Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YCC3

Protein Details
Accession A0A2C5YCC3    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-166QKVPRALRRRTASHNAKRVPRRLRSRARREMAQDKTPVVEARRRKPRTTRARIRAETARRLGLLAARVRKRQRRRLGQSGSGLHydrophilic
238-260APPKACSKFGRRQRNKTWLPTHTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-158KVPRALRRRTASHNAKRVPRRLRSRARREMAQDKTPVVEARRRKPRTTRARIRAETARRLGLLAARVRKRQRRR
212-233RGGEGRGGRGENGHAGRPKIRP
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MSPTNTTARSGTKRHGEASSADSGRQKRAKIHAARSIAAQTGEAGLSNGQLQLDAFVAAHEFEMASLQQSMATSKAVSASRAFQKVPRALRRRTASHNAKRVPRRLRSRARREMAQDKTPVVEARRRKPRTTRARIRAETARRLGLLAARVRKRQRRRLGQSGSGLLAAAAAQGGANDAQGGGGTNDAQGGGGAGDAQGGEGGGEGGGGEGRGGEGRGGRGENGHAGRPKIRPNMLNAPPKACSKFGRRQRNKTWLPTHTWHAKRARMTDPKNPLWRFALALTPTDKVHRATHRTLGEKGTMVWDMSYMSTIGLYGNCTGLQRVLERIGLNDDACWKQRGSKWRLGTRAWTGMLSRDQEGYRRPLCPATVLWNPASAEACKQRQVWLRVPPSAFLESFDELVRLCKMQKPRVYVEDLRFDIGSLELTGPASTETLLAVLTPYSTQSLAKSPHGALFETLHGLTNPAALPTNAVLHFCIHEPRRPWHAWQQPGAHRLAERLASWPAEEGLQAAALFDPEARHAASSLFPDKAMQARRACLQPTHAHAHAHGAIPISLIASSPAGSTLSQGSWTLLAPWRCILPLWHAVVRLPLASGLTPRFGGLDETMQLAFERGLPWFPADYPATHAGAEWELARRRERTRLWEQRPKSKRIHWSSLDLGAGRRGELGHGLSCHFEVLFGLDDDASSLRHLTHVPKPAFDALVADCRLVPPPSPNALLTVRLRLLARGTVSPCARIYRLPSAPSRAEPSSSTDATHSLLPSDLRAQWLARLPCSLALSSPPASHAPPTRHMQPRPWPAAPPLKTPPLVPDAHDLVGFVTTGSFCLATGRSTAIGSIALHKVLAHVRSHYNEGTLCIVRNAGQSHGWLAQWQAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.53
3 0.47
4 0.44
5 0.44
6 0.45
7 0.37
8 0.36
9 0.39
10 0.39
11 0.46
12 0.48
13 0.46
14 0.45
15 0.53
16 0.6
17 0.63
18 0.69
19 0.68
20 0.68
21 0.66
22 0.61
23 0.55
24 0.47
25 0.38
26 0.29
27 0.21
28 0.17
29 0.16
30 0.13
31 0.11
32 0.08
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.09
41 0.08
42 0.07
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.05
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.1
57 0.11
58 0.1
59 0.11
60 0.1
61 0.1
62 0.15
63 0.15
64 0.17
65 0.18
66 0.24
67 0.3
68 0.34
69 0.35
70 0.34
71 0.42
72 0.47
73 0.55
74 0.59
75 0.6
76 0.62
77 0.7
78 0.74
79 0.71
80 0.72
81 0.74
82 0.74
83 0.76
84 0.8
85 0.78
86 0.8
87 0.83
88 0.83
89 0.82
90 0.81
91 0.82
92 0.83
93 0.86
94 0.88
95 0.9
96 0.91
97 0.88
98 0.85
99 0.82
100 0.81
101 0.77
102 0.73
103 0.65
104 0.56
105 0.51
106 0.46
107 0.41
108 0.36
109 0.37
110 0.38
111 0.45
112 0.55
113 0.59
114 0.64
115 0.71
116 0.77
117 0.81
118 0.83
119 0.84
120 0.83
121 0.89
122 0.84
123 0.8
124 0.79
125 0.76
126 0.73
127 0.66
128 0.59
129 0.48
130 0.45
131 0.4
132 0.33
133 0.31
134 0.29
135 0.34
136 0.36
137 0.44
138 0.53
139 0.62
140 0.69
141 0.74
142 0.78
143 0.81
144 0.85
145 0.88
146 0.87
147 0.84
148 0.79
149 0.71
150 0.61
151 0.5
152 0.4
153 0.29
154 0.21
155 0.13
156 0.07
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.02
