FuNGI

A0A2C5YF31

Protein Details

Accession

A0A2C5YF31

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-34	LNLATFTPKRKHGKKEGGSKKRAREEED	Basic
56-116	TALVDSIKPEKKKKKKVKKEEEDLKEDKDREEARIKKKKEKKKKKEKKDKKEEKEEKEEEE	Basic
122-155	KEEIREIEKKRRKEKKEKKKKKKEEQDKEEEKQD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-31	PKRKHGKKEGGSKKRARE
63-145	KPEKKKKKKVKKEEEDLKEDKDREEARIKKKKEKKKKKEKKDKKEEKEEKEEEEKEKVEKEEIREIEKKRRKEKKEKKKKKKE
453-458	ARKARK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.333, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MAEDAPLNLATFTPKRKHGKKEGGSKKRAREEEDETADAERKLKKSKSVSELPSETALVDSIKPEKKKKKKVKKEEEDLKEDKDREEARIKKKKEKKKKKEKKDKKEEKEEKEEEEKEKVEKEEIREIEKKRRKEKKEKKKKKKEEQDKEEEKQDDFGAHDDTKSTVERDNNKIQHNEVQKKQDNTQPSLDAMKIDQVPTAPQASTIHQPLDTPDNVVYPFYAQTISIYEPLYPVGWAQPVSCMEDQHLRLLRNKYVPKLRGVLLDYSNVSLGVSPGDCAATSDETPTTVTSYNEYGVGFTYLTVDVKLFVPTRGAWMEGLIHIQTEGHIGVVCFGRFNAAIETSRLPPDWHWVKRDVGNDGEGHDFLAQDEDDDSRSVDSATNQHGRVRQANSTGYWVDARGTPIGGRLRFRIRNYDAGLNGNVSYLSLEGTMLDLEAEKKLVEKENLVARARKARKLGLTSGARRFRPPELGMTRFEMSALQDTLGEESGGAEWSKGSR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.5
3	0.59
4	0.69
5	0.74
6	0.8
7	0.82
8	0.87
9	0.89
10	0.89
11	0.91
12	0.89
13	0.88
14	0.87
15	0.83
16	0.79
17	0.75
18	0.72
19	0.72
20	0.69
21	0.6
22	0.51
23	0.48
24	0.44
25	0.37
26	0.34
27	0.3
28	0.29
29	0.36
30	0.39
31	0.46
32	0.52
33	0.61
34	0.64
35	0.68
36	0.69
37	0.68
38	0.67
39	0.61
40	0.54
41	0.45
42	0.36
43	0.27
44	0.22
45	0.15
46	0.12
47	0.12
48	0.18
49	0.24
50	0.3
51	0.4
52	0.5
53	0.6
54	0.71
55	0.8
56	0.84
57	0.89
58	0.94
59	0.96
60	0.96
61	0.96
62	0.95
63	0.92
64	0.89
65	0.81
66	0.75
67	0.71
68	0.61
69	0.51
70	0.48
71	0.41
72	0.38
73	0.44
74	0.48
75	0.51
76	0.6
77	0.65
78	0.68
79	0.77
80	0.82
81	0.84
82	0.87
83	0.87
84	0.89
85	0.95
86	0.96
87	0.97
88	0.97
89	0.97
90	0.97
91	0.97
92	0.96
93	0.96
94	0.95
95	0.92
96	0.91
97	0.83
98	0.78
99	0.74
100	0.69
101	0.6
102	0.55
103	0.48
104	0.39
105	0.39
106	0.34
107	0.31
108	0.3
109	0.32
110	0.36
111	0.36
112	0.4
113	0.44
114	0.47
115	0.52
116	0.57
117	0.61
118	0.63
119	0.71
120	0.75
121	0.8
122	0.87
123	0.87
124	0.91
125	0.94
126	0.95
127	0.96
128	0.97
129	0.97
130	0.97
131	0.97
132	0.97
133	0.95
134	0.95
135	0.92
136	0.84
137	0.8
138	0.7
139	0.59
140	0.5
141	0.4
142	0.3
143	0.22
144	0.19
145	0.16
146	0.14
147	0.14
148	0.12
149	0.13
150	0.14
151	0.14
152	0.14
153	0.14
154	0.2
155	0.26
156	0.32
157	0.4
158	0.44
159	0.47
160	0.47
161	0.46
162	0.47
163	0.5
164	0.51
165	0.48
166	0.52
167	0.53
168	0.55
169	0.56
170	0.54
171	0.49
172	0.46
173	0.43
174	0.35
175	0.31
176	0.29
177	0.26
178	0.22
179	0.16
180	0.16
181	0.14
182	0.13
183	0.12
184	0.11
185	0.11
186	0.12
187	0.13
188	0.09
189	0.1
190	0.11
191	0.13
192	0.15
193	0.16
194	0.15
195	0.14
196	0.14
197	0.15
198	0.17
199	0.15
200	0.14
201	0.13
202	0.13
203	0.13
204	0.13
205	0.11
206	0.08
207	0.08
208	0.07
209	0.07
210	0.06
211	0.06
212	0.08
213	0.09
214	0.1
215	0.1
216	0.09
217	0.09
218	0.1
219	0.09
220	0.07
221	0.07
222	0.06
223	0.06
224	0.07
225	0.06
226	0.08
227	0.09
228	0.13
229	0.13
230	0.12
231	0.13
232	0.17
233	0.18
234	0.21
235	0.23
236	0.21
237	0.26
238	0.29
239	0.31
240	0.33
241	0.35
242	0.36
243	0.4
244	0.41
245	0.38
246	0.38
247	0.35
248	0.32
249	0.31
250	0.29
251	0.22
252	0.22
253	0.19
254	0.16
255	0.15
256	0.12
257	0.1
258	0.06
259	0.06
260	0.05
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.09
279	0.1
280	0.1
281	0.11
282	0.11
283	0.09
284	0.08
285	0.09
286	0.07
287	0.06
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.06
293	0.07
294	0.07
295	0.1
296	0.09
297	0.09
298	0.1
299	0.1
300	0.13
301	0.13
302	0.13
303	0.11
304	0.1
305	0.11
306	0.1
307	0.11
308	0.08
309	0.07
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.07
319	0.09
320	0.08
321	0.07
322	0.07
323	0.09
324	0.08
325	0.1
326	0.09
327	0.1
328	0.11
329	0.13
330	0.16
331	0.16
332	0.18
333	0.17
334	0.16
335	0.15
336	0.23
337	0.3
338	0.32
339	0.33
340	0.35
341	0.39
342	0.43
343	0.45
344	0.39
345	0.32
346	0.3
347	0.27
348	0.26
349	0.24
350	0.19
351	0.16
352	0.13
353	0.11
354	0.09
355	0.1
356	0.08
357	0.07
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.09
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.09
367	0.1
368	0.13
369	0.19
370	0.24
371	0.25
372	0.28
373	0.32
374	0.35
375	0.39
376	0.39
377	0.36
378	0.36
379	0.38
380	0.35
381	0.35
382	0.31
383	0.26
384	0.23
385	0.2
386	0.16
387	0.16
388	0.17
389	0.13
390	0.14
391	0.13
392	0.17
393	0.24
394	0.25
395	0.25
396	0.28
397	0.37
398	0.43
399	0.45
400	0.49
401	0.48
402	0.53
403	0.55
404	0.55
405	0.48
406	0.45
407	0.43
408	0.35
409	0.3
410	0.23
411	0.18
412	0.12
413	0.11
414	0.07
415	0.07
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.06
420	0.06
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.08
427	0.07
428	0.09
429	0.12
430	0.18
431	0.2
432	0.21
433	0.26
434	0.33
435	0.4
436	0.42
437	0.43
438	0.41
439	0.5
440	0.53
441	0.54
442	0.51
443	0.52
444	0.56
445	0.58
446	0.59
447	0.58
448	0.62
449	0.63
450	0.67
451	0.68
452	0.62
453	0.6
454	0.59
455	0.55
456	0.54
457	0.48
458	0.49
459	0.49
460	0.51
461	0.5
462	0.51
463	0.47
464	0.39
465	0.37
466	0.28
467	0.22
468	0.24
469	0.22
470	0.17
471	0.16
472	0.17
473	0.18
474	0.18
475	0.15
476	0.09
477	0.09
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.08

A0A2C5YF31

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer