Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XTA7

Protein Details
Accession A0A2C5XTA7    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-135GDVDTKTWLKNQKKRQKRIEKAKKAQKLMDDHydrophilic
305-331LAPPQVKFRKRAKNKHARKIEKKEEDYBasic
431-450RKHDEEDKPRSKRRRNTTTSBasic
646-665GKGKTEKKLKQVEEEKRREABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-81RRREAKAAAVR
115-129NQKKRQKRIEKAKKA
311-327KFRKRAKNKHARKIEKK
442-442K
646-654GKGKTEKKL
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.166, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MDAATIEETNRIRLSLGMKPLPVPGATSSHQPTEQTTASNGDGEAASTLESRQAQAYDNYKSHMEADVNKRRREAKAAAVRKARDDAQRFALLDGKGLGEADKDGDVDTKTWLKNQKKRQKRIEKAKKAQKLMDDLLEAEELAASTYTSKDLAGLKVAHDSSVFIEGDEQILTLKDATIDENEEAGDELENINLRETEKLNDTLKLKKQRPGYNPLDDENEDGKRGILSQYDDEILGKQSKQFTLDANGTLDGGTDILTQPPPDTKKKWMMGLDDIVGKFKGLLPDLWNRADAGKGEGPTSSDYLAPPQVKFRKRAKNKHARKIEKKEEDYLLPADWKLDTSPIVVGGETFTIKKRKVDADALLDDDDELQKSLAAQRKVALQKRQKVQKTDIGELCRQVRARANEPEPLDESMQGGLVIGQVSEFIASLRKHDEEDKPRSKRRRNTTTSGIHTEATPTAASLSEDKPMVDVDEQTNDTIPIQATQDNNNNNDNNNKTNDGDDGDILDNEKTVGGSISATLALLRERGLIEESRGDATHRSQRSRQDFLLRKRQLEDELDEKARQQRERDRASGKLDRMSRADREDYARQQNAWRDQQHSRRMADLISSTYRPTVELKYTDEHGRTLDQKEAFKHLSHQFHGKGSGKGKTEKKLKQVEEEKRREAQSLFDASQGSGMSAATSQQIKKRKEAGVRLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.33
4 0.33
5 0.33
6 0.34
7 0.36
8 0.35
9 0.3
10 0.26
11 0.21
12 0.23
13 0.23
14 0.29
15 0.3
16 0.32
17 0.33
18 0.32
19 0.32
20 0.33
21 0.33
22 0.28
23 0.26
24 0.26
25 0.25
26 0.25
27 0.22
28 0.17
29 0.16
30 0.14
31 0.13
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.09
36 0.11
37 0.12
38 0.13
39 0.15
40 0.16
41 0.18
42 0.23
43 0.29
44 0.31
45 0.31
46 0.33
47 0.32
48 0.31
49 0.3
50 0.28
51 0.26
52 0.28
53 0.37
54 0.46
55 0.53
56 0.54
57 0.57
58 0.59
59 0.59
60 0.59
61 0.54
62 0.53
63 0.57
64 0.62
65 0.66
66 0.68
67 0.66
68 0.61
69 0.6
70 0.55
71 0.54
72 0.51
73 0.47
74 0.46
75 0.49
76 0.46
77 0.43
78 0.43
79 0.33
80 0.29
81 0.25
82 0.19
83 0.14
84 0.14
85 0.13
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.1
93 0.11
94 0.11
95 0.14
96 0.19
97 0.19
98 0.25
99 0.34
100 0.42
101 0.51
102 0.61
103 0.68
104 0.73
105 0.83
106 0.88
107 0.9
108 0.91
109 0.94
110 0.94
111 0.95
112 0.95
113 0.95
114 0.92
115 0.87
116 0.8
117 0.74
118 0.7
119 0.62
120 0.54
121 0.44
122 0.36
123 0.31
124 0.26
125 0.2
126 0.13
127 0.1
128 0.07
129 0.06
130 0.05
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.09
138 0.11
139 0.12
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.21
144 0.21
145 0.18
146 0.16
147 0.16
148 0.13
149 0.16
150 0.15
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.11
156 0.1
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.11
183 0.12
184 0.14
185 0.16
186 0.2
187 0.21
188 0.25
189 0.27
190 0.32
191 0.39
192 0.46
193 0.47
194 0.49
195 0.56
196 0.61
197 0.65
198 0.66
199 0.65
200 0.64
201 0.62
202 0.58
203 0.54
204 0.46
205 0.43
206 0.37
207 0.3
208 0.22
209 0.2
210 0.18
211 0.13
212 0.14
213 0.11
214 0.1
215 0.12
216 0.12
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.13
226 0.15
227 0.16
228 0.18
229 0.18
230 0.17
231 0.2
232 0.21
233 0.2
234 0.18
235 0.18
236 0.15
237 0.14
238 0.12
239 0.08
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.12
249 0.16
250 0.21
251 0.24
252 0.29
253 0.38
254 0.4
255 0.45
256 0.44
257 0.42
258 0.4
259 0.39
260 0.34
261 0.29
262 0.26
263 0.22
264 0.18
265 0.14
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.09
270 0.1
271 0.13
272 0.19
273 0.22
274 0.23
275 0.22
