Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XCW8

Protein Details
Accession A0A2C5XCW8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
659-683EYPITYKAKGNRKGKHRGSTSPQAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
507-511KRRPR
669-673NRKGK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.5, cyto 9.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027040  PSMD4  
IPR003903  UIM_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0008540  C:proteasome regulatory particle, base subcomplex  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
Amino Acid Sequences MQVAALPYGEGGGPASVPSVMDVSQPYGVLVGEGFPGGRAHFRGASEMCGRYLDVGAADAAGSLPGVPRIPQAAEAICSVWIAKSTMTPVTTQSICGMLTGSTLGIITAYSLGWDPAVARRSDGDMTARWIVSPGIPIIALKIDDGYSPGRKSASRMWAVALNALGEVYYLTETPAATTKPSSGENAHQRAWLAGQSAQWRLIEATRRVRRQDEPACDASEGEQQQLVAETERLMRLGPAHVRRLYEGWDMQRRLEADFAADDGNGAGEGVFVLNCGLAADLPVCVSRWSRSVVVCDAVPEPGERQSADGLQPARLHEWRRSQLDLTGHGQAVISASGMDCSSYALLTLTEDPLHAAKQTSTASFNARDAYEVPGRRARFLAVGTDSGAIVVWNARQHHETRIQPVRIIQTESPEITSLAVSALYLVHGGSDGLVQAWDPLASTTDAIRTIHDRSGGRALRQTAGSNTAARTIFLDPDPTVLRGVVSLGTLIRFWSYSSANQAVGRKRRPRHSDVHGRIASRRLGGVVSGYIAAEEAEVRREKEQLAREQARLRKRFGSLGDLTEEEALRYAQMVSQEAYLEDERRRASDSAADASLDTASSLGETTVDTVTPPPSIAEASPSPRDTTSDAENESEQQMQQALRLSLLEAGGSPPGGFEYPITYKAKGNRKGKHRGSTSPQAGSSALWDDEDEDEALARALSLSLQDQAAVEASSSSSPLRRDDFPPLDGGGEVSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.07
4 0.07
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.1
9 0.12
10 0.14
11 0.15
12 0.15
13 0.14
14 0.13
15 0.12
16 0.1
17 0.09
18 0.07
19 0.06
20 0.07
21 0.06
22 0.07
23 0.08
24 0.09
25 0.12
26 0.13
27 0.16
28 0.19
29 0.2
30 0.26
31 0.26
32 0.31
33 0.32
34 0.32
35 0.29
36 0.27
37 0.26
38 0.21
39 0.21
40 0.16
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.08
45 0.08
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.04
50 0.04
51 0.05
52 0.06
53 0.07
54 0.08
55 0.1
56 0.13
57 0.14
58 0.16
59 0.18
60 0.18
61 0.19
62 0.19
63 0.18
64 0.15
65 0.14
66 0.13
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.1
72 0.13
73 0.16
74 0.17
75 0.18
76 0.19
77 0.23
78 0.23
79 0.22
80 0.2
81 0.18
82 0.17
83 0.16
84 0.15
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.12
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.17
108 0.21
109 0.22
110 0.23
111 0.2
112 0.18
113 0.22
114 0.25
115 0.23
116 0.2
117 0.2
118 0.18
119 0.16
120 0.16
121 0.12
122 0.09
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.1
133 0.13
134 0.16
135 0.17
136 0.18
137 0.2
138 0.2
139 0.24
140 0.31
141 0.36
142 0.35
143 0.35
144 0.35
145 0.37
146 0.37
147 0.34
148 0.26
149 0.17
150 0.13
151 0.12
152 0.1
153 0.06
154 0.05
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.16
169 0.18
170 0.18
171 0.26
172 0.34
173 0.38
174 0.38
175 0.36
176 0.35
177 0.32
178 0.31
179 0.24
180 0.17
181 0.14
182 0.16
183 0.18
184 0.2
185 0.21
186 0.2
187 0.19
188 0.18
189 0.2
190 0.24
191 0.26
192 0.35
193 0.41
194 0.46
195 0.49
196 0.52
197 0.53
198 0.55
199 0.58
200 0.55
201 0.53
202 0.51
203 0.49
204 0.45
205 0.41
206 0.32
207 0.3
208 0.23
209 0.18
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.13
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.12
225 0.19
226 0.21
227 0.27
228 0.29
229 0.3
230 0.31
231 0.31
232 0.31
233 0.28
234 0.27
235 0.28
236 0.34
237 0.34
238 0.32
239 0.34
240 0.31
241 0.28
242 0.25
243 0.18
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.02
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.06
273 0.07
274 0.08
275 0.1
276 0.13
277 0.15
278 0.16
279 0.18
280 0.19
281 0.19
282 0.18
283 0.17
284 0.15
285 0.13
286 0.12
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.11
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.12
