Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YY79

Protein Details
Accession A0A2C5YY79    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-144QTPHKINRSEVRQQKRKRDHEDQQSLAHydrophilic
626-652DLDSDGQRKKKSKKEVRTKYDKMFERKBasic
798-823EGDRLLAKMRRREKRERAKAREMAELBasic
829-854EEEDGRPSKKMKRERSDSKGNKRSVIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
523-538KRIPVKKVHVKETKKR
633-642RKKKSKKEVR
731-744RREKALLSKKKMLK
804-850AKMRRREKRERAKAREMAELRGGREEEEDGRPSKKMKRERSDSKGNK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR033121  PEPTIDASE_A1  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51767  PEPTIDASE_A1  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17941  DEADc_DDX10  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MGDYVVPVSQINVTWEGGEPNTVLSSEKGSPFLLDSSSTINFFPPRVLRRILNEFPNAQRVEGLPLFEVGCDTRELKGSIDFTVGNKVIRVALRDFIWHVKPLPGRCYLPIMSHRAQQTPHKINRSEVRQQKRKRDHEDQQSLAAAVEHLDIKSTEIKTFSDLPLSQSTAAGLKASHFQTLTDVQQRAIPLALKGHDVLAAAKTGSGKTLAFLIPLLEKLYRAQWTEYDGLGALVLSPTRELAVQIFDVLRKIGRNHVFSAGLVIGGKSLKEEAERLGRMNILVCTPGRMLQHLDQTAGFVADNLQILVLDEADRIMDMGFQSAVDALVEHLPKTRQTLLFSATQSKKVSDLARLSLKDPEYVSVHQEAATATPSTLQQHYISTPLSEKLDTLYGFIKSNLKSKMIVFLSSGKQVRFVYESFRHLQPGVPLLHLHGRQKQTARLEITSRFTAARHSCLFATDVVARGIDFPSVDWVIQVDCPEDVDTYIHRVGRTARYQSNGHAVLFLDPSEEQGMIKKLEQKRIPVKKVHVKETKKRSIKNQLQNMCFRNPDLKYLGQKAFISYTRAIHLQKDKDIFKLKQLDLDGYAASMGLPGTPQIKFQKGEDVKKLKNAPRKCMSSGSESDLDSDGQRKKKSKKEVRTKYDKMFERKNQDVLSSHYAKLVPNGPSDDRAQATDNNKGNEDDDDDFLQVKRRLNDKDLEDESRKAAHPLPKTIQIGGDHPYIIDSKRREKALLSKKKMLKFKGTGSKLIFDDQGLPHETYELQDEADFASHGPAEEQRRRFAAVESARARDADEGDRLLAKMRRREKRERAKAREMAELRGGREEEEDGRPSKKMKRERSDSKGNKRSVIEVDGQPETLEDLEALATGLLDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.17
4 0.16
5 0.17
6 0.14
7 0.12
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.11
12 0.15
13 0.18
14 0.2
15 0.21
16 0.2
17 0.21
18 0.22
19 0.22
20 0.19
21 0.16
22 0.15
23 0.18
24 0.19
25 0.2
26 0.18
27 0.2
28 0.2
29 0.2
30 0.24
31 0.27
32 0.31
33 0.35
34 0.4
35 0.41
36 0.47
37 0.55
38 0.56
39 0.55
40 0.55
41 0.54
42 0.53
43 0.57
44 0.5
45 0.41
46 0.37
47 0.31
48 0.33
49 0.29
50 0.27
51 0.19
52 0.2
53 0.2
54 0.18
55 0.18
56 0.12
57 0.11
58 0.12
59 0.13
60 0.13
61 0.17
62 0.18
63 0.18
64 0.22
65 0.22
66 0.21
67 0.22
68 0.21
69 0.19
70 0.26
71 0.25
72 0.21
73 0.2
74 0.2
75 0.22
76 0.22
77 0.25
78 0.2
79 0.22
80 0.22
81 0.24
82 0.26
83 0.28
84 0.29
85 0.28
86 0.27
87 0.3
88 0.35
89 0.38
90 0.4
91 0.4
92 0.4
93 0.39
94 0.43
95 0.38
96 0.39
97 0.4
98 0.44
99 0.4
100 0.43
101 0.44
102 0.42
103 0.44
104 0.46
105 0.5
106 0.52
107 0.58
108 0.61
109 0.6
110 0.64
111 0.69
112 0.68
113 0.68
114 0.67
115 0.7
116 0.72
117 0.79
118 0.83
119 0.85
120 0.87
121 0.87
122 0.87
123 0.86
124 0.88
125 0.88
126 0.79
127 0.72
128 0.63
129 0.53
130 0.43
131 0.33
132 0.21
133 0.13
134 0.11
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.1
140 0.16
141 0.17
142 0.17
143 0.18
144 0.19
145 0.21
146 0.25
147 0.24
148 0.24
149 0.23
150 0.25
151 0.27
152 0.28
153 0.25
154 0.22
155 0.22
