Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YIV3

Protein Details
Accession A0A2C5YIV3    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-307SRPAADIAAKRKRRRKSKVTVEPERQEMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-188GKRK
233-256GAEKANKSRQRGPKGPNPLSVRKP
282-297PAADIAAKRKRRRKSK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MRGKRSKQYRKLMEQFSMTFGFREPYQILVDAEMIVDSCRFKMELAPALQRTVHGKAKPMITQCEIRKLYARKSEMGMDEAIEVARSYERRRCGHHPNEFPEPLSTMECLKAVVDSKSTGENKHRYVVASQNQQVRRMLRSIRGVPLIYIKRSVMILEPMSDKSAETRVREERGKFRSEIKTSLGKRKRMDKEADDGRDERESFKDNDAEDNAVDDELPTNDKSKSQNLSAKGAEKANKSRQRGPKGPNPLSVRKPKQTTVAATLADAGRRDTPMPKADSRPAADIAAKRKRRRKSKVTVEPERQEM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.66
3 0.59
4 0.52
5 0.42
6 0.33
7 0.27
8 0.24
9 0.18
10 0.22
11 0.18
12 0.18
13 0.19
14 0.2
15 0.2
16 0.18
17 0.19
18 0.14
19 0.13
20 0.1
21 0.09
22 0.07
23 0.08
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.08
28 0.09
29 0.13
30 0.18
31 0.24
32 0.28
33 0.34
34 0.34
35 0.35
36 0.35
37 0.32
38 0.31
39 0.3
40 0.33
41 0.27
42 0.32
43 0.35
44 0.39
45 0.42
46 0.42
47 0.42
48 0.39
49 0.45
50 0.42
51 0.48
52 0.45
53 0.41
54 0.45
55 0.45
56 0.49
57 0.5
58 0.5
59 0.43
60 0.44
61 0.47
62 0.4
63 0.38
64 0.3
65 0.22
66 0.19
67 0.16
68 0.14
69 0.09
70 0.07
71 0.06
72 0.08
73 0.09
74 0.12
75 0.18
76 0.25
77 0.28
78 0.34
79 0.41
80 0.49
81 0.57
82 0.63
83 0.66
84 0.64
85 0.69
86 0.64
87 0.58
88 0.48
89 0.4
90 0.31
91 0.24
92 0.2
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.11
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.16
105 0.18
106 0.19
107 0.25
108 0.29
109 0.3
110 0.32
111 0.32
112 0.28
113 0.29
114 0.34
115 0.33
116 0.34
117 0.37
118 0.41
119 0.41
120 0.43
121 0.43
122 0.37
123 0.32
124 0.29
125 0.27
126 0.25
127 0.29
128 0.29
129 0.29
130 0.29
131 0.27
132 0.24
133 0.29
134 0.26
135 0.21
136 0.2
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.09
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.09
151 0.14
152 0.16
153 0.16
154 0.2
155 0.23
156 0.27
157 0.32
158 0.34
159 0.36
160 0.38
161 0.4
162 0.36
163 0.4
164 0.44
165 0.42
166 0.41
167 0.37
168 0.41
169 0.42
170 0.51
171 0.51
172 0.5
173 0.51
174 0.59
175 0.62
176 0.6
177 0.63
178 0.56
179 0.58
180 0.6
181 0.59
182 0.52
183 0.45
184 0.4
185 0.37
186 0.34
187 0.27
188 0.21
189 0.22
190 0.21
191 0.23
192 0.24
193 0.21
194 0.24
195 0.23
196 0.22
197 0.18
198 0.17
199 0.15
200 0.11
201 0.11
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.09
206 0.08
207 0.1
208 0.11
209 0.14
210 0.17
211 0.23
212 0.26
213 0.31
214 0.36
215 0.38
216 0.43
217 0.42
218 0.42
219 0.39
220 0.4
221 0.38
222 0.38
223 0.43
224 0.48
225 0.53
226 0.56
227 0.62
228 0.67
229 0.72
230 0.75
231 0.74
232 0.73
233 0.76
234 0.75
235 0.74
236 0.71
237 0.7
238 0.7
239 0.73
240 0.72
241 0.7
242 0.71
243 0.65
244 0.66
245 0.64
246 0.6
247 0.56
248 0.52
249 0.44
250 0.39
251 0.38
252 0.32
253 0.27
254 0.22
255 0.18
256 0.15
257 0.17
258 0.19
259 0.19
260 0.24
261 0.29
262 0.35
263 0.38
264 0.42
265 0.48
266 0.53
267 0.52
268 0.5
269 0.45
270 0.42
271 0.42
272 0.41
273 0.43
274 0.47
275 0.53
276 0.59
277 0.65
278 0.73
279 0.79
280 0.85
281 0.86
282 0.87
283 0.89
284 0.91
285 0.93
286 0.93
287 0.92