Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XT29

Protein Details
Accession A0A2C5XT29    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
395-428VPDVILVKKHYPRQQRNRRRHWKLKRMDKDEGELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
406-433PRQQRNRRRHWKLKRMDKDEGELLPKKA
437-448RMAREMRRSRTR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039768  Nmd3  
IPR007064  Nmd3_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04981  NMD3  
Amino Acid Sequences MAIGDTQQQTAATILCCNCGAPIDGTTSTGALCFACVKLTVDISQGVQREATLNFCRDCDRWLMPPTSWVVAMPESRELLALCLKKLRGLNKVRIVDAAFVWTEPHSRRIKVKITVQDSVQDGVLLQQSFEVVYIVATQQCPECAKSYTANVWRACVQVRQKVLHKRTFLFLEQLIMKHGAHRDTLNIKEAKDGIDFFFSQRNQAVHFIDFLNSVVPVKVKASQELISQDIHTSKKSFKFTYSAELVPICRDDLVAMPIRLAKQCGNISPLVLCHKIGTSVYLVDPQTLQTADISAPIYWRAPFASLADSRELVEFIVMDIERTATRKGKWVLAEVTVARASDLGVNDKTYFTRTHLGHYLRTGDSVMGYMLTGTMFNNADYEAIEESSTYSSTVPDVILVKKHYPRQQRNRRRHWKLKRMDKDEGELLPKKADQDRMAREMRRSRTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.18
4 0.17
5 0.16
6 0.16
7 0.17
8 0.14
9 0.15
10 0.17
11 0.18
12 0.19
13 0.19
14 0.18
15 0.15
16 0.14
17 0.13
18 0.08
19 0.08
20 0.09
21 0.08
22 0.09
23 0.1
24 0.13
25 0.14
26 0.16
27 0.16
28 0.17
29 0.18
30 0.19
31 0.21
32 0.2
33 0.19
34 0.17
35 0.16
36 0.17
37 0.16
38 0.21
39 0.21
40 0.24
41 0.24
42 0.25
43 0.29
44 0.27
45 0.29
46 0.29
47 0.28
48 0.3
49 0.35
50 0.37
51 0.33
52 0.36
53 0.37
54 0.32
55 0.29
56 0.22
57 0.19
58 0.19
59 0.2
60 0.18
61 0.17
62 0.17
63 0.17
64 0.17
65 0.15
66 0.14
67 0.19
68 0.19
69 0.17
70 0.21
71 0.21
72 0.25
73 0.3
74 0.33
75 0.37
76 0.43
77 0.51
78 0.56
79 0.58
80 0.55
81 0.53
82 0.48
83 0.4
84 0.32
85 0.26
86 0.17
87 0.14
88 0.14
89 0.12
90 0.15
91 0.15
92 0.23
93 0.24
94 0.28
95 0.33
96 0.4
97 0.47
98 0.49
99 0.56
100 0.57
101 0.58
102 0.58
103 0.53
104 0.49
105 0.43
106 0.37
107 0.29
108 0.2
109 0.14
110 0.13
111 0.15
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.07
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.1
128 0.11
129 0.12
130 0.14
131 0.14
132 0.17
133 0.18
134 0.21
135 0.26
136 0.31
137 0.37
138 0.35
139 0.34
140 0.34
141 0.33
142 0.31
143 0.3
144 0.29
145 0.28
146 0.32
147 0.34
148 0.4
149 0.49
150 0.55
151 0.55
152 0.53
153 0.49
154 0.49
155 0.48
156 0.42
157 0.35
158 0.28
159 0.24
160 0.21
161 0.2
162 0.18
163 0.16
164 0.14
165 0.14
166 0.16
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.17
171 0.2
172 0.21
173 0.25
174 0.24
175 0.23
176 0.24
177 0.24
178 0.21
179 0.18
180 0.17
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.17
186 0.15
187 0.16
188 0.17
189 0.17
190 0.16
191 0.19
192 0.2
193 0.15
194 0.16
195 0.15
196 0.13
197 0.13
198 0.11
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.15
210 0.15
211 0.17
212 0.18
213 0.19
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.16
222 0.21
223 0.25
224 0.26
225 0.25
226 0.28
227 0.29
228 0.33
229 0.32
230 0.26
231 0.23
232 0.23
233 0.21
234 0.17
235 0.16
236 0.11
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.09
242 0.11
243 0.1
244 0.11
245 0.12
246 0.13
247 0.14
248 0.14
249 0.13
250 0.15
251 0.17
252 0.18
253 0.19
254 0.18
255 0.18
256 0.17
257 0.17
258 0.16
259 0.15
260 0.14
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.07
278 0.08
279 0.07
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.11
292 0.15
293 0.15
294 0.17
295 0.18
296 0.18
297 0.17
298 0.17
299 0.16
300 0.11
301 0.09
302 0.07
303 0.05
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.1
311 0.14
312 0.15
313 0.16
314 0.24
315 0.26
316 0.31
317 0.32
318 0.35
319 0.34
320 0.32
321 0.34
322 0.27
323 0.27
324 0.22
325 0.2
326 0.15
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.13
332 0.13
333 0.15
334 0.16
335 0.17
336 0.17
337 0.17
338 0.17
339 0.17
340 0.23
341 0.22
342 0.27
343 0.34
344 0.36
345 0.37
346 0.38
347 0.39
348 0.32
349 0.32
350 0.27
351 0.2
352 0.17
353 0.15
354 0.12
355 0.07
356 0.07
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.11
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.08
374 0.09
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.09
383 0.1
384 0.13
385 0.15
386 0.19
387 0.23
388 0.29
389 0.35
390 0.43
391 0.49
392 0.57
393 0.66
394 0.73
395 0.8
396 0.85
397 0.89
398 0.93
399 0.96
400 0.95
401 0.95
402 0.95
403 0.95
404 0.95
405 0.95
406 0.94
407 0.91
408 0.9
409 0.83
410 0.78
411 0.73
412 0.66
413 0.62
414 0.56
415 0.49
416 0.43
417 0.39
418 0.38
419 0.38
420 0.42
421 0.4
422 0.45
423 0.51
424 0.55
425 0.62
426 0.61
427 0.64
428 0.66