Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YNP8

Protein Details
Accession A0A2C5YNP8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
467-494DDKSPKRSKFFPSPKPKGPRRTASEPYLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
472-487KRSKFFPSPKPKGPRR
Subcellular Location(s) nucl 9cyto 9cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR037315  EXO1_H3TH  
IPR008918  HhH2  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR044752  PIN-like_EXO1  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR019974  XPG_CS  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0035312  F:5'-3' DNA exonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00842  XPG_2  
CDD cd09908  H3TH_EXO1  
cd09857  PIN_EXO1  
Amino Acid Sequences MGVSGLLPLLKSTHRPTEIKKYKGKTLGVDAFVKSAMHRVKMLRHFDITPYMVFDGDFLPSKAATEESRAKNRQEKRRMALELMKAGKSAQAAQEFQKCIDITPQMASMLIQELKKMGIPYVVAPYEADAQLVYLERHGFVDGIISDDSDLLVFGAKRLLTKLDQYGNCVEVNRRDFCACREVSLAGWTDTEFRRMAILSGCDYLDNLPGVGLKTAYRLLRKGKTPERVVRMLQFEGKRVSENYLTQFYQAEMTFLHQWVFCPTKKKLVHLTELDEKRTAEEMPFIGSYVEPELARAVAAGDVDPITKKPIMLQTTPSKRRHSQAMPTLATQPPSKPINSYFKGANRIPMGEMDPNCFSIDAQRVAQITQGGLVPRVFPLPRPYVDEFRRGRAKAPEQADANPSQTSPRLGQVGQRRTEPQASSQPEAVNNPAPSRSVSDGTGSLAAKSQPNRPIKKVRLCGDVDDDDKSPKRSKFFPSPKPKGPRRTASEPYLLSDDSIEAALGELPDVDGWASVQKREKPVAVFRDATPSCNKIGVNGRKDADNGIPEDSAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.43
3 0.49
4 0.58
5 0.66
6 0.69
7 0.72
8 0.69
9 0.72
10 0.75
11 0.72
12 0.66
13 0.66
14 0.65
15 0.6
16 0.58
17 0.49
18 0.42
19 0.38
20 0.33
21 0.23
22 0.24
23 0.23
24 0.22
25 0.26
26 0.28
27 0.37
28 0.46
29 0.53
30 0.49
31 0.49
32 0.48
33 0.47
34 0.5
35 0.42
36 0.34
37 0.3
38 0.26
39 0.22
40 0.2
41 0.18
42 0.13
43 0.13
44 0.14
45 0.11
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.12
50 0.14
51 0.13
52 0.18
53 0.27
54 0.34
55 0.44
56 0.47
57 0.52
58 0.59
59 0.67
60 0.71
61 0.73
62 0.74
63 0.72
64 0.76
65 0.74
66 0.71
67 0.69
68 0.64
69 0.61
70 0.56
71 0.49
72 0.4
73 0.36
74 0.32
75 0.26
76 0.23
77 0.2
78 0.22
79 0.23
80 0.28
81 0.35
82 0.34
83 0.33
84 0.35
85 0.3
86 0.26
87 0.28
88 0.26
89 0.2
90 0.21
91 0.21
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.12
96 0.14
97 0.15
98 0.13
99 0.13
100 0.13
101 0.14
102 0.16
103 0.15
104 0.12
105 0.11
106 0.11
107 0.13
108 0.18
109 0.17
110 0.16
111 0.15
112 0.16
113 0.17
114 0.17
115 0.15
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.11
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.09
127 0.07
128 0.1
129 0.08
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.09
136 0.06
137 0.06
138 0.03
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.13
147 0.13
148 0.16
149 0.21
150 0.27
151 0.27
152 0.3
153 0.31
154 0.3
155 0.29
156 0.27
157 0.24
158 0.23
159 0.27
160 0.25
161 0.25
162 0.25
163 0.26
164 0.27
165 0.33
166 0.26
167 0.23
168 0.23
169 0.21
170 0.2
171 0.22
172 0.21
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.14
177 0.13
178 0.15
179 0.13
