Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YNT0

Protein Details
Accession A0A2C5YNT0    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MAPEQKRKRGRPPKQPRAEDASPBasic
40-66AEVETPPSQPRKRGRPRKSLGQEQTAEHydrophilic
118-138ETDDSRPKQKQQKSQENEQQDHydrophilic
208-231DQEPAPKPRKRGRPSLKRKSSPEHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-57KRKRGRPPKQPRAEDASPAVNKVESERPSKRGKVAEVETPPSQPRKRGRPRK
213-233PKPRKRGRPSLKRKSSPEHAR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR025212  CAD_CENP-Q  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0000775  C:chromosome, centromeric region  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF13094  CENP-Q  
Amino Acid Sequences MAPEQKRKRGRPPKQPRAEDASPAVNKVESERPSKRGKVAEVETPPSQPRKRGRPRKSLGQEQTAEAKEREEALRQQQRGELEKQNREREERELQQQREAEQQRERRLQEKERERERETDDSRPKQKQQKSQENEQQDEPQRKRTLRHQQASQEEPEVPQLPKKKVGRPSLQKRVPEATPEPTSDTAPRRGRGRPLQPAADDAEQQSDQEPAPKPRKRGRPSLKRKSSPEHARDAAPSSSKAQRASPPLESDDEHERVRPMKRARAGKDISRQEAEAEAEVTSSEAEADDEDGQDQPRRARSPKPYPRLVAHVRRVRQSTIAAKWTPLTAPSLSVVKDLLSLAQQPVLQQLSGANRRRAHAADVLRFMSRRISRKVARGLPFPPASMPAPARGQQVTDGGRESELDFESVLDAKALLEAQLEPATHAVELLRREKQKIEKDLERDYETLRALEMAARAQAREHRGLLKKTHLLTPRPGVTPSEERRPVVNPAPTAPDDVFDALDEQDVRQLAEHVVSIRANMRPVDGLIPQLARGRAELQAVLLGHLTSEQYEEVILG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.92
3 0.87
4 0.86
5 0.79
6 0.73
7 0.66
8 0.64
9 0.55
10 0.48
11 0.42
12 0.33
13 0.3
14 0.29
15 0.32
16 0.27
17 0.35
18 0.39
19 0.44
20 0.51
21 0.56
22 0.59
23 0.57
24 0.58
25 0.59
26 0.57
27 0.6
28 0.57
29 0.57
30 0.52
31 0.49
32 0.49
33 0.49
34 0.49
35 0.48
36 0.52
37 0.58
38 0.68
39 0.75
40 0.8
41 0.83
42 0.87
43 0.9
44 0.89
45 0.89
46 0.86
47 0.84
48 0.75
49 0.67
50 0.67
51 0.58
52 0.52
53 0.41
54 0.34
55 0.27
56 0.28
57 0.26
58 0.24
59 0.27
60 0.34
61 0.43
62 0.43
63 0.43
64 0.43
65 0.46
66 0.47
67 0.47
68 0.46
69 0.47
70 0.55
71 0.62
72 0.67
73 0.67
74 0.67
75 0.63
76 0.61
77 0.6
78 0.57
79 0.59
80 0.6
81 0.57
82 0.58
83 0.57
84 0.52
85 0.53
86 0.51
87 0.47
88 0.46
89 0.52
90 0.54
91 0.6
92 0.61
93 0.58
94 0.62
95 0.65
96 0.67
97 0.7
98 0.71
99 0.73
100 0.78
101 0.74
102 0.73
103 0.69
104 0.69
105 0.62
106 0.63
107 0.63
108 0.64
109 0.69
110 0.69
111 0.72
112 0.72
113 0.76
114 0.76
115 0.77
116 0.79
117 0.78
118 0.81
119 0.82
120 0.79
121 0.74
122 0.67
123 0.65
124 0.61
125 0.64
126 0.56
127 0.56
128 0.55
129 0.54
130 0.56
131 0.58
132 0.61
133 0.62
134 0.68
135 0.66
136 0.68
137 0.72
138 0.72
139 0.64
140 0.55
141 0.44
142 0.37
143 0.34
144 0.29
145 0.22
146 0.23
147 0.28
148 0.28
149 0.36
150 0.41
151 0.44
152 0.5
153 0.59
154 0.64
155 0.68
156 0.75
157 0.78
158 0.79
159 0.74
160 0.7
161 0.66
162 0.57
163 0.52
164 0.45
165 0.4
166 0.36
167 0.34
168 0.33
169 0.29
170 0.3
171 0.29
172 0.29
173 0.32
174 0.34
175 0.36
176 0.37
177 0.39
178 0.46
179 0.5
180 0.55
181 0.55
182 0.56
183 0.56
184 0.52
185 0.51
186 0.46
187 0.38
188 0.3
189 0.21
190 0.19
191 0.16
192 0.15
193 0.14
194 0.11
195 0.1
196 0.15
197 0.18
198 0.23
199 0.33
200 0.37
201 0.43
202 0.51
