Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5XZD1

Protein Details
Accession A0A2C5XZD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-108EVKSQSPLKAPRRVRRRARRTIDSGTGHydrophilic
346-368CKSAEHNKVARRRRLDNKTGSDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-62KRRRK
90-101KAPRRVRRRARR
Subcellular Location(s) mito 15, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR000445  HhH_motif  
IPR030841  NTH1  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000703  F:oxidized pyrimidine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00633  HHH  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MRSSRISQDASKVFDRVSSAASPPCRVTRSLSRFAFTATETATPDIEDGITAHPAATKRRRKVSPASTRKVVKQEVQEETVEVKSQSPLKAPRRVRRRARRTIDSGTGEQMMTPPSGWQDIYSTVEKMRAPGGIAYGAPVDTMGCERLADAEASPRDQRFHTLVALMLSSQTKDTVNAVAMERLKKELPPHQPGAPAGLNLENMVAVDAKLLNELIWAVGFHNNKTKYLKQTAVLLRDTWKGDVPDTIEGLTSLPGVGPKMAFLCLSAAWHRCEGIGVDVHVHRITNLWGWNKSKTPEQTRLALQAWLPRDKWRDINWLLVGLGQTICLPVGRRCGDCDLGLQGLCKSAEHNKVARRRRLDNKTGSDVGIKMEEAKRQVTVKREVVDATATTIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.33
3 0.26
4 0.25
5 0.22
6 0.23
7 0.28
8 0.31
9 0.31
10 0.32
11 0.36
12 0.35
13 0.34
14 0.38
15 0.43
16 0.48
17 0.55
18 0.54
19 0.5
20 0.48
21 0.48
22 0.43
23 0.33
24 0.28
25 0.2
26 0.2
27 0.19
28 0.2
29 0.18
30 0.16
31 0.15
32 0.13
33 0.11
34 0.09
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.12
41 0.14
42 0.23
43 0.32
44 0.4
45 0.48
46 0.57
47 0.63
48 0.67
49 0.75
50 0.77
51 0.78
52 0.79
53 0.78
54 0.76
55 0.76
56 0.75
57 0.72
58 0.66
59 0.61
60 0.59
61 0.59
62 0.56
63 0.54
64 0.48
65 0.41
66 0.39
67 0.33
68 0.26
69 0.19
70 0.15
71 0.15
72 0.19
73 0.19
74 0.23
75 0.32
76 0.38
77 0.47
78 0.56
79 0.62
80 0.68
81 0.77
82 0.82
83 0.84
84 0.87
85 0.88
86 0.88
87 0.87
88 0.84
89 0.81
90 0.77
91 0.71
92 0.62
93 0.53
94 0.45
95 0.36
96 0.28
97 0.23
98 0.16
99 0.11
100 0.1
101 0.08
102 0.08
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.1
107 0.11
108 0.15
109 0.16
110 0.16
111 0.15
112 0.19
113 0.18
114 0.17
115 0.17
116 0.13
117 0.13
118 0.12
119 0.13
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.05
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.11
139 0.12
140 0.14
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.2
146 0.17
147 0.18
148 0.16
149 0.15
150 0.15
151 0.14
152 0.13
153 0.1
154 0.09
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.07
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.1
166 0.12
167 0.14
168 0.15
169 0.14
170 0.15
171 0.15
172 0.15
173 0.18
174 0.23
175 0.29
176 0.34
177 0.36
178 0.35
179 0.37
180 0.35
181 0.36
182 0.29
183 0.2
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.1
188 0.1
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.03
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.18
210 0.19
211 0.21
212 0.26
213 0.3
214 0.31
215 0.36
216 0.38
217 0.32
218 0.4
219 0.42
220 0.41
221 0.38
222 0.33
223 0.3
224 0.3
225 0.3
226 0.22
227 0.2
228 0.17
229 0.16
230 0.17
231 0.16
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.07
253 0.09
254 0.12
255 0.14
256 0.15
257 0.16
258 0.16
259 0.14
260 0.15
261 0.14
262 0.13
263 0.11
264 0.1
265 0.12
266 0.13
267 0.14
268 0.14
269 0.13
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.13
274 0.18
275 0.2
276 0.25
277 0.28
278 0.32
279 0.35
280 0.36
281 0.39
282 0.43
283 0.46
284 0.51
285 0.51
286 0.52
287 0.51
288 0.54
289 0.48
290 0.41
291 0.34
292 0.31
293 0.32
294 0.31
295 0.3
296 0.31
297 0.35
298 0.36
299 0.41
300 0.41
301 0.46
302 0.43
303 0.49
304 0.43
305 0.4
306 0.36
307 0.31
308 0.26
309 0.18
310 0.16
311 0.09
312 0.08
313 0.07
314 0.08
315 0.07
316 0.1
317 0.11
318 0.19
319 0.23
320 0.24
321 0.27
322 0.32
323 0.33
324 0.31
325 0.31
326 0.25
327 0.24
328 0.23
329 0.21
330 0.17
331 0.17
332 0.17
333 0.15
334 0.15
335 0.21
336 0.28
337 0.33
338 0.39
339 0.44
340 0.54
341 0.63
342 0.7
343 0.69
344 0.71
345 0.76
346 0.8
347 0.82
348 0.82
349 0.8
350 0.79
351 0.73
352 0.65
353 0.58
354 0.48
355 0.4
356 0.32
357 0.24
358 0.23
359 0.24
360 0.27
361 0.27
362 0.28
363 0.29
364 0.33
365 0.38
366 0.39
367 0.44
368 0.46
369 0.46
370 0.46
371 0.43
372 0.4
373 0.38
374 0.31