Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XFW1

Protein Details
Accession A0A2C5XFW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-245DEAWEKSHPKQPRAKQRRFKTTVPTSRGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-232RAK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MDSCCTCATILSPSETHSQHRIVECCNRIICAKCIQRNPRFSRYCPFCQISSEPSPLPQRLRDPPPYTPLPRTRRPNSQPCAPPPYTPSAAAGPSSQPSDAKSEKPSDTLHFLDHDHDSISSLSLRYGVPQSALRSANNITSDHLLLGRKTILIPAEYYTAGISLSPLPINGEDEELRKAKIRRFMTSCKESDYDVALLYLEQSDYDVAAATASYLADEAWEKSHPKQPRAKQRRFKTTVPTSRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.31
4 0.3
5 0.31
6 0.33
7 0.38
8 0.38
9 0.38
10 0.45
11 0.44
12 0.45
13 0.43
14 0.4
15 0.38
16 0.39
17 0.37
18 0.37
19 0.43
20 0.44
21 0.53
22 0.62
23 0.66
24 0.73
25 0.77
26 0.78
27 0.75
28 0.71
29 0.72
30 0.7
31 0.68
32 0.66
33 0.61
34 0.51
35 0.51
36 0.5
37 0.46
38 0.44
39 0.4
40 0.33
41 0.34
42 0.38
43 0.36
44 0.37
45 0.34
46 0.35
47 0.4
48 0.46
49 0.51
50 0.51
51 0.51
52 0.54
53 0.56
54 0.54
55 0.54
56 0.57
57 0.55
58 0.59
59 0.65
60 0.64
61 0.68
62 0.73
63 0.75
64 0.71
65 0.73
66 0.71
67 0.67
68 0.7
69 0.61
70 0.54
71 0.46
72 0.47
73 0.4
74 0.33
75 0.3
76 0.23
77 0.22
78 0.21
79 0.18
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.11
84 0.1
85 0.11
86 0.16
87 0.17
88 0.18
89 0.2
90 0.24
91 0.24
92 0.26
93 0.27
94 0.23
95 0.26
96 0.24
97 0.21
98 0.18
99 0.18
100 0.18
101 0.17
102 0.15
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.11
118 0.12
119 0.15
120 0.17
121 0.15
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.17
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.12
131 0.13
132 0.12
133 0.1
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.08
157 0.1
158 0.09
159 0.11
160 0.11
161 0.13
162 0.16
163 0.16
164 0.17
165 0.2
166 0.23
167 0.25
168 0.33
169 0.36
170 0.4
171 0.46
172 0.54
173 0.57
174 0.61
175 0.58
176 0.54
177 0.51
178 0.44
179 0.39
180 0.34
181 0.25
182 0.18
183 0.17
184 0.12
185 0.11
186 0.1
187 0.09
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.13
209 0.16
210 0.2
211 0.28
212 0.35
213 0.42
214 0.51
215 0.59
216 0.68
217 0.76
218 0.83
219 0.86
220 0.89
221 0.92
222 0.89
223 0.85
224 0.84
225 0.84