FuNGI

A0A2C5YXZ6

Protein Details

Accession

A0A2C5YXZ6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
208-228	LVTAGRKRKKRWDISSTPADD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
213-217	RKRKK

Subcellular Location(s)

plas 10, cyto 8.5, cyto_nucl 8, nucl 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDADFEAVARLQRERNAAAAGKKNSHDASNQRGDSKRQKLTENADSDLYEKDGDKFAGYHQSLPMGDDDDDAAEDRTVRLTGQYTASRDMIDEFARGEGVEEDDVLAGRGEKSGRIIDRESDYQKRRFNRVLTPTRADPFAENRQAGAAEKGTTYREIMQSNELDREEDRVRRAIQAKQKDEANVEHAKPTLQNTDKENSDAGSTELVTAGRKRKKRWDISSTPADDQSQSEAAPPKRSRWDEAPSVSSEPQRQRSRWDQAPSATPMGNSGLSTPAQPTKVLSLPTTFGTDIGRNMPLTDEELDMLLPGEDQGYKILEFPAGFVQARVPSHRSMAMPPPPTGFIMQDPDQVRLGGQPMPTEISGVGDLQFLKPEDMTYFGKLNDGVDESTMSVDELKERKIMKLLLKIKNGTPPMRKTALRQITDNARQFGPGPLFAQILPLLMEKTLEEQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPFVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNVAKAAGLATMISVMRPDIDHVDDYVRNTTARAFAVVASALSIPALLPFLGAVCRSKKSWHARHTGVKIVQQIAILMGCAVLPHLKGLVECIANNLNDDQTKVRTVTSLAIAALAEASNPYGIESFDEILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTTQIMEILLREFSSPDEEMKKVVLKVVSQCAATKGVSGNYLKEHVLDDFFKNFWVKRMALDKRNYKQVVETTVDIGQKVGVSEMLERIVDNLKDESEAYRKMTVETMEKVVTSLGAADIDDRLEERLVDGILYTFQEQSVEDIVILNGFGSVVNALGDRCGPFLPQITSTILWRLNHKSPTVRQQAADLISRIAMVMKQCGEDELMGKLGVVLYEYLGEEYPEVLGSMLGALRSIVTVVGIAQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLSNLRVQERQSRVNTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKALSFLFEYIGEMGKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHIGLGVIGLGCEDAMVHLLNLLYPNLFETSPHVIDRIIEAIEAIRMAVGPGAVLNYVWAGLFHPARKVRTPYWRLFNDAYVQGADAMVPYYPNWCEEGLDRPELGVML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.29
3	0.3
4	0.33
5	0.36
6	0.4
7	0.46
8	0.47
9	0.48
10	0.48
11	0.51
12	0.48
13	0.46
14	0.46
15	0.44
16	0.48
17	0.52
18	0.53
19	0.54
20	0.56
21	0.61
22	0.64
23	0.67
24	0.66
25	0.61
26	0.63
27	0.65
28	0.69
29	0.7
30	0.64
31	0.57
32	0.5
33	0.46
34	0.42
35	0.35
36	0.28
37	0.2
38	0.17
39	0.17
40	0.18
41	0.18
42	0.18
43	0.17
44	0.19
45	0.27
46	0.27
47	0.28
48	0.26
49	0.29
50	0.28
51	0.29
52	0.27
53	0.2
54	0.19
55	0.17
56	0.16
57	0.13
58	0.13
59	0.13
60	0.12
61	0.1
62	0.1
63	0.1
64	0.11
65	0.1
66	0.1
67	0.12
68	0.13
69	0.16
70	0.21
71	0.26
72	0.27
73	0.31
74	0.32
75	0.29
76	0.27
77	0.27
78	0.24
79	0.2
80	0.17
81	0.14
82	0.14
83	0.14
84	0.13
85	0.12
86	0.1
87	0.11
88	0.1
89	0.1
90	0.09
91	0.1
92	0.1
93	0.09
94	0.08
95	0.07
96	0.07
97	0.09
98	0.1
99	0.1
100	0.14
101	0.2
102	0.22
103	0.26
104	0.28
105	0.3
106	0.35
107	0.41
108	0.45
109	0.48
110	0.52
111	0.56
112	0.61
113	0.63
114	0.65
115	0.66
116	0.65
117	0.65
118	0.69
119	0.71
120	0.71
121	0.71
122	0.68
123	0.63
124	0.59
125	0.5
126	0.43
127	0.41
128	0.42
129	0.43
130	0.38
131	0.36
132	0.35
133	0.35
134	0.32
135	0.28
136	0.2
137	0.14
138	0.15
139	0.16
140	0.17
141	0.17
142	0.18
143	0.19
144	0.22
145	0.22
146	0.24
147	0.28
148	0.29
149	0.3
150	0.32
151	0.28
152	0.26
153	0.24
154	0.28
155	0.27
156	0.28
157	0.29
158	0.3
159	0.31
160	0.37
161	0.41
162	0.43
163	0.48
164	0.54
165	0.55
166	0.55
167	0.57
168	0.53
169	0.52
170	0.46
171	0.43
172	0.39
173	0.36
174	0.34
175	0.31
176	0.29
177	0.27
178	0.28
179	0.32
180	0.29
181	0.32
182	0.34
183	0.39
184	0.39
185	0.39
186	0.36
187	0.27
188	0.24
189	0.21
190	0.17
191	0.13
192	0.11
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.11
197	0.16
198	0.24
199	0.31
200	0.38
201	0.44
202	0.54
203	0.64
204	0.73
205	0.77
206	0.79
207	0.78
208	0.8
209	0.83
210	0.77
211	0.69
212	0.6
213	0.51
214	0.42
215	0.35
216	0.3
217	0.21
218	0.17
219	0.19
220	0.24
221	0.26
222	0.34
223	0.35
224	0.37
225	0.46
226	0.49
227	0.51
228	0.5
229	0.55
230	0.53
231	0.55
232	0.53
233	0.47
234	0.47
235	0.44
236	0.4
237	0.41
238	0.4
239	0.45
240	0.49
241	0.47
242	0.51
243	0.58
244	0.63
245	0.63
246	0.63
247	0.58
248	0.54
249	0.59
250	0.55
251	0.49
252	0.4
253	0.32
254	0.27
255	0.24
256	0.21
257	0.16
258	0.12
259	0.12
260	0.11
261	0.12
262	0.14
263	0.15
264	0.16
265	0.16
266	0.16
267	0.18
268	0.21
269	0.22
270	0.2
271	0.19
272	0.19
273	0.2
274	0.22
275	0.18
276	0.15
277	0.16
278	0.16
279	0.16
280	0.17
281	0.17
282	0.14
283	0.14
284	0.15
285	0.13
286	0.14
287	0.14
288	0.12
289	0.11
290	0.11
291	0.1
292	0.09
293	0.09
294	0.06
295	0.05
296	0.04
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.08
304	0.09
305	0.1
306	0.09
307	0.11
308	0.12
309	0.13
310	0.13
311	0.12
312	0.14
313	0.16
314	0.17
315	0.2
316	0.2
317	0.19
318	0.21
319	0.24
320	0.23
321	0.23
322	0.3
323	0.34
324	0.34
325	0.33
326	0.33
327	0.32
328	0.31
329	0.29
330	0.22
331	0.17
332	0.19
333	0.19
334	0.24
335	0.23
336	0.24
337	0.24
338	0.22
339	0.2
340	0.16
341	0.17
342	0.14
343	0.13
344	0.11
345	0.12
346	0.14
347	0.13
348	0.13
349	0.11
350	0.09
351	0.09
352	0.09
353	0.09
354	0.08
355	0.09
356	0.08
357	0.1
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.13
364	0.14
365	0.15
366	0.16
367	0.15
368	0.16
369	0.16
370	0.16
371	0.13
372	0.12
373	0.1
374	0.09
375	0.09
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.07
380	0.06
381	0.06
382	0.1
383	0.11
384	0.12
