Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YUL0

Protein Details
Accession A0A2C5YUL0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-118NDDRPHHQPRCKPRPSTGKSEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
622-648AGGRVGRGGSGSGRAGPNKRRRVRGGA
Subcellular Location(s) cyto 11, mito 7, nucl 4, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MKLSAVCINLFLFLTPAVRAAPIDNDSNEIATETALVDNDPIEIATEPFPRQRQDRIVGGSEVNGTYLCRNMPGNVGCMIAKEASVMREKHRHSDDNDDRPHHQPRCKPRPSTGKSEDQPPMPDEDAPQPIKLSLPLEYQQSLFQELRAEDELVVLARGLGLMRLVTNLLHSYDAAGNNLVLVVGADEQENGWMGEALAEHAAVSASPRARGLTVVNTDSQSVAARQKMYAAGGIFSVTSRILVVDLLVRLLDPESITGIVVLHAERVVATSTEAFILRLYRQRNKAGFLKALSDNPEPLASGFSPLARTMRNLFVTKASLWPRFQVAVARSLEGKNRAEVIELEVPMTDSIRDMQNAILECVEVSIQELKKANTGLDMDDWNLDNALLGNFDVMIRKQLEPNWHRVSRKTQQIVNDLSVLRALLGNVLTYDAVSFLERLDTIHAAHSPQPGSTRQSQSPWLFLDAAQTLFDTARRRVYAAQPKTVSQGGAETDVDALRPVLEELPKWKILAEVLEEMDRDMYLEPTTRDDSNGSILIMCSSVQTCRQLRDYLQTMYLKPSGSKQQNDDDDDDDEEPQASAAYMMRRRLRKYLLWKKKFARVSATLLAENQKALSGAADARAGGRVGRGGSGSGRAGPNKRRRVRGGAGAGTGSRTSSARMDNGAMAQYLEKPGEVAELMAEVRVTEAEEEEEEDEAAAAAADALQDVDDHFGLYEMQDLVVVHAYEGDADEHVLEEVKPRYIVMYEPDAGFIRRVEVYRSSHASRNVRVYFLYYGGSTEEQRYLTAVRREKDAFTKAIRERASMSLVISTAASGPEDAQEALLRTVNTRIAGGGRLTSATATPPRVVVDMREFRSSLPCLLHGRGLQVVPCMLTVGDYILSPDMCVERKSISDLVSSLRDGRLYAQAESMFQHYRHPLLLIEFDQGRAFTLEPFGDLSGGPVATAANASDVQSKLVLLTLAFPRLRILWSSSPVQTADMFSALKAHEHEPDPMAAVRAGLDDDEEGGGNLDRPFFNRQPREMLAAVPGVTQVNVQGLVMGAENVREVANMEVGRLAEILGEGAARAVYGFFNRNVMEEEGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.11
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.12
8 0.16
9 0.18
10 0.21
11 0.21
12 0.23
13 0.23
14 0.23
15 0.22
16 0.17
17 0.15
18 0.11
19 0.11
20 0.08
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.07
29 0.07
30 0.08
31 0.09
32 0.13
33 0.17
34 0.19
35 0.25
36 0.29
37 0.33
38 0.37
39 0.43
40 0.48
41 0.5
42 0.55
43 0.54
44 0.54
45 0.51
46 0.47
47 0.41
48 0.34
49 0.28
50 0.22
51 0.16
52 0.14
53 0.12
54 0.14
55 0.13
56 0.13
57 0.14
58 0.15
59 0.22
60 0.23
61 0.24
62 0.23
63 0.24
64 0.22
65 0.22
66 0.22
67 0.15
68 0.13
69 0.12
70 0.13
71 0.15
72 0.21
73 0.22
74 0.27
75 0.36
76 0.39
77 0.46
78 0.52
79 0.56
80 0.53
81 0.62
82 0.65
83 0.66
84 0.71
85 0.66
86 0.63
87 0.63
88 0.69
89 0.65
90 0.63
91 0.62
92 0.66
93 0.73
94 0.78
95 0.77
96 0.77
97 0.8
98 0.79
99 0.8
100 0.76
101 0.76
102 0.69
103 0.73
104 0.68
105 0.6
106 0.58
107 0.49
108 0.47
109 0.38
110 0.35
111 0.3
112 0.3
113 0.34
114 0.32
115 0.31
116 0.26
117 0.25
118 0.25
119 0.25
120 0.21
121 0.16
122 0.19
123 0.21
124 0.24
125 0.25
126 0.25
127 0.25
128 0.25
129 0.26
130 0.22
131 0.2
132 0.21
133 0.2
134 0.23
135 0.23
136 0.22
