Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PAP0

Protein Details
Accession J3PAP0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-38ASQLVNLRRSSRKRPSQPGPSPPSPKRRYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-36RSSRKRPSQPGPSPPSPKR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 11, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MARQTSATRASQLVNLRRSSRKRPSQPGPSPPSPKRRYEEDEDRTRVKPEDGNEDVQPSMKAAKSRTIKQEQTKDEPSLQKNPPPTTQPVPSSLSSLDTSLAARKLRLYYGTDGTHATTPASPFPDFAHPTAAECRLAHSILASLHGPRERPTNPPASGPAGRAGCGDAATVLDALVRTILSQNTTDANSARAKRAMDAAYGGRHDNWAAVAAGGTARLEDAIRCGGLAAAKSRVIISILERLRERHASSSSLSSLSSSPAVAKDDDEKNQNDSIYSLEHIRDLPTADAMRELLSFRGVGPKTASCVLLFCLGRDSFAVDTHVHRIAGLLGWRPPRATRDETHLHLDARVPDTDKYGLHVLMVTHGKRCAECKAGGRAAGRCELRKAFWGREV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.47
3 0.5
4 0.57
5 0.63
6 0.68
7 0.7
8 0.72
9 0.76
10 0.82
11 0.86
12 0.88
13 0.9
14 0.9
15 0.88
16 0.86
17 0.86
18 0.84
19 0.85
20 0.8
21 0.79
22 0.73
23 0.73
24 0.71
25 0.71
26 0.74
27 0.72
28 0.76
29 0.73
30 0.72
31 0.64
32 0.6
33 0.53
34 0.45
35 0.4
36 0.33
37 0.37
38 0.37
39 0.39
40 0.37
41 0.37
42 0.33
43 0.3
44 0.27
45 0.19
46 0.18
47 0.17
48 0.2
49 0.19
50 0.28
51 0.33
52 0.41
53 0.5
54 0.55
55 0.61
56 0.67
57 0.74
58 0.72
59 0.74
60 0.72
61 0.66
62 0.63
63 0.63
64 0.59
65 0.59
66 0.56
67 0.52
68 0.54
69 0.55
70 0.52
71 0.49
72 0.5
73 0.46
74 0.48
75 0.46
76 0.43
77 0.43
78 0.39
79 0.37
80 0.31
81 0.29
82 0.23
83 0.21
84 0.17
85 0.13
86 0.13
87 0.14
88 0.17
89 0.15
90 0.15
91 0.17
92 0.18
93 0.19
94 0.21
95 0.22
96 0.23
97 0.27
98 0.28
99 0.26
100 0.25
101 0.25
102 0.23
103 0.2
104 0.17
105 0.13
106 0.13
107 0.15
108 0.17
109 0.15
110 0.15
111 0.17
112 0.23
113 0.24
114 0.23
115 0.25
116 0.22
117 0.24
118 0.26
119 0.25
120 0.2
121 0.18
122 0.2
123 0.17
124 0.17
125 0.15
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.12
130 0.1
131 0.09
132 0.11
133 0.13
134 0.13
135 0.13
136 0.19
137 0.19
138 0.23
139 0.26
140 0.31
141 0.31
142 0.32
143 0.33
144 0.32
145 0.32
146 0.29
147 0.29
148 0.22
149 0.21
150 0.2
151 0.18
152 0.13
153 0.11
154 0.1
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.12
176 0.15
177 0.16
178 0.17
179 0.18
180 0.17
181 0.17
182 0.21
183 0.19
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.14
188 0.15
189 0.15
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.16
226 0.16
227 0.19
228 0.19
229 0.2
230 0.23
231 0.26
232 0.26
233 0.22
234 0.23
235 0.23
236 0.24
237 0.26
238 0.23
239 0.21
240 0.19
241 0.16
242 0.14
243 0.13
244 0.12
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.11
251 0.16
252 0.19
253 0.22
254 0.25
255 0.26
256 0.27
257 0.28
258 0.27
259 0.22
260 0.18
261 0.17
262 0.14
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.13
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.17
285 0.16
286 0.17
287 0.19
288 0.2
289 0.22
290 0.24
291 0.24
292 0.16
293 0.17
294 0.17
295 0.2
296 0.19
297 0.16
298 0.2
299 0.19
300 0.19
301 0.19
302 0.2
303 0.14
304 0.15
305 0.17
306 0.13
307 0.16
308 0.19
309 0.21
310 0.18
311 0.17
312 0.17
313 0.15
314 0.16
315 0.17
316 0.16
317 0.19
318 0.23
319 0.24
320 0.25
321 0.27
322 0.29
323 0.33
324 0.36
325 0.34
326 0.38
327 0.43
328 0.45
329 0.49
330 0.48
331 0.42
332 0.37
333 0.38
334 0.35
335 0.31
336 0.3
337 0.26
338 0.24
339 0.27
340 0.28
341 0.24
342 0.23
343 0.23
344 0.21
345 0.19
346 0.2
347 0.16
348 0.2
349 0.27
350 0.24
351 0.24
352 0.27
353 0.28
354 0.28
355 0.31
356 0.31
357 0.3
358 0.34
359 0.38
360 0.45
361 0.47
362 0.49
363 0.51
364 0.48
365 0.47
366 0.49
367 0.47
368 0.41
369 0.43
370 0.43
371 0.41
372 0.46
373 0.48