Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5Y3T9

Protein Details
Accession A0A2C5Y3T9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
246-272RRDPDERRYARNRSRSPQRQERNMDSYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
246-247RR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035542  CRIP  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003755  F:peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12235  RRM_PPIL4  
Amino Acid Sequences MASLGASEAALSGAAPASTSEAADKSQSINEPEPHADDGLDKQSSPQDKGPSKEDLDKQLRERKAAIQAVQLELMGDLPFAEVKPPENVLFVCKLNAVTQDEDLELIFGRFGKIVSCEIIRDAKTKDSLQYAFIEFDEKAACEAAYFKMQDVLIDDRRIHVDFSQSVSKLSDAWRKGANKQRRANASRGGWGGVEELEKKRQYRAHMDKREGEGYDMVHGDKTARGRHEGVQEDVRREARSLRSHRRDPDERRYARNRSRSPQRQERNMDSYSSSRRDGDGRRKETELDMRSRDQRHYTRDVKQHRDAGRYHDRHSDSYRSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.08
5 0.09
6 0.09
7 0.11
8 0.11
9 0.13
10 0.14
11 0.15
12 0.14
13 0.17
14 0.21
15 0.24
16 0.29
17 0.31
18 0.33
19 0.35
20 0.36
21 0.33
22 0.3
23 0.25
24 0.21
25 0.22
26 0.23
27 0.21
28 0.18
29 0.18
30 0.24
31 0.28
32 0.31
33 0.32
34 0.36
35 0.41
36 0.45
37 0.47
38 0.47
39 0.47
40 0.51
41 0.5
42 0.5
43 0.53
44 0.54
45 0.58
46 0.61
47 0.59
48 0.54
49 0.52
50 0.47
51 0.49
52 0.48
53 0.43
54 0.39
55 0.39
56 0.37
57 0.35
58 0.29
59 0.2
60 0.15
61 0.14
62 0.08
63 0.06
64 0.04
65 0.04
66 0.05
67 0.05
68 0.06
69 0.06
70 0.08
71 0.1
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.14
76 0.16
77 0.18
78 0.17
79 0.16
80 0.14
81 0.15
82 0.14
83 0.18
84 0.17
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.15
89 0.15
90 0.13
91 0.1
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.12
106 0.15
107 0.16
108 0.17
109 0.18
110 0.19
111 0.21
112 0.22
113 0.22
114 0.23
115 0.23
116 0.22
117 0.22
118 0.21
119 0.18
120 0.17
121 0.17
122 0.12
123 0.12
124 0.11
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.05
130 0.07
131 0.07
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.16
140 0.15
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.17
145 0.17
146 0.15
147 0.11
148 0.12
149 0.11
150 0.14
151 0.17
152 0.15
153 0.15
154 0.15
155 0.14
156 0.13
157 0.16
158 0.19
159 0.17
160 0.19
161 0.24
162 0.25
163 0.32
164 0.41
165 0.47
166 0.5
167 0.55
168 0.6
169 0.64
170 0.66
171 0.63
172 0.6
173 0.53
174 0.47
175 0.42
176 0.36
177 0.26
178 0.23
179 0.19
180 0.12
181 0.12
182 0.1
183 0.11
184 0.16
185 0.18
186 0.19
187 0.23
188 0.26
189 0.29
190 0.38
191 0.47
192 0.53
193 0.59
194 0.63
195 0.64
196 0.65
197 0.63
198 0.53
199 0.43
200 0.33
201 0.25
202 0.22
203 0.17
204 0.14
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.11
209 0.14
210 0.16
211 0.17
212 0.21
213 0.23
214 0.28
215 0.34
216 0.35
217 0.35
218 0.39
219 0.4
220 0.38
221 0.39
222 0.37
223 0.3
224 0.28
225 0.3
226 0.29
227 0.36
228 0.43
229 0.51
230 0.58
231 0.64
232 0.7
233 0.75
234 0.77
235 0.76
236 0.78
237 0.77
238 0.73
239 0.74
240 0.76
241 0.77
242 0.76
243 0.78
244 0.75
245 0.74
246 0.81
247 0.82
248 0.84
249 0.85
250 0.85
251 0.84
252 0.84
253 0.83
254 0.78
255 0.69
256 0.61
257 0.53
258 0.5
259 0.47
260 0.43
261 0.37
262 0.32
263 0.33
264 0.37
265 0.43
266 0.48
267 0.52
268 0.54
269 0.56
270 0.57
271 0.57
272 0.57
273 0.57
274 0.53
275 0.49
276 0.49
277 0.5
278 0.56
279 0.57
280 0.56
281 0.56
282 0.57
283 0.57
284 0.61
285 0.63
286 0.64
287 0.71
288 0.76
289 0.75
290 0.76
291 0.77
292 0.74
293 0.72
294 0.66
295 0.65
296 0.66
297 0.62
298 0.58
299 0.58
300 0.56
301 0.56
302 0.59
303 0.6