Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3P2Z0

Protein Details
Accession J3P2Z0    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-68DDYDRNRDRDRRYRTRSRSPGDGRBasic
252-273VGEIRKEKKTEYRQYMNRQGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-44RDRRDRGSDHPRRRD
48-141DRNRDRDRRYRTRSRSPGDGRGGSYRDRRRDAGREPPRGTRDADRPPRDRGDKDRDRDRDSQRRGGREDRDHGHRRDRPREDGRRRSNSPRRSA
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MAGGKQYRRDDGRDDAGGYRGARGEPDGHRDRRDRGSDHPRRRDDDYDRNRDRDRRYRTRSRSPGDGRGGSYRDRRRDAGREPPRGTRDADRPPRDRGDKDRDRDRDSQRRGGREDRDHGHRRDRPREDGRRRSNSPRRSASPGLATKGSRDNDIKESSLPTRSKNSATEKSAPMSFKVGANDNGDEGRSRSVSRQQRHASETGDDTPMGGSGDAEDDDLEVDDDGLAAMQAMMGFGGFGTTKNKKIVGNDVGEIRKEKKTEYRQYMNRQGGFNRPLSPSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.39
3 0.37
4 0.36
5 0.31
6 0.26
7 0.21
8 0.19
9 0.17
10 0.18
11 0.22
12 0.22
13 0.31
14 0.37
15 0.4
16 0.47
17 0.5
18 0.54
19 0.57
20 0.6
21 0.55
22 0.56
23 0.63
24 0.67
25 0.73
26 0.78
27 0.75
28 0.73
29 0.76
30 0.74
31 0.72
32 0.72
33 0.72
34 0.72
35 0.72
36 0.73
37 0.73
38 0.72
39 0.72
40 0.7
41 0.7
42 0.7
43 0.74
44 0.79
45 0.82
46 0.86
47 0.86
48 0.82
49 0.82
50 0.77
51 0.77
52 0.73
53 0.67
54 0.58
55 0.53
56 0.5
57 0.45
58 0.48
59 0.47
60 0.47
61 0.48
62 0.49
63 0.5
64 0.56
65 0.57
66 0.59
67 0.6
68 0.62
69 0.62
70 0.65
71 0.62
72 0.57
73 0.54
74 0.49
75 0.47
76 0.49
77 0.56
78 0.56
79 0.56
80 0.59
81 0.63
82 0.62
83 0.58
84 0.56
85 0.57
86 0.58
87 0.61
88 0.66
89 0.64
90 0.65
91 0.69
92 0.7
93 0.69
94 0.67
95 0.69
96 0.64
97 0.64
98 0.62
99 0.61
100 0.59
101 0.54
102 0.54
103 0.5
104 0.54
105 0.56
106 0.54
107 0.57
108 0.55
109 0.57
110 0.61
111 0.62
112 0.62
113 0.65
114 0.73
115 0.73
116 0.78
117 0.79
118 0.77
119 0.77
120 0.79
121 0.78
122 0.76
123 0.73
124 0.69
125 0.63
126 0.62
127 0.59
128 0.5
129 0.48
130 0.42
131 0.36
132 0.33
133 0.29
134 0.23
135 0.28
136 0.26
137 0.22
138 0.21
139 0.22
140 0.24
141 0.26
142 0.25
143 0.19
144 0.21
145 0.2
146 0.26
147 0.24
148 0.22
149 0.25
150 0.27
151 0.29
152 0.32
153 0.38
154 0.38
155 0.41
156 0.44
157 0.41
158 0.41
159 0.42
160 0.36
161 0.3
162 0.26
163 0.22
164 0.19
165 0.19
166 0.2
167 0.19
168 0.21
169 0.2
170 0.18
171 0.17
172 0.15
173 0.14
174 0.12
175 0.12
176 0.1
177 0.11
178 0.13
179 0.22
180 0.31
181 0.35
182 0.43
183 0.47
184 0.51
185 0.54
186 0.54
187 0.47
188 0.41
189 0.4
190 0.33
191 0.28
192 0.23
193 0.19
194 0.16
195 0.14
196 0.12
197 0.08
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.02
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.12
228 0.16
229 0.2
230 0.23
231 0.26
232 0.28
233 0.32
234 0.4
235 0.4
236 0.41
237 0.39
238 0.43
239 0.42
240 0.42
241 0.42
242 0.37
243 0.35
244 0.32
245 0.35
246 0.39
247 0.47
248 0.56
249 0.62
250 0.69
251 0.73
252 0.81
253 0.87
254 0.86
255 0.8
256 0.73
257 0.67
258 0.65
259 0.61
260 0.54
261 0.49