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.02
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.18
210 0.18
211 0.22
212 0.23
213 0.24
214 0.29
215 0.32
216 0.39
217 0.4
218 0.43
219 0.41
220 0.45
221 0.53
222 0.57
223 0.61
224 0.55
225 0.51
226 0.49
227 0.51
228 0.46
229 0.39
230 0.36
231 0.36
232 0.44
233 0.51
234 0.6
235 0.66
236 0.73
237 0.8
238 0.85
239 0.84
240 0.83
241 0.82
242 0.75
243 0.73
244 0.67
245 0.64
246 0.63
247 0.59
248 0.57
249 0.55
250 0.55
251 0.53
252 0.54
253 0.57
254 0.57
255 0.59
256 0.6
257 0.62
258 0.65
259 0.69
260 0.64
261 0.58
262 0.51
263 0.47
264 0.39
265 0.31
266 0.29
267 0.21
268 0.22
269 0.21
270 0.2
271 0.19
272 0.2
273 0.2
274 0.18
275 0.23
276 0.28
277 0.33
278 0.35
279 0.42
280 0.45
281 0.46
282 0.46
283 0.42
284 0.36
285 0.3
286 0.27
287 0.22
288 0.18
289 0.14
290 0.12
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.14
316 0.14
317 0.13
318 0.12
319 0.14
320 0.14
321 0.15
322 0.16
323 0.14
324 0.18
325 0.22
326 0.32
327 0.36
328 0.42
329 0.48
330 0.53
331 0.57
332 0.54
333 0.55
334 0.49
335 0.46
336 0.39
337 0.31
338 0.25
339 0.24
340 0.25
341 0.22
342 0.18
343 0.16
344 0.16
345 0.18
346 0.21
347 0.24
348 0.23
349 0.22
350 0.23
351 0.22
352 0.22
353 0.22
354 0.2
355 0.19
356 0.21
357 0.22
358 0.21
359 0.21
360 0.21
361 0.2
362 0.2
363 0.14
364 0.14
365 0.17
366 0.19
367 0.2
368 0.21
369 0.25
370 0.31
371 0.37
372 0.39
373 0.43
374 0.45
375 0.45
376 0.45
377 0.4
378 0.36
379 0.33
380 0.27
381 0.19
382 0.19
383 0.15
384 0.16
385 0.14
386 0.12
387 0.1
388 0.11
389 0.1
390 0.07
391 0.08
392 0.11
393 0.17
394 0.24
395 0.28
396 0.33
397 0.35
398 0.38
399 0.44
400 0.44
401 0.42
402 0.41
403 0.37
404 0.33
405 0.29
406 0.25
407 0.19
408 0.15
409 0.11
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.05
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.04
430 0.05
431 0.05
432 0.06
433 0.1
434 0.13
435 0.14
436 0.15
437 0.15
438 0.18
439 0.19
440 0.18
441 0.15
442 0.14
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.07
456 0.06
457 0.09
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.09
464 0.14
465 0.14
466 0.17
467 0.2
468 0.23
469 0.3
470 0.31
471 0.34
472 0.39
473 0.44
474 0.46
475 0.48
476 0.51
477 0.49
478 0.51
479 0.48
480 0.39
481 0.32
482 0.28
483 0.24
484 0.18
485 0.13
486 0.12
487 0.13
488 0.12
489 0.12
490 0.11
491 0.1
492 0.09
493 0.08
494 0.06
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.07
510 0.08
511 0.11
512 0.13
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.13
517 0.18
518 0.2
519 0.23
520 0.22
521 0.24
522 0.27
523 0.29
524 0.3
525 0.25
526 0.27
527 0.25
528 0.28
529 0.32
530 0.3
531 0.28
532 0.27
533 0.3
534 0.27
535 0.24
536 0.19
537 0.15
538 0.13
539 0.13
540 0.13
541 0.09
542 0.06
543 0.06
544 0.05
545 0.04