276 0.2
277 0.19
278 0.19
279 0.16
280 0.14
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.11
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.15
293 0.15
294 0.14
295 0.21
296 0.28
297 0.31
298 0.38
299 0.46
300 0.52
301 0.61
302 0.71
303 0.75
304 0.78
305 0.85
306 0.88
307 0.89
308 0.88
309 0.89
310 0.88
311 0.88
312 0.86
313 0.78
314 0.72
315 0.64
316 0.54
317 0.46
318 0.36
319 0.27
320 0.18
321 0.15
322 0.11
323 0.09
324 0.08
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.08
339 0.12
340 0.13
341 0.15
342 0.18
343 0.2
344 0.24
345 0.27
346 0.28
347 0.29
348 0.29
349 0.29
350 0.25
351 0.22
352 0.18
353 0.14
354 0.11
355 0.06
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.05
360 0.09
361 0.14
362 0.15
363 0.15
364 0.16
365 0.23
366 0.3
367 0.35
368 0.4
369 0.42
370 0.49
371 0.57
372 0.65
373 0.63
374 0.62
375 0.61
376 0.59
377 0.56
378 0.55
379 0.51
380 0.46
381 0.42
382 0.39
383 0.36
384 0.32
385 0.27
386 0.23
387 0.25
388 0.25
389 0.3
390 0.34
391 0.35
392 0.37
393 0.37
394 0.37
395 0.33
396 0.31
397 0.26
398 0.19
399 0.17
400 0.12
401 0.11
402 0.09
403 0.07
404 0.05
405 0.05
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.08
415 0.08
416 0.1
417 0.13
418 0.14
419 0.15
420 0.2
421 0.28
422 0.33
423 0.43
424 0.51
425 0.56
426 0.64
427 0.73
428 0.77
429 0.78
430 0.8
431 0.81
432 0.79
433 0.78
434 0.79
435 0.77
436 0.73
437 0.69
438 0.6
439 0.49
440 0.42
441 0.36
442 0.27
443 0.2
444 0.14
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.1
450 0.1
451 0.11
452 0.11
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.12
457 0.1
458 0.11
459 0.1
460 0.13
461 0.14
462 0.14
463 0.14
464 0.13
465 0.12
466 0.12
467 0.11
468 0.08
469 0.09
470 0.12
471 0.13
472 0.17
473 0.24
474 0.26
475 0.28
476 0.31
477 0.31
478 0.3
479 0.34
480 0.33
481 0.31
482 0.3
483 0.3
484 0.26
485 0.26
486 0.26
487 0.22
488 0.19
489 0.16
490 0.15
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.11
495 0.09
496 0.08
497 0.08
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.07
513 0.07
514 0.08
515 0.11
516 0.11
517 0.12
518 0.14
519 0.15
520 0.15
521 0.15
522 0.15
523 0.15
524 0.19
525 0.27
526 0.3
527 0.34
528 0.38
529 0.47
530 0.54
531 0.58
532 0.57
533 0.59
534 0.62
535 0.66
536 0.72
537 0.66
538 0.62
539 0.59
540 0.58
541 0.52
542 0.47
543 0.42
544 0.35
545 0.36
546 0.36
547 0.34
548 0.33
549 0.35
550 0.37
551 0.37
552 0.4
553 0.44
554 0.51
555 0.58
556 0.63
557 0.6
558 0.6
559 0.64
560 0.65
561 0.58
562 0.55
563 0.52
564 0.48
565 0.49
566 0.48
567 0.45
568 0.42
569 0.42
570 0.39
571 0.41
572 0.45
573 0.48
574 0.52
575 0.5
576 0.46
577 0.49
578 0.54
579 0.56
580 0.57
581 0.53
582 0.5
583 0.57
584 0.64
585 0.68
586 0.66
587 0.6
588 0.54
589 0.51
590 0.46
591 0.4
592 0.33
593 0.28
594 0.26
595 0.26
596 0.23
597 0.24
598 0.23
599 0.21
600 0.23
601 0.23
602 0.24
603 0.26
604 0.29
605 0.31
606 0.35
607 0.39
608 0.37
609 0.33
610 0.29
611 0.31
612 0.32
613 0.31
614 0.34
615 0.33
616 0.35
617 0.37
618 0.43
619 0.4
620 0.37
621 0.42
622 0.43
623 0.46
624 0.46
625 0.51
626 0.47
627 0.47
628 0.54
629 0.5
630 0.49
631 0.47
632 0.5
633 0.48
634 0.53
635 0.57
636 0.58
637 0.65
638 0.65
639 0.69
640 0.73
641 0.72
642 0.74
643 0.77
644 0.79
645 0.8
646 0.81
647 0.77
648 0.74
649 0.72
650 0.65
651 0.55
652 0.5
653 0.46
654 0.45
655 0.39
656 0.35
657 0.34
658 0.3
659 0.32
660 0.26
661 0.19
662 0.12
663 0.11
664 0.09
665 0.08
666 0.09
667 0.11
668 0.16
669 0.19
670 0.26
671 0.36
672 0.39
673 0.47
674 0.54
675 0.58
676 0.63