Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5Z874

Protein Details
Accession A0A2C5Z874    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
354-375SHQTRWIRWKQMRRLRHQGPDAHydrophilic
452-478EEAWQRHVRGKNHRRVLRKRKMLELVPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
460-472RGKNHRRVLRKRK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 10, cyto 2, pero 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR018022  IPT  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
Amino Acid Sequences MLRLLARLVSQSRITVASAMADCAPKMTACAPPTTTASSTTAARSPPTEPLIVVLGSTGTGKSDLALELASRFNGEVINADAMQLYDGLPILTNKMPVSAQRGIRHHLLGHISPLDPPWNVDVFKREASRAVADIRSRGKLPILVGGTHYYLDALLFPDVLLDTVRHEDQGNDAVPHHHYPLLDQPTDVLLAELRKCDPIMADRWHPNDRRKIQRSLEIFLSTGRPASDFYAEQEQRRSAAIQHQHHHDHHPWDKLLLWVHADREPLCRRLDRRVDAMLQAGLLDEVRQLYHLRRNAPRPYDMTKGIWQSIGYRQFEPYLDALLDTVPAPTSSLPALKTAALEGVKAATRRYASHQTRWIRWKQMRRLRHQGPDAVSSLYLVDSTEPDLFRDRVLDPAAELVSLFLRGEPRPLPTDLSPCARHVLSAAWDSPTPEVRRKRTCDVCQITLLTEEAWQRHVRGKNHRRVLRKRKMLELVPYEAPEQRPQSPSQDGSSSPEIASLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.19
3 0.17
4 0.17
5 0.16
6 0.17
7 0.17
8 0.16
9 0.15
10 0.15
11 0.16
12 0.11
13 0.13
14 0.14
15 0.19
16 0.2
17 0.24
18 0.25
19 0.27
20 0.31
21 0.33
22 0.32
23 0.28
24 0.3
25 0.28
26 0.27
27 0.27
28 0.27
29 0.24
30 0.24
31 0.24
32 0.23
33 0.27
34 0.29
35 0.27
36 0.23
37 0.24
38 0.24
39 0.22
40 0.19
41 0.13
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.07
46 0.06
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.1
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.1
65 0.12
66 0.11
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.09
72 0.07
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.14
83 0.14
84 0.16
85 0.23
86 0.26
87 0.31
88 0.36
89 0.4
90 0.42
91 0.44
92 0.44
93 0.37
94 0.35
95 0.33
96 0.26
97 0.26
98 0.24
99 0.21
100 0.2
101 0.21
102 0.19
103 0.15
104 0.15
105 0.15
106 0.16
107 0.17
108 0.18
109 0.21
110 0.22
111 0.26
112 0.27
113 0.25
114 0.25
115 0.27
116 0.27
117 0.25
118 0.25
119 0.24
120 0.23
121 0.27
122 0.28
123 0.27
124 0.26
125 0.25
126 0.23
127 0.21
128 0.21
129 0.22
130 0.21
131 0.19
132 0.19
133 0.2
134 0.19
135 0.17
136 0.16
137 0.1
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.05
149 0.04
150 0.06
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.16
158 0.15
159 0.13
160 0.14
161 0.14
162 0.17
163 0.18
164 0.17
165 0.15
166 0.13
167 0.14
168 0.22
169 0.26
170 0.23
171 0.22
172 0.21
173 0.2
174 0.2
175 0.19
176 0.1
177 0.06
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.16
188 0.19
189 0.24
190 0.28
191 0.32
192 0.39
193 0.43
194 0.46
195 0.51
196 0.55
197 0.61
198 0.61
199 0.65
200 0.62
201 0.65
202 0.61
203 0.54
204 0.48
205 0.38
206 0.33
207 0.26
208 0.24
209 0.16
210 0.14
211 0.11
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.11
216 0.09
217 0.11
218 0.2
219 0.21
220 0.22
221 0.23
222 0.22
223 0.21
224 0.21
225 0.2
226 0.12
227 0.18
228 0.25
229 0.28
230 0.31
231 0.35
232 0.38
233 0.39
234 0.42
235 0.39
236 0.37
237 0.37
238 0.37
239 0.32
240 0.29
241 0.28
242 0.26
243 0.23
244 0.17
245 0.15
246 0.12
247 0.14
248 0.15
249 0.16
250 0.14
251 0.2
252 0.22
253 0.22
254 0.23
255 0.26
256 0.26
257 0.34
258 0.41
259 0.37
260 0.38
261 0.38
262 0.37
263 0.34
264 0.33
265 0.24
266 0.16
267 0.13
268 0.1
269 0.07
270 0.05
271 0.04
272 0.03
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.06
277 0.09
278 0.15
279 0.19
280 0.24
281 0.3
282 0.37
283 0.44
284 0.46
285 0.47
286 0.45
287 0.47
288 0.45
289 0.42
290 0.38
291 0.35
292 0.34
293 0.31
294 0.27
295 0.23
296 0.21
297 0.25
298 0.28
299 0.26
300 0.25
301 0.25
302 0.25
303 0.26
304 0.25
305 0.19
306 0.14
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.08
311 0.08
312 0.06
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.07
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.1
327 0.13
328 0.11
329 0.1
330 0.09
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.13
337 0.15
338 0.21
339 0.3
340 0.34
341 0.41
342 0.49
343 0.52
344 0.59
345 0.65
346 0.65
347 0.64
348 0.67
349 0.7
350 0.71
351 0.75
352 0.77
353 0.78
354 0.82
355 0.8
356 0.81
357 0.76
358 0.71
359 0.65
360 0.59
361 0.51
362 0.42
363 0.34
364 0.25
365 0.2
366 0.14
367 0.1
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.08
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.16
376 0.16
377 0.16
378 0.18
379 0.17
380 0.18
381 0.19
382 0.18
383 0.14
384 0.16
385 0.16
386 0.13
387 0.12
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.07
393 0.1
394 0.1
395 0.14
396 0.15
397 0.19
398 0.22
399 0.23
400 0.26
401 0.26
402 0.32
403 0.32
404 0.37
405 0.35
406 0.33
407 0.35
408 0.31
409 0.28
410 0.23
411 0.23
412 0.2
413 0.21
414 0.21
415 0.19
416 0.2
417 0.21
418 0.23
419 0.27
420 0.27
421 0.33
422 0.41
423 0.48
424 0.57
425 0.62
426 0.7
427 0.73
428 0.76
429 0.78
430 0.77
431 0.71
432 0.66
433 0.6
434 0.52
435 0.43
436 0.36
437 0.25
438 0.21
439 0.2
440 0.17
441 0.2
442 0.2
443 0.21
444 0.28
445 0.35
446 0.4
447 0.49
448 0.58
449 0.65
450 0.74
451 0.8
452 0.82
453 0.86
454 0.89
455 0.89
456 0.89
457 0.83
458 0.83
459 0.84
460 0.79
461 0.78
462 0.72
463 0.67
464 0.59
465 0.56
466 0.48
467 0.44
468 0.41
469 0.38
470 0.36
471 0.37
472 0.37
473 0.39
474 0.43
475 0.46
476 0.46
477 0.44
478 0.42
479 0.38
480 0.41
481 0.42
482 0.37
483 0.3