Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YYV1

Protein Details
Accession A0A2C5YYV1    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-223PATASRPWRTSRRQRRIRMPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
216-216R
218-218R
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025742  CSTF2_hinge  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14327  CSTF2_hinge  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12398  RRM_CSTF2_RNA15_like  
Amino Acid Sequences MSTRPPSRVVFVGNIPYEEQITEIFSSVGKVERFRLVYDSETGRPKGFGFADYPDTDSASSAVRNLNDHEIMGRKLRVDFSNDQKGGDDDNGAHQPSSTLNPHASNGAGMLSQTTSLPPLPAGKEIPPGLTCTDAISRTLNTLPPPQLLDILGQMKTLASSDPQRATELLQQAPQLAYAVFQALLVMGLVSPEAIQAVAEPGAPATASRPWRTSRRQRRIRMP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.3
3 0.28
4 0.25
5 0.21
6 0.18
7 0.11
8 0.12
9 0.11
10 0.11
11 0.1
12 0.09
13 0.1
14 0.1
15 0.15
16 0.14
17 0.15
18 0.17
19 0.23
20 0.24
21 0.25
22 0.27
23 0.24
24 0.25
25 0.28
26 0.29
27 0.28
28 0.31
29 0.31
30 0.29
31 0.28
32 0.26
33 0.27
34 0.23
35 0.2
36 0.18
37 0.19
38 0.23
39 0.23
40 0.24
41 0.2
42 0.2
43 0.18
44 0.16
45 0.14
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.14
53 0.17
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.16
58 0.17
59 0.19
60 0.18
61 0.15
62 0.16
63 0.19
64 0.19
65 0.22
66 0.26
67 0.3
68 0.39
69 0.39
70 0.38
71 0.35
72 0.34
73 0.29
74 0.24
75 0.18
76 0.08
77 0.11
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.13
85 0.12
86 0.11
87 0.13
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.13
92 0.1
93 0.08
94 0.07
95 0.06
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.11
110 0.11
111 0.14
112 0.14
113 0.15
114 0.14
115 0.15
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.11
120 0.12
121 0.11
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.14
129 0.17
130 0.18
131 0.17
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.16
136 0.14
137 0.13
138 0.14
139 0.13
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.07
146 0.07
147 0.11
148 0.15
149 0.18
150 0.19
151 0.21
152 0.21
153 0.23
154 0.26
155 0.27
156 0.24
157 0.23
158 0.23
159 0.23
160 0.22
161 0.2
162 0.15
163 0.1
164 0.09
165 0.07
166 0.08
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.04
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.06
192 0.07
193 0.14
194 0.2
195 0.23
196 0.27
197 0.34
198 0.43
199 0.53
200 0.62
201 0.67
202 0.73
203 0.8