137 0.17
138 0.18
139 0.17
140 0.13
141 0.13
142 0.08
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.12
160 0.15
161 0.16
162 0.16
163 0.15
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.09
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.06
192 0.1
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.13
197 0.14
198 0.15
199 0.16
200 0.19
201 0.22
202 0.23
203 0.24
204 0.24
205 0.24
206 0.23
207 0.21
208 0.15
209 0.14
210 0.16
211 0.17
212 0.18
213 0.17
214 0.19
215 0.2
216 0.19
217 0.19
218 0.16
219 0.13
220 0.12
221 0.12
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.07
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.08
264 0.1
265 0.12
266 0.17
267 0.23
268 0.29
269 0.35
270 0.43
271 0.45
272 0.48
273 0.52
274 0.52
275 0.5
276 0.43
277 0.43
278 0.37
279 0.37
280 0.37
281 0.31
282 0.27
283 0.24
284 0.23
285 0.18
286 0.16
287 0.16
288 0.11
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.12
296 0.14
297 0.15
298 0.2
299 0.24
300 0.24
301 0.24
302 0.25
303 0.26
304 0.25
305 0.28
306 0.28
307 0.29
308 0.29
309 0.29
310 0.29
311 0.27
312 0.27
313 0.26
314 0.22
315 0.24
316 0.24
317 0.23
318 0.23
319 0.23
320 0.26
321 0.26
322 0.25
323 0.2
324 0.21
325 0.2
326 0.2
327 0.19
328 0.2
329 0.19
330 0.18
331 0.17
332 0.15
333 0.16
334 0.14
335 0.14
336 0.09
337 0.05
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.11
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.05
352 0.05
353 0.1
354 0.1
355 0.14
356 0.16
357 0.16
358 0.19
359 0.19
360 0.18
361 0.15
362 0.16
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.12
367 0.13
368 0.13
369 0.11
370 0.1
371 0.08
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.06
381 0.05
382 0.08
383 0.1
384 0.11
385 0.13
386 0.16
387 0.26
388 0.28
389 0.36
390 0.41
391 0.44
392 0.45
393 0.46
394 0.52
395 0.5
396 0.57
397 0.53
398 0.48
399 0.48
400 0.53
401 0.52
402 0.44
403 0.4
404 0.3
405 0.26
406 0.23
407 0.17
408 0.11
409 0.09
410 0.07
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.08
431 0.09
432 0.1
433 0.12
434 0.15
435 0.13
436 0.13
437 0.15
438 0.16
439 0.2
440 0.25
441 0.27
442 0.27
443 0.29
444 0.35
445 0.33
446 0.34
447 0.31
448 0.26
449 0.22
450 0.2
451 0.2
452 0.14
453 0.14
454 0.11
455 0.1
456 0.08
457 0.08
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.15
462 0.15
463 0.16
464 0.19
465 0.27
466 0.35
467 0.36
468 0.41
469 0.38
470 0.39
471 0.4
472 0.38
473 0.29
474 0.19
475 0.17
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.08
483 0.06
484 0.06
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.05
489 0.06
490 0.06
491 0.09
