Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3P5F9

Protein Details
Accession J3P5F9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
541-597DVGGRLKPGRRKSPLLRRRSARRRRSVQHGDTRSSRSSLQRRPRRALSRRRGSFEDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
391-401SKKRMGAIGRG
457-470KPKPARGRMGRIGA
506-523KARPARRMGKIGKAAAGG
543-591GGRLKPGRRKSPLLRRRSARRRRSVQHGDTRSSRSSLQRRPRRALSRRR
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 11, cyto 7.5, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MAVTARPSWRPFPVSHRSIPNLLVSASFSTTPVSYSVHITDLANVWRESLDRKAILLRCLQENTSIDPSDDPENFKELLRWIEAAFDPDSPNHADTALALSSTGPNDGAAPADLLLEVTCVLPAGFRPLKWPVRLRHGGAAALVADLVLPLVQAHLTRSQEVEALLGVVREKDGVISRVVDKLESTGARMEHVFSALVNTGKKKITRAVAEARVKGLAPFDAAGFKRKFRGGGVGDDDAHDGEEDGPGNSRIKGPVPARDVKDLMDNVFEPALQRHPSLEYPEWPALDNWWSEIQEGSGDKVRLVQRNRVSSSRKTPPPSERRRSGDDDDDDDFEVQATPPHLLSARRAEQAKKQAPPSVNDDESTDSGGEGNTQIPDSNPPPKITTPTKSKKRMGAIGRGKEPEREPDPEAETASEGEAAEAPRPRAEAVAMKDGAGSETASDADEPVVVDLSSPKPKPARGRMGRIGAAVKASEKAPPAAEDKPPESSNTATAEEDDGSAAAAKARPARRMGKIGKAAAGGTKQGGTEKTSATTAAPGDVGGRLKPGRRKSPLLRRRSARRRRSVQHGDTRSSRSSLQRRPRRALSRRRGSFEDVVEVLHH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.57
3 0.6
4 0.59
5 0.58
6 0.57
7 0.51
8 0.43
9 0.36
10 0.3
11 0.24
12 0.21
13 0.2
14 0.18
15 0.15
16 0.15
17 0.15
18 0.15
19 0.14
20 0.14
21 0.14
22 0.17
23 0.18
24 0.18
25 0.19
26 0.18
27 0.19
28 0.21
29 0.23
30 0.23
31 0.21
32 0.2
33 0.19
34 0.2
35 0.21
36 0.23
37 0.26
38 0.23
39 0.24
40 0.32
41 0.34
42 0.37
43 0.4
44 0.38
45 0.37
46 0.39
47 0.38
48 0.36
49 0.34
50 0.36
51 0.36
52 0.33
53 0.28
54 0.26
55 0.28
56 0.28
57 0.27
58 0.26
59 0.22
60 0.25
61 0.25
62 0.25
63 0.25
64 0.22
65 0.24
66 0.22
67 0.21
68 0.18
69 0.21
70 0.21
71 0.22
72 0.2
73 0.18
74 0.17
75 0.17
76 0.2
77 0.18
78 0.18
79 0.16
80 0.15
81 0.13
82 0.12
83 0.15
84 0.12
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.13
112 0.15
113 0.15
114 0.19
115 0.28
116 0.34
117 0.4
118 0.47
119 0.44
120 0.53
121 0.59
122 0.57
123 0.55
124 0.51
125 0.45
126 0.38
127 0.33
128 0.23
129 0.17
130 0.14
131 0.07
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.02
137 0.02
138 0.03
139 0.04
140 0.04
141 0.06
142 0.11
143 0.13
144 0.14
145 0.15
146 0.15
147 0.16
148 0.16
149 0.14
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.12
164 0.13
165 0.16
166 0.17
167 0.15
168 0.13
169 0.13
170 0.15
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.11
179 0.12
180 0.11
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.15
188 0.18
189 0.2
190 0.21
191 0.24
192 0.29
193 0.31
194 0.35
195 0.39
196 0.45
197 0.49
198 0.47
199 0.43
200 0.37
201 0.34
202 0.28
203 0.21
204 0.13
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.11
209 0.12
210 0.18
211 0.19
212 0.2
213 0.22
214 0.23
215 0.24
216 0.2
217 0.28
218 0.23
219 0.27
220 0.3
221 0.28
222 0.27
223 0.26
224 0.26
225 0.18
226 0.15
227 0.1
228 0.07
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.17
241 0.18
242 0.24
243 0.28
244 0.33