385	0.16
386	0.17
387	0.18
388	0.22
389	0.26
390	0.26
391	0.34
392	0.43
393	0.46
394	0.49
395	0.51
396	0.49
397	0.51
398	0.51
399	0.48
400	0.45
401	0.42
402	0.43
403	0.46
404	0.45
405	0.42
406	0.48
407	0.5
408	0.45
409	0.43
410	0.42
411	0.45
412	0.52
413	0.51
414	0.43
415	0.34
416	0.33
417	0.32
418	0.31
419	0.24
420	0.17
421	0.15
422	0.13
423	0.14
424	0.13
425	0.14
426	0.1
427	0.09
428	0.09
429	0.08
430	0.07
431	0.06
432	0.07
433	0.06
434	0.08
435	0.11
436	0.12
437	0.12
438	0.13
439	0.16
440	0.18
441	0.18
442	0.16
443	0.15
444	0.14
445	0.18
446	0.2
447	0.18
448	0.18
449	0.18
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.13
454	0.13
455	0.14
456	0.15
457	0.16
458	0.18
459	0.17
460	0.18
461	0.19
462	0.17
463	0.15
464	0.13
465	0.12
466	0.12
467	0.12
468	0.1
469	0.1
470	0.09
471	0.08
472	0.08
473	0.08
474	0.05
475	0.04
476	0.03
477	0.04
478	0.05
479	0.05
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.07
484	0.09
485	0.1
486	0.12
487	0.12
488	0.14
489	0.14
490	0.14
491	0.14
492	0.12
493	0.1
494	0.07
495	0.07
496	0.05
497	0.04
498	0.03
499	0.03
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.05
508	0.06
509	0.07
510	0.08
511	0.08
512	0.11
513	0.12
514	0.13
515	0.14
516	0.12
517	0.11
518	0.11
519	0.11
520	0.11
521	0.1
522	0.1
523	0.09
524	0.08
525	0.09
526	0.09
527	0.07
528	0.06
529	0.06
530	0.05
531	0.04
532	0.04
533	0.03
534	0.03
535	0.04
536	0.03
537	0.03
538	0.03
539	0.03
540	0.04
541	0.04
542	0.06
543	0.08
544	0.1
545	0.11
546	0.13
547	0.21
548	0.31
549	0.4
550	0.45
551	0.51
552	0.55
553	0.62
554	0.63
555	0.6
556	0.52
557	0.46
558	0.41
559	0.35
560	0.3
561	0.23
562	0.2
563	0.13
564	0.11
565	0.08
566	0.05
567	0.04
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.03
572	0.03
573	0.03
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.05
578	0.08
579	0.08
580	0.08
581	0.09
582	0.11
583	0.11
584	0.11
585	0.1
586	0.09
587	0.09
588	0.1
589	0.09
590	0.09
591	0.1
592	0.1
593	0.1
594	0.09
595	0.1
596	0.11
597	0.1
598	0.1
599	0.08
600	0.08
601	0.08
602	0.07
603	0.06
604	0.04
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.04
613	0.04
614	0.05
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.07
619	0.07
620	0.07
621	0.06
622	0.05
623	0.05
624	0.06
625	0.08
626	0.13
627	0.22
628	0.24
629	0.25
630	0.31
631	0.34
632	0.36
633	0.36
634	0.37
635	0.31
636	0.3
637	0.29
638	0.24
639	0.2
640	0.18
641	0.15
642	0.08
643	0.05
644	0.04
645	0.03
646	0.04
647	0.03
648	0.04
649	0.05
650	0.05
651	0.04
652	0.07
653	0.08
654	0.08
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.08
659	0.08
660	0.06
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.08
671	0.08
672	0.1
673	0.12
674	0.13
675	0.13
676	0.14
677	0.16
678	0.13
679	0.15
680	0.14
681	0.13
682	0.16
683	0.19
684	0.19
685	0.17
686	0.18
687	0.17
688	0.18
689	0.16
690	0.14
691	0.11
692	0.11
693	0.14
694	0.14
695	0.13
696	0.13
697	0.15
698	0.14
699	0.13
700	0.13
701	0.1
702	0.12
703	0.13
704	0.13
705	0.13
706	0.13
707	0.14
708	0.15
709	0.14
710	0.15
711	0.18
712	0.16
713	0.19
714	0.28
715	0.33
716	0.39
717	0.47
718	0.53
719	0.52
720	0.61
721	0.58
722	0.49
723	0.46
724	0.42
725	0.39
726	0.32
727	0.29
728	0.22
729	0.24
730	0.24
731	0.2
732	0.17
733	0.13
734	0.11
735	0.1
736	0.08
737	0.05
738	0.05
739	0.06
740	0.07
741	0.07
742	0.07
743	0.07
744	0.08
745	0.1
746	0.1
747	0.11
748	0.11
749	0.1
750	0.11
751	0.11
752	0.12
753	0.13
754	0.15
755	0.15
756	0.17
757	0.17
758	0.18
759	0.19
760	0.19
761	0.19
762	0.19
763	0.19
764	0.17
765	0.17
766	0.16
767	0.14
768	0.12
769	0.08
770	0.06
771	0.04
772	0.04
773	0.04
774	0.04
775	0.04
776	0.05
777	0.05
778	0.05
779	0.05
780	0.05
781	0.05
782	0.05
783	0.06
784	0.06
785	0.06
786	0.06
787	0.05
788	0.06
789	0.07
790	0.07
791	0.06
792	0.06
793	0.07
794	0.07
795	0.08
796	0.09
797	0.08
798	0.07
799	0.07
800	0.07
801	0.07
802	0.07
803	0.05
804	0.03
805	0.03
806	0.03
807	0.03
808	0.03
809	0.03
810	0.04
811	0.04
812	0.04
813	0.04
814	0.05
815	0.06
816	0.07
817	0.07
818	0.07
819	0.08
820	0.11
821	0.13
822	0.13
823	0.15
824	0.16
825	0.17
826	0.17
827	0.2
828	0.2
829	0.19
830	0.23
831	0.27
832	0.31
833	0.33
834	0.35
835	0.38
836	0.4
837	0.49
838	0.53
839	0.49
840	0.43
841	0.42
842	0.44
843	0.4
844	0.37
845	0.28
846	0.2
847	0.17
848	0.17
849	0.14
850	0.1
851	0.09
852	0.07
853	0.1
854	0.1
855	0.11
856	0.11
857	0.12
858	0.12
859	0.11
860	0.11
861	0.1
862	0.1
863	0.09
864	0.08
865	0.08
866	0.07
867	0.06
868	0.06
869	0.05
870	0.04
871	0.05
872	0.05
873	0.06
874	0.06
875	0.06
876	0.06
877	0.06
878	0.06
879	0.05
880	0.05
881	0.04
882	0.04
883	0.04
884	0.04
885	0.05
886	0.04
887	0.04
888	0.04
889	0.04
890	0.04
891	0.04
892	0.04
893	0.03
894	0.03
895	0.04
896	0.05
897	0.05
898	0.05
899	0.06
900	0.09
901	0.1
902	0.1
903	0.11
904	0.12
905	0.13
906	0.16
907	0.17
908	0.21
909	0.23
910	0.24
911	0.26
912	0.28
913	0.33
914	0.37
915	0.45
916	0.45
917	0.5
918	0.53
919	0.59
920	0.62
921	0.64
922	0.61
923	0.61
924	0.57
925	0.53
926	0.5
927	0.42
928	0.35
929	0.28
930	0.23
931	0.14
932	0.11
933	0.08
934	0.08
935	0.08
936	0.09
937	0.1