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.12
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.09
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.11
203 0.13
204 0.15
205 0.18
206 0.24
207 0.29
208 0.34
209 0.41
210 0.46
211 0.51
212 0.57
213 0.6
214 0.6
215 0.58
216 0.54
217 0.5
218 0.46
219 0.39
220 0.37
221 0.31
222 0.27
223 0.26
224 0.25
225 0.22
226 0.2
227 0.21
228 0.17
229 0.19
230 0.19
231 0.21
232 0.2
233 0.19
234 0.19
235 0.16
236 0.16
237 0.14
238 0.11
239 0.08
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.09
245 0.09
246 0.12
247 0.16
248 0.15
249 0.2
250 0.21
251 0.3
252 0.31
253 0.34
254 0.4
255 0.41
256 0.45
257 0.41
258 0.45
259 0.44
260 0.44
261 0.42
262 0.34
263 0.29
264 0.24
265 0.23
266 0.19
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.1
297 0.16
298 0.19
299 0.2
300 0.25
301 0.32
302 0.42
303 0.51
304 0.53
305 0.53
306 0.52
307 0.54
308 0.57
309 0.53
310 0.52
311 0.51
312 0.55
313 0.5
314 0.48
315 0.49
316 0.42
317 0.38
318 0.31
319 0.23
320 0.21
321 0.21
322 0.2
323 0.19
324 0.24
325 0.31
326 0.32
327 0.34
328 0.32
329 0.34
330 0.41
331 0.39
332 0.38
333 0.3
334 0.29
335 0.27
336 0.24
337 0.23
338 0.21
339 0.21
340 0.19
341 0.19
342 0.19
343 0.19
344 0.17
345 0.15
346 0.14
347 0.17
348 0.16
349 0.16
350 0.17
351 0.17
352 0.17
353 0.19
354 0.15
355 0.11
356 0.1
357 0.11
358 0.09
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.12
364 0.11
365 0.12
366 0.18
367 0.21
368 0.22
369 0.28
370 0.32
371 0.37
372 0.4
373 0.47
374 0.43
375 0.46
376 0.52
377 0.46
378 0.47
379 0.47
380 0.51
381 0.49
382 0.5
383 0.49
384 0.43
385 0.45
386 0.44
387 0.37
388 0.33
389 0.26
390 0.22
391 0.19
392 0.18
393 0.18
394 0.16
395 0.17
396 0.18
397 0.18
398 0.25
399 0.32
400 0.39
401 0.39
402 0.4
403 0.4
404 0.42
405 0.47
406 0.42
407 0.38
408 0.39
409 0.41
410 0.41
411 0.41
412 0.39
413 0.35
414 0.36
415 0.33
416 0.3
417 0.26
418 0.25
419 0.23
420 0.22
421 0.21
422 0.24
423 0.24
424 0.2
425 0.2
426 0.21
427 0.2
428 0.21
429 0.23
430 0.19
431 0.16
432 0.16
433 0.17
434 0.19
435 0.21
436 0.27
437 0.31
438 0.41
439 0.47
440 0.52
441 0.61
442 0.66
443 0.74
444 0.76
445 0.72
446 0.71
447 0.67
448 0.63
449 0.59
450 0.54
451 0.45
452 0.39
453 0.35
454 0.33
455 0.34
456 0.35
457 0.36
458 0.36
459 0.39
460 0.42
461 0.49
462 0.55
463 0.62
464 0.68
465 0.73
466 0.78
467 0.83
468 0.88
469 0.88
470 0.88
471 0.87
472 0.86
473 0.83
474 0.83
475 0.8
476 0.76
477 0.74
478 0.65
479 0.58
480 0.52
481 0.43
482 0.34
483 0.28
484 0.22
485 0.15
486 0.14
487 0.1
488 0.06
489 0.07
490 0.07
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.05
498 0.04
499 0.05
500 0.11
501 0.12
502 0.17
503 0.24
504 0.3
505 0.36
506 0.41
507 0.45
508 0.46
509 0.54
510 0.57
511 0.56
512 0.53
513 0.48
514 0.54
515 0.5
516 0.47
517 0.44
518 0.39
519 0.34
520 0.35
521 0.33
522 0.29
523 0.4
524 0.46
525 0.45
526 0.5
527 0.5
528 0.48
529 0.5
530 0.47
531 0.42
532 0.37
533 0.33
534 0.29