528	0.13
529	0.13
530	0.12
531	0.1
532	0.08
533	0.11
534	0.12
535	0.1
536	0.1
537	0.09
538	0.1
539	0.1
540	0.08
541	0.06
542	0.06
543	0.09
544	0.09
545	0.1
546	0.1
547	0.11
548	0.13
549	0.13
550	0.14
551	0.13
552	0.13
553	0.13
554	0.12
555	0.11
556	0.09
557	0.08
558	0.06
559	0.05
560	0.04
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.04
570	0.04
571	0.06
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.06
581	0.07
582	0.07
583	0.08
584	0.07
585	0.08
586	0.08
587	0.08
588	0.08
589	0.08
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.06
594	0.05
595	0.05
596	0.03
597	0.03
598	0.02
599	0.02
600	0.02
601	0.02
602	0.02
603	0.02
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.05
611	0.09
612	0.09
613	0.11
614	0.16
615	0.17
616	0.17
617	0.18
618	0.19
619	0.19
620	0.21
621	0.21
622	0.18
623	0.2
624	0.2
625	0.19
626	0.17
627	0.14
628	0.12
629	0.1
630	0.09
631	0.07
632	0.07
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.06
637	0.08
638	0.08
639	0.08
640	0.09
641	0.09
642	0.09
643	0.09
644	0.08
645	0.06
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.06
651	0.06
652	0.06
653	0.08
654	0.09
655	0.1
656	0.11
657	0.12
658	0.15
659	0.17
660	0.17
661	0.16
662	0.15
663	0.14
664	0.12
665	0.12
666	0.08
667	0.06
668	0.07
669	0.08
670	0.09
671	0.14
672	0.2
673	0.21
674	0.22
675	0.27
676	0.37
677	0.4
678	0.44
679	0.42
680	0.42
681	0.41
682	0.43
683	0.43
684	0.36
685	0.32
686	0.29
687	0.31
688	0.27
689	0.26
690	0.23
691	0.19
692	0.24
693	0.24
694	0.27
695	0.29
696	0.34
697	0.35
698	0.39
699	0.41
700	0.32
701	0.32
702	0.29
703	0.21
704	0.16
705	0.14
706	0.1
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.06
711	0.06
712	0.06
713	0.08
714	0.1
715	0.11
716	0.12
717	0.12
718	0.13
719	0.14
720	0.17
721	0.18
722	0.18
723	0.17
724	0.17
725	0.16
726	0.18
727	0.18
728	0.15
729	0.13
730	0.12
731	0.11
732	0.11
733	0.12
734	0.09
735	0.07
736	0.07
737	0.05
738	0.05
739	0.05
740	0.05
741	0.04
742	0.05
743	0.11
744	0.14
745	0.16
746	0.19
747	0.22
748	0.23
749	0.29
750	0.3
751	0.26
752	0.29
753	0.29
754	0.27
755	0.27
756	0.25
757	0.18
758	0.18
759	0.18
760	0.11
761	0.12
762	0.12
763	0.12
764	0.15
765	0.16
766	0.18
767	0.17
768	0.26
769	0.26
770	0.25
771	0.23
772	0.21
773	0.21
774	0.21
775	0.2
776	0.11
777	0.09
778	0.09
779	0.09
780	0.09
781	0.08
782	0.05
783	0.05
784	0.07
785	0.11
786	0.11
787	0.13
788	0.13
789	0.13
790	0.17
791	0.24
792	0.24
793	0.24
794	0.25
795	0.23
796	0.24
797	0.27
798	0.23
799	0.17
800	0.15
801	0.12
802	0.14
803	0.14
804	0.12
805	0.1
806	0.09
807	0.1
808	0.1
809	0.1
810	0.07
811	0.07
812	0.11
813	0.11
814	0.11
815	0.12
816	0.17
817	0.2
818	0.25
819	0.25
820	0.22
821	0.23
822	0.24
823	0.23
824	0.22
825	0.22
826	0.23
827	0.29
828	0.37
829	0.41
830	0.42
831	0.45
832	0.42
833	0.39
834	0.41
835	0.41
836	0.34
837	0.33
838	0.32
839	0.28
840	0.28
841	0.26
842	0.2
843	0.16
844	0.14
845	0.1
846	0.1
847	0.1
848	0.09
849	0.09
850	0.08
851	0.06
852	0.07
853	0.07
854	0.08
855	0.16
856	0.19
857	0.21
858	0.24
859	0.27
860	0.29
861	0.37
862	0.47