156 0.17
157 0.17
158 0.13
159 0.1
160 0.09
161 0.14
162 0.15
163 0.17
164 0.15
165 0.15
166 0.19
167 0.22
168 0.26
169 0.27
170 0.27
171 0.25
172 0.27
173 0.27
174 0.24
175 0.22
176 0.18
177 0.12
178 0.15
179 0.16
180 0.15
181 0.15
182 0.15
183 0.14
184 0.13
185 0.13
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.12
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.11
203 0.12
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.15
208 0.17
209 0.18
210 0.19
211 0.18
212 0.22
213 0.24
214 0.22
215 0.19
216 0.16
217 0.14
218 0.12
219 0.11
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.12
240 0.2
241 0.25
242 0.28
243 0.29
244 0.32
245 0.32
246 0.29
247 0.3
248 0.21
249 0.16
250 0.13
251 0.1
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.11
261 0.17
262 0.18
263 0.19
264 0.19
265 0.19
266 0.18
267 0.19
268 0.16
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.14
275 0.13
276 0.14
277 0.17
278 0.19
279 0.25
280 0.24
281 0.24
282 0.21
283 0.21
284 0.2
285 0.16
286 0.12
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.1
319 0.11
320 0.12
321 0.15
322 0.19
323 0.18
324 0.21
325 0.23
326 0.23
327 0.27
328 0.27
329 0.33
330 0.29
331 0.32
332 0.3
333 0.28
334 0.27
335 0.26
336 0.27
337 0.23
338 0.24
339 0.24
340 0.28
341 0.28
342 0.28
343 0.29
344 0.28
345 0.24
346 0.22
347 0.2
348 0.18
349 0.18
350 0.19
351 0.17
352 0.16
353 0.14
354 0.15
355 0.13
356 0.1
357 0.11
358 0.09
359 0.07
360 0.07
361 0.08
362 0.1
363 0.1
364 0.11
365 0.1
366 0.11
367 0.12
368 0.13
369 0.13
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.1
376 0.1
377 0.12
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.12
383 0.13
384 0.16
385 0.15
386 0.2
387 0.21
388 0.21
389 0.21
390 0.2
391 0.27
392 0.23
393 0.22
394 0.18
395 0.2
396 0.21
397 0.24
398 0.26
399 0.19
400 0.21
401 0.2
402 0.21
403 0.19
404 0.17
405 0.19
406 0.21
407 0.24
408 0.24
409 0.25
410 0.25
411 0.23
412 0.23
413 0.18
414 0.19
415 0.16
416 0.14
417 0.13
418 0.13
419 0.17
420 0.18
421 0.2
422 0.21
423 0.23
424 0.25
425 0.27
426 0.31
427 0.29
428 0.32
429 0.32
430 0.28
431 0.28
432 0.28
433 0.29
434 0.25
435 0.23
436 0.18
437 0.16
438 0.2
439 0.19
440 0.21
441 0.18
442 0.19
443 0.18
444 0.19
445 0.19
446 0.13
447 0.14
448 0.1
449 0.1
450 0.09
451 0.09
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.06
456 0.06
457 0.05
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.06
462 0.06
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.06
467 0.05
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.09
475 0.12
476 0.12
477 0.12
478 0.13
479 0.16
480 0.21
481 0.25
482 0.27
483 0.27
484 0.3
485 0.31
486 0.32
487 0.35
488 0.31
489 0.26
490 0.22
491 0.19
492 0.17
493 0.16
494 0.14
495 0.08
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.06
501 0.08
502 0.1
503 0.1
504 0.12
505 0.19
506 0.22
507 0.3
508 0.33
509 0.38
510 0.47
511 0.56
512 0.59
513 0.58
514 0.62
515 0.63
516 0.66
517 0.68
518 0.67
519 0.66
520 0.7
521 0.74
522 0.77
