Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PFI4

Protein Details
Accession J3PFI4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
431-453FQTTKRCPGCRWPIEKNKGCSHIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
413-415RRR
Subcellular Location(s) extr 12, cyto 5, mito 4, cyto_nucl 4, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
cd20336  Rcat_RBR  
Amino Acid Sequences MLDLCGLWVALFWMTCSDNNTTCSLPLSTTSRATRQPRFTSLNPRATMQQSKLKRLLLARKHVHEQQQQQPQDLLRNEAAPFRGYLPTHPSILDHSLDPAVSAAIPPLQGAATSNPPAGPAPPARNRGPSPPPPNNPYLAAIAAKERSMTLAYIRTIPPSSSSQPSADLPTIPADDRGFGQRYQQLHPSAAPVVTHTRVPAALLTGGPRDCVVCADTLPASRFPALAVTRRCAHPPRACLRCVAASIAADLAARLQLWDYNTKNNNTNGGGGGSVRCPECAAPLAYDDVQLFADPPDRARYQALSFRAVAAAAAPGFRWCPAAGCGSGQACGSGSESGSGRAECVRCGAGFCVAHDVTWHEGLTCAEYDGLLADPDGGGGGGGAREEEEEEEDEDTREGRERAERARLVHEARRRAAQRGRELRLTEATIFQTTKRCPGCRWPIEKNKGCSHITCTMCSYEFCYDCGLKWMDGCRNTSCGGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.17
4 0.2
5 0.22
6 0.25
7 0.27
8 0.25
9 0.24
10 0.26
11 0.23
12 0.2
13 0.21
14 0.24
15 0.25
16 0.3
17 0.34
18 0.36
19 0.44
20 0.51
21 0.56
22 0.6
23 0.63
24 0.65
25 0.68
26 0.68
27 0.71
28 0.72
29 0.72
30 0.64
31 0.6
32 0.57
33 0.56
34 0.57
35 0.51
36 0.51
37 0.48
38 0.55
39 0.58
40 0.55
41 0.54
42 0.55
43 0.6
44 0.59
45 0.64
46 0.63
47 0.63
48 0.67
49 0.69
50 0.7
51 0.69
52 0.68
53 0.67
54 0.69
55 0.66
56 0.62
57 0.59
58 0.51
59 0.51
60 0.43
61 0.39
62 0.3
63 0.31
64 0.29
65 0.29
66 0.28
67 0.21
68 0.21
69 0.19
70 0.22
71 0.2
72 0.23
73 0.27
74 0.28
75 0.28
76 0.27
77 0.25
78 0.24
79 0.27
80 0.25
81 0.18
82 0.18
83 0.17
84 0.17
85 0.16
86 0.12
87 0.09
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.1
99 0.13
100 0.14
101 0.15
102 0.14
103 0.15
104 0.16
105 0.15
106 0.17
107 0.18
108 0.24
109 0.31
110 0.37
111 0.38
112 0.44
113 0.46
114 0.49
115 0.52
116 0.54
117 0.57
118 0.61
119 0.64
120 0.63
121 0.63
122 0.58
123 0.51
124 0.44
125 0.36
126 0.28
127 0.22
128 0.18
129 0.18
130 0.16
131 0.14
132 0.12
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.13
139 0.14
140 0.17
141 0.17
142 0.18
143 0.18
144 0.18
145 0.19
146 0.2
147 0.23
148 0.23
149 0.25
150 0.23
151 0.25
152 0.26
153 0.25
154 0.21
155 0.18
156 0.16
157 0.15
158 0.16
159 0.14
160 0.14
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.15
165 0.15
166 0.14
167 0.18
168 0.21
169 0.23
170 0.25
171 0.3
172 0.27
173 0.26
174 0.27
175 0.25
176 0.21
177 0.19
178 0.16
179 0.12
180 0.14
181 0.14
182 0.14
183 0.12
184 0.12
185 0.11
186 0.12
187 0.1
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.13
212 0.13
213 0.18
214 0.19
215 0.21
216 0.23
217 0.24
218 0.27
219 0.26
220 0.32
221 0.31
222 0.37
223 0.42
224 0.44
225 0.43
226 0.41
227 0.39
228 0.33
229 0.28
230 0.22
231 0.15
232 0.11
233 0.11
234 0.09
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.05
244 0.06
245 0.12
246 0.13
247 0.2
248 0.24
249 0.26
250 0.3
251 0.29
252 0.31
253 0.27
254 0.26
255 0.2
256 0.17
257 0.15
258 0.11
259 0.11
260 0.08
261 0.09
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.1
271 0.12
272 0.11
273 0.12
274 0.11
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.06
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.14
284 0.14
285 0.16
286 0.17
287 0.19
288 0.19
289 0.24
290 0.26
291 0.24
292 0.24
293 0.23
294 0.21
295 0.19
296 0.15
297 0.1
298 0.08
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.06
307 0.08
308 0.1
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.15
313 0.14
314 0.14
315 0.13
316 0.11
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.08
321 0.07
322 0.08
323 0.09
324 0.1
325 0.11
326 0.1
327 0.1
328 0.14
329 0.14
330 0.13
331 0.14
332 0.14
333 0.13
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.15
338 0.15
339 0.2
340 0.18
341 0.18
342 0.17
343 0.19
344 0.16
345 0.17
346 0.17
347 0.1
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.11
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.04
373 0.05
374 0.06
375 0.08
376 0.09
377 0.1
378 0.11
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.13
385 0.12
386 0.14
387 0.2
388 0.23
389 0.28
390 0.37
391 0.39
392 0.38
393 0.43
394 0.47
395 0.46
396 0.5
397 0.52
398 0.5
399 0.5
400 0.56
401 0.53
402 0.56
403 0.57
404 0.59
405 0.62
406 0.64
407 0.67
408 0.64
409 0.64
410 0.59
411 0.57
412 0.51
413 0.42
414 0.35
415 0.32
416 0.29
417 0.28
418 0.26
419 0.29
420 0.28
421 0.36
422 0.39
423 0.4
424 0.41
425 0.51
426 0.6
427 0.62
428 0.68
429 0.7
430 0.74
431 0.82
432 0.86
433 0.83
434 0.8
435 0.77
436 0.72
437 0.64
438 0.6
439 0.58
440 0.52
441 0.47
442 0.41
443 0.38
444 0.37
445 0.35
446 0.33
447 0.31
448 0.3
449 0.28
450 0.3
451 0.27
452 0.27
453 0.33
454 0.3
455 0.24
456 0.26
457 0.33
458 0.35
459 0.39
460 0.42
461 0.39
462 0.39