863	0.45
864	0.52
865	0.58
866	0.58
867	0.6
868	0.58
869	0.54
870	0.47
871	0.43
872	0.33
873	0.3
874	0.28
875	0.26
876	0.27
877	0.24
878	0.25
879	0.27
880	0.27
881	0.23
882	0.21
883	0.19
884	0.17
885	0.17
886	0.17
887	0.14
888	0.19
889	0.2
890	0.21
891	0.21
892	0.23
893	0.26
894	0.24
895	0.3
896	0.27
897	0.27
898	0.32
899	0.41
900	0.4
901	0.45
902	0.51
903	0.5
904	0.56
905	0.55
906	0.5
907	0.46
908	0.46
909	0.38
910	0.34
911	0.32
912	0.27
913	0.29
914	0.29
915	0.27
916	0.26
917	0.27
918	0.28
919	0.29
920	0.34
921	0.33
922	0.34
923	0.32
924	0.32
925	0.33
926	0.35
927	0.31
928	0.27
929	0.31
930	0.31
931	0.32
932	0.35
933	0.34
934	0.33
935	0.38
936	0.4
937	0.38
938	0.38
939	0.38
940	0.39
941	0.35
942	0.3
943	0.27
944	0.23
945	0.18
946	0.17
947	0.18
948	0.18
949	0.21
950	0.29
951	0.29
952	0.37
953	0.39
954	0.41
955	0.45
956	0.44
957	0.45
958	0.42
959	0.41
960	0.35
961	0.4
962	0.42
963	0.38
964	0.42
965	0.41
966	0.37
967	0.39
968	0.37
969	0.31
970	0.29
971	0.32
972	0.31
973	0.36
974	0.36
975	0.37
976	0.44
977	0.5
978	0.56
979	0.59
980	0.57
981	0.56
982	0.62
983	0.59
984	0.54
985	0.48
986	0.41
987	0.35
988	0.3
989	0.27
990	0.22
991	0.2
992	0.17
993	0.16
994	0.16
995	0.15
996	0.17
997	0.15
998	0.15
999	0.17
1000	0.19
1001	0.21
1002	0.23
1003	0.26
1004	0.24
1005	0.23
1006	0.26
1007	0.29
1008	0.3
1009	0.28
1010	0.25
1011	0.25
1012	0.31
1013	0.34
1014	0.29
1015	0.26
1016	0.25
1017	0.26
1018	0.31
1019	0.34
1020	0.32
1021	0.32
1022	0.32
1023	0.32
1024	0.3
1025	0.32
1026	0.31
1027	0.32
1028	0.34
1029	0.37
1030	0.4
1031	0.46
1032	0.48
1033	0.48
1034	0.45
1035	0.41
1036	0.38
1037	0.35
1038	0.34
1039	0.31
1040	0.33
1041	0.33
1042	0.32
1043	0.32
1044	0.31
1045	0.28
1046	0.28
1047	0.24
1048	0.21
1049	0.21
1050	0.24
1051	0.29
1052	0.3
1053	0.32
1054	0.31
1055	0.31
1056	0.31
1057	0.3
1058	0.24
1059	0.17
1060	0.16
1061	0.12
1062	0.13
1063	0.15
1064	0.14
1065	0.15
1066	0.16
1067	0.16
1068	0.15
1069	0.15
1070	0.12
1071	0.09
1072	0.09
1073	0.08
1074	0.08
1075	0.08
1076	0.08
1077	0.08
1078	0.07
1079	0.07
1080	0.06
1081	0.08
1082	0.08
1083	0.08
1084	0.09
1085	0.09
1086	0.09
1087	0.1
1088	0.1
1089	0.09
1090	0.09
1091	0.11
1092	0.11
1093	0.11
1094	0.11
1095	0.12
1096	0.12
1097	0.14
1098	0.14
1099	0.14
1100	0.16
1101	0.18
1102	0.21
1103	0.22
1104	0.23
1105	0.21
1106	0.21
1107	0.22
1108	0.2
1109	0.19
1110	0.16
1111	0.16
1112	0.14
1113	0.13
1114	0.12
1115	0.1
1116	0.09
1117	0.08
1118	0.08
1119	0.06
1120	0.06
1121	0.06
1122	0.06
1123	0.06
1124	0.06
1125	0.05
1126	0.05
1127	0.05
1128	0.05
1129	0.06
1130	0.05
1131	0.05
1132	0.05
1133	0.05
1134	0.06
1135	0.12
1136	0.13
1137	0.15
1138	0.16
1139	0.17
1140	0.22
1141	0.25
1142	0.26
1143	0.26
1144	0.26
1145	0.25
1146	0.27
1147	0.28
1148	0.24
1149	0.21
1150	0.2
1151	0.14
1152	0.13
1153	0.11
1154	0.09
1155	0.08
1156	0.07
1157	0.07
1158	0.06
1159	0.07
1160	0.06
1161	0.06
1162	0.05
1163	0.06
1164	0.07
1165	0.12
1166	0.18
1167	0.26
1168	0.35
1169	0.44
1170	0.49
1171	0.51
1172	0.53

A0A2G8SSW1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer