FuNGI

A0A2G8S3C6

Protein Details

Accession

A0A2G8S3C6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
212-233	FARSSGKKKGPKCFKCHGKTGY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
243-272	RKGKGKGKDSGHGKGKNEARGGGKKEKKED

Subcellular Location(s)

cyto 10, mito 8, pero 5, nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MTTATDAAAQATRVRIDPLTGVEDWGSWSVQMEDLLYGLGLWGYVKEVNKPKPKDTEKPTKEETEKLDEWRKLDRSALSAIRMRVSKSLVHTLKWCTTSAEAWSRLEKNFEPKGILHVVQIRRKLLQAQYCESDDVEEFLRVMVGLRESLACMGFDLSEEEFSITLLTALPESWDPMVSSINHTRDLSDSDEIVSRIRQHASRINDSATALFARSSGKKKGPKCFKCHGKTGYQRDCPNHDSRKGKGKGKDSGHGKGKNEARGGGKKEKKEDPKALVAEESDSDSEYAFALLEEWDDSDSDEVALAARVAADAWVSDSATTVHVARRRADFSTYEPTPGRTLKGAGITPILGVGDINLEFEHEGRKTVIQLRDVVHAPAIPHNLIALGRVEAGGHKITMESGMIQFLNPKGQVYASGERVGNLYVMRAAVVPGKPADVACAAAVTRPKRVRTYDEWHRVLGHIGMKAVISMKKKGLVEGMEVDESVEPSQQCESCVRAKQTVAPYPKKSEMVVEAIGDLTVMDLWGKAPTTGIRGEKYFSTFTDMHSRRTVIEFSKTKTDELENFKAYQAHVQNVHGVKLKKIRCDNGGEYLSKDFTNYLRAEGIELDTTTPNSSAQNGVAKRVNRTVMDRALAILIEMDLPKFLWPEAVAHVAYLKNRSPTRALKDKTPEEVWSGRKPDVSDLQEWGVKCWVLTDRKKRTKLELKSQLMRFMGVAPGSKGWKYYDPKARRIGKSRNIIFAVPKRTQPAPDSDEDEYDLIELSTPTPLEGENVTGGEQASGGDRAPLTAQSTDAPAPAPPSKPTPVAPEPRTLRNIPRIDYKASEDGRGKVIKALTRAPVTTPSRDEEDEVEQLIDDPESHFLCLLTLHGTPTAREPRTFKEAMTLPEADQWRAAMDAEIAQLQKLGTWSMVDLPTDRKAIGCTWVYRIKENLEGEVKFKARLVAQGFSQIPGYDVFDTFAPVIRTDSVRTLLAIGTERNMEMRQFDVVGAYLNADLDEEIYMRQPPGYEDGTRKVLRLQKALYGLKQGGRKWNIHFNRIMVDELGFRRLNSDPCVYLRQDKHGLTIVGVHVDNMIALADTTALMDAFAAGLAKRVKITDLGMPSLLLGLEISRDRPSRTLSICQSQYILRVLERFGMADANPVSTPLDPNIKLVKTPDDADLSEMRDVPYQAAIGSLMYAALGTRPDISYAVQALSQYSSRPGPEHWTAVKRVLRYLKGTHNYGITFTGKGAPRLRAYYLNLRLEGYSDADWGSNPDDRRSISGYAFLVGNAVVAWSSKKQTTSGPP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.18
3	0.18
4	0.2
5	0.21
6	0.23
7	0.21
8	0.22
9	0.19
10	0.19
11	0.19
12	0.18
13	0.15
14	0.11
15	0.11
16	0.11
17	0.12
18	0.12
19	0.11
20	0.1
21	0.09
22	0.09
23	0.08
24	0.07
25	0.05
26	0.05
27	0.04
28	0.04
29	0.04
30	0.06
31	0.1
32	0.12
33	0.2
34	0.3
35	0.39
36	0.49
37	0.55
38	0.6
39	0.67
40	0.74
41	0.76
42	0.76
43	0.78
44	0.75
45	0.78
46	0.77
47	0.75
48	0.71
49	0.67
50	0.64
51	0.61
52	0.58
53	0.58
54	0.61
55	0.55
56	0.53
57	0.56
58	0.53
59	0.46
60	0.48
61	0.42
62	0.37
63	0.41
64	0.42
65	0.38
66	0.4
67	0.39
68	0.4
69	0.38
70	0.37
71	0.34
72	0.33
73	0.32
74	0.32
75	0.41
76	0.38
77	0.39
78	0.42
79	0.45
80	0.48
81	0.46
82	0.41
83	0.34
84	0.34
85	0.33
86	0.35
87	0.37
88	0.33
89	0.34
90	0.39
91	0.4
92	0.39
93	0.42
94	0.38
95	0.39
96	0.42
97	0.42
98	0.39
99	0.36
100	0.41
101	0.4
102	0.37
103	0.33
104	0.35
105	0.41
106	0.43
107	0.48
108	0.45
109	0.41
110	0.43
111	0.45
112	0.45
113	0.44
114	0.44
115	0.45
116	0.47
117	0.47
118	0.46
119	0.39
120	0.34
121	0.26
122	0.22
123	0.18
124	0.14
125	0.12
126	0.11
127	0.11
128	0.09
129	0.09
130	0.09
131	0.08
132	0.08
133	0.09
134	0.09
135	0.1
136	0.11
137	0.11
138	0.09
139	0.09
140	0.09
141	0.08
142	0.08
143	0.1
144	0.1
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.1
150	0.09
151	0.07
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.07
159	0.09
160	0.09
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.14
165	0.13
166	0.19
167	0.25
168	0.27
169	0.29
170	0.29
171	0.29
172	0.28
173	0.3
174	0.28
175	0.23
176	0.21
177	0.19
178	0.21
179	0.2
180	0.2
181	0.19
182	0.17
183	0.19
184	0.22
185	0.23
186	0.26
187	0.33
188	0.39
189	0.44
190	0.44
191	0.42
192	0.4
193	0.39
194	0.34
195	0.28
196	0.22
197	0.15
198	0.12
199	0.11
200	0.13
201	0.18
202	0.23
203	0.29
204	0.36
205	0.44
206	0.52
207	0.62
208	0.69
209	0.72
210	0.75
211	0.79
212	0.81
213	0.8
214	0.82
215	0.77
216	0.76
217	0.77
218	0.8
219	0.79
220	0.76
221	0.76
222	0.72
223	0.73
224	0.68
225	0.68
226	0.65
227	0.63
228	0.6
229	0.59
230	0.65
231	0.66
232	0.67
233	0.66
234	0.65
235	0.66
236	0.66
237	0.7
238	0.65
239	0.66
240	0.68
241	0.66
242	0.6
243	0.59
244	0.6
245	0.57
246	0.53
247	0.48
248	0.46
249	0.47
250	0.52
251	0.54
252	0.55
253	0.55
254	0.6
255	0.65
256	0.68
257	0.7
258	0.71
259	0.67
260	0.68
261	0.64
262	0.59
263	0.5
264	0.41
265	0.33
266	0.26
267	0.22
268	0.14
269	0.13
270	0.11
271	0.1
272	0.1
273	0.08
274	0.08
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.06
288	0.06
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.03
299	0.03
300	0.05
301	0.05
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.07
306	0.08
307	0.09
308	0.08
309	0.12
310	0.16
311	0.19
312	0.22
313	0.25
314	0.27
315	0.28
316	0.3
317	0.28
318	0.3
319	0.35
320	0.33
321	0.32
322	0.3
323	0.3
324	0.31
325	0.3
326	0.27
327	0.2
328	0.21
329	0.19
330	0.23
331	0.21
332	0.18
333	0.18
334	0.16
335	0.15
336	0.13
337	0.1
338	0.06
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.09
349	0.08
350	0.1
351	0.1
352	0.11
353	0.14
354	0.21
355	0.25
356	0.24
357	0.28
358	0.28
359	0.31
360	0.31
361	0.29
362	0.22
363	0.19
364	0.18
365	0.18
366	0.18
367	0.14
368	0.13
369	0.12
370	0.13
371	0.11
372	0.11
373	0.09
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.06
379	0.09
380	0.08
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.06
388	0.06
389	0.08
390	0.07
391	0.07
392	0.09
393	0.09
394	0.12
395	0.11
396	0.11
397	0.1
398	0.11
399	0.13
400	0.17
401	0.2
402	0.19
403	0.22
404	0.22
405	0.21
406	0.22
407	0.2
408	0.15
409	0.11
410	0.09
411	0.07
412	0.07
413	0.07
414	0.06
415	0.06
416	0.09
417	0.1
418	0.11
419	0.1
420	0.11
421	0.11
422	0.11
423	0.12
424	0.08