938	0.11
939	0.14
940	0.17
941	0.19
942	0.22
943	0.23
944	0.23
945	0.25
946	0.25
947	0.24
948	0.24
949	0.22
950	0.21
951	0.18
952	0.18
953	0.19
954	0.18
955	0.19
956	0.15
957	0.18
958	0.22
959	0.22
960	0.24
961	0.22
962	0.27
963	0.33
964	0.43
965	0.49
966	0.5
967	0.59
968	0.65
969	0.72
970	0.67
971	0.6
972	0.51
973	0.41
974	0.36
975	0.28
976	0.2
977	0.11
978	0.13
979	0.13
980	0.12
981	0.11
982	0.11
983	0.11
984	0.1
985	0.09
986	0.07
987	0.07
988	0.07
989	0.08
990	0.09
991	0.1
992	0.11
993	0.13
994	0.15
995	0.17
996	0.26
997	0.3
998	0.37
999	0.39
1000	0.44
1001	0.43
1002	0.43
1003	0.41
1004	0.33
1005	0.28
1006	0.2
1007	0.17
1008	0.11
1009	0.09
1010	0.06
1011	0.06
1012	0.05
1013	0.04
1014	0.04
1015	0.04
1016	0.05
1017	0.05
1018	0.06
1019	0.09
1020	0.1
1021	0.1
1022	0.11
1023	0.16
1024	0.16
1025	0.18
1026	0.18
1027	0.17
1028	0.18
1029	0.18
1030	0.19
1031	0.2
1032	0.23
1033	0.25
1034	0.26
1035	0.25
1036	0.26
1037	0.25
1038	0.24
1039	0.18
1040	0.14
1041	0.11
1042	0.1
1043	0.11
1044	0.08
1045	0.08
1046	0.08
1047	0.08
1048	0.1
1049	0.1
1050	0.11
1051	0.1
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.09
1055	0.09
1056	0.09
1057	0.08
1058	0.07
1059	0.08
1060	0.08
1061	0.08
1062	0.08
1063	0.08
1064	0.08
1065	0.07
1066	0.06
1067	0.07
1068	0.1
1069	0.1
1070	0.1
1071	0.11
1072	0.14
1073	0.19
1074	0.21
1075	0.23
1076	0.2
1077	0.2
1078	0.22
1079	0.27
1080	0.3
1081	0.27
1082	0.27
1083	0.26
1084	0.26
1085	0.25
1086	0.23
1087	0.18
1088	0.11
1089	0.1
1090	0.08
1091	0.06
1092	0.05
1093	0.05
1094	0.05
1095	0.04
1096	0.04
1097	0.04
1098	0.03
1099	0.04
1100	0.05
1101	0.05
1102	0.06
1103	0.06
1104	0.07
1105	0.09
1106	0.09
1107	0.08
1108	0.08
1109	0.1
1110	0.11
1111	0.11
1112	0.1
1113	0.14
1114	0.21
1115	0.23
1116	0.24
1117	0.23
1118	0.21
1119	0.22
1120	0.23
1121	0.21
1122	0.14
1123	0.11
1124	0.11
1125	0.11
1126	0.11
1127	0.1
1128	0.08
1129	0.06
1130	0.05
1131	0.06
1132	0.06
1133	0.05
1134	0.05
1135	0.05
1136	0.06
1137	0.06
1138	0.06
1139	0.06
1140	0.06
1141	0.06
1142	0.06
1143	0.06
1144	0.06
1145	0.12
1146	0.16
1147	0.17
1148	0.25
1149	0.31
1150	0.36
1151	0.43
1152	0.49
1153	0.52
1154	0.59
1155	0.66
1156	0.66
1157	0.71
1158	0.69
1159	0.69
1160	0.64
1161	0.6
1162	0.55
1163	0.48
1164	0.41
1165	0.32
1166	0.29
1167	0.22
1168	0.2
1169	0.16
1170	0.1
1171	0.09
1172	0.07
1173	0.07
1174	0.07
1175	0.1
1176	0.11
1177	0.13
1178	0.15
1179	0.14
1180	0.16
1181	0.17
1182	0.26
1183	0.27
1184	0.29
1185	0.28
1186	0.26

A0A2C5YXZ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer