Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YXC1

Protein Details
Accession A0A2C5YXC1    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-111RTASKRSRSPVKSSARRKTIHydrophilic
139-162DATVETKSKRRSRRTITPQIKDESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-109KRSRSPVKSSARRK
621-623RRR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025856  HeH/LEM_domain  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR041885  MAN1_winged_helix_dom  
IPR018996  MSC  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12949  HeH  
PF09402  MSC  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MVEGEDYLEEGFDPRSVTMPRLRSILVTHSIDFPSTAKKAQLVELVTDRVLPQVPRLRAERAKAKRSSFGIVNAGSADDTNTWDDAELQPPRTASKRSRSPVKSSARRKTIEPEADPPLFKSSRKSSSRSASRPLDDDDATVETKSKRRSRRTITPQIKDESDEDRPRLDELQAAKLEEESVFTDDNPFQSGSSPPAIKSANQRRRTAGDELFKDIVRPSGRRSEGTSRKSSAMTTSRFQPEAVDDTLEPGEEFTPNEQLELERAERAGEISIAPRKPQHETGRRSSIRAPLLALMMALLSAYGAWYRQEKMAVGYCGLGRPAKSILPPDIPVPNFLRPLVEVQCEPCPLHAYCYQDYSVRCESDFILQPHPLSLGGLVPVPPSCEPDGEKARRVQAVADKAVEELRERRAKFECGVPADDESGQQHKSPAMSEDELKESVGKKRSKRLSQIEFDELWKAAIGEVTARDEVSIEREESVENEADPSIPHFFQVSNLRLPHTLDFPSPLLAQAVFYLRSKYRRHRAASAQVPGLVDAVLGRLADQKELGDEDLDDSWLFLPNLRDDVLRNVHSLSERESIWRRVRRVVELNSNVRTSQREGRSGEVGRAWEWIGPVKGEGARRRRSGRVSWAPESAPETPENVRETVEAKRWDEPRPFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.14
3 0.16
4 0.2
5 0.27
6 0.31
7 0.32
8 0.34
9 0.34
10 0.32
11 0.33
12 0.35
13 0.35
14 0.33
15 0.32
16 0.33
17 0.33
18 0.31
19 0.29
20 0.24
21 0.24
22 0.23
23 0.24
24 0.22
25 0.25
26 0.27
27 0.3
28 0.34
29 0.29
30 0.3
31 0.31
32 0.32
33 0.28
34 0.27
35 0.23
36 0.2
37 0.21
38 0.17
39 0.22
40 0.29
41 0.32
42 0.35
43 0.39
44 0.45
45 0.48
46 0.55
47 0.57
48 0.58
49 0.65
50 0.67
51 0.68
52 0.67
53 0.65
54 0.63
55 0.55
56 0.51
57 0.47
58 0.4
59 0.37
60 0.3
61 0.27
62 0.21
63 0.18
64 0.14
65 0.08
66 0.1
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.13
73 0.19
74 0.21
75 0.22
76 0.24
77 0.24
78 0.28
79 0.3
80 0.35
81 0.36
82 0.43
83 0.5
84 0.57
85 0.67
86 0.69
87 0.73
88 0.76
89 0.79
90 0.79
91 0.79
92 0.82
93 0.8
94 0.76
95 0.71
96 0.69
97 0.68
98 0.66
99 0.6
100 0.55
101 0.53
102 0.53
103 0.51
104 0.44
105 0.41
106 0.34
107 0.31
108 0.33
109 0.34
110 0.41
111 0.46
112 0.49
113 0.5
114 0.59
115 0.68
116 0.66
117 0.67
118 0.64
119 0.62
120 0.6
121 0.56
122 0.5
123 0.4
124 0.35
125 0.29
126 0.24
127 0.22
128 0.19
129 0.18
130 0.17
131 0.22
132 0.31
133 0.37
134 0.44
135 0.54
136 0.64
137 0.7
138 0.78
139 0.83
140 0.85
141 0.87
142 0.86
143 0.81
144 0.75
145 0.67
146 0.58
147 0.5
148 0.45
149 0.43
150 0.39
151 0.35
152 0.32
153 0.32
154 0.31
155 0.3
156 0.25
157 0.21
158 0.19
159 0.25
160 0.24
161 0.24
162 0.22
163 0.21
164 0.21
165 0.17
166 0.15
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.11
177 0.12
178 0.13
179 0.13
180 0.17
181 0.17
182 0.15
183 0.2
184 0.2
185 0.21
186 0.31
187 0.39
188 0.45
189 0.51
190 0.53
191 0.52
192 0.55
193 0.57
194 0.53
195 0.48
196 0.46
197 0.41
198 0.44
199 0.41
200 0.38
201 0.34
202 0.28
203 0.26
204 0.22
205 0.21
206 0.21
207 0.28
208 0.3
209 0.31
210 0.36
211 0.41
212 0.48
213 0.52
214 0.54
215 0.47
216 0.47
217 0.46
218 0.41
219 0.37
220 0.34
221 0.32
222 0.29
223 0.32
224 0.34
225 0.34
226 0.33
227 0.28
228 0.23
229 0.23
230 0.22
231 0.17
232 0.13
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.11
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.06
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.13
249 0.12
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.06
257 0.06
258 0.08
259 0.14
260 0.14
261 0.15
262 0.17
263 0.19
264 0.22
265 0.3
266 0.37
267 0.41
268 0.47
269 0.53
270 0.61
271 0.6
272 0.58
273 0.54
274 0.5
275 0.43
276 0.37
277 0.31
278 0.21
279 0.21
280 0.18
281 0.15
282 0.08
283 0.06
284 0.05
285 0.04
286 0.02
287 0.02
288 0.02
289 0.02
290 0.02
291 0.02
292 0.04
293 0.05
294 0.07
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.11
299 0.15
300 0.14
301 0.13
302 0.13
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.12
313 0.14
314 0.15
315 0.16
316 0.16
317 0.19
318 0.18
319 0.19
320 0.2
321 0.2
322 0.19
323 0.18
324 0.17
325 0.13
326 0.16
327 0.16
328 0.14
329 0.12
330 0.13
331 0.15
332 0.16
333 0.15
334 0.12
335 0.14
336 0.13
337 0.16
338 0.17
339 0.2
340 0.2
341 0.22
342 0.22
343 0.22
344 0.22
345 0.25
346 0.24
347 0.2
348 0.19
349 0.18
350 0.19
351 0.2
352 0.25
353 0.21
354 0.21
355 0.21
356 0.21
357 0.2
358 0.2
359 0.15
360 0.1
361 0.08
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.1
371 0.1
372 0.11
373 0.12
374 0.18
375 0.27
376 0.28
377 0.31
378 0.31
379 0.34
380 0.34
381 0.33
382 0.29
383 0.26
384 0.29
385 0.27
386 0.25
387 0.22
388 0.21
389 0.21
390 0.19
391 0.15
392 0.12
393 0.18
394 0.24
395 0.24
396 0.27
397 0.29
398 0.32
399 0.32
400 0.34
401 0.33
402 0.29
403 0.3
404 0.28
405 0.26
406 0.24
407 0.23
408 0.18
409 0.15
410 0.15
411 0.14
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.16
420 0.17
421 0.18
422 0.2
423 0.2
424 0.19
425 0.19
426 0.17
427 0.22
428 0.28
429 0.32
430 0.34
431 0.43
432 0.52
433 0.58
434 0.65
435 0.69
436 0.7
437 0.7
438 0.71
439 0.66
440 0.58
441 0.51
442 0.43
443 0.34
444 0.25
445 0.19
446 0.13
447 0.09
448 0.08
449 0.07
450 0.06
451 0.07
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.11
459 0.12
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.12
464 0.12
465 0.15
466 0.12
467 0.1
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.11
473 0.11
474 0.11
475 0.11
476 0.11
477 0.11
478 0.16
479 0.23
480 0.24
481 0.27
482 0.28
483 0.29
484 0.3
485 0.32
486 0.28
487 0.24
488 0.23
489 0.18
490 0.21
491 0.19
492 0.2
493 0.18
494 0.17
495 0.14
496 0.12
497 0.12
498 0.1
499 0.12
500 0.12
501 0.12
502 0.16
503 0.19
504 0.26
505 0.33
506 0.42
507 0.49
508 0.57
509 0.62
510 0.66
511 0.72
512 0.74
513 0.75
514 0.71
515 0.63
516 0.55
517 0.5
518 0.42
519 0.33
520 0.22
521 0.14
522 0.08
523 0.07
524 0.06
525 0.05
526 0.05
527 0.1
528 0.11
529 0.12
530 0.12
531 0.12
532 0.13
533 0.14
534 0.14
535 0.1
536 0.1
537 0.11
538 0.11
539 0.12
540 0.1
541 0.09
542 0.09
543 0.12
544 0.11
545 0.12
546 0.14
547 0.15
548 0.17
549 0.18
550 0.18
551 0.17
552 0.24
553 0.28
554 0.27
555 0.26
556 0.25
557 0.27
558 0.28
559 0.28
560 0.26
561 0.23
562 0.22
563 0.27
564 0.32
565 0.38
566 0.45
567 0.51
568 0.5
569 0.55
570 0.59
571 0.61
572 0.65
573 0.64
574 0.65
575 0.66
576 0.69
577 0.64
578 0.61
579 0.53
580 0.46
581 0.42
582 0.37
583 0.38
584 0.37
585 0.4
586 0.41
587 0.45
588 0.5
589 0.48
590 0.46
591 0.4
592 0.36
593 0.29
594 0.29
595 0.25
596 0.19
597 0.19
598 0.2
599 0.18
600 0.17
601 0.17
602 0.19
603 0.22
604 0.28
605 0.36
606 0.41
607 0.47
608 0.54
609 0.6
610 0.64
611 0.67
612 0.68
613 0.7
614 0.71
615 0.71
616 0.68
617 0.66
618 0.6
619 0.55
620 0.53
621 0.44
622 0.36
623 0.29
624 0.28
625 0.26
626 0.3
627 0.3
628 0.26
629 0.24
630 0.23
631 0.24
632 0.28
633 0.33
634 0.35
635 0.35
636 0.41
637 0.44
638 0.5