Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XDG6

Protein Details
Accession A0A2C5XDG6    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
369-394LSPPPPPAPTRKRKAVDIFMRPRKRIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-145PRAGRVGPKR
378-384TRKRKAV
388-393MRPRKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPVKSLMELAAMACIKNIRGLNGIGDYLPYSSMRQILLKVDNASQLRQIEVNSPQLQGETGEIWIKIIEKDFPLECKANAYKPPTPDKWYRVWEKYKKEHDDALEESQAKLANALAGLRQDKEKNTSKIVERKFLPRAGRVGPKRLGPRDHSSSALTFGLGSRTKTHNGASIMRKVRREVREIATIHGPLSKPTRAGAGASDLKKAPASMISEHQRAAQPQFRTSTQSAVVETQPSSVEQYEKRATVISDSEGEIDDHSQDEAVRKTTKQSSSSHVKRPSSTQRQDDTTTTTTTTITNRPVAGRGSATLANKFGHKQPPRPRPTIEKASPEPTPQASKDAEPDSCLPSSRTVREGSFSPHSAEEVIASLSPPPPPAPTRKRKAVDIFMRPRKRIN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.19
4 0.2
5 0.17
6 0.19
7 0.2
8 0.22
9 0.23
10 0.23
11 0.18
12 0.17
13 0.16
14 0.13
15 0.14
16 0.12
17 0.12
18 0.13
19 0.15
20 0.16
21 0.17
22 0.19
23 0.24
24 0.27
25 0.29
26 0.29
27 0.29
28 0.34
29 0.34
30 0.33
31 0.32
32 0.28
33 0.26
34 0.25
35 0.24
36 0.22
37 0.24
38 0.31
39 0.28
40 0.28
41 0.27
42 0.26
43 0.25
44 0.2
45 0.18
46 0.11
47 0.11
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.13
56 0.12
57 0.16
58 0.17
59 0.2
60 0.23
61 0.24
62 0.23
63 0.28
64 0.3
65 0.31
66 0.36
67 0.4
68 0.4
69 0.44
70 0.53
71 0.5
72 0.54
73 0.57
74 0.56
75 0.57
76 0.6
77 0.62
78 0.63
79 0.68
80 0.71
81 0.72
82 0.77
83 0.8
84 0.79
85 0.74
86 0.7
87 0.63
88 0.59
89 0.53
90 0.47
91 0.42
92 0.35
93 0.32
94 0.28
95 0.26
96 0.2
97 0.17
98 0.12
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.15
107 0.17
108 0.19
109 0.26
110 0.33
111 0.33
112 0.37
113 0.41
114 0.44
115 0.51
116 0.52
117 0.52
118 0.46
119 0.5
120 0.5
121 0.5
122 0.47
123 0.41
124 0.42
125 0.4
126 0.47
127 0.44
128 0.46
129 0.43
130 0.45
131 0.5
132 0.51
133 0.5
134 0.47
135 0.51
136 0.5
137 0.49
138 0.46
139 0.4
140 0.35
141 0.32
142 0.27
143 0.19
144 0.12
145 0.11
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.15
150 0.17
151 0.19
152 0.21
153 0.21
154 0.22
155 0.23
156 0.29
157 0.29
158 0.34
159 0.39
160 0.41
161 0.42
162 0.4
163 0.45
164 0.43
165 0.44
166 0.41
167 0.38
168 0.42
169 0.41
170 0.4
171 0.34
172 0.31
173 0.26
174 0.23
175 0.19
176 0.14
177 0.17
178 0.16
179 0.14
180 0.14
181 0.15
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.18
187 0.18
188 0.19
189 0.17
190 0.17
191 0.17
192 0.17
193 0.12
194 0.09
195 0.11
196 0.11
197 0.17
198 0.2
199 0.21
200 0.22
201 0.23
202 0.22
203 0.22
204 0.24
205 0.24
206 0.21
207 0.23
208 0.25
209 0.24
210 0.28
211 0.27
212 0.26
213 0.22
214 0.22
215 0.2
216 0.19
217 0.19
218 0.15
219 0.14
220 0.13
221 0.11
222 0.1
223 0.11
224 0.1
225 0.13
226 0.12
227 0.18
228 0.19
229 0.19
230 0.19
231 0.19
232 0.18
233 0.17
234 0.18
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.09
249 0.1
250 0.13
251 0.15
252 0.15
253 0.2
254 0.27
255 0.31
256 0.33
257 0.34
258 0.38
259 0.47
260 0.53
261 0.57
262 0.58
263 0.56
264 0.54
265 0.6
266 0.63
267 0.64
268 0.64
269 0.63
270 0.6
271 0.61
272 0.62
273 0.56
274 0.51
275 0.43
276 0.37
277 0.3
278 0.26
279 0.22
280 0.21
281 0.22
282 0.2
283 0.21
284 0.22
285 0.22
286 0.23
287 0.25
288 0.24
289 0.23
290 0.2
291 0.17
292 0.18
293 0.21
294 0.21
295 0.2
296 0.21
297 0.2
298 0.21
299 0.23
300 0.26
301 0.32
302 0.37
303 0.45
304 0.53
305 0.63
306 0.69
307 0.72
308 0.71
309 0.71
310 0.73
311 0.74
312 0.7
313 0.67
314 0.64
315 0.64
316 0.6
317 0.54
318 0.48
319 0.42
320 0.41
321 0.34
322 0.34
323 0.32
324 0.31
325 0.34
326 0.34
327 0.31
328 0.29
329 0.3
330 0.29
331 0.28
332 0.28
333 0.24
334 0.27
335 0.33
336 0.32
337 0.33
338 0.33
339 0.33
340 0.35
341 0.35
342 0.35
343 0.35
344 0.33
345 0.33
346 0.3
347 0.3
348 0.27
349 0.25
350 0.19
351 0.14
352 0.13
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.12
357 0.13
358 0.14
359 0.14
360 0.18
361 0.23
362 0.34
363 0.42
364 0.52
365 0.6
366 0.69
367 0.72
368 0.76
369 0.8
370 0.81
371 0.8
372 0.8
373 0.82
374 0.82
375 0.86