Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YQE3

Protein Details
Accession A0A2C5YQE3    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-248AGTGGKTKRERERKTRQTIDFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-109GGYGARVRGGRGSRRPR
234-239KRERER
256-298RSRGGGGMRGGRGGRGGRGGDRGDRGGDRGGDRGRGSMARGGR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSNVASQNRFAYLGNDDDGEEKPFAPVKSVDKATSRTTKRNVEPQAPQAPLGSGGNRRGGPRGSEAAFRDRAAGSDRNHGRPTEEVSRDAPRGGYGARVRGGRGSRRPREQDDRHPSRAGGYGGSEKQSAQSWGAVEGDAELKDEQAGEAMARSEHRDALAEDGAAEEAAEPEEKSMSYDDYMAQLAEKKLALDSGFKVREANEGSKLDKKWANAKALEKDEEDFIAGTGGKTKRERERKTRQTIDFDPRFVEPERSRGGGGMRGGRGGRGGRGGDRGDRGGDRGGDRGRGSMARGGRRDYGSQDAPINTNDEAAFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.18
4 0.18
5 0.19
6 0.19
7 0.17
8 0.14
9 0.16
10 0.2
11 0.19
12 0.21
13 0.24
14 0.25
15 0.32
16 0.36
17 0.37
18 0.37
19 0.41
20 0.45
21 0.51
22 0.52
23 0.53
24 0.57
25 0.62
26 0.64
27 0.7
28 0.7
29 0.68
30 0.68
31 0.68
32 0.68
33 0.6
34 0.54
35 0.45
36 0.38
37 0.32
38 0.28
39 0.23
40 0.2
41 0.22
42 0.26
43 0.27
44 0.28
45 0.3
46 0.3
47 0.29
48 0.3
49 0.32
50 0.29
51 0.32
52 0.33
53 0.36
54 0.36
55 0.33
56 0.3
57 0.25
58 0.25
59 0.25
60 0.28
61 0.23
62 0.31
63 0.36
64 0.39
65 0.41
66 0.4
67 0.37
68 0.33
69 0.38
70 0.37
71 0.34
72 0.31
73 0.33
74 0.37
75 0.35
76 0.34
77 0.27
78 0.18
79 0.18
80 0.15
81 0.19
82 0.16
83 0.19
84 0.21
85 0.22
86 0.22
87 0.26
88 0.3
89 0.31
90 0.39
91 0.46
92 0.51
93 0.59
94 0.64
95 0.67
96 0.72
97 0.72
98 0.73
99 0.74
100 0.74
101 0.7
102 0.65
103 0.57
104 0.49
105 0.45
106 0.35
107 0.24
108 0.18
109 0.18
110 0.18
111 0.2
112 0.18
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.06
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.04
138 0.04
139 0.05
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.11
147 0.11
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.04
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.17
183 0.18
184 0.18
185 0.18
186 0.18
187 0.22
188 0.23
189 0.24
190 0.22
191 0.23
192 0.25
193 0.31
194 0.31
195 0.31
196 0.3
197 0.3
198 0.33
199 0.37
200 0.39
201 0.39
202 0.43
203 0.45
204 0.46
205 0.47
206 0.39
207 0.35
208 0.3
209 0.26
210 0.21
211 0.14
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.13
217 0.14
218 0.18
219 0.21
220 0.27
221 0.36
222 0.47
223 0.56
224 0.6
225 0.7
226 0.76
227 0.84
228 0.87
229 0.82
230 0.8
231 0.78
232 0.78
233 0.71
234 0.61
235 0.53
236 0.44
237 0.41
238 0.35
239 0.36
240 0.27
241 0.3
242 0.32
243 0.31
244 0.31
245 0.29
246 0.29
247 0.25
248 0.27
249 0.27
250 0.24
251 0.25
252 0.25
253 0.24
254 0.25
255 0.22
256 0.2
257 0.19
258 0.2
259 0.2
260 0.25
261 0.27
262 0.27
263 0.29
264 0.29
265 0.27
266 0.27
267 0.26
268 0.25
269 0.26
270 0.24
271 0.27
272 0.27
273 0.29
274 0.28
275 0.28
276 0.27
277 0.25
278 0.26
279 0.26
280 0.3
281 0.34
282 0.36
283 0.39
284 0.42
285 0.44
286 0.44
287 0.43
288 0.44
289 0.39
290 0.39
291 0.4
292 0.36
293 0.35
294 0.33
295 0.32
296 0.24
297 0.23
298 0.2
299 0.16
300 0.16
301 0.16
302 0.15