Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5ZI55

Protein Details
Accession A0A2C5ZI55    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-39GESTGKRSKVKFQRPRHASDRIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-31TGKRSKVKFQR
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto_nucl 9, cyto 7, mito 4, plas 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51165  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MEDGAQKRKQRPGCARGGESTGKRSKVKFQRPRHASDRIAEGSSLQGGSAGRWKTPHQQAKTAEKTDTGAVLDVGDGGIWVTFVRGMQTKALREFKALCGEYCETMYNMTQLGSEDTPLDDETSDERDIESSIQDELSSLKEKSKLKPREPFRVVTTGLDCLFFMKLSKPIDPASMVSRMCEDARDCPEPRLRKCRYINRLTPVTDIDRATEKGIVRVGRKVLAPFFALQGDAEAQVPENDSALPCTYAIRYNIRNHTAFTSDAVIKLIASLIHSRHKVKLGKPDKVILVEIFQLFCGLSVVDGREWEALKRYNVNSLYEMPRPETGTEAAPSGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.74
3 0.69
4 0.67
5 0.65
6 0.57
7 0.58
8 0.54
9 0.52
10 0.52
11 0.52
12 0.56
13 0.59
14 0.67
15 0.68
16 0.73
17 0.78
18 0.8
19 0.85
20 0.82
21 0.79
22 0.72
23 0.66
24 0.63
25 0.55
26 0.5
27 0.41
28 0.35
29 0.28
30 0.25
31 0.2
32 0.12
33 0.1
34 0.09
35 0.1
36 0.17
37 0.16
38 0.16
39 0.19
40 0.23
41 0.3
42 0.41
43 0.49
44 0.47
45 0.55
46 0.61
47 0.69
48 0.74
49 0.67
50 0.57
51 0.49
52 0.46
53 0.39
54 0.33
55 0.23
56 0.15
57 0.12
58 0.11
59 0.09
60 0.08
61 0.06
62 0.04
63 0.04
64 0.03
65 0.03
66 0.03
67 0.03
68 0.03
69 0.04
70 0.04
71 0.06
72 0.09
73 0.1
74 0.15
75 0.19
76 0.22
77 0.29
78 0.35
79 0.33
80 0.34
81 0.35
82 0.34
83 0.38
84 0.36
85 0.29
86 0.28
87 0.29
88 0.27
89 0.26
90 0.23
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.11
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.1
117 0.09
118 0.06
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.08
125 0.1
126 0.1
127 0.12
128 0.18
129 0.21
130 0.28
131 0.37
132 0.44
133 0.49
134 0.58
135 0.62
136 0.67
137 0.67
138 0.64
139 0.57
140 0.52
141 0.46
142 0.38
143 0.33
144 0.24
145 0.21
146 0.18
147 0.14
148 0.1
149 0.1
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.11
154 0.12
155 0.13
156 0.14
157 0.15
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.14
162 0.17
163 0.16
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.12
170 0.13
171 0.18
172 0.22
173 0.22
174 0.24
175 0.31
176 0.37
177 0.41
178 0.47
179 0.46
180 0.52
181 0.59
182 0.66
183 0.68
184 0.7
185 0.71
186 0.68
187 0.69
188 0.61
189 0.54
190 0.46
191 0.4
192 0.34
193 0.28
194 0.22
195 0.2
196 0.2
197 0.19
198 0.2
199 0.17
200 0.16
201 0.19
202 0.21
203 0.19
204 0.22
205 0.23
206 0.21
207 0.22
208 0.22
209 0.2
210 0.19
211 0.19
212 0.16
213 0.16
214 0.14
215 0.13
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.13
236 0.17
237 0.21
238 0.26
239 0.33
240 0.4
241 0.44
242 0.44
243 0.42
244 0.42
245 0.38
246 0.33
247 0.27
248 0.24
249 0.2
250 0.19
251 0.18
252 0.15
253 0.13
254 0.12
255 0.11
256 0.07
257 0.08
258 0.11
259 0.13
260 0.2
261 0.24
262 0.27
263 0.3
264 0.38
265 0.42
266 0.45
267 0.53
268 0.55
269 0.6
270 0.61
271 0.62
272 0.57
273 0.53
274 0.5
275 0.4
276 0.32
277 0.27
278 0.25
279 0.2
280 0.16
281 0.14
282 0.12
283 0.11
284 0.1
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.12
292 0.14
293 0.15
294 0.16
295 0.21
296 0.24
297 0.27
298 0.33
299 0.33
300 0.39
301 0.4
302 0.42
303 0.4
304 0.41
305 0.43
306 0.4
307 0.41
308 0.36
309 0.37
310 0.36
311 0.33
312 0.3
313 0.27
314 0.26
315 0.25