295 0.12
296 0.14
297 0.13
298 0.14
299 0.15
300 0.15
301 0.17
302 0.19
303 0.21
304 0.23
305 0.3
306 0.33
307 0.35
308 0.36
309 0.34
310 0.35
311 0.35
312 0.32
313 0.27
314 0.24
315 0.2
316 0.19
317 0.18
318 0.14
319 0.12
320 0.08
321 0.06
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.03
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.11
349 0.12
350 0.14
351 0.15
352 0.15
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.12
357 0.15
358 0.17
359 0.17
360 0.18
361 0.22
362 0.22
363 0.22
364 0.22
365 0.19
366 0.16
367 0.15
368 0.16
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.11
374 0.09
375 0.08
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.05
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.11
384 0.13
385 0.18
386 0.24
387 0.25
388 0.3
389 0.37
390 0.37
391 0.35
392 0.37
393 0.36
394 0.31
395 0.32
396 0.25
397 0.2
398 0.21
399 0.21
400 0.19
401 0.15
402 0.14
403 0.11
404 0.1
405 0.07
406 0.05
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.05
429 0.05
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.09
435 0.09
436 0.11
437 0.13
438 0.14
439 0.18
440 0.17
441 0.19
442 0.27
443 0.28
444 0.27
445 0.28
446 0.29
447 0.26
448 0.27
449 0.26
450 0.18
451 0.21
452 0.21
453 0.18
454 0.17
455 0.19
456 0.18
457 0.17
458 0.17
459 0.14
460 0.15
461 0.14
462 0.16
463 0.11
464 0.14
465 0.15
466 0.14
467 0.13
468 0.11
469 0.11
470 0.09
471 0.09
472 0.07
473 0.06
474 0.05
475 0.05
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.08
483 0.1
484 0.11
485 0.16
486 0.18
487 0.19
488 0.22
489 0.27
490 0.32
491 0.38
492 0.46
493 0.49
494 0.55
495 0.63
496 0.68
497 0.69
498 0.7
499 0.72
500 0.74
501 0.71
502 0.75
503 0.68
504 0.61
505 0.57
506 0.53
507 0.45
508 0.34
509 0.29
510 0.19
511 0.16
512 0.15
513 0.13
514 0.09
515 0.08
516 0.07
517 0.07
518 0.06
519 0.06
520 0.05
521 0.04
522 0.05
523 0.05
524 0.08
525 0.1
526 0.12
527 0.13
528 0.14
529 0.16
530 0.22
531 0.28
532 0.32
533 0.41
534 0.43
535 0.47
536 0.53
537 0.58
538 0.61
539 0.58
540 0.54
541 0.5
542 0.48
543 0.49
544 0.44
545 0.45
546 0.38
547 0.36
548 0.34
549 0.29
550 0.28
551 0.24
552 0.22
553 0.14
554 0.12
555 0.1
556 0.07
557 0.08
558 0.07
559 0.07
560 0.08
561 0.1
562 0.1
563 0.11
564 0.11
565 0.11
566 0.14
567 0.14
568 0.16
569 0.16
570 0.19
571 0.19
572 0.2
573 0.24
574 0.21
575 0.21
576 0.24
577 0.25
578 0.25
579 0.24
580 0.23
581 0.19
582 0.19
583 0.18
584 0.12
585 0.09
586 0.05
587 0.05
588 0.04
589 0.05
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.06
594 0.07
595 0.07
596 0.07
597 0.09
598 0.1
599 0.1
600 0.1
601 0.09
602 0.1
603 0.11
604 0.11
605 0.14
606 0.17
607 0.22
608 0.26
609 0.27
610 0.28
611 0.27
612 0.29
613 0.27
614 0.27
615 0.27
616 0.27
617 0.27
618 0.27
619 0.27
620 0.27
621 0.26
622 0.24
623 0.19
624 0.15
625 0.17
626 0.15
627 0.16
628 0.19
629 0.17
630 0.16
631 0.16
632 0.16
633 0.15
634 0.15
635 0.13
636 0.08
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.08
641 0.06
642 0.08
643 0.08
644 0.08
645 0.07
646 0.13
647 0.16
648 0.22
649 0.25
650 0.25
651 0.29
652 0.38
653 0.47
654 0.51
655 0.58
656 0.61
657 0.67
658 0.77
659 0.82
660 0.83
661 0.8
662 0.79
663 0.78
664 0.81
665 0.78
666 0.71
667 0.63
668 0.54
669 0.48
670 0.39
671 0.33
672 0.25
673 0.19
674 0.15
675 0.14
676 0.14
677 0.14
678 0.16
679 0.14
680 0.1
681 0.1
682 0.1
683 0.1
684 0.08
685 0.07
686 0.05
687 0.05
688 0.05
689 0.06
690 0.08
691 0.09
692 0.1
693 0.1
694 0.1
695 0.11
696 0.12
697 0.1
698 0.09
699 0.07
700 0.09
701 0.09
702 0.1
703 0.11
704 0.13
705 0.16
706 0.2
707 0.24
708 0.28
709 0.31
710 0.41
711 0.44
712 0.42
713 0.43
714 0.39
715 0.35
716 0.31
717 0.28