203 0.62
204 0.62
205 0.69
206 0.72
207 0.74
208 0.81
209 0.86
210 0.87
211 0.84
212 0.84
213 0.8
214 0.79
215 0.78
216 0.71
217 0.67
218 0.59
219 0.52
220 0.48
221 0.44
222 0.36
223 0.27
224 0.24
225 0.2
226 0.23
227 0.24
228 0.23
229 0.23
230 0.26
231 0.3
232 0.32
233 0.31
234 0.29
235 0.28
236 0.29
237 0.26
238 0.25
239 0.25
240 0.23
241 0.21
242 0.2
243 0.19
244 0.21
245 0.23
246 0.28
247 0.26
248 0.3
249 0.37
250 0.44
251 0.47
252 0.52
253 0.52
254 0.51
255 0.56
256 0.54
257 0.5
258 0.43
259 0.39
260 0.3
261 0.29
262 0.23
263 0.14
264 0.11
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.04
270 0.04
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.07
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.15
285 0.19
286 0.21
287 0.28
288 0.37
289 0.46
290 0.55
291 0.6
292 0.61
293 0.61
294 0.6
295 0.61
296 0.59
297 0.56
298 0.56
299 0.55
300 0.53
301 0.54
302 0.54
303 0.47
304 0.42
305 0.37
306 0.34
307 0.31
308 0.34
309 0.3
310 0.28
311 0.27
312 0.25
313 0.21
314 0.16
315 0.15
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.12
322 0.11
323 0.08
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.09
337 0.12
338 0.17
339 0.25
340 0.29
341 0.33
342 0.34
343 0.35
344 0.38
345 0.37
346 0.33
347 0.32
348 0.33
349 0.31
350 0.32
351 0.33
352 0.3
353 0.29
354 0.27
355 0.28
356 0.27
357 0.29
358 0.31
359 0.38
360 0.42
361 0.49
362 0.58
363 0.58
364 0.56
365 0.55
366 0.52
367 0.51
368 0.47
369 0.4
370 0.32
371 0.27
372 0.24
373 0.23
374 0.22
375 0.18
376 0.2
377 0.23
378 0.25
379 0.22
380 0.22
381 0.2
382 0.24
383 0.22
384 0.2
385 0.19
386 0.16
387 0.16
388 0.16
389 0.15
390 0.13
391 0.11
392 0.1
393 0.09
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.09
398 0.06
399 0.06
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.07
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.1
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.09
416 0.13
417 0.18
418 0.24
419 0.26
420 0.29
421 0.35
422 0.44
423 0.49
424 0.54
425 0.58
426 0.58
427 0.61
428 0.66
429 0.64
430 0.59
431 0.51
432 0.44
433 0.4
434 0.33
435 0.28
436 0.21
437 0.16
438 0.13
439 0.14
440 0.14
441 0.1
442 0.13
443 0.13
444 0.13
445 0.15
446 0.2
447 0.23
448 0.26
449 0.27
450 0.32
451 0.39
452 0.45
453 0.47
454 0.5
455 0.51
456 0.5
457 0.55
458 0.53
459 0.5
460 0.52
461 0.55
462 0.52
463 0.48
464 0.47
465 0.42
466 0.41
467 0.47
468 0.45
469 0.47
470 0.46
471 0.45
472 0.46
473 0.48
474 0.48
475 0.45
476 0.46
477 0.38
478 0.36
479 0.41
480 0.4
481 0.4
482 0.34
483 0.27
484 0.23
485 0.22
486 0.2
487 0.14
488 0.14
489 0.11
490 0.13
491 0.12
492 0.1
493 0.13
494 0.13
495 0.13
496 0.12
497 0.13
498 0.12
499 0.13
500 0.14
501 0.12
502 0.15
503 0.15
504 0.16
505 0.18
506 0.19
507 0.21
508 0.2
509 0.21
510 0.19
511 0.21
512 0.22
513 0.19
514 0.19
515 0.2
516 0.2
517 0.2
518 0.24
519 0.24
520 0.21
521 0.22
522 0.22
523 0.21
524 0.23
525 0.21
526 0.17
527 0.19
528 0.19
529 0.18
530 0.16
531 0.13
532 0.11
533 0.11
534 0.11
535 0.08
536 0.09
537 0.08
538 0.08