425	0.09
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.09
430	0.13
431	0.13
432	0.21
433	0.24
434	0.27
435	0.32
436	0.35
437	0.4
438	0.43
439	0.51
440	0.54
441	0.59
442	0.58
443	0.54
444	0.51
445	0.45
446	0.38
447	0.32
448	0.24
449	0.15
450	0.13
451	0.13
452	0.12
453	0.12
454	0.13
455	0.14
456	0.14
457	0.15
458	0.16
459	0.21
460	0.21
461	0.22
462	0.22
463	0.19
464	0.19
465	0.19
466	0.2
467	0.15
468	0.15
469	0.15
470	0.11
471	0.11
472	0.09
473	0.09
474	0.07
475	0.08
476	0.1
477	0.1
478	0.11
479	0.12
480	0.14
481	0.18
482	0.23
483	0.24
484	0.25
485	0.25
486	0.3
487	0.34
488	0.39
489	0.42
490	0.44
491	0.45
492	0.47
493	0.5
494	0.45
495	0.39
496	0.34
497	0.28
498	0.25
499	0.22
500	0.17
501	0.14
502	0.13
503	0.12
504	0.1
505	0.07
506	0.04
507	0.03
508	0.03
509	0.02
510	0.02
511	0.03
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.05
516	0.06
517	0.08
518	0.12
519	0.14
520	0.15
521	0.15
522	0.16
523	0.17
524	0.19
525	0.18
526	0.15
527	0.18
528	0.17
529	0.19
530	0.28
531	0.29
532	0.29
533	0.3
534	0.3
535	0.25
536	0.27
537	0.27
538	0.18
539	0.25
540	0.25
541	0.25
542	0.32
543	0.32
544	0.3
545	0.29
546	0.3
547	0.28
548	0.33
549	0.35
550	0.29
551	0.29
552	0.29
553	0.29
554	0.26
555	0.26
556	0.2
557	0.18
558	0.18
559	0.18
560	0.22
561	0.22
562	0.24
563	0.22
564	0.21
565	0.22
566	0.28
567	0.31
568	0.32
569	0.36
570	0.37
571	0.36
572	0.41
573	0.4
574	0.39
575	0.39
576	0.33
577	0.3
578	0.28
579	0.25
580	0.19
581	0.17
582	0.11
583	0.09
584	0.14
585	0.13
586	0.13
587	0.12
588	0.12
589	0.13
590	0.12
591	0.13
592	0.08
593	0.07
594	0.08
595	0.07
596	0.08
597	0.07
598	0.07
599	0.07
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.08
604	0.14
605	0.13
606	0.16
607	0.19
608	0.2
609	0.22
610	0.24
611	0.25
612	0.2
613	0.24
614	0.25
615	0.23
616	0.23
617	0.2
618	0.18
619	0.15
620	0.14
621	0.1
622	0.06
623	0.04
624	0.04
625	0.04
626	0.04
627	0.03
628	0.04
629	0.04
630	0.04
631	0.04
632	0.04
633	0.04
634	0.06
635	0.07
636	0.09
637	0.09
638	0.08
639	0.1
640	0.1
641	0.11
642	0.12
643	0.12
644	0.16
645	0.16
646	0.18
647	0.22
648	0.27
649	0.33
650	0.4
651	0.4
652	0.41
653	0.48
654	0.49
655	0.47
656	0.43
657	0.37
658	0.32
659	0.35
660	0.32
661	0.3
662	0.3
663	0.27
664	0.27
665	0.26
666	0.25
667	0.27
668	0.26
669	0.23
670	0.22
671	0.22
672	0.23
673	0.22
674	0.2
675	0.14
676	0.12
677	0.1
678	0.1
679	0.13
680	0.19
681	0.27
682	0.37
683	0.46
684	0.55
685	0.62
686	0.62
687	0.67
688	0.7
689	0.69
690	0.7
691	0.7
692	0.66
693	0.68
694	0.67
695	0.61
696	0.51
697	0.44
698	0.33
699	0.23
700	0.19
701	0.12
702	0.12
703	0.08
704	0.09
705	0.1
706	0.1
707	0.1
708	0.11
709	0.18
710	0.21
711	0.29
712	0.38
713	0.42
