FuNGI

A0A2C5ZA78

Protein Details

Accession

A0A2C5ZA78

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
34-53	LSPSFASKKQQQQQQQSGGP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, cyto_nucl 8, mito 6, cyto 5.5, plas 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR037700 NUP88/NUP82 IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus

Amino Acid Sequences

MPKVKQYSAAWLSGNAPGRQLFEPSADSIRYRALSPSFASKKQQQQQQQSGGPRRTIARRGTEIFVAVGREIRWADLVYLRDDWVAKQPRARGVRVKREDSLSPFDGETGLDSAAGFRTLKTPVADDIRQLVISPDSSLLAILTTHTVHICVLPDSSHLTANDTSPMRPSIFTLGPTTHVTSRSPIASAVWHPLGVKGSCIVTVTTDAVVRLWELSPTDRWTYDLPTTSIDLKRLADGTTLDQDFAPAGATNKSFSPDSFEMEVAAASFPSRGSGGWSPMTLWVAMREGDVYALCPLLPKRWAPPPTLIPSLSVSVVTTVAAIEDDARVDDREKLLAQQQLQWMAELDAQEPQVIDSGPGERLVEVYTRPQRPGAIPRLQGPFELVADPQSSDDLDVTITDVLVIGSKTETDRLMMGEEDDGLDLDLGESDGQGLSLTIVCLVSTSGQVRVYLDTDGVQAQWLPPKSSKPRPPGPPTEASRLLALQAIDTMTPVEVSEEAWPVFSTDVTSRYSFFVTHHAAITCLSLTSWIFRLEGELEGNHEAGADFRIGLLAKAQSGRDRIYGQPAADVSVPLAGCVAMRDPDLGYFVLSATPYDAVALTLETPETEAGPSSRFMEASLSPEASIMTPLDFYEPRPAFNPPYAFGQESALPTLLERLKSSRHKTTMSQEVKLSPLTLQMMTEAHRVLSDETYKLGVAAAELFRRCELLQTEVGQQVGKAAEVRAKIEALSGGDDGDEDEDRESDRVAYDRRIAEARGRRERLGERMDGLRKVLHRAAAPDLSIKERAWADEVRSLSSSVLGDSSLSSSSSSTTTAAAAAAAATSDRRQPWRRFDEASGLKTQLTTDAAHLAKEVAADQHQQQPSPANKAGAPATAATASDLRIPKEVRRKKMQLVQGLLARESALVEALTARLERLQTGV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.3
3	0.28
4	0.26
5	0.29
6	0.28
7	0.3
8	0.25
9	0.22
10	0.25
11	0.25
12	0.28
13	0.25
14	0.25
15	0.23
16	0.27
17	0.25
18	0.23
19	0.25
20	0.24
21	0.26
22	0.28
23	0.37
24	0.38
25	0.41
26	0.47
27	0.51
28	0.59
29	0.63
30	0.7
31	0.69
32	0.74
33	0.79
34	0.81
35	0.79
36	0.78
37	0.8
38	0.76
39	0.68
40	0.61
41	0.57
42	0.56
43	0.57
44	0.55
45	0.53
46	0.55
47	0.57
48	0.57
49	0.52
50	0.46
51	0.39
52	0.33
53	0.26
54	0.19
55	0.18
56	0.15
57	0.16
58	0.16
59	0.15
60	0.15
61	0.14
62	0.16
63	0.18
64	0.2
65	0.2
66	0.21
67	0.2
68	0.21
69	0.21
70	0.2
71	0.26
72	0.32
73	0.32
74	0.36
75	0.4
76	0.48
77	0.52
78	0.56
79	0.57
80	0.59
81	0.67
82	0.71
83	0.71
84	0.66
85	0.66
86	0.66
87	0.61
88	0.58
89	0.49
90	0.43
91	0.37
92	0.33
93	0.29
94	0.23
95	0.19
96	0.13
97	0.1
98	0.08
99	0.08
100	0.09
101	0.09
102	0.1
103	0.09
104	0.08
105	0.11
106	0.13
107	0.16
108	0.16
109	0.18
110	0.21
111	0.28
112	0.28
113	0.27
114	0.29
115	0.27
116	0.26
117	0.24
118	0.21
119	0.15
120	0.15
121	0.15
122	0.12
123	0.11
124	0.11
125	0.1
126	0.09
127	0.07
128	0.07
129	0.06
130	0.07
131	0.07
132	0.08
133	0.08
134	0.09
135	0.09
136	0.1
137	0.11
138	0.1
139	0.1
140	0.1
141	0.11
142	0.15
143	0.16
144	0.17
145	0.16
146	0.19
147	0.19
148	0.2
149	0.25
150	0.22
151	0.21
152	0.21
153	0.23
154	0.21
155	0.2
156	0.21
157	0.21
158	0.21
159	0.22
160	0.23
161	0.21
162	0.23
163	0.25
164	0.27
165	0.23
166	0.24
167	0.23
168	0.23
169	0.25
170	0.23
171	0.21
172	0.18
173	0.16
174	0.18
175	0.18
176	0.21
177	0.19
178	0.18
179	0.18
180	0.19
181	0.22
182	0.19
183	0.18
184	0.14
185	0.14
186	0.14
187	0.14
188	0.12
189	0.09
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.11
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.09
198	0.08
199	0.07
200	0.08
201	0.09
202	0.11
203	0.14
204	0.17
205	0.2
206	0.19
207	0.21
208	0.21
209	0.24
210	0.26
211	0.26
212	0.23
213	0.22
214	0.24
