Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YCW1

Protein Details
Accession A0A2C5YCW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-361QHEAKKRRGRAAPPGRCHSCBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
346-352KKRRGRA
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 11.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MATATVLAPSSHYPPQSSYTVAHHHSVMMPSEPRRSCDDHEPPNRQSLPSISEVISGTRPAVFAPSAAQPAMRPGSGLPSPFSQSSLHYSDLDKRSSPQPLHPASSFAQPPEALPAFADSPRPPFNARHSLPPVADRRPTPPTKSELSPTLAQKPSDSHASNGSYAHQPPPPAPTSHPYPPGQLPLPNYPISPRHPAPLAPGRFDPRTHPRHAEEGDFNHARARCDGAVGRNFETWSYYDALSRIAASSRTMFNFAEAYARIAIEQHGSQPIPERLPTEREISDMLSHNEAIHRSLEQVRDAVQVSMQNERAREGVKIKTAYDEDSDVPMYTDAIKPQYSIQHEAKKRRGRAAPPGRCHSCNRIDTPEWRRGPDGARTLCNACGLHYAKLERKRQLEARTVRPKQEERN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.31
3 0.31
4 0.31
5 0.29
6 0.3
7 0.36
8 0.37
9 0.36
10 0.32
11 0.31
12 0.31
13 0.31
14 0.27
15 0.25
16 0.27
17 0.28
18 0.37
19 0.37
20 0.37
21 0.4
22 0.44
23 0.44
24 0.5
25 0.55
26 0.57
27 0.65
28 0.7
29 0.67
30 0.71
31 0.68
32 0.58
33 0.51
34 0.44
35 0.39
36 0.35
37 0.35
38 0.26
39 0.26
40 0.26
41 0.26
42 0.23
43 0.19
44 0.16
45 0.14
46 0.13
47 0.11
48 0.13
49 0.11
50 0.1
51 0.12
52 0.14
53 0.16
54 0.16
55 0.16
56 0.13
57 0.19
58 0.2
59 0.18
60 0.15
61 0.13
62 0.19
63 0.21
64 0.22
65 0.19
66 0.19
67 0.22
68 0.22
69 0.24
70 0.19
71 0.2
72 0.24
73 0.25
74 0.25
75 0.23
76 0.25
77 0.32
78 0.35
79 0.35
80 0.3
81 0.3
82 0.33
83 0.39
84 0.39
85 0.37
86 0.42
87 0.43
88 0.47
89 0.44
90 0.43
91 0.37
92 0.41
93 0.36
94 0.27
95 0.25
96 0.21
97 0.21
98 0.23
99 0.22
100 0.16
101 0.14
102 0.16
103 0.15
104 0.16
105 0.19
106 0.13
107 0.18
108 0.21
109 0.23
110 0.23
111 0.25
112 0.32
113 0.39
114 0.4
115 0.43
116 0.45
117 0.46
118 0.45
119 0.47
120 0.45
121 0.39
122 0.41
123 0.34
124 0.34
125 0.39
126 0.42
127 0.4
128 0.39
129 0.4
130 0.4
131 0.41
132 0.39
133 0.35
134 0.35
135 0.35
136 0.34
137 0.37
138 0.35
139 0.33
140 0.31
141 0.29
142 0.27
143 0.29
144 0.27
145 0.21
146 0.23
147 0.24
148 0.24
149 0.23
150 0.23
151 0.19
152 0.19
153 0.21
154 0.18
155 0.17
156 0.17
157 0.21
158 0.21
159 0.2
160 0.21
161 0.22
162 0.26
163 0.3
164 0.34
165 0.3
166 0.31
167 0.31
168 0.32
169 0.3
170 0.26
171 0.25
172 0.24
173 0.27
174 0.24
175 0.23
176 0.22
177 0.24
178 0.25
179 0.28
180 0.25
181 0.23
182 0.24
183 0.24
184 0.28
185 0.32
186 0.3
187 0.26
188 0.27
189 0.29
190 0.29
191 0.29
192 0.29
193 0.3
194 0.34
195 0.35
196 0.37
197 0.36
198 0.41
199 0.41
200 0.39
201 0.33
202 0.3
203 0.32
204 0.29
205 0.26
206 0.24
207 0.24
208 0.22
209 0.2
210 0.21
211 0.14
212 0.15
213 0.17
214 0.18
215 0.21
216 0.23
217 0.24
218 0.22
219 0.22
220 0.2
221 0.2
222 0.15
223 0.13
224 0.13
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.11
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.14
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.11
245 0.12
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.16
258 0.19
259 0.18
260 0.19
261 0.2
262 0.2
263 0.24
264 0.26
265 0.25
266 0.22
267 0.22
268 0.22
269 0.21
270 0.22
271 0.2
272 0.2
273 0.17
274 0.17
275 0.16
276 0.17
277 0.16
278 0.14
279 0.13
280 0.11
281 0.13
282 0.17
283 0.18
284 0.17
285 0.17
286 0.18
287 0.19
288 0.2
289 0.17
290 0.14
291 0.16
292 0.16
293 0.2
294 0.22
295 0.21
296 0.21
297 0.22
298 0.22
299 0.2
300 0.22
301 0.22
302 0.22
303 0.27
304 0.28
305 0.27
306 0.3
307 0.31
308 0.3
309 0.28
310 0.26
311 0.21
312 0.22
313 0.22
314 0.17
315 0.17
316 0.15
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.13
321 0.15
322 0.15
323 0.15
324 0.18
325 0.25
326 0.27
327 0.33
328 0.38
329 0.44
330 0.52
331 0.61
332 0.68
333 0.7
334 0.71
335 0.74
336 0.75
337 0.72
338 0.76
339 0.77
340 0.78
341 0.77
342 0.81
343 0.78
344 0.73
345 0.72
346 0.69
347 0.67
348 0.63
349 0.6
350 0.59
351 0.57
352 0.63
353 0.64
354 0.66
355 0.6
356 0.56
357 0.53
358 0.49
359 0.49
360 0.48
361 0.51
362 0.45
363 0.45
364 0.46
365 0.46
366 0.43
367 0.43
368 0.34
369 0.26
370 0.3
371 0.3
372 0.3
373 0.32
374 0.37
375 0.41
376 0.5
377 0.57
378 0.56
379 0.58
380 0.63
381 0.66
382 0.67
383 0.7
384 0.69
385 0.72
386 0.75
387 0.77
388 0.76
389 0.77