714	0.48
715	0.56
716	0.63
717	0.61
718	0.66
719	0.67
720	0.66
721	0.7
722	0.66
723	0.62
724	0.55
725	0.5
726	0.47
727	0.43
728	0.41
729	0.33
730	0.32
731	0.31
732	0.3
733	0.32
734	0.29
735	0.29
736	0.27
737	0.27
738	0.3
739	0.27
740	0.26
741	0.25
742	0.23
743	0.16
744	0.12
745	0.1
746	0.06
747	0.05
748	0.05
749	0.04
750	0.05
751	0.05
752	0.05
753	0.05
754	0.05
755	0.06
756	0.06
757	0.07
758	0.06
759	0.07
760	0.07
761	0.07
762	0.07
763	0.06
764	0.06
765	0.05
766	0.05
767	0.05
768	0.05
769	0.06
770	0.05
771	0.06
772	0.06
773	0.07
774	0.08
775	0.08
776	0.09
777	0.08
778	0.11
779	0.11
780	0.1
781	0.1
782	0.08
783	0.12
784	0.14
785	0.15
786	0.14
787	0.18
788	0.21
789	0.22
790	0.24
791	0.28
792	0.32
793	0.39
794	0.39
795	0.43
796	0.44
797	0.47
798	0.5
799	0.44
800	0.43
801	0.44
802	0.45
803	0.39
804	0.44
805	0.42
806	0.4
807	0.4
808	0.38
809	0.37
810	0.35
811	0.37
812	0.31
813	0.29
814	0.31
815	0.3
816	0.26
817	0.22
818	0.23
819	0.22
820	0.22
821	0.24
822	0.24
823	0.25
824	0.25
825	0.23
826	0.29
827	0.29
828	0.3
829	0.28
830	0.27
831	0.28
832	0.29
833	0.29
834	0.23
835	0.23
836	0.21
837	0.19
838	0.16
839	0.13
840	0.13
841	0.12
842	0.09
843	0.06
844	0.06
845	0.08
846	0.08
847	0.08
848	0.08
849	0.08
850	0.08
851	0.08
852	0.08
853	0.07
854	0.07
855	0.08
856	0.1
857	0.1
858	0.11
859	0.17
860	0.25
861	0.24
862	0.27
863	0.29
864	0.32
865	0.39
866	0.39
867	0.33
868	0.31
869	0.33
870	0.33
871	0.34
872	0.3
873	0.23
874	0.28
875	0.29
876	0.22
877	0.19
878	0.17
879	0.13
880	0.12
881	0.12
882	0.07
883	0.06
884	0.07
885	0.07
886	0.09
887	0.08
888	0.08
889	0.08
890	0.08
891	0.08
892	0.08
893	0.08
894	0.06
895	0.06
896	0.07
897	0.1
898	0.11
899	0.1
900	0.11
901	0.14
902	0.16
903	0.17
904	0.17
905	0.14
906	0.14
907	0.15
908	0.19
909	0.19
910	0.18
911	0.22
912	0.28
913	0.29
914	0.3
915	0.31
916	0.29
917	0.32
918	0.31
919	0.3
920	0.29
921	0.28
922	0.28
923	0.3
924	0.29
925	0.22
926	0.22
927	0.2
928	0.16
929	0.22
930	0.23
931	0.2
932	0.2
933	0.26
934	0.26
935	0.24
936	0.24
937	0.18
938	0.16
939	0.14
940	0.16
941	0.11
942	0.1
943	0.11
944	0.1
945	0.11
946	0.11
947	0.13
948	0.11
949	0.11
950	0.12
951	0.13
952	0.14
953	0.15
954	0.17
955	0.16
956	0.16
957	0.16
958	0.15
959	0.14
960	0.14
961	0.14
962	0.12
963	0.11
964	0.11
965	0.11
966	0.12
967	0.12
968	0.11
969	0.1
970	0.11
971	0.11
972	0.11
973	0.11
974	0.1
975	0.09
976	0.09
977	0.08
978	0.08
979	0.07
980	0.06
981	0.06
982	0.06
983	0.05
984	0.05
985	0.05
986	0.05
987	0.05
988	0.07
989	0.08
990	0.08
991	0.08
992	0.08
993	0.1
994	0.14
995	0.17
996	0.19
997	0.22
998	0.26
999	0.33
1000	0.34
1001	0.33
1002	0.34
1003	0.38
1004	0.39
1005	0.41
1006	0.38
1007	0.36
1008	0.44