546 0.05
547 0.04
548 0.05
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.08
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.1
560 0.13
561 0.14
562 0.14
563 0.14
564 0.14
565 0.14
566 0.14
567 0.13
568 0.14
569 0.19
570 0.21
571 0.22
572 0.22
573 0.22
574 0.23
575 0.22
576 0.17
577 0.12
578 0.08
579 0.08
580 0.08
581 0.1
582 0.09
583 0.1
584 0.1
585 0.09
586 0.09
587 0.09
588 0.1
589 0.09
590 0.1
591 0.09
592 0.11
593 0.1
594 0.1
595 0.1
596 0.09
597 0.08
598 0.07
599 0.07
600 0.06
601 0.08
602 0.08
603 0.09
604 0.1
605 0.1
606 0.13
607 0.13
608 0.13
609 0.17
610 0.19
611 0.19
612 0.18
613 0.18
614 0.15
615 0.14
616 0.14
617 0.11
618 0.13
619 0.16
620 0.19
621 0.22
622 0.26
623 0.29
624 0.37
625 0.4
626 0.44
627 0.51
628 0.6
629 0.66
630 0.72
631 0.74
632 0.76
633 0.79
634 0.78
635 0.74
636 0.71
637 0.72
638 0.7
639 0.74
640 0.67
641 0.66
642 0.62
643 0.58
644 0.51
645 0.41
646 0.33
647 0.28
648 0.24
649 0.18
650 0.15
651 0.12
652 0.11
653 0.12
654 0.13
655 0.12
656 0.12
657 0.13
658 0.13
659 0.13
660 0.13
661 0.11
662 0.09
663 0.07
664 0.08
665 0.08
666 0.08
667 0.08
668 0.07
669 0.07
670 0.08
671 0.09
672 0.07
673 0.06
674 0.07
675 0.06
676 0.08
677 0.1
678 0.15
679 0.21
680 0.3
681 0.31
682 0.31
683 0.34
684 0.35
685 0.34
686 0.28
687 0.24
688 0.17
689 0.22
690 0.22
691 0.19
692 0.17
693 0.17
694 0.19
695 0.18
696 0.17
697 0.15
698 0.2
699 0.23
700 0.26
701 0.25
702 0.27
703 0.27
704 0.31
705 0.29
706 0.28
707 0.25
708 0.26
709 0.26
710 0.22
711 0.23
712 0.21
713 0.21
714 0.21
715 0.22
716 0.27
717 0.27
718 0.29
719 0.28
720 0.29
721 0.28
722 0.26
723 0.3
724 0.33
725 0.36
726 0.38
727 0.41
728 0.44
729 0.46
730 0.46
731 0.46
732 0.39
733 0.37
734 0.34
735 0.36
736 0.36
737 0.33
738 0.31
739 0.26
740 0.26
741 0.25
742 0.26
743 0.19
744 0.14
745 0.15
746 0.14
747 0.15
748 0.17
749 0.17
750 0.17
751 0.19
752 0.18
753 0.21
754 0.29
755 0.29
756 0.27
757 0.27
758 0.26
759 0.28
760 0.29
761 0.25
762 0.18
763 0.19
764 0.22
765 0.22
766 0.22
767 0.21
768 0.21
769 0.22
770 0.26
771 0.3
772 0.31
773 0.35
774 0.41
775 0.48
776 0.55
777 0.58
778 0.61
779 0.65
780 0.7
781 0.72
782 0.68
783 0.62
784 0.61
785 0.67
786 0.61
787 0.59
788 0.55
789 0.53
790 0.52
791 0.49
792 0.46
793 0.42
794 0.4
795 0.35
796 0.35
797 0.32
798 0.32
799 0.31
800 0.26
801 0.2
802 0.19
803 0.17
804 0.1
805 0.07
806 0.06
807 0.07
808 0.08
809 0.07
810 0.07
811 0.1
812 0.11
813 0.11
814 0.12
815 0.13
816 0.14
817 0.14
818 0.14
819 0.12
820 0.13
821 0.13
822 0.16
823 0.16
824 0.15
825 0.15
826 0.15
827 0.18
828 0.21
829 0.24
830 0.21
831 0.24
832 0.3
833 0.33
834 0.39
835 0.36
836 0.35
837 0.32
838 0.32
839 0.33
840 0.29
841 0.26
842 0.22
843 0.22
844 0.21
845 0.25
846 0.24
847 0.21
848 0.21
849 0.21
850 0.24
851 0.26
852 0.24
853 0.2