Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YR43

Protein Details
Accession A0A2C5YR43    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
258-296QIGINKKSKKQKEAYKKAVSKVKRSERKKSKPHPLNFSAHydrophilic
682-724KKEAAGKSTSNREKQRKKNFLMTLGKAKSKQKRSLVEARKVLRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-289NKKSKKQKEAYKKAVSKVKRSERKKSKP
648-740ARLRKLSKEEKLALAKEGKPDREEHKSTQAIRKSKKEAAGKSTSNREKQRKKNFLMTLGKAKSKQKRSLVEARKVLRGHVERSSRGGRRRNGR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 11.833, mito 9, cyto_mito 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027312  Sda1  
IPR007949  SDA1_C  
IPR012977  SDA1_N  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08158  NUC130_3NT  
PF05285  SDA1  
Amino Acid Sequences MVKRKVAALEKLDADFASLQYKIRRDPKSYKDDFLRQWEQYESQREIFLSSPTTASADSVESFHNMVDLMAHVADCYPEETKAFPDDLKAILAQHHAALHPDLREKVVGSLVLLRRKDVIDSTSLLTTLFPILVSSPSKTLRELLFNKIVSDLRNSNTRSINHPLNRTIQTVLYNLVVADRSSPRALWAVKLTRELWKRHIWNDAKPVDVMKEACLADNEKVAVGAARFFLGGDKEREELEDESSDEDDVDLTKVRHQIGINKKSKKQKEAYKKAVSKVKRSERKKSKPHPLNFSALHLLHDPQTFAEQLFSKHLQNTKAKLSLDSKLLILQLVTRLVGLHRLTVITLYSWFIKFLTPRQQSVTSFLASLAQGTHDLVPPDVLEPLLQKIANEFVSEASAAEVAAAGLNAIREICARQPLAMTEALLQDLVQYRKSKDKGVMMAAKGLLSLYREVGAELLKKRDRGKDASIGLKEGLQQQRKFGEEQADGIDGLHLLLKWKEEERKRKRTEAGLSATGEDDEKDGEDDDDDSSGWEVDSDDGSSSGGEWITVEHSDDEAPAVKRQKKTGEEDDDGDGDKDGEVDEEMALRTSKLATTTILTPADLAKLQELRTAAAVGTAMGRNKPQGATEGRHADDGVTAEKIEAPARLRKLSKEEKLALAKEGKPDREEHKSTQAIRKSKKEAAGKSTSNREKQRKKNFLMTLGKAKSKQKRSLVEARKVLRGHVERSSRGGRRRNGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.24
3 0.19
4 0.17
5 0.15
6 0.17
7 0.22
8 0.26
9 0.32
10 0.41
11 0.47
12 0.52
13 0.61
14 0.68
15 0.73
16 0.74
17 0.74
18 0.73
19 0.75
20 0.73
21 0.73
22 0.7
23 0.61
24 0.59
25 0.55
26 0.51
27 0.49
28 0.5
29 0.45
30 0.39
31 0.4
32 0.37
33 0.35
34 0.32
35 0.27
36 0.23
37 0.19
38 0.18
39 0.17
40 0.18
41 0.16
42 0.15
43 0.14
44 0.13
45 0.12
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.13
51 0.12
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.1
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.13
68 0.15
69 0.18
70 0.19
71 0.17
72 0.18
73 0.19
74 0.19
75 0.19
76 0.17
77 0.15
78 0.16
79 0.18
80 0.16
81 0.15
82 0.16
83 0.14
84 0.16
85 0.17
86 0.18
87 0.18
88 0.22
89 0.21
90 0.21
91 0.22
92 0.21
93 0.2
94 0.19
95 0.17
96 0.14
97 0.2
98 0.24
99 0.3
100 0.29
101 0.28
102 0.29
103 0.29
104 0.3
105 0.25
106 0.22
107 0.19
108 0.21
109 0.22
110 0.2
111 0.2
112 0.18
113 0.15
114 0.14
115 0.11
116 0.09
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.1
121 0.12
122 0.13
123 0.16
124 0.2
125 0.21
126 0.22
127 0.25
128 0.24
129 0.32
130 0.33
131 0.36
132 0.4
133 0.39
134 0.39
135 0.38
136 0.36
137 0.29
138 0.31
139 0.27
140 0.23
141 0.3
142 0.31
143 0.33
144 0.38
145 0.38
146 0.38
147 0.41
148 0.48
149 0.47
150 0.5
151 0.48
152 0.49
153 0.5
154 0.46
155 0.41
156 0.34
157 0.3
158 0.26
159 0.24
160 0.18
161 0.15
162 0.13
163 0.12
164 0.11
165 0.08
166 0.11
167 0.11
168 0.14
169 0.15
170 0.15
171 0.15
172 0.2
173 0.21
174 0.2
175 0.26
176 0.28
177 0.3
178 0.33
179 0.33
180 0.37
181 0.42
182 0.43
183 0.41
184 0.45
185 0.47
186 0.47
187 0.55
188 0.51
189 0.51
190 0.57
191 0.53
192 0.46
193 0.42
194 0.39
195 0.31
196 0.3
197 0.24
198 0.15
199 0.18
200 0.17
201 0.17
202 0.17
203 0.18
204 0.16
205 0.17
206 0.16
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.07
212 0.08
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.09
219 0.11
220 0.13
221 0.14
222 0.15
223 0.15
224 0.16
225 0.18
226 0.16
227 0.16
228 0.14
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.1
234 0.09
235 0.07
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.11
241 0.14
242 0.15
243 0.18
244 0.18
245 0.26
246 0.35
247 0.45
248 0.51
249 0.54
250 0.6
251 0.67
252 0.72
253 0.72
254 0.7
255 0.7
256 0.73
257 0.77
258 0.81
259 0.81
260 0.8
261 0.78
262 0.77
263 0.71
264 0.68
265 0.68
266 0.68
267 0.68