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.13
496 0.12
497 0.12
498 0.13
499 0.12
500 0.1
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.09
505 0.09
506 0.07
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.07
513 0.09
514 0.12
515 0.11
516 0.12
517 0.12
518 0.12
519 0.13
520 0.12
521 0.1
522 0.08
523 0.08
524 0.07
525 0.07
526 0.06
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.07
531 0.12
532 0.13
533 0.15
534 0.17
535 0.18
536 0.19
537 0.24
538 0.26
539 0.22
540 0.25
541 0.24
542 0.22
543 0.24
544 0.24
545 0.19
546 0.16
547 0.18
548 0.22
549 0.26
550 0.28
551 0.28
552 0.33
553 0.37
554 0.39
555 0.38
556 0.31
557 0.27
558 0.26
559 0.23
560 0.17
561 0.13
562 0.1
563 0.08
564 0.07
565 0.05
566 0.04
567 0.04
568 0.05
569 0.09
570 0.11
571 0.16
572 0.22
573 0.26
574 0.28
575 0.33
576 0.36
577 0.38
578 0.47
579 0.54
580 0.6
581 0.62
582 0.67
583 0.66
584 0.7
585 0.67
586 0.58
587 0.54
588 0.46
589 0.46
590 0.43
591 0.41
592 0.33
593 0.3
594 0.3
595 0.23
596 0.19
597 0.13
598 0.09
599 0.07
600 0.07
601 0.06
602 0.05
603 0.05
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.06
610 0.06
611 0.05
612 0.06
613 0.06
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.07
618 0.09
619 0.09
620 0.1
621 0.11
622 0.14
623 0.19
624 0.27
625 0.37
626 0.45
627 0.51
628 0.55
629 0.58
630 0.63
631 0.62
632 0.62
633 0.58
634 0.5
635 0.45
636 0.39
637 0.34
638 0.27
639 0.22
640 0.14
641 0.08
642 0.07
643 0.07
644 0.09
645 0.11
646 0.11
647 0.12
648 0.13
649 0.13
650 0.13
651 0.12
652 0.1
653 0.09
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.08
658 0.07
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.05
664 0.04
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.04
675 0.05
676 0.05
677 0.06
678 0.06
679 0.07
680 0.06
681 0.06
682 0.06
683 0.05
684 0.05
685 0.03
686 0.03
687 0.02
688 0.02
689 0.02
690 0.02
691 0.02
692 0.02
693 0.03
694 0.03
695 0.04
696 0.04
697 0.04
698 0.04
699 0.05
700 0.05
701 0.05
702 0.06
703 0.05
704 0.05
705 0.06
706 0.06
707 0.06
708 0.08
709 0.08
710 0.06
711 0.06
712 0.06
713 0.05
714 0.06
715 0.06
716 0.04
717 0.05
718 0.05
719 0.05
720 0.05
721 0.05
722 0.05
723 0.09
724 0.1
725 0.11
726 0.11
727 0.11
728 0.11
729 0.11
730 0.13
731 0.12
732 0.15
733 0.15
734 0.16
735 0.17
736 0.17
737 0.17
738 0.17
739 0.14
740 0.11
741 0.12
742 0.12
743 0.14
744 0.18
745 0.22
746 0.25
747 0.3
748 0.31
749 0.34
750 0.41
751 0.43
752 0.42
753 0.47
754 0.44
755 0.4
756 0.37
757 0.35
758 0.29
759 0.25
760 0.22
761 0.13
762 0.13
763 0.13
764 0.14
765 0.12
766 0.13
767 0.14
768 0.13
769 0.13
770 0.14
771 0.14
772 0.19
773 0.26
774 0.3
775 0.29
776 0.33