1009	0.46
1010	0.42
1011	0.41
1012	0.38
1013	0.37
1014	0.4
1015	0.38
1016	0.4
1017	0.42
1018	0.44
1019	0.43
1020	0.51
1021	0.51
1022	0.52
1023	0.51
1024	0.43
1025	0.43
1026	0.4
1027	0.37
1028	0.27
1029	0.23
1030	0.22
1031	0.2
1032	0.24
1033	0.2
1034	0.18
1035	0.2
1036	0.22
1037	0.24
1038	0.24
1039	0.26
1040	0.24
1041	0.27
1042	0.32
1043	0.31
1044	0.37
1045	0.36
1046	0.4
1047	0.43
1048	0.41
1049	0.41
1050	0.41
1051	0.39
1052	0.3
1053	0.31
1054	0.25
1055	0.21
1056	0.2
1057	0.17
1058	0.12
1059	0.12
1060	0.11
1061	0.08
1062	0.07
1063	0.04
1064	0.04
1065	0.04
1066	0.04
1067	0.04
1068	0.04
1069	0.04
1070	0.04
1071	0.04
1072	0.04
1073	0.04
1074	0.03
1075	0.04
1076	0.04
1077	0.04
1078	0.08
1079	0.1
1080	0.11
1081	0.12
1082	0.12
1083	0.13
1084	0.15
1085	0.17
1086	0.19
1087	0.21
1088	0.23
1089	0.22
1090	0.21
1091	0.2
1092	0.18
1093	0.16
1094	0.1
1095	0.06
1096	0.04
1097	0.07
1098	0.08
1099	0.1
1100	0.14
1101	0.16
1102	0.19
1103	0.21
1104	0.26
1105	0.31
1106	0.34
1107	0.41
1108	0.42
1109	0.49
1110	0.49
1111	0.48
1112	0.45
1113	0.39
1114	0.37
1115	0.32
1116	0.28
1117	0.2
1118	0.2
1119	0.2
1120	0.21
1121	0.21
1122	0.18
1123	0.15
1124	0.16
1125	0.14
1126	0.18
1127	0.17
1128	0.16
1129	0.15
1130	0.16
1131	0.16
1132	0.15
1133	0.17
1134	0.15
1135	0.22
1136	0.21
1137	0.25
1138	0.31
1139	0.3
1140	0.31
1141	0.32
1142	0.35
1143	0.3
1144	0.32
1145	0.31
1146	0.28
1147	0.28
1148	0.3
1149	0.3
1150	0.26
1151	0.25
1152	0.24
1153	0.22
1154	0.21
1155	0.21
1156	0.18
1157	0.17
1158	0.15
1159	0.13
1160	0.12
1161	0.11
1162	0.08
1163	0.08
1164	0.07
1165	0.05
1166	0.05
1167	0.05
1168	0.04
1169	0.05
1170	0.06
1171	0.06
1172	0.08
1173	0.09
1174	0.1
1175	0.12
1176	0.13
1177	0.15
1178	0.16
1179	0.16
1180	0.15
1181	0.15
1182	0.15
1183	0.16
1184	0.16
1185	0.14
1186	0.16
1187	0.18
1188	0.19
1189	0.2
1190	0.21
1191	0.26
1192	0.3
1193	0.36
1194	0.4
1195	0.43
1196	0.44
1197	0.51
1198	0.53
1199	0.47
1200	0.5
1201	0.52
1202	0.5
1203	0.49
1204	0.53
1205	0.55
1206	0.57
1207	0.6
1208	0.55
1209	0.51
1210	0.46
1211	0.42
1212	0.4
1213	0.31
1214	0.25
1215	0.22
1216	0.26
1217	0.25
1218	0.3
1219	0.34
1220	0.35
1221	0.38
1222	0.41
1223	0.44
1224	0.43
1225	0.46
1226	0.5
1227	0.54
1228	0.54
1229	0.5
1230	0.48
1231	0.44
1232	0.4
1233	0.35
1234	0.28
1235	0.2
1236	0.16
1237	0.15
1238	0.14
1239	0.14
1240	0.15
1241	0.16
1242	0.18
1243	0.2
1244	0.23
1245	0.26
1246	0.27
1247	0.32
1248	0.33
1249	0.34
1250	0.3
1251	0.33
1252	0.3
1253	0.28
1254	0.26
1255	0.21
1256	0.18
1257	0.14
1258	0.13
1259	0.07
1260	0.07
1261	0.05
1262	0.06
1263	0.09
1264	0.12
1265	0.17
1266	0.2
1267	0.22
1268	0.24

A0A2G8S3C6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer