Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YQT8

Protein Details
Accession A0A2C5YQT8    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-106DMARTLKATKRKRPDGEAPKKPREGRREKKRRDRDDEIPADEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-97KATKRKRPDGEAPKKPREGRREKKRRD
114-133KAPRRSRRAGDGERRRAKEA
148-175EERRKRAIDRALDAAIKKGGGGGKRRRK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDVDSPAANVPVDDGQEQTFQDEIAAANSDRDSDLLSEIDENQFEDYDPETANIEDRPVDIDEDMARTLKATKRKRPDGEAPKKPREGRREKKRRDRDDEIPADEDDGADTGKAPRRSRRAGDGERRRAKEAETPQEAPKEEQLTPEERRKRAIDRALDAAIKKGGGGGKRRRKDEIDLEDEIDEKLAQLKYQMEQACQADNAARESGQPALHKLKLLPEVNAILNRNNVQHAVLDPDTNFLQHVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDIFSALTRLNVEKEALLSSGIGKVVLFYTRSKKPEPSIRRMAERLLGEWSRPILKRTDDYKKRHVETREFDYQAAKMAQRQKTNSQFTLSQRPSQSAREAFLAPQGNNNQARMASLPSSYTIAPKSTFDGSQGQDHRPLGASGMEAFRRMTQKTQRAKKRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.15
4 0.18
5 0.18
6 0.17
7 0.15
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.1
12 0.09
13 0.12
14 0.1
15 0.12
16 0.12
17 0.13
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.11
22 0.12
23 0.11
24 0.12
25 0.12
26 0.13
27 0.15
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.11
44 0.11
45 0.13
46 0.13
47 0.14
48 0.12
49 0.14
50 0.13
51 0.14
52 0.15
53 0.13
54 0.11
55 0.11
56 0.16
57 0.2
58 0.29
59 0.37
60 0.46
61 0.56
62 0.66
63 0.72
64 0.75
65 0.81
66 0.83
67 0.84
68 0.85
69 0.84
70 0.82
71 0.84
72 0.82
73 0.8
74 0.79
75 0.8
76 0.8
77 0.82
78 0.85
79 0.88
80 0.92
81 0.94
82 0.94
83 0.92
84 0.89
85 0.86
86 0.85
87 0.8
88 0.72
89 0.64
90 0.53
91 0.45
92 0.36
93 0.28
94 0.17
95 0.12
96 0.08
97 0.05
98 0.06
99 0.1
100 0.16
101 0.22
102 0.26
103 0.34
104 0.42
105 0.49
106 0.52
107 0.57
108 0.61
109 0.65
110 0.72
111 0.75
112 0.78
113 0.8
114 0.79
115 0.72
116 0.63
117 0.55
118 0.53
119 0.51
120 0.49
121 0.46
122 0.47
123 0.46
124 0.49
125 0.48
126 0.41
127 0.36
128 0.31
129 0.25
130 0.25
131 0.25
132 0.27
133 0.3
134 0.38
135 0.41
136 0.38
137 0.42
138 0.43
139 0.45
140 0.48
141 0.51
142 0.47
143 0.43
144 0.46
145 0.43
146 0.41
147 0.36
148 0.29
149 0.22
150 0.16
151 0.13
152 0.11
153 0.12
154 0.14
155 0.23
156 0.32
157 0.41
158 0.47
159 0.5
160 0.52
161 0.53
162 0.55
163 0.56
164 0.53
165 0.49
166 0.45
167 0.43
168 0.39
169 0.36
170 0.29
171 0.2
172 0.12
173 0.06
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.11
179 0.11
180 0.17
181 0.18
182 0.15
183 0.18
184 0.19
185 0.18
186 0.17
187 0.16
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.09
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.13
199 0.16
200 0.17
201 0.17
202 0.17
203 0.19
204 0.24
205 0.24
206 0.22
207 0.19
208 0.2
209 0.21
210 0.23
211 0.2
212 0.14
213 0.14
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.1
220 0.09
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.11
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.14
240 0.16
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.12
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.1
255 0.09
256 0.1
257 0.09
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.11
280 0.17
281 0.24
282 0.28
283 0.31
284 0.34
285 0.4
286 0.49
287 0.55
288 0.58
289 0.62
290 0.62
291 0.65
292 0.62
293 0.57
294 0.52
295 0.44
296 0.36
297 0.32
298 0.28
299 0.23
300 0.22
301 0.22
302 0.23
303 0.23
304 0.24
305 0.22
306 0.25
307 0.31
308 0.37
309 0.47
310 0.5
311 0.56
312 0.64
313 0.69
314 0.7
315 0.71
316 0.7
317 0.68
318 0.65
319 0.66
320 0.65
321 0.57
322 0.54
323 0.49
324 0.42
325 0.37
326 0.33
327 0.26
328 0.23
329 0.31
330 0.36
331 0.41
332 0.46
333 0.5
334 0.58
335 0.64
336 0.6
337 0.56
338 0.56
339 0.54
340 0.61
341 0.54
342 0.52
343 0.46
344 0.48
345 0.47
346 0.45
347 0.48
348 0.39
349 0.38
350 0.35
351 0.34
352 0.31
353 0.34
354 0.34
355 0.27
356 0.31
357 0.31
358 0.36
359 0.36
360 0.37
361 0.32
362 0.27
363 0.28
364 0.23
365 0.24
366 0.17
367 0.16
368 0.16
369 0.16
370 0.19
371 0.18
372 0.2
373 0.18
374 0.19
375 0.2
376 0.21
377 0.23
378 0.24
379 0.24
380 0.24
381 0.28
382 0.28
383 0.35
384 0.38
385 0.38
386 0.4
387 0.4
388 0.39
389 0.34
390 0.32
391 0.24
392 0.21
393 0.19
394 0.16
395 0.2
396 0.2
397 0.19
398 0.2
399 0.24
400 0.27
401 0.29
402 0.35
403 0.4
404 0.49
405 0.59
406 0.68