Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YNH2

Protein Details
Accession A0A2C5YNH2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
158-178PPSARRPRPSWQQQQQQQQQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-129HRAAFRKARLAAKKRLEAAQ
Subcellular Location(s) mito 9.5, cyto_mito 8.333, nucl 7.5, cyto_nucl 7.333, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005606  Sec20  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005484  F:SNAP receptor activity  
GO:0006890  P:retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum  
Pfam View protein in Pfam  
PF03908  Sec20  
Amino Acid Sequences MWKLVPLDSRRNAALFVPNMSLQGLHERLTALQETTTQLRDLIDRLAGLHLPSPDADADDECAEIGQLLRSGFDEQELLWEDLKYARPEGHDKERLKEGAERLRVQLSSHRAAFRKARLAAKKRLEAAQRRERELFVRSLSMTATESEGAPSEDALPPPSARRPRPSWQQQQQQQQQSTLSRKDQLTVGASGNVTTALRRTHDLIAAELSRSEFAHQTLTESSAALKQLDESYMSLEGMLASSRDLLGTLLRSQKSDTWYLQTALYMLLATGAWLFFRRILYGPLWWLLWLPLRTFFGIGSRAGSAVLRTRNGGGRDSSAVVSDEKAGPAVVVGVPGDELPTARIGRGGEEDDGDLDTVLDRVREAVEAVGGAEDVAWEAGTPPGLEPEEVEAPVGEEGVYVRDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.31
3 0.29
4 0.28
5 0.26
6 0.26
7 0.25
8 0.22
9 0.15
10 0.21
11 0.2
12 0.18
13 0.18
14 0.19
15 0.19
16 0.22
17 0.22
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.18
22 0.21
23 0.21
24 0.18
25 0.18
26 0.18
27 0.19
28 0.19
29 0.17
30 0.15
31 0.13
32 0.14
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.16
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.15
41 0.13
42 0.13
43 0.14
44 0.11
45 0.13
46 0.12
47 0.12
48 0.1
49 0.1
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.1
58 0.12
59 0.11
60 0.12
61 0.11
62 0.09
63 0.13
64 0.17
65 0.17
66 0.16
67 0.15
68 0.15
69 0.18
70 0.22
71 0.2
72 0.18
73 0.18
74 0.21
75 0.28
76 0.34
77 0.4
78 0.45
79 0.45
80 0.48
81 0.53
82 0.5
83 0.46
84 0.45
85 0.42
86 0.42
87 0.46
88 0.44
89 0.39
90 0.42
91 0.4
92 0.35
93 0.35
94 0.32
95 0.32
96 0.33
97 0.36
98 0.34
99 0.38
100 0.43
101 0.42
102 0.44
103 0.44
104 0.49
105 0.54
106 0.6
107 0.65
108 0.66
109 0.66
110 0.6
111 0.61
112 0.61
113 0.61
114 0.63
115 0.63
116 0.6
117 0.6
118 0.59
119 0.54
120 0.48
121 0.43
122 0.36
123 0.27
124 0.25
125 0.21
126 0.2
127 0.18
128 0.16
129 0.14
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.13
146 0.2
147 0.25
148 0.27
149 0.34
150 0.39
151 0.46
152 0.56
153 0.64
154 0.68
155 0.7
156 0.76
157 0.77
158 0.81
159 0.81
160 0.78
161 0.69
162 0.6
163 0.53
164 0.49
165 0.47
166 0.4
167 0.34
168 0.32
169 0.3
170 0.3
171 0.28
172 0.25
173 0.22
174 0.2
175 0.18
176 0.14
177 0.14
178 0.13
179 0.12
180 0.1
181 0.08
182 0.06
183 0.07
184 0.06
185 0.08
186 0.09
187 0.11
188 0.12
189 0.14
190 0.15
191 0.14
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.1
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.11
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.03
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.1
237 0.15
238 0.16
239 0.16
240 0.18
241 0.21
242 0.23
243 0.26
244 0.24
245 0.23
246 0.25
247 0.25
248 0.24
249 0.21
250 0.18
251 0.14
252 0.13
253 0.08
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.1
266 0.1
267 0.13
268 0.14
269 0.15
270 0.16
271 0.16
272 0.15
273 0.13
274 0.13
275 0.12
276 0.16
277 0.15
278 0.15
279 0.17
280 0.18
281 0.19
282 0.19
283 0.17
284 0.15
285 0.16
286 0.15
287 0.13
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.1
293 0.14
294 0.17
295 0.16
296 0.17
297 0.2
298 0.24
299 0.26
300 0.27
301 0.23
302 0.23
303 0.24
304 0.25
305 0.23
306 0.19
307 0.18
308 0.16
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.12
313 0.12
314 0.11
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.13
332 0.12
333 0.15
334 0.18
335 0.19
336 0.16
337 0.17
338 0.17
339 0.16
340 0.16
341 0.14
342 0.1
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.12
372 0.13
373 0.13
374 0.13
375 0.18
376 0.2
377 0.19
378 0.19
379 0.15
380 0.15
381 0.15
382 0.14
383 0.09
384 0.06
385 0.07
386 0.08