215	0.27
216	0.27
217	0.24
218	0.23
219	0.2
220	0.21
221	0.2
222	0.19
223	0.15
224	0.15
225	0.16
226	0.2
227	0.19
228	0.18
229	0.17
230	0.16
231	0.15
232	0.14
233	0.11
234	0.06
235	0.07
236	0.09
237	0.1
238	0.11
239	0.11
240	0.14
241	0.13
242	0.13
243	0.2
244	0.19
245	0.23
246	0.23
247	0.23
248	0.21
249	0.2
250	0.2
251	0.12
252	0.11
253	0.07
254	0.05
255	0.05
256	0.04
257	0.05
258	0.06
259	0.05
260	0.1
261	0.12
262	0.16
263	0.16
264	0.17
265	0.17
266	0.18
267	0.19
268	0.14
269	0.12
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.09
274	0.08
275	0.07
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.07
283	0.08
284	0.11
285	0.13
286	0.14
287	0.17
288	0.26
289	0.29
290	0.3
291	0.35
292	0.39
293	0.42
294	0.44
295	0.4
296	0.33
297	0.32
298	0.3
299	0.24
300	0.18
301	0.12
302	0.1
303	0.1
304	0.08
305	0.06
306	0.05
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.06
316	0.07
317	0.09
318	0.09
319	0.11
320	0.11
321	0.12
322	0.16
323	0.19
324	0.19
325	0.21
326	0.23
327	0.24
328	0.24
329	0.23
330	0.19
331	0.16
332	0.16
333	0.13
334	0.11
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.08
339	0.08
340	0.07
341	0.07
342	0.06
343	0.05
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.08
352	0.07
353	0.14
354	0.21
355	0.23
356	0.24
357	0.24
358	0.25
359	0.28
360	0.35
361	0.36
362	0.35
363	0.34
364	0.38
365	0.41
366	0.4
367	0.36
368	0.3
369	0.23
370	0.17
371	0.16
372	0.11
373	0.09
374	0.09
375	0.09
376	0.08
377	0.07
378	0.07
379	0.06
380	0.06
381	0.05
382	0.05
383	0.04
384	0.05
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.03
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.05
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.07
401	0.08
402	0.07
403	0.07
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.05
408	0.05
409	0.04
410	0.04
411	0.03
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.02
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.03
423	0.03
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.04
430	0.04
431	0.05
432	0.06
433	0.07
434	0.08
435	0.08
436	0.08
437	0.09
438	0.1
439	0.09
440	0.08
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.06
446	0.05
447	0.05
448	0.09
449	0.09
450	0.11
451	0.12
452	0.18
453	0.26
454	0.34
455	0.42
456	0.46
457	0.53
458	0.6
459	0.65
460	0.67
461	0.65
462	0.64
463	0.59
464	0.58
465	0.51
466	0.43
467	0.37
468	0.3
469	0.25
470	0.18
471	0.15
472	0.08
473	0.07
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.05
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.06
485	0.06
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.07
491	0.06
492	0.07
493	0.06
494	0.09
495	0.11
496	0.11
497	0.12
498	0.13
499	0.14
500	0.13
501	0.12
502	0.16
503	0.17
504	0.17
505	0.18
506	0.17
507	0.16
508	0.16
509	0.16
510	0.1
511	0.07
512	0.06
513	0.05
514	0.05
515	0.06
516	0.07
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.09
521	0.09
522	0.1
523	0.1
524	0.08
525	0.09
526	0.1
527	0.1
528	0.08
529	0.07
530	0.06
531	0.06
532	0.07
533	0.05
534	0.04
535	0.04
536	0.05
537	0.05
538	0.05
539	0.06
540	0.06
541	0.07
542	0.08
543	0.09
544	0.11
545	0.14
546	0.15
547	0.16
548	0.18
549	0.18
550	0.23
551	0.25
552	0.22
553	0.21
554	0.2
555	0.19
556	0.17
557	0.16