523 0.74
524 0.73
525 0.73
526 0.74
527 0.76
528 0.77
529 0.76
530 0.73
531 0.71
532 0.73
533 0.68
534 0.59
535 0.49
536 0.41
537 0.38
538 0.31
539 0.3
540 0.27
541 0.27
542 0.29
543 0.34
544 0.35
545 0.31
546 0.31
547 0.28
548 0.27
549 0.25
550 0.25
551 0.2
552 0.2
553 0.19
554 0.23
555 0.22
556 0.24
557 0.3
558 0.29
559 0.32
560 0.36
561 0.36
562 0.38
563 0.44
564 0.4
565 0.39
566 0.45
567 0.4
568 0.39
569 0.39
570 0.35
571 0.29
572 0.29
573 0.22
574 0.13
575 0.13
576 0.08
577 0.07
578 0.06
579 0.04
580 0.03
581 0.03
582 0.04
583 0.06
584 0.07
585 0.11
586 0.15
587 0.19
588 0.2
589 0.21
590 0.31
591 0.35
592 0.41
593 0.46
594 0.51
595 0.48
596 0.54
597 0.62
598 0.58
599 0.61
600 0.61
601 0.61
602 0.61
603 0.65
604 0.61
605 0.59
606 0.55
607 0.53
608 0.5
609 0.45
610 0.4
611 0.34
612 0.33
613 0.27
614 0.25
615 0.18
616 0.22
617 0.23
618 0.26
619 0.32
620 0.39
621 0.46
622 0.55
623 0.65
624 0.7
625 0.75
626 0.8
627 0.86
628 0.88
629 0.9
630 0.88
631 0.85
632 0.83
633 0.8
634 0.76
635 0.75
636 0.73
637 0.71
638 0.68
639 0.65
640 0.57
641 0.52
642 0.46
643 0.42
644 0.42
645 0.37
646 0.33
647 0.31
648 0.31
649 0.28
650 0.3
651 0.3
652 0.24
653 0.23
654 0.27
655 0.26
656 0.27
657 0.29
658 0.29
659 0.24
660 0.23
661 0.23
662 0.25
663 0.26
664 0.32
665 0.35
666 0.33
667 0.33
668 0.32
669 0.31
670 0.27
671 0.27
672 0.21
673 0.19
674 0.18
675 0.18
676 0.18
677 0.18
678 0.23
679 0.23
680 0.26
681 0.29
682 0.34
683 0.38
684 0.41
685 0.48
686 0.44
687 0.48
688 0.48
689 0.5
690 0.47
691 0.44
692 0.41
693 0.38
694 0.34
695 0.29
696 0.3
697 0.31
698 0.33
699 0.39
700 0.41
701 0.45
702 0.47
703 0.45
704 0.43
705 0.38
706 0.35
707 0.31
708 0.28
709 0.2
710 0.18
711 0.18
712 0.16
713 0.16
714 0.21
715 0.22
716 0.3
717 0.36
718 0.38
719 0.38
720 0.41
721 0.5
722 0.54
723 0.6
724 0.59
725 0.63
726 0.69
727 0.75
728 0.79
729 0.74
730 0.72
731 0.67
732 0.69
733 0.7
734 0.66
735 0.66
736 0.61
737 0.6
738 0.52
739 0.48
740 0.39
741 0.29
742 0.3
743 0.24
744 0.25
745 0.23
746 0.23
747 0.2
748 0.21
749 0.2
750 0.16
751 0.18
752 0.15
753 0.12
754 0.11
755 0.12
756 0.11
757 0.12
758 0.11
759 0.08
760 0.09
761 0.08
762 0.08
763 0.1
764 0.14
765 0.23
766 0.31
767 0.34
768 0.37
769 0.38
770 0.41
771 0.41
772 0.38
773 0.39
774 0.36
775 0.42
776 0.42
777 0.43
778 0.41
779 0.39
780 0.38
781 0.31
782 0.29
783 0.23
784 0.22
785 0.21
786 0.21
787 0.23
788 0.22
789 0.25
790 0.26
791 0.29
792 0.35
793 0.44
794 0.53
795 0.6
796 0.71
797 0.76
798 0.83
799 0.88
800 0.9
801 0.89
802 0.9
803 0.88
804 0.81
805 0.8
806 0.7
807 0.64
808 0.61
809 0.54
810 0.45
811 0.44
812 0.41
813 0.32
814 0.31
815 0.3
816 0.25
817 0.27
818 0.29
819 0.27
820 0.29
821 0.3
822 0.34
823 0.39
824 0.44
825 0.5
826 0.57
827 0.65
828 0.73
829 0.81
830 0.85
831 0.88
832 0.9
833 0.91
834 0.89
835 0.83
836 0.79
837 0.7
838 0.67
839 0.6
840 0.55
841 0.5
842 0.44
843 0.45
844 0.39
845 0.37
846 0.32
847 0.27
848 0.23
849 0.17
850 0.13
851 0.08
852 0.07
853 0.07
854 0.07
855 0.07
856 0.05