Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5ZI80

Protein Details
Accession A0A2C5ZI80    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-185TQARSKPKSKPAKSARAGRRNRTTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-181RSKPKSKPAKSARAGRRN
269-283AKRSSRIAGKVEKRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028938  Rsf1-like  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0031213  C:RSF complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
Amino Acid Sequences MPSRKRPIQAEEDAVGVTNGDDAPAALVRIRNMWQFANLCQWIYIFGKAAKIDESIDIEEIEADCLKPQQNLLVDLALAILKLVSSHRGLNHDILDDQLHKQYLMRAPDRAFGNGDNRSNKFCDLSVCQKRIEPYGWDKEDRTYFVLDDNRVYRLTEAPPTQARSKPKSKPAKSARAGRRNRTTETDMTDKGDDDGLGGKMWECVAVTLQDVQSLLGNFAKTRDENEKILRRQLQTHLVPILEKMEEAQKRKQAQKERELLNLAKMANAKRSSRIAGKVEKRKLEEQAKEDELKERQSEVMKVREEQKRQRLERDRDFRMFSRQRRLQEREARRLQHKEELAQLSEDSRHTSTGAGRMSERRLEAEIEKKKQSLEDLDREEEEWAFDCICGLFGHVDDGTHCVACERCNVWQHSGCLGISEAEADRPEFQFVCDSCKRQDGRPFKMVKLKLNPSRSTASSRAEQALDTQSMEQRAPCDDSSKPCSGAPLSGDGGSAPNVPEPTSSLLVAPTASEPVSQLTPGPSEEARNAISAVNTGETSAAGNLLKQNGDEPLPRPPEEPQLDKGDSGAKAHESLPTTVP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.29
3 0.2
4 0.13
5 0.08
6 0.07
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.07
11 0.08
12 0.09
13 0.09
14 0.11
15 0.12
16 0.16
17 0.19
18 0.21
19 0.23
20 0.24
21 0.28
22 0.29
23 0.3
24 0.35
25 0.33
26 0.3
27 0.28
28 0.26
29 0.24
30 0.24
31 0.24
32 0.18
33 0.18
34 0.21
35 0.22
36 0.23
37 0.21
38 0.2
39 0.2
40 0.19
41 0.21
42 0.18
43 0.18
44 0.17
45 0.15
46 0.15
47 0.14
48 0.13
49 0.1
50 0.09
51 0.09
52 0.12
53 0.14
54 0.14
55 0.15
56 0.19
57 0.21
58 0.23
59 0.24
60 0.21
61 0.19
62 0.18
63 0.18
64 0.12
65 0.09
66 0.06
67 0.04
68 0.03
69 0.04
70 0.06
71 0.08
72 0.1
73 0.14
74 0.17
75 0.21
76 0.24
77 0.27
78 0.27
79 0.26
80 0.24
81 0.22
82 0.22
83 0.2
84 0.19
85 0.19
86 0.18
87 0.16
88 0.17
89 0.22
90 0.26
91 0.31
92 0.32
93 0.34
94 0.35
95 0.41
96 0.42
97 0.37
98 0.33
99 0.29
100 0.33
101 0.34
102 0.38
103 0.38
104 0.38
105 0.4
106 0.4
107 0.38
108 0.33
109 0.28
110 0.27
111 0.27
112 0.36
113 0.42
114 0.42
115 0.42
116 0.42
117 0.44
118 0.43
119 0.4
120 0.35
121 0.34
122 0.41
123 0.44
124 0.45
125 0.43
126 0.45
127 0.45
128 0.42
129 0.36
130 0.27
131 0.23
132 0.26
133 0.3
134 0.25
135 0.26
136 0.25
137 0.24
138 0.23
139 0.24
140 0.2
141 0.18
142 0.2
143 0.22
144 0.22
145 0.25
146 0.28
147 0.32
148 0.35
149 0.37
150 0.42
151 0.44
152 0.52
153 0.55
154 0.62
155 0.69
156 0.69
157 0.75
158 0.77
159 0.8
160 0.78
161 0.8
162 0.81
163 0.8
164 0.83
165 0.81
166 0.81
167 0.75
168 0.71
169 0.67
170 0.62
171 0.55
172 0.53
173 0.49
174 0.4
175 0.38
176 0.35
177 0.28
178 0.24
179 0.2
180 0.15
181 0.1
182 0.11
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.12
208 0.1
209 0.14
210 0.19
211 0.21
212 0.24
213 0.32
214 0.4
215 0.39
216 0.46
217 0.48
218 0.43
219 0.44
220 0.45
221 0.45
222 0.38
223 0.39
224 0.33
225 0.28
226 0.26
227 0.22
228 0.2
229 0.11
230 0.1
231 0.08
232 0.14
233 0.17
234 0.21
235 0.25
236 0.3
237 0.35
238 0.42
239 0.48
240 0.51
241 0.56
242 0.61
243 0.65
244 0.61
245 0.59
246 0.57
247 0.5
248 0.42
249 0.37
250 0.28
251 0.21
252 0.21
253 0.18
254 0.21
255 0.23
256 0.22
257 0.22
258 0.24
259 0.25
260 0.26
261 0.3
262 0.29
263 0.34
264 0.42
265 0.48
266 0.52
267 0.53
268 0.52
269 0.5
270 0.53
271 0.53
272 0.49
273 0.43
274 0.43
275 0.41
276 0.39
277 0.37
278 0.33
279 0.27
280 0.24
281 0.22
282 0.17
283 0.17
284 0.17
285 0.2
286 0.2
287 0.24
288 0.23
289 0.24
290 0.31
291 0.35
292 0.4
293 0.44
294 0.49
295 0.53
296 0.54
297 0.62
298 0.65
299 0.67
300 0.71
301 0.71
302 0.68
303 0.62
304 0.63
305 0.54
306 0.54
307 0.54
308 0.49
309 0.52
310 0.52
311 0.55
312 0.6
313 0.65
314 0.64
315 0.66
316 0.7
317 0.69
318 0.7
319 0.69
320 0.66
321 0.65
322 0.59
323 0.55
324 0.48
325 0.4
326 0.4
327 0.37
328 0.32
329 0.27
330 0.24
331 0.18
332 0.18
333 0.17
334 0.13
335 0.12
336 0.11
337 0.11
338 0.12
339 0.13
340 0.16
341 0.17
342 0.15
343 0.16
344 0.19
345 0.21
346 0.22
347 0.21
348 0.18
349 0.18
350 0.19
351 0.21
352 0.27
353 0.32
354 0.34
355 0.36
356 0.35
357 0.34
358 0.33
359 0.33
360 0.32
361 0.31
362 0.33
363 0.35
364 0.36
365 0.36
366 0.36
367 0.34
368 0.26
369 0.2
370 0.13
371 0.1
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.1
392 0.14
393 0.14
394 0.18
395 0.24
396 0.27
397 0.32
398 0.35
399 0.36
400 0.33
401 0.34
402 0.29
403 0.23
404 0.21
405 0.15
406 0.11
407 0.1
408 0.09
409 0.08
410 0.09
411 0.09
412 0.1
413 0.1
414 0.12
415 0.11
416 0.11
417 0.16
418 0.16
419 0.23
420 0.26
421 0.28
422 0.29
423 0.36
424 0.38
425 0.39
426 0.48
427 0.5
428 0.53
429 0.59
430 0.61
431 0.58
432 0.65
433 0.63
434 0.61
435 0.61
436 0.63
437 0.63
438 0.67
439 0.64
440 0.6
441 0.6
442 0.54
443 0.52
444 0.47
445 0.43
446 0.38
447 0.39
448 0.37
449 0.33
450 0.31
451 0.27
452 0.26
453 0.23
454 0.21
455 0.19
456 0.19
457 0.2
458 0.21
459 0.18
460 0.16
461 0.17
462 0.2
463 0.19
464 0.2
465 0.22
466 0.28
467 0.34
468 0.36
469 0.34
470 0.31
471 0.34
472 0.32
473 0.31
474 0.26
475 0.23
476 0.22
477 0.2
478 0.2
479 0.17
480 0.16
481 0.15
482 0.14
483 0.1
484 0.11
485 0.11
486 0.12
487 0.12
488 0.14
489 0.17
490 0.18
491 0.18
492 0.16
493 0.15
494 0.16
495 0.15
496 0.13
497 0.1
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.12
503 0.13
504 0.12
505 0.12
506 0.13
507 0.14
508 0.15
509 0.18
510 0.16
511 0.18
512 0.19
513 0.22
514 0.2
515 0.2
516 0.2
517 0.17
518 0.17
519 0.15
520 0.15
521 0.13
522 0.12
523 0.11
524 0.1
525 0.1
526 0.1
527 0.09
528 0.1
529 0.08
530 0.1
531 0.13
532 0.15
533 0.16
534 0.15
535 0.16
536 0.17
537 0.2
538 0.23
539 0.22
540 0.29
541 0.34
542 0.35
543 0.35
544 0.36
545 0.43
546 0.46
547 0.48
548 0.44
549 0.47
550 0.47
551 0.45
552 0.43
553 0.39
554 0.34
555 0.3
556 0.28
557 0.22
558 0.22
559 0.23
560 0.27
561 0.24