268 0.69
269 0.74
270 0.77
271 0.83
272 0.85
273 0.85
274 0.86
275 0.86
276 0.87
277 0.85
278 0.78
279 0.74
280 0.63
281 0.57
282 0.5
283 0.4
284 0.34
285 0.25
286 0.22
287 0.18
288 0.18
289 0.15
290 0.11
291 0.12
292 0.11
293 0.1
294 0.11
295 0.09
296 0.1
297 0.14
298 0.15
299 0.16
300 0.18
301 0.22
302 0.26
303 0.3
304 0.32
305 0.32
306 0.35
307 0.34
308 0.34
309 0.33
310 0.3
311 0.28
312 0.25
313 0.21
314 0.18
315 0.18
316 0.14
317 0.11
318 0.09
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.09
341 0.09
342 0.13
343 0.23
344 0.24
345 0.25
346 0.29
347 0.32
348 0.31
349 0.35
350 0.32
351 0.22
352 0.2
353 0.18
354 0.16
355 0.13
356 0.12
357 0.07
358 0.06
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.07
368 0.06
369 0.05
370 0.04
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.05
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.02
394 0.02
395 0.02
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.05
401 0.06
402 0.09
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.13
408 0.12
409 0.11
410 0.09
411 0.1
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.1
417 0.11
418 0.13
419 0.14
420 0.16
421 0.24
422 0.26
423 0.28
424 0.28
425 0.32
426 0.33
427 0.37
428 0.41
429 0.33
430 0.34
431 0.31
432 0.26
433 0.21
434 0.17
435 0.11
436 0.08
437 0.08
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.08
444 0.12
445 0.13
446 0.19
447 0.21
448 0.24
449 0.28
450 0.34
451 0.38
452 0.39
453 0.42
454 0.43
455 0.44
456 0.48
457 0.44
458 0.39
459 0.34
460 0.3
461 0.26
462 0.26
463 0.3
464 0.3
465 0.3
466 0.32
467 0.35
468 0.36
469 0.35
470 0.31
471 0.3
472 0.23
473 0.24
474 0.22
475 0.2
476 0.18
477 0.17
478 0.14
479 0.08
480 0.07
481 0.07
482 0.05
483 0.06
484 0.07
485 0.08
486 0.09
487 0.14
488 0.22
489 0.3
490 0.41
491 0.5
492 0.61
493 0.65
494 0.71
495 0.72
496 0.72
497 0.71
498 0.68
499 0.63
500 0.57
501 0.52
502 0.45
503 0.4
504 0.32
505 0.24
506 0.16
507 0.11
508 0.07
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.06
522 0.05
523 0.05
524 0.06
525 0.06
526 0.07
527 0.06
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.06
532 0.07
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.07
538 0.07
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.09
543 0.09
544 0.09
545 0.12
546 0.13
547 0.17
548 0.25
549 0.3
550 0.34
551 0.39
552 0.46
553 0.48
554 0.54
555 0.59
556 0.59
557 0.56
558 0.56
559 0.53
560 0.46
561 0.4
562 0.32
563 0.23
564 0.15
565 0.11
566 0.09
567 0.07
568 0.06
569 0.05
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.07
574 0.07
575 0.08
576 0.07
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.09
581 0.1
582 0.1
583 0.13
584 0.15
585 0.19
586 0.18
587 0.17
588 0.16
589 0.16
590 0.17
591 0.15
592 0.14
593 0.13
594 0.15
595 0.16
596 0.18
597 0.18
598 0.17
599 0.17
600 0.17
601 0.13
602 0.11
603 0.11
604 0.08
605 0.1
606 0.11
607 0.12
608 0.13
609 0.14
610 0.15
611 0.18
612 0.18
613 0.17
614 0.21
615 0.25
616 0.28
617 0.35
618 0.39
619 0.38
620 0.38
621 0.37
622 0.3
623 0.27
624 0.24
625 0.18
626 0.13
627 0.12
628 0.11
629 0.12
630 0.13
631 0.13
632 0.14
633 0.16
634 0.22
635 0.27
636 0.33
637 0.34
638 0.38
639 0.47
640 0.53
641 0.57
642 0.59
643 0.59
644 0.6
645 0.65
646 0.61
647 0.57
648 0.54
649 0.49
650 0.49
651 0.52
652 0.47
653 0.43
654 0.46
655 0.47
656 0.5
657 0.53
658 0.5
659 0.52
660 0.56
661 0.6
662 0.65
663 0.67
664 0.67
665 0.69
666 0.73
667 0.71
668 0.71
669 0.73
670 0.73
671 0.72
672 0.7
673 0.71
674 0.69
675 0.68
676 0.72
677 0.72
678 0.72
679 0.75
680 0.78
681 0.79
682 0.84
683 0.88
684 0.88
685 0.86
686 0.87
687 0.84
688 0.83
689 0.82
690 0.77
691 0.76
692 0.71
693 0.7
694 0.66
695 0.68
696 0.68
697 0.69
698 0.72
699 0.71
700 0.74
701 0.76
702 0.82
703 0.82
704 0.82
705 0.81
706 0.76
707 0.74
708 0.66
709 0.59
710 0.58
711 0.53
712 0.48
713 0.48
714 0.51
715 0.47
716 0.53
717 0.6
718 0.58
719 0.62
720 0.67