777 0.35
778 0.37
779 0.41
780 0.39
781 0.36
782 0.33
783 0.4
784 0.38
785 0.44
786 0.42
787 0.37
788 0.36
789 0.34
790 0.34
791 0.26
792 0.24
793 0.18
794 0.17
795 0.16
796 0.12
797 0.1
798 0.07
799 0.07
800 0.07
801 0.05
802 0.06
803 0.06
804 0.07
805 0.07
806 0.07
807 0.08
808 0.09
809 0.1
810 0.12
811 0.11
812 0.11
813 0.13
814 0.15
815 0.14
816 0.13
817 0.13
818 0.12
819 0.14
820 0.13
821 0.12
822 0.1
823 0.1
824 0.1
825 0.1
826 0.09
827 0.11
828 0.14
829 0.15
830 0.15
831 0.16
832 0.17
833 0.18
834 0.18
835 0.17
836 0.23
837 0.29
838 0.31
839 0.33
840 0.32
841 0.32
842 0.37
843 0.35
844 0.29
845 0.23
846 0.24
847 0.25
848 0.26
849 0.29
850 0.25
851 0.25
852 0.25
853 0.24
854 0.21
855 0.18
856 0.17
857 0.13
858 0.13
859 0.11
860 0.08
861 0.08
862 0.07
863 0.07
864 0.07
865 0.06
866 0.07
867 0.08
868 0.08
869 0.08
870 0.09
871 0.1
872 0.11
873 0.12
874 0.13
875 0.13
876 0.14
877 0.19
878 0.2
879 0.19
880 0.19
881 0.19
882 0.21
883 0.21
884 0.21
885 0.19
886 0.18
887 0.17
888 0.16
889 0.17
890 0.21
891 0.21
892 0.21
893 0.22
894 0.22
895 0.22
896 0.23
897 0.24
898 0.21
899 0.19
900 0.23
901 0.22
902 0.24
903 0.24
904 0.23
905 0.21
906 0.2
907 0.24
908 0.19
909 0.21
910 0.2
911 0.2
912 0.19
913 0.18
914 0.16
915 0.14
916 0.13
917 0.1
918 0.13
919 0.12
920 0.12
921 0.13
922 0.12
923 0.11
924 0.11
925 0.11
926 0.1
927 0.1
928 0.09
929 0.08
930 0.07
931 0.07
932 0.07
933 0.06
934 0.06
935 0.07
936 0.08
937 0.13
938 0.13
939 0.14
940 0.14
941 0.14
942 0.12
943 0.13
944 0.12
945 0.07
946 0.12
947 0.13
948 0.19
949 0.19
950 0.19
951 0.2
952 0.21
953 0.22
954 0.2
955 0.24
956 0.24
957 0.28
958 0.32
959 0.32
960 0.33
961 0.32
962 0.31
963 0.26
964 0.22
965 0.19
966 0.17
967 0.16
968 0.13
969 0.16
970 0.15
971 0.16
972 0.17
973 0.18
974 0.21
975 0.23
976 0.26
977 0.25
978 0.25
979 0.26
980 0.24
981 0.24
982 0.18
983 0.16
984 0.13
985 0.12
986 0.12
987 0.09
988 0.09
989 0.07
990 0.08
991 0.08
992 0.08
993 0.07
994 0.08
995 0.08
996 0.1
997 0.11
998 0.12
999 0.12
1000 0.15
1001 0.24
1002 0.29
1003 0.39
1004 0.44
1005 0.47
1006 0.52
1007 0.54
1008 0.57
1009 0.5
1010 0.45
1011 0.37
1012 0.32
1013 0.29
1014 0.22
1015 0.2
1016 0.14
1017 0.14
1018 0.12
1019 0.1
1020 0.1
1021 0.09
1022 0.09
1023 0.08
1024 0.08
1025 0.08
1026 0.08
1027 0.08
1028 0.07
1029 0.07
1030 0.07
1031 0.07
1032 0.07
1033 0.07
1034 0.08
1035 0.08
1036 0.14
1037 0.13
1038 0.14
1039 0.15
1040 0.15
1041 0.15
1042 0.14
1043 0.13
1044 0.08
1045 0.08
1046 0.08
1047 0.06
1048 0.06
1049 0.05
1050 0.05
1051 0.05
1052 0.04
1053 0.04
1054 0.05
1055 0.06
1056 0.1
1057 0.14
1058 0.15
1059 0.19
1060 0.19
1061 0.21
1062 0.24