245 0.35
246 0.37
247 0.36
248 0.3
249 0.32
250 0.26
251 0.21
252 0.17
253 0.15
254 0.12
255 0.12
256 0.11
257 0.07
258 0.08
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.13
264 0.14
265 0.19
266 0.19
267 0.18
268 0.21
269 0.22
270 0.22
271 0.2
272 0.19
273 0.15
274 0.16
275 0.13
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.15
289 0.19
290 0.23
291 0.25
292 0.31
293 0.33
294 0.4
295 0.42
296 0.43
297 0.44
298 0.44
299 0.49
300 0.5
301 0.51
302 0.49
303 0.52
304 0.57
305 0.63
306 0.68
307 0.68
308 0.67
309 0.66
310 0.68
311 0.68
312 0.61
313 0.57
314 0.49
315 0.44
316 0.38
317 0.35
318 0.29
319 0.23
320 0.19
321 0.12
322 0.11
323 0.07
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.12
332 0.17
333 0.2
334 0.23
335 0.26
336 0.27
337 0.32
338 0.42
339 0.45
340 0.42
341 0.41
342 0.43
343 0.43
344 0.44
345 0.44
346 0.4
347 0.34
348 0.31
349 0.29
350 0.26
351 0.25
352 0.23
353 0.16
354 0.1
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.06
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.1
365 0.13
366 0.19
367 0.21
368 0.22
369 0.25
370 0.26
371 0.32
372 0.34
373 0.38
374 0.41
375 0.5
376 0.58
377 0.64
378 0.67
379 0.68
380 0.68
381 0.69
382 0.64
383 0.64
384 0.64
385 0.61
386 0.61
387 0.58
388 0.53
389 0.48
390 0.44
391 0.41
392 0.35
393 0.33
394 0.31
395 0.31
396 0.33
397 0.3
398 0.29
399 0.23
400 0.2
401 0.16
402 0.14
403 0.11
404 0.08
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.1
409 0.12
410 0.13
411 0.13
412 0.13
413 0.13
414 0.12
415 0.14
416 0.16
417 0.18
418 0.24
419 0.24
420 0.23
421 0.23
422 0.22
423 0.21
424 0.15
425 0.12
426 0.05
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.08
440 0.12
441 0.18
442 0.19
443 0.23
444 0.26
445 0.32
446 0.41
447 0.48
448 0.55
449 0.56
450 0.65
451 0.68
452 0.7
453 0.67
454 0.59
455 0.51
456 0.41
457 0.34
458 0.25
459 0.19
460 0.15
461 0.13
462 0.14
463 0.14
464 0.15
465 0.15
466 0.17
467 0.2
468 0.22
469 0.26
470 0.28
471 0.29
472 0.32
473 0.32
474 0.32
475 0.31
476 0.28
477 0.27
478 0.26
479 0.26
480 0.21
481 0.21
482 0.21
483 0.18
484 0.17
485 0.14
486 0.1
487 0.08
488 0.08
489 0.07
490 0.08
491 0.08
492 0.11
493 0.18
494 0.22
495 0.26
496 0.32
497 0.39
498 0.43
499 0.52
500 0.55
501 0.57
502 0.6
503 0.58
504 0.55
505 0.49
506 0.44
507 0.37
508 0.34
509 0.25
510 0.19
511 0.18
512 0.15
513 0.17
514 0.18
515 0.18
516 0.19
517 0.19
518 0.2
519 0.2
520 0.2
521 0.18
522 0.19
523 0.16
524 0.14
525 0.13
526 0.11
527 0.11
528 0.14
529 0.14
530 0.12
531 0.16
532 0.18
533 0.25
534 0.33
535 0.42
536 0.49
537 0.55
538 0.64
539 0.7
540 0.78
541 0.81
542 0.83
543 0.84
544 0.83
545 0.87
546 0.89
547 0.89
548 0.88
549 0.9
550 0.9
551 0.88
552 0.9
553 0.9
554 0.89
555 0.88
556 0.85
557 0.81
558 0.77
559 0.75
560 0.67
561 0.59
562 0.54
563 0.53
564 0.56
565 0.59
566 0.64
567 0.69
568 0.75
569 0.8
570 0.86
571 0.87
572 0.87
573 0.88
574 0.88
575 0.89
576 0.88
577 0.86
578 0.81
579 0.77
580 0.73
581 0.65
582 0.6
583 0.49