558	0.09
559	0.1
560	0.09
561	0.07
562	0.07
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.07
567	0.05
568	0.05
569	0.06
570	0.06
571	0.07
572	0.08
573	0.08
574	0.07
575	0.07
576	0.07
577	0.07
578	0.07
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.05
583	0.06
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.04
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.06
598	0.07
599	0.08
600	0.1
601	0.1
602	0.1
603	0.1
604	0.12
605	0.12
606	0.15
607	0.16
608	0.14
609	0.13
610	0.13
611	0.13
612	0.11
613	0.11
614	0.07
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.09
619	0.09
620	0.1
621	0.19
622	0.19
623	0.2
624	0.22
625	0.25
626	0.24
627	0.29
628	0.3
629	0.21
630	0.26
631	0.28
632	0.27
633	0.24
634	0.23
635	0.21
636	0.2
637	0.2
638	0.15
639	0.12
640	0.11
641	0.16
642	0.16
643	0.15
644	0.15
645	0.16
646	0.24
647	0.32
648	0.39
649	0.42
650	0.45
651	0.47
652	0.51
653	0.56
654	0.59
655	0.55
656	0.51
657	0.45
658	0.42
659	0.4
660	0.36
661	0.29
662	0.18
663	0.17
664	0.16
665	0.14
666	0.12
667	0.12
668	0.12
669	0.13
670	0.15
671	0.12
672	0.1
673	0.1
674	0.11
675	0.12
676	0.14
677	0.14
678	0.13
679	0.14
680	0.15
681	0.14
682	0.13
683	0.12
684	0.09
685	0.07
686	0.09
687	0.1
688	0.12
689	0.13
690	0.14
691	0.14
692	0.16
693	0.15
694	0.17
695	0.17
696	0.18
697	0.2
698	0.22
699	0.25
700	0.25
701	0.26
702	0.21
703	0.19
704	0.17
705	0.14
706	0.12
707	0.1
708	0.09
709	0.12
710	0.14
711	0.15
712	0.14
713	0.14
714	0.14
715	0.14
716	0.14
717	0.11
718	0.12
719	0.11
720	0.09
721	0.09
722	0.09
723	0.08
724	0.08
725	0.08
726	0.07
727	0.07
728	0.08
729	0.09
730	0.09
731	0.09
732	0.08
733	0.1
734	0.13
735	0.15
736	0.18
737	0.23
738	0.24
739	0.27
740	0.28
741	0.28
742	0.33
743	0.39
744	0.45
745	0.49
746	0.52
747	0.5
748	0.54
749	0.57
750	0.57
751	0.54
752	0.46
753	0.4
754	0.44
755	0.47
756	0.42
757	0.39
758	0.35
759	0.31
760	0.34
761	0.34
762	0.3
763	0.27
764	0.29
765	0.32
766	0.3
767	0.29
768	0.27
769	0.27
770	0.26
771	0.27
772	0.24
773	0.24
774	0.22
775	0.23
776	0.23
777	0.24
778	0.24
779	0.27
780	0.28
781	0.26
782	0.26
783	0.25
784	0.21
785	0.21
786	0.18
787	0.13
788	0.12
789	0.09
790	0.09
791	0.09
792	0.1
793	0.09
794	0.09
795	0.09
796	0.09
797	0.1
798	0.11
799	0.11
800	0.11
801	0.11
802	0.1
803	0.1
804	0.1
805	0.09
806	0.07
807	0.06
808	0.05
809	0.05
810	0.05
811	0.06
812	0.07
813	0.12
814	0.17
815	0.26
816	0.35
817	0.43
818	0.53
819	0.59
820	0.64
821	0.64
822	0.63
823	0.65
824	0.63
825	0.6
826	0.53
827	0.47
828	0.41
829	0.36
830	0.33
831	0.25
832	0.2
833	0.17
834	0.14
835	0.2
836	0.2
837	0.2
838	0.2
839	0.18
840	0.16
841	0.16
842	0.15
843	0.11
844	0.13
845	0.16
846	0.19
847	0.27
848	0.29
849	0.29
850	0.29
851	0.35
852	0.38
853	0.43
854	0.43
855	0.36
856	0.35
857	0.38
858	0.39
859	0.32
860	0.28
861	0.21
862	0.2
863	0.18
864	0.17
865	0.15
866	0.14
867	0.13
868	0.19
869	0.21
870	0.2
871	0.26
872	0.28
873	0.35
874	0.45
875	0.53
876	0.56
877	0.64
878	0.7
879	0.73
880	0.8
881	0.8
882	0.78
883	0.75
884	0.72
885	0.66
886	0.6
887	0.51
888	0.42
889	0.34
890	0.25
891	0.19
892	0.13
893	0.1
894	0.07
895	0.07
896	0.07
897	0.08
898	0.09
899	0.09
900	0.09
901	0.11
902	0.12

